Бисульфосукцинимидил суберат - Bissulfosuccinimidyl suberate
Имена | |
---|---|
Название ИЮПАК 1- [8- (2,5-диоксо-3-сульфопирролидин-1-ил) окси-8-оксооктаноил] окси-2,5-диоксопирролидин-3-сульфоновая кислота | |
Другие имена Суберат дисульфосукцинимидила; Бис (сульфосукцинимидил) суберат; BS3 | |
Идентификаторы | |
3D модель (JSmol ) | |
ChemSpider | |
ECHA InfoCard | 100.110.895 |
PubChem CID | |
UNII | |
| |
| |
Свойства | |
C16ЧАС20N2О14S2 | |
Молярная масса | 528.46 г · моль−1 |
Если не указано иное, данные для материалов приведены в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа). | |
проверить (что ?) | |
Ссылки на инфобоксы | |
Бисульфосукцинимидил суберат (BS3) - это сшивающий агент используется в биологических исследованиях. Это водорастворимая версия дисукцинимидил суберат.
Сшивающие агенты
Сшивающие агенты химические реагенты которые играют решающую роль в подготовке конъюгирует используется в биологических исследованиях, в частности в иммунотехнологиях и исследованиях белков. Сшивающие агенты предназначены для ковалентного взаимодействия с интересующими молекулами, что приводит к конъюгации. А распорка, обычно состоящий из нескольких атомов, разделяет две молекулы, и природа и длина этого спейсера важно учитывать при разработке анализа с участием выбранного сшивающего агента. Бисульфосукцинимидиловый суберат является примером гомобифункционального сшивающего агента.
Характеристики
Водорастворимый: BS3 является гидрофильным из-за его концевых сульфонильных заместителей и в результате диссоциирует в воде, устраняя необходимость в использовании органических растворителей, которые мешают структуре и функции белка. Поскольку при использовании BS3 в качестве сшивающего агента нет необходимости использовать органические растворители, он идеально подходит для исследований структуры и функции белка в физиологических условиях.
Нерасщепляемый: сшивающий агент BS3 имеет 8-атомный спейсер, не расщепляется, и молекула не проницаема для клеточной мембраны. BS3 необратимо связывается со своими конъюгированными молекулами, а это означает, что как только BS3 создает ковалентные связи со своими молекулами-мишенями, эти ассоциации нелегко разрушить.
Мембрана непроницаема: поскольку BS3 является заряженной молекулой, он не может свободно проходить через клеточные мембраны, что делает его идеальным сшивающим агентом для белков клеточной поверхности.
Гомобифункциональный: BS3 является гомобифункциональным сшивающим агентом в том смысле, что он имеет две идентичные реактивные группы, т.е. N-гидроксисульфосукцинимидные эфиры, и необходима только одна стадия для установления сшивки между молекулами конъюгата.
Реагирует с амином: BS3 реагирует с амином в том смысле, что его N-гидроксисульфосукцинимидные (NHS) сложные эфиры на каждом конце специфически реагируют с первичными аминами с образованием стабильных амидных связей в реакции типа нуклеофильного ацильного замещения, в которой N-гидроксисульфосукцинимид действует как уходящая группа. BS3 особенно полезен в приложениях, связанных с белками, поскольку он может реагировать с первичными аминами на боковой цепи остатков лизина и на N-конце полипептидных цепей. Этот сшивающий агент также можно использовать для стабилизации белок-белковых взаимодействий для дальнейшего анализа с помощью иммунопреципитации.
Дейтерированный BS3
Дейтерированный сшивающий агент бис (сульфосукцинимидил) 2,2,7,7-суберат-d4 является «тяжелым» сшивающим агентом BS3, который содержит 4 атома дейтерия. При использовании в масс-спектрометрии исследований, BS3-d4 обеспечивает сдвиг на 4 дальтона по сравнению со сшитыми белками с недейтерированным аналогом (BS3-d0). Таким образом, «тяжелые» и «легкие» аналоги сшивающих агентов можно использовать для изотопного мечения белков и пептидов в приложениях масс-спектрометрических исследований.
Приложения
- Исследования рецепторов-лигандов на клеточной поверхности
- Сшивание биомолекул на клетках
- Фиксация белковых комплексов перед анализом взаимодействия белков
Дисукцинимидил суберат
Дисукцинимидил суберат (DSS) является нерастворимым в воде аналогом BS3. DSS и BS3 проявляют одинаковую способность к сшиванию по отношению к первичным аминам. Основное структурное различие между этими двумя молекулами состоит в том, что DSS не содержит сульфонат заместители на обоих концах молекулы, и именно это различие отвечает за незаряженную, неполярную природу молекулы DSS. Из-за гидрофобной природы этого сшивающего агента его необходимо растворять в органическом растворителе, таком как диметилсульфоксид перед добавлением к водной пробе. Благодаря способности DSS проникать через клеточные мембраны, он лучше всего подходит для применений, где требуется внутриклеточное сшивание.
использованная литература
эта статья не цитировать Любые источники.Сентябрь 2009 г.) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения) ( |