Бисульфосукцинимидил суберат - Bissulfosuccinimidyl suberate

Бисульфосукцинимидил суберат
Бисульфосукцинимидил suberate.png
Имена
Название ИЮПАК
1- [8- (2,5-диоксо-3-сульфопирролидин-1-ил) окси-8-оксооктаноил] окси-2,5-диоксопирролидин-3-сульфоновая кислота
Другие имена
Суберат дисульфосукцинимидила; Бис (сульфосукцинимидил) суберат; BS3
Идентификаторы
3D модель (JSmol )
ChemSpider
ECHA InfoCard100.110.895 Отредактируйте это в Викиданных
UNII
Свойства
C16ЧАС20N2О14S2
Молярная масса528.46 г · моль−1
Если не указано иное, данные для материалов приведены в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
☒N проверить (что проверятьY☒N ?)
Ссылки на инфобоксы

Бисульфосукцинимидил суберат (BS3) - это сшивающий агент используется в биологических исследованиях. Это водорастворимая версия дисукцинимидил суберат.

Сшивающие агенты

Сшивающие агенты химические реагенты которые играют решающую роль в подготовке конъюгирует используется в биологических исследованиях, в частности в иммунотехнологиях и исследованиях белков. Сшивающие агенты предназначены для ковалентного взаимодействия с интересующими молекулами, что приводит к конъюгации. А распорка, обычно состоящий из нескольких атомов, разделяет две молекулы, и природа и длина этого спейсера важно учитывать при разработке анализа с участием выбранного сшивающего агента. Бисульфосукцинимидиловый суберат является примером гомобифункционального сшивающего агента.

Характеристики

Водорастворимый: BS3 является гидрофильным из-за его концевых сульфонильных заместителей и в результате диссоциирует в воде, устраняя необходимость в использовании органических растворителей, которые мешают структуре и функции белка. Поскольку при использовании BS3 в качестве сшивающего агента нет необходимости использовать органические растворители, он идеально подходит для исследований структуры и функции белка в физиологических условиях.

Нерасщепляемый: сшивающий агент BS3 имеет 8-атомный спейсер, не расщепляется, и молекула не проницаема для клеточной мембраны. BS3 необратимо связывается со своими конъюгированными молекулами, а это означает, что как только BS3 создает ковалентные связи со своими молекулами-мишенями, эти ассоциации нелегко разрушить.

Мембрана непроницаема: поскольку BS3 является заряженной молекулой, он не может свободно проходить через клеточные мембраны, что делает его идеальным сшивающим агентом для белков клеточной поверхности.

Гомобифункциональный: BS3 является гомобифункциональным сшивающим агентом в том смысле, что он имеет две идентичные реактивные группы, т.е. N-гидроксисульфосукцинимидные эфиры, и необходима только одна стадия для установления сшивки между молекулами конъюгата.

Реагирует с амином: BS3 реагирует с амином в том смысле, что его N-гидроксисульфосукцинимидные (NHS) сложные эфиры на каждом конце специфически реагируют с первичными аминами с образованием стабильных амидных связей в реакции типа нуклеофильного ацильного замещения, в которой N-гидроксисульфосукцинимид действует как уходящая группа. BS3 особенно полезен в приложениях, связанных с белками, поскольку он может реагировать с первичными аминами на боковой цепи остатков лизина и на N-конце полипептидных цепей. Этот сшивающий агент также можно использовать для стабилизации белок-белковых взаимодействий для дальнейшего анализа с помощью иммунопреципитации.

Дейтерированный BS3

Дейтерированный сшивающий агент бис (сульфосукцинимидил) 2,2,7,7-суберат-d4 является «тяжелым» сшивающим агентом BS3, который содержит 4 атома дейтерия. При использовании в масс-спектрометрии исследований, BS3-d4 обеспечивает сдвиг на 4 дальтона по сравнению со сшитыми белками с недейтерированным аналогом (BS3-d0). Таким образом, «тяжелые» и «легкие» аналоги сшивающих агентов можно использовать для изотопного мечения белков и пептидов в приложениях масс-спектрометрических исследований.

Приложения

  • Исследования рецепторов-лигандов на клеточной поверхности
  • Сшивание биомолекул на клетках
  • Фиксация белковых комплексов перед анализом взаимодействия белков

Дисукцинимидил суберат

Дисукцинимидил суберат (DSS) является нерастворимым в воде аналогом BS3. DSS и BS3 проявляют одинаковую способность к сшиванию по отношению к первичным аминам. Основное структурное различие между этими двумя молекулами состоит в том, что DSS не содержит сульфонат заместители на обоих концах молекулы, и именно это различие отвечает за незаряженную, неполярную природу молекулы DSS. Из-за гидрофобной природы этого сшивающего агента его необходимо растворять в органическом растворителе, таком как диметилсульфоксид перед добавлением к водной пробе. Благодаря способности DSS проникать через клеточные мембраны, он лучше всего подходит для применений, где требуется внутриклеточное сшивание.

Химическая структура дисукцинимидила суберата

использованная литература