Ингибитор протеазы Боумена-Бирка - Bowman–Birk protease inhibitor
| Нога Боумена – Бирка | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура высокого разрешения ингибитора протеазы Боумена-Бирка ячменя | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Bowman-Birk_leg | ||||||||
| Pfam | PF00228 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000877 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00253 | ||||||||
| SCOP2 | 1pi2 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CDD | cd00023 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярная биология, то Ингибитор протеазы Боумена-Бирка семейство белков состоит из эукариотический ингибиторы протеиназ, принадлежащие к семейству ингибиторов MEROPS I12, клан IF. Они в основном подавлять серин пептидазы семейства S1, но также ингибируют пептидазы S3.[1][2]
Члены этого семейства имеют дублированную структуру и обычно обладают двумя разными ингибирующими сайтами. Эти ингибиторы в основном встречаются в растения и в частности в семена из бобовые, а также в зерновых культурах.[3] В злаках они существуют в двух формах, одна из которых является дублированием основной структуры.[4] Белки семейства ингибиторов Боумена – Бирка ингибиторов сериновых протеиназ взаимодействовать с ферменты они ингибируют через открытую поверхностную петлю, которая принимает каноническую конформацию ингибирования протеиназ. Образующийся нековалентный комплекс делает протеиназу неактивной. Этот механизм ингибирования является общим для большинства ингибиторов сериновых протеиназ. белки, и известно много аналогичных примеров. Однако особой особенностью белка ингибитора Боумена-Бирка является то, что взаимодействующая петля является особенно четко определенной, дисульфид -связанный, короткий бета-лист область, край.[5][6][7]
Рекомендации
- ^ Роулингс Н.Д., Толле Д.П., Барретт А.Дж. (март 2004 г.). «Эволюционные семейства ингибиторов пептидазы». Biochem. J. 378 (Pt 3): 705–16. Дои:10.1042 / BJ20031825. ЧВК 1224039. PMID 14705960.
- ^ Ласковский М, Като I (1980). «Белковые ингибиторы протеиназ». Анну. Преподобный Biochem. 49: 593–626. Дои:10.1146 / annurev.bi.49.070180.003113. PMID 6996568.
- ^ Бирк, Y (февраль 1985 г.). «Ингибитор Боумена-Бирка. Ингибитор трипсина и химотрипсина из соевых бобов». Международный журнал исследований пептидов и белков. 25 (2): 113–31. Дои:10.1111 / j.1399-3011.1985.tb02155.x. PMID 3886572.
- ^ Таширо М., Хашино К., Сиодзаки М., Ибуки Ф., Маки Зи (август 1987 г.). «Полная аминокислотная последовательность ингибитора трипсина рисовых отрубей». J. Biochem. 102 (2): 297–306. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a122054. PMID 3667571.
- ^ Макбрайд Дж. Д., Лезербэрроу Р. Дж. (Июль 2001 г.). «Синтетические пептиды, имитирующие белок ингибитор Боумена-Бирка». Curr. Med. Chem. 8 (8): 909–17. Дои:10.2174/0929867013372832. PMID 11375759.
- ^ Макбрайд Дж. Д., Уотсон Э. М., Брауэр А. Б., Джолент А. М., Лезербарроу Р. Дж. (2002). «Пептидные имитаторы петли реактивного сайта ингибитора Боумена-Бирка». Биополимеры. 66 (2): 79–92. Дои:10.1002 / bip.10228. PMID 12325158.
- ^ Брауэр А.Б., Ньево М., Макбрайд Д.Д., Лезербарроу Р.Дж. (апрель 2003 г.). «Структурная основа консервативного треонина P2 в канонических ингибиторах сериновых протеиназ». J. Biomol. Struct. Dyn. 20 (5): 645–56. Дои:10.1080/07391102.2003.10506881. PMID 12643767. S2CID 45800486.