CONN (набор инструментов для функционального подключения) - Википедия - CONN (functional connectivity toolbox)

CONN
CONN (функциональный набор инструментов для подключения)
CONN (функциональный набор инструментов для подключения)
Разработчики)Лаборатория Габриэли. Институт Макговерна по исследованию мозга. Массачусетский технологический институт
Стабильный выпуск
2018
Операционная системаМайкрософт Виндоус Linux Mac OS X
ТипАнализ данных нейровизуализации
ЛицензияЛицензия MIT
Интернет сайтwww.nitrc.org/ проекты/ conn - NITRC
www.conn-toolbox.org - CONN

CONN это Matlab -на основе кроссплатформенности программное обеспечение для обработки изображений для вычисления, отображения и анализа функциональная связь в фМРТ (функциональная магнитно-резонансная томография ) в состояние покоя и во время задачи.

CONN доступен как SPM набор инструментов, и он находится в свободном доступе для некоммерческого использования.

использование

CONN предлагает удобный графический интерфейс для управления всеми аспектами функционального анализа подключения,[1] в том числе предварительная обработка функциональных и анатомических объемов,[2] устранение предметно-движения и физиологического шума,[3] очистка выбросов,[4] оценка множественных подключений и сетевых показателей, а также на уровне населения проверка гипотезы. Кроме того, конвейер обработки также можно автоматизировать с помощью пакетных скриптов.

История

CONN написан Альфонсо Ньето-Кастаноном. Это было поддержано Лаборатория Габриэли в Массачусетский технологический институт, Guenther Lab в Бостонский университет, и PEN Lab в Северо-Восточный университет. Первый выпуск CONN был выпущен в 2011 году, и на сегодняшний день ежегодно выпускается примерно один крупный новый выпуск.

Влияние

С момента выпуска CONN был загружен более 50 000 раз,[5] он был использован в более чем 1000 публикаций,[6] и он включен в Национальные институты здравоохранения США финансируется Информационный центр инструментов и ресурсов для нейровизуализации и информатики список 10 лучших инструментов и ресурсов по нейровизуализации[7]

Скачать

CONN можно скачать с его домашняя страница на NITRC сайт, а пользовательские ресурсы и поддержка предоставляются на CONN сайт и Форум поддержки CONN

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Whitfield-Gabrieli, S; Ньето-Кастанон, А (2012). «Conn: функциональный набор инструментов подключения для коррелированных и антикоррелированных сетей мозга». Brain Connect. 2: 125–41. Дои:10.1089 / brain.2012.0073. PMID  22642651.
  2. ^ Ньето-Кастанон, А. (2020). Справочник по методам fcMRI в CONN. Бостон, Массачусетс: Hilbert Press. ISBN  978-0-578-64400-4.
  3. ^ Бехзади, Y; Рестом, К; Liau, J; Лю, ТТ. «Компонентный метод коррекции шума (CompCor) для BOLD и перфузионной фМРТ». NeuroImage. 37: 90–101. Дои:10.1016 / j.neuroimage.2007.04.042. ЧВК  2214855. PMID  17560126.
  4. ^ Мощность, JD; Barnes, KA; Снайдер, Аризона; Schlaggar, BL; Петерсен, SE. «Ложные, но систематические корреляции в функциональной связности сетей МРТ возникают из-за движения объекта». NeuroImage. 59: 2142–54. Дои:10.1016 / j.neuroimage.2011.10.018. ЧВК  3254728. PMID  22019881.
  5. ^ [1] Статистика загрузки панели инструментов CONN
  6. ^ [2] Google ученый
  7. ^ [3] Самые популярные инструменты и ресурсы NITRC