Чарльз Офриа - Charles Ofria
Чарльз Офриа | |
---|---|
Родился | Нью-Йорк, штат Нью-Йорк (США) | 13 декабря 1973 г.
Гражданство | Соединенные Штаты |
Альма-матер | Университет Стоуни-Брук (Б.С., 1994) Калифорнийский технологический институт (Доктор философии, 1999 г.) |
Известен | Цифровая эволюция, Вида |
Награды | Премия Заслуженного ученого Уитроу (2006, 2016)[1] Награда NSF CAREER (2007) Премия Withrow за выдающиеся достижения в области преподавания (2010)[2] |
Научная карьера | |
Поля | Компьютерные науки, эволюционная биология |
Учреждения | Университет штата Мичиган |
Докторант | Кристоф Адами |
Другие научные консультанты | Ричард Ленски |
Интернет сайт | www |
Д-р Чарльз А. Офрия является профессором кафедры компьютерных наук и инженерии в Университет штата Мичиган, директор Лаборатория цифровой эволюции (DEvo) там и директор МАЯК Центр для изучения эволюции в действии. Он сын покойного Чарльза Офриа,[3] кто разработал первый полностью интегрированный магазин программа управления для автомобильной ремонтной отрасли. Офрия присутствовала Stuyvesant High School, дневная и закончил Средняя школа Уорда Мелвилла в 1991 г. Он получил степень бакалавра наук. в области компьютерных наук, чистой математики и прикладной математики от Университет Стоуни-Брук в 1994 г. и докторскую степень. в вычислительных и нейронных системах от Калифорнийский технологический институт в 1999 году. Исследования Офрии сосредоточены на взаимодействии между Информатика и дарвиновская эволюция.[4]
Офрия - один из дизайнеров Вида, искусственная жизнь программная платформа для изучения эволюционная биология самовоспроизводящихся и развивающихся компьютерных программ (цифровые организмы, смотрите также Цифровые симуляторы организма ). Авида широко использовалась для изучения основных процессов, лежащих в основе дарвиновской эволюции.[5] Avida находится в стадии активной разработки в лаборатории цифровой эволюции Ofria по адресу: Университет штата Мичиган и изначально был разработан Ofria, Крис Адами и К. Титус Браун в Калтех в 1993 г.
Почести
Офрия получила награду NSF Career Award в 2007 году.[6] и награда Withrow Excellence Award за выдающиеся достижения в преподавании в 2010 г.[7] и за выдающиеся достижения в области исследований в 2006 и 2016 годах.[8] Он также был лауреатом премии Уильяма Дж. Била за выдающиеся способности факультета в 2017 году.[9]
Репрезентативные журнальные публикации
- Clune J, Pennock RT, Ofria C, Lenski RE (2012) Онтогенез имеет тенденцию повторять филогению цифровых организмов " Американский натуралист 180: E54 – E63. (pdf )
- Clune J, Goldsby HJ, Ofria C, and Pennock RT (2011) Выборочное давление для точного нацеливания на альтруизм: данные цифровой эволюции для трудных для проверки аспектов теории инклюзивной приспособленности. Труды Королевского общества. 278: 666-674. (PDF )
- Clune J, Stanley KO, Pennock RT, Ofria C (2011) О производительности косвенного кодирования через континуум регулярности. IEEE Transactions по эволюционным вычислениям. 15 (3): 346-367. (PDF )
- Clune J, Misevic D, Ofria C, Lenski RE, Elena SF и Sanjuán R. Естественный отбор не может оптимизировать частоту мутаций для долгосрочной адаптации в суровых условиях фитнеса.[10]
- Офриа К., Хуанг В. и Торнг Э. О постепенной эволюции сложности и внезапном появлении сложных функций[11]
- Елена С.Ф., Wilke CO, Ofria C и Lenski RE. Влияние размера популяции и скорости мутаций на эволюцию мутационной устойчивости[12]
- Островски Э., Офрия С., Ленски Р. Э., Экологическая специализация и адаптивный распад цифровых организмов[13]
- Ленски Р.Э., Баррик Дж. Э., Офриа К. Баланс устойчивости и эволюционируемости[14]
- Мишевич Д., Офрия С. и Ленски Р.Э. Половое размножение меняет генетическую архитектуру цифровых организмов[15]
Избранные научные публикации с участием Avida
- Р. Э. Ленский, К. Офрия, Т. К. Кольер, К. Адами (1999). Геномная сложность, устойчивость и генетические взаимодействия в цифровых организмах. Природа 400:661-664. Абстрактные
- К. Адами, К. Офриа и Т. Кольер (2000). Эволюция биологической сложности. «Известия Национальной академии наук» 97:4463-4468. Абстрактные
- К. О. Вилке, Дж. Л. Ван, К. Офриа, Р. Э. Ленский, и К. Адами (2001). Эволюция цифровых организмов при высокой скорости мутаций приводит к выживанию самых плоских. Природа 412:331-333 Абстрактные.
- Р. Э. Ленский, К. Офрия, Р. Т. Пеннок, и К. Адами (2003). Эволюционное происхождение сложных элементов. Природа 423:139-145. Абстрактные
- С.С. Чоу, C.O. Уилке, К. Офрия, Р. Э. Ленский, и С. Адами (2004). Адаптивное излучение от конкуренции за ресурсы в цифровых организмах. Наука 305:84-86 Абстрактные.
использованная литература
- ^ «Офрия и Оуэн получают награды Withrow». Университет штата Мичиган. Архивировано из оригинал 4 июня 2016 г.. Получено 2 октября 2017.
- ^ «Офрия и Тан получают награды Withrow». Университет штата Мичиган. Архивировано из оригинал 25 марта 2015 г.. Получено 2 октября 2017.
- ^ "Чарльз Офриа (старший)". FamilyCar.com. Архивировано из оригинал 8 февраля 2013 г.. Получено 11 декабря 2011.
- ^ Информатика Мичиганский государственный университет
- ^ «Тестирование Дарвина». Откройте для себя журнал. Февраль 2005 г.
- ^ «Чарльз Офриа получает награду NSF CAREER». Университет штата Мичиган. 2007. Архивировано с оригинал на 2012-04-06.
- ^ «Офрия и Тан получают награды Withrow». 2010.
- ^ «Джайн, Офрия и Стируолт получили награды Withrow». 2006.
- ^ «Награды выдающегося факультета Уильяма Дж. Била, 2017 г.». 2017.
- ^ Clune, J; Misevic, D; Ofria, C; Ленский, Р. Э .; Елена, СФ; Санхуан, Р. (2008). «Естественный отбор не может оптимизировать частоту мутаций для долгосрочной адаптации в суровых условиях фитнеса». PLOS вычислительная биология. 4 (9): e1000187. Bibcode:2008PLSCB ... 4E0187C. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1000187. ЧВК 2527516. PMID 18818724.
- ^ Офрия, Чарльз; Хуанг, Вэй; Торнг, Эрик (2007). «О постепенном развитии сложности и внезапном появлении сложных функций». Искусственная жизнь. 14 (3): 255–263. Дои:10.1162 / artl.2008.14.3.14302. PMID 18489251.
- ^ Елена, Сантьяго Ф .; Wilke, Claus O .; Офрия, Чарльз; Ленски, Ричард Э. (2007). «Влияние размера популяции и скорости мутаций на эволюцию мутационной устойчивости». Эволюция. 61 (3): 666–674. Дои:10.1111 / j.1558-5646.2007.00064.x. PMID 17348929.
- ^ Островски, Элизабет А .; Офрия, Чарльз; Ленски, Ричард Э. (2007). «Экологическая специализация и адаптивный распад цифровых организмов». Американский натуралист. 169 (1): E1–20. Дои:10.1086/510211. JSTOR 10.1086/510211. PMID 17206577.
- ^ Ленский, Р. Э .; Баррик, Дж. Э .; Офрия, С. (2006). «Уравновешивание устойчивости и эволюционируемости». PLOS Биология. 4 (12): e428. Дои:10.1371 / journal.pbio.0040428. ЧВК 1750925. PMID 17238277.
- ^ Мишевич, Душан; Офрия, Чарльз; Ленски, Ричард Э. (2005). «Половое размножение меняет генетическую архитектуру цифровых организмов». Труды Королевского общества B: биологические науки. 273 (1585): 457–464. Дои:10.1098 / rspb.2005.3338. ЧВК 1560214. PMID 16615213.