Хромосомный скачок - Chromosome jumping

Хромосомный скачок это инструмент молекулярной биологии, который используется в физических отображение из геномы. Это связано с несколькими другими инструментами, используемыми для той же цели, включая хромосомная ходьба.

Прыжок хромосом используется для обхода труднопроходимых участков. клон, например, содержащие повторяющаяся ДНК, который не может быть легко отображен с помощью хромосомного хождения, и полезен для быстрого перемещения по хромосоме в поисках определенного ген.

Прыжок хромосом позволяет более быстро перемещаться по геном по сравнению с другими методами, такими как хромосомная ходьба, и может быть использован для создания геномных маркеров с известным хромосомным положением.[1]

Прыжок хромосомы позволяет клонировать два конца последовательности ДНК без среднего участка. Геномная ДНК может быть частично расщеплена с использованием рестрикционных эндонуклеаз, и с помощью ДНК-лигазы фрагменты подвергаются циркуляризации.[2] Из известного последовательность, а грунтовка предназначен для последовательность через круговое соединение. Этот праймер используется для прыжков на 100 kb Интервалы -300 kb: последовательность на расстоянии 100 kb могла бы приблизиться к известной последовательности при циркуляризации. Таким образом, последовательности, недоступные при ходьбе по хромосомам, могут быть секвенированы. Хромосомную ходьбу можно использовать из новой позиции прыжка (в любом направлении) для поиска ген -подобные последовательности или дополнительные скачки могут использоваться для дальнейшего продвижения по хромосоме.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Драмм, Митчелл (май 2001 г.). Модуль 5.4 Создание хромосомных прыжковых и связывающих библиотек в E.coli. Текущие протоколы в генетике человека. Глава 5. С. Раздел 5.4. Дои:10.1002 / 0471142905.hg0504s01. ISBN  978-0471142904. PMID  18428292.
  2. ^ Энциклопедия генетики, геномики, протеомики и информатики. Springer Нидерланды. 2008-04-25. стр.354. ISBN  978-1-4020-6753-2.