ClearVolume - ClearVolume

ClearVolume[1] живое видео в реальном времени с открытым исходным кодом 3D визуализация библиотека, предназначенная для объемных световые микроскопы. ClearVolume обеспечивает визуализацию данных микроскопа в реальном времени, позволяя биологам сразу решить, стоит ли визуализировать образец. ClearVolume можно легко интегрировать в существующие Ява, C / C ++, Python, или же LabVIEW на базе программного обеспечения микроскопа. Он имеет специальный интерфейс для управляющего программного обеспечения MicroManager / OpenSpim / OpenSpin. ClearVolume поддерживает многоканальную потоковую передачу трехмерных данных с удаленных микроскопов и использует многопроходный алгоритм рендеринга Фибоначчи, который может обрабатывать большие объемы. Кроме того, ClearVolume интегрирован в Фиджи /ИзображениеJ2 /KNIME экосистема.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Ройер, Лоик А; Вейгерт, Мартин; Гюнтер, Ульрик; Магелли, Никола; Кувшин, Флориан; Sbalzarini, Ivo F .; Майерс, Юджин В. (2015). «ClearVolume - 3D визуализация в реальном времени с открытым исходным кодом для световой микроскопии». Методы природы. 12 (6): 480–481. Дои:10.1038 / nmeth.3372. PMID  26020498. S2CID  205423715.

внешняя ссылка

  • [1] Веб-сайт проекта ClearVolume с открытым исходным кодом со ссылками на wiki, репозитории кода и отслеживание проблем.
  • [2] Страница проекта плагина ClearVolume KNIME.
  • [3] Страница проекта плагина ClearVolume FiJi.