Смерть - Death fold

Структура белка домена смерти. 1нгр

В загон смерти это третичная структура мотив обычно встречается в белки участвует в апоптоз или же воспаление связанные процессы. Этот мотив обычно встречается в доменах, которые участвуют в межбелковых взаимодействиях, ведущих к образованию больших функциональных комплексов. Примеры доменов складки смерти включают область смерти (ДД), эффекторный домен смерти (DED), Домен найма Caspase (КАРТА) и Pyrin домен (PYD).

Домены «складки смерти» представляют собой эволюционно консервативное суперсемейство доменов, которые обеспечивают передачу сигналов апоптоза. Два типа апоптоза, внешний и внутренний, жестко регулируются взаимодействием активирующих и тормозных путей. Взаимодействия между четырьмя различными мотивами складки смерти являются объединяющим механизмом в обоих типах апоптоза.

Структура

Существует большое различие в первичной аминокислотной последовательности четырех разных мотивов гибкой складки, но каждый из них имеет сходную трехмерную структуру. Мотивы складок смерти характеризуются от шести до семи плотно скрученных альфа-спиралей, расположенных в складке «греческого ключа». Мотивы состоят из нескольких определенных белковых взаимодействий с другими предполагаемыми апоптотическими ролями (Лам).

Четыре смертоносных домена

Домен рекрутинга Caspase (CARD)CARD-содержащие белки встречаются повсюду в животном мире, а также могут присутствовать в грибах, растениях и прокариоты. CARD домены присутствуют на нескольких млекопитающих Procaspases, и имеют функции в апоптоз, цитокин обработка, иммунная защита и NF-κB активация. У насекомых и нематоды, CARD пока, кажется, ограничиваются апоптотическими белками.

Домен смерти (DD)DD встречаются в основном в позвоночные (хотя они присутствуют и у некоторых других животных). DD содержатся на рецепторах цитокинов в TNF семейство рецепторов. Белки DD участвуют в апоптозе и передаче сигналов NF-κB у млекопитающих, но только в передаче сигналов NF-κB. Дрозофила.

Домен эффектора смерти (DED)DED присутствуют на каспасы и участвуют в активации каспаз. DED-содержащие каспазы участвуют в апоптозе, индуцированном рецептором смерти, у млекопитающих, но отличаются у насекомых, поскольку они участвуют в передаче сигналов NF-κB и антибактериальных ответах.

ПИРИНПИРИНЫ являются наиболее недавно обнаруженным доменом складки смерти, и их функции и взаимодействия еще не выяснены.

Связывание и взаимодействия

Смерть мотивы как полагают, оказывают свое влияние исключительно через одновалентный, гомотипный взаимодействия. В этих взаимодействиях складки смерти связываются с другой складкой смерти, содержащей домен через тот же тип домена взаимодействия белков. Эти взаимодействия высокоспецифичны, и нет известных взаимодействий между различными типами смертоносных доменов - во всех известных случаях партнеры по связыванию имеют гомологичный домен (DD-DD, CARD-CARD, DED-DED). Считается, что роль этих гомотипических взаимодействий заключается в самосборке (Лам). Это приводит к образованию больших многосубъединичных структур, состоящих только из одного типа белка.

Рекомендации

  • Лам А., Парадиси А., Грин Д.Р., Мелино Дж. (Январь 2003 г.). «Взаимодействие домена гибкой складки при апоптозе». Разница в гибели клеток. 10 (1): 10–2. Дои:10.1038 / sj.cdd.4401203. PMID  12655289.
  • Нам Й.Дж., Мани К., Эштон А.В. и др. (Сентябрь 2004 г.). «Ингибирование как внешних, так и внутренних путей смерти посредством негомотипических взаимодействий кратности смерти». Мол. Клетка. 15 (6): 901–12. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.08.020. PMID  15383280.