Эббе Нильсен Вызов - Ebbe Nielsen Challenge

В Эббе Нильсен Вызов международный научный конкурс, проводимый ежегодно с 2015 г. Глобальный информационный фонд по биоразнообразию (GBIF), с набором денежных призов, которые признают предложения исследователей в создании программного обеспечения или подходов, которые успешно решают поставленную GBIF задачу в области информатика биоразнообразия. Он приходит на смену Премия Эббе Нильсена, который ежегодно вручается GBIF в период с 2002 по 2014 год. Название конкурса чтит память выдающегося энтомолога и сторонника информатики биоразнообразия. Эббе Нильсен, который умер от сердечного приступа в США по дороге на заседание Совета управляющих GBIF в 2001 году.

История

В 2001 году GBIF создал Премия Эббе Нильсена в честь недавно умершего датско-австралийского энтомолога Эббе Нильсен, который был активным сторонником как GBIF, так и дисциплины информатики биоразнообразия.[1] Эта награда была признана мировым исследователем или исследовательской группой за их ретроспективный вклад в область информатика биоразнообразия, в соответствии с критериями, установленными GBIF в условиях награждения. Начиная с 2015 года GBIF повторно запустил процесс награждения как соревнование между людьми или группами исследователей со всего мира за создание нового программного обеспечения или подходов к использованию данных о биоразнообразии в соответствии с темой, ежегодно объявляемой для каждого раунда конкурса, а также для разделения приза. деньги между несколькими группами вместо одного победителя, как в начальную эпоху приза.[2] Прием заявок на участие в конкурсе, который теперь называется «Ebbe Nielsen Challenge», проводится ежегодно с 2015 года по настоящее время, при этом победители объявляются на конкурсной основе во все годы, кроме 2017 года, когда было получено недостаточное количество заявок.[3]

Список победителей, 2015 г.

2015

Задача: «В значительной степени используйте данные, опосредованные GBIF, таким образом, чтобы обеспечить новые представления или идеи. Ваша заявка может включать в себя ряд результатов - веб-сайты, автономные или мобильные приложения или результаты анализов - или может стремиться улучшить какие-либо количество проблем или процессов, включая (но не ограничиваясь) анализ или визуализацию данных, рабочие процессы данных, загрузку или аннотации ».[4]

Список финалистов конкурса 2015 года доступен здесь.[5]

Обладатель Первой премии:

  • "Метрики набора данных GBIF"- Питер Десмет, Барт Элтерман и Николя Ноэ (Бельгия)[6]

Лауреат второй премии:

Подробности доступны на сайте GBIF здесь.[8]

2016

Задача: «В 2016 году задача будет сосредоточена на вопросе пробелов и полноты данных, поиске инструментов, методов и механизмов, которые помогут проанализировать пригодность данных, опосредованных GBIF, и / или определить приоритеты для мобилизации данных о биоразнообразии. Мы ожидаем, что как пользователи данных, так и держатели данных извлекут выгоду из акцента в этом году на пробелы и полноту ".[9][10]

Обладатель Первой премии:

  • "Изучение невежества в пространстве и времени"- Алехандро Руэте (Аргентина)[11]

Совместные обладатели Второй премии:

  • "сампбиас"- Александр Жижка, Александр Антонелли и Даниэле Сильвестро (Швеция)[12]
  • "Инструменты оценки покрытия GBIF"- Вальтер Джетц, Джереми Мальчик, Карстен Мейер, Мишель Дуонг, Аджай Ранипета и Луис Дж. Вильянуэва (США, Южная Африка и Германия)[13]

Подробности доступны на сайте GBIF здесь.[14]

2017

Задача: «В 2017 году GBIF Ebbe Nielsen Challenge собирает заявки, которые изменяют назначение этих наборов данных [в общедоступных репозиториях с открытым доступом] и адаптируют их к формату Darwin Core Archive (DwC-A), интероперабельному и многократно используемому стандарту, обеспечивающему публикацию почти 800 миллионы записей о встречаемости видов из почти 1000 всемирных организаций, которые сейчас активны в сети GBIF. Ebbe Nielsen Challenge 2017 года поставит перед разработчиками и исследователями данных задачу создать веб-приложения, сценарии или другие инструменты, которые автоматизируют обнаружение и извлечение соответствующих данных о биоразнообразии из открытых данных репозитории ".[15]

Победители не объявлялись, что указывает на то, что призовые деньги 2017 года не были присуждены ни одной из работ.

2018

Задача: «Конкурс Ebbe Nielsen Challenge 2018 намеренно открыт для всех участников, поэтому участники имеют широкие полномочия по созданию инструментов и методов, которые продвигают открытую науку и улучшают доступ, полезность или качество данных, опосредованных GBIF. Заявки на участие могут быть новыми. , методы визуализации, рабочие процессы или анализ, или они основываются на существующих инструментах и ​​функциях и расширяют их ".[16][17]

Совместные обладатели Первой премии:

  • "Рецепт контрольного списка: шаблон для воспроизводимой стандартизации данных контрольного списка видов"- Льен Рейсерхове, Дамиано Олдони и Питер Десмет (Бельгия)[18]
  • "Озимандиас: граф знаний о биоразнообразии" - Родерик Д. М. Пейдж (Объединенное Королевство)[19]

Совместные обладатели Второй премии:

  • "Вселенная"- Томер Гета, Йохай Кармель, Виджай Барве, Тилошон Нагараджа, Повилас Гибас, Ашвин Агравал (Израиль, США, Шри-Ланка, Литва и Индия)[20]
  • "Обзор проблем GBIF"- Луис Дж. Вильянуэва (США)[21]
  • "Умная ловушка для комаров на трубопроводе DwC"- Коннор Ховингтон и Сэмюэл Рунд (США)[22]
  • "Редактор дерева таксономии"- Ашиш Сингх Томар (Испания)[23]

Подробности доступны на сайте GBIF здесь.[24]

2019

Задача: «Конкурс Ebbe Nielsen Challenge 2019 намеренно является открытым, поэтому участники имеют широкие полномочия по созданию инструментов и методов, которые продвигают открытую науку и улучшают доступ, полезность или качество данных, опосредованных GBIF. Заявки на участие могут быть новыми. , методы визуализации, рабочие процессы или анализы, либо они основываются на существующих инструментах и ​​функциях и расширяют их. Ожидается, что успешные заявки обеспечат практические, прагматические решения для сети GBIF, одновременно продвигая информатику биоразнообразия и управление данными о биоразнообразии в связи с миссией и стратегией GBIF. строить планы."[25]

Обладатель Первой премии:

  • "WhereNext: рекомендательная система для определения приоритетов выборки на основе обобщенного моделирования несходства."- Хорхе Веласкес-Тибата (Колумбия)[26]

Совместные обладатели Второй премии:

  • "occCite: Инструменты для цитирования всеобъемлющих данных о биоразнообразии"- Ханна Л. Оуэнс, Кори Мероу, Брайан С. Майтнер, Виджей В. Барве и Роберт Гуралник (Дания, США)[27]
  • "Органелла"- Андреа Бидерманн, Диана Герт, Димитар Рушев и Пауль Рёдер (Германия)[28]
  • "Быстрая наименьшая озабоченность: автоматизированная оценка растений с низким уровнем риска для включения в Красный список МСОП видов, находящихся под угрозой исчезновения (Красный список)"- Стивен Бахман, Барнаби Уокер и Джастин Моут (Соединенное Королевство)[29]

Совместные обладатели Третьей премии:

  • "Публикация Agile GBIF"- Евгений Мейке (Финляндия)[30]
  • "Обзор информации о биоразнообразии и поддержка принятия решений: пакет BIRDS для R"- Дебора Арльт, Алехандро Руэте и Антон Хаммарстрём (Швеция)[31]
  • "GB Sifter: GBIF для сифтера данных GenBank"- Луис Альенде (США)[32]
  • "натуралист"- Артур Винисиус Родригес и Габриэль Накамура (Бразилия)[33]
  • "GeoNature-atlas: опубликуйте онлайн-атлас биоразнообразия с данными GBIF о вашем районе."- Джордан Селлис, Амандин Саль (Франция)[34]

Подробности доступны на сайте GBIF здесь.[35]

Рекомендации

  1. ^ Кристенсен, Нильс П. (2001). «Эббе Шмидт Нильсен, 7 июня 1950 г. - 6 марта 2001 г.». Nota Lepidopterologica. 24 (3): 3–9.
  2. ^ "GBIF Ebbe Nielsen Challenge". GBIF Ebbe Nielsen Challenge.
  3. ^ «2018 GBIF Ebbe Nielsen Challenge уже открыт». iphylo.blogspot.com.
  4. ^ «Названы победители первого конкурса GBIF Ebbe Nielsen Challenge». www.gbif.org.
  5. ^ «Финалисты GBIF Ebbe Nielsen Challenge». dna-barcoding.blogspot.com.
  6. ^ «Метрики набора данных GBIF». chrome.google.com.
  7. ^ «BioGUID.org - Связывание данных во вселенной биоразнообразия с помощью уникальных идентификаторов и связанных объектов данных». devpost.com.
  8. ^ «Задача GBIF Ebbe Nielsen: оживление информации о биоразнообразии». www.gbif.org.
  9. ^ «GBIF 2016 Ebbe Nielsen Challenge: Анализ и устранение пробелов и предубеждений в первичных данных о биоразнообразии». www.gbif.org.
  10. ^ "GBIF 2016 Ebbe Nielsen Challenge". www.biodiv.be.
  11. ^ "Ученый SLU получил приз за" Картирование невежества "'". www.slu.se.
  12. ^ "sampbias - Оценка смещений географической выборки в наборах данных о распределении видов". devpost.com.
  13. ^ «Инструменты оценки охвата GBIF - онлайн-инструменты для выявления и отслеживания пробелов в данных, опосредованных GBIF, для характеристики распределения видов в пространстве и времени». devpost.com.
  14. ^ «Запись о картировании невежества данных - победитель конкурса Ebbe Nielsen Challenge 2016». www.gbif.org.
  15. ^ «Освобождение записей о видах из открытых хранилищ данных для научных открытий и повторного использования». www.gbif.org.
  16. ^ «2018 GBIF Ebbe Nielsen Challenge стремится к инновациям в области открытых данных для сохранения биоразнообразия». www.gbif.org.
  17. ^ «2018 GBIF Ebbe Nielsen Challenge». www.europeandataportal.eu.
  18. ^ «Рецепт контрольного списка - как мы создали шаблон для стандартизации данных о видах». ropensci.org.
  19. ^ "PROF RODERIC PAGE ВЫИРАЛ ПРИЗ EBBE NIELSEN". www.gla.ac.uk.
  20. ^ "bdverse: Структура очистки данных о биоразнообразии". www.researchgate.net.
  21. ^ «Офис программы оцифровки Смитсоновского института стал победителем конкурса GBIF 2018 Ebbe Nielsen Challenge». dpo.si.edu.
  22. ^ «Члены команды VectorBase среди шести победителей конкурса Ebbe Nielsen Challenge 2018». www.vectorbase.org.
  23. ^ «СТАТЬЯ В БЛОГЕ: Визуальное изучение таксономических, филогеномных данных и данных о биоразнообразии». big4-project.eu.
  24. ^ «Шесть победителей возглавляют Ebbe Nielsen Challenge 2018». www.gbif.org.
  25. ^ «2019 GBIF Ebbe Nielsen Challenge стремится к инновациям в области открытых данных для сохранения биоразнообразия». www.gbif.org.
  26. ^ «WhereNext: рекомендательная система для определения приоритетов выборки на основе обобщенного моделирования несходства». rpubs.com.
  27. ^ "occCite: Инструменты для обеспечения полного цитирования данных о биоразнообразии". github.com.
  28. ^ "Органелла". netlify.com.
  29. ^ «Быстрый наименьший интерес: автоматизированная оценка растений с низким уровнем риска для включения в Красный список видов, находящихся под угрозой исчезновения (Красный список) МСОП». shinyapps.io.
  30. ^ "Agile GBIF Publishing". earthcape.com/.
  31. ^ «Обзор информации о биоразнообразии и поддержка принятия решений: пакет BIRDS для R». github.com.
  32. ^ "GB Sifter: GBIF to GenBank Data Sifter". youtube.com.
  33. ^ "натуралист". shinyapps.io.
  34. ^ «GeoNature-atlas: опубликуйте онлайн-атлас биоразнообразия с данными GBIF о вашем районе». ecrins-parcnational.com.
  35. ^ «WhereNext выигрывает 2019 GBIF Ebbe Nielsen Challenge». www.gbif.org.