Энтеротип - Enterotype

An энтеротип классификация живых организмов на основе их бактериологического экосистема в микробиом кишечника. Об открытии трех человеческих энтеротипов было объявлено в апрельском выпуске журнала 2011 г. Природа к Пэр Борк и его соратники.[1] Они обнаружили, что энтеротипы не зависят от возраста, пола, массы тела или национальной принадлежности.[2] Есть признаки того, что длительная диета влияет на энтеротип.[3] Тип 1 характеризуется высоким уровнем Бактероиды, тип 2 мало Бактероиды но Prevotella распространены, а тип 3 имеет высокий уровень Руминококк.[1][4][5]

Ценность классификации по энтеротипу оспаривается.[6][7]

При исследовании кишечных бактерий у детей в Буркина-Фасо (в Африке), Prevotella составляли 53% кишечных бактерий, но отсутствовали у детей европейского возраста.[8]

Исследования также показывают, что длительная диета тесно связана с составом микробиома кишечника - те, кто ест много белка и животных жиров, типичных для западной диеты, преимущественно Бактероиды бактерии, а для тех, кто потребляет больше углеводов, особенно клетчатки, Prevotella виды доминируют.[9]

Шимпанзе имеют энтеротипы, которые по составу аналогичны энтеротипам человека. Используя продольные образцы, исследователи обнаружили, что энтеротип отдельных шимпанзе со временем менялся.[10]

Рекомендации

  1. ^ а б Циммер, Карл (20 апреля 2011 г.). «Бактерии делят людей на 3 типа, - говорят ученые». Нью-Йорк Таймс. Получено 21 апреля 2011. группа ученых теперь сообщает только о трех различных экосистемах в кишечнике людей, которых они изучали.
  2. ^ Арумугам М., Раес Дж. И др. (Апрель 2011 г.). «Энтеротипы микробиома кишечника человека». Природа. 473 (7346): 174–80. Дои:10.1038 / природа09944. ЧВК  3728647. PMID  21508958. Наши знания о видовом и функциональном составе микробиома кишечника человека быстро расширяются, но они по-прежнему основаны на очень небольшом количестве когорт, и мало что известно об изменениях во всем мире. Объединив 22 недавно секвенированных фекальных метагенома людей из четырех стран с ранее опубликованными наборами данных, мы выявили три устойчивых кластера (далее называемых энтеротипами), которые не зависят от страны или континента.
  3. ^ Ву Г.Д., Чен Дж., Хоффманн С., Биттингер К., Чен Ю.Й. и др. (2011). «Связь долгосрочных диетических моделей с кишечными микробными энтеротипами». Наука. 334 (6052): 105–108. Дои:10.1126 / science.1208344. ЧВК  3368382. PMID  21885731.
  4. ^ Кейм, Брэндон (20 апреля 2011 г.). «Картирование кишечных бактерий обнаруживает три глобальных разновидности». Проводной журнал. Получено 21 апреля 2011.
  5. ^ Коглан, Энди (20 апреля 2011 г.). «У каждого человека есть только одна из трех экосистем кишечника». Новый ученый. Получено 21 апреля 2011.
  6. ^ Рыцари, Дэн; Уорд, Тоня; Маккинли, Кристофер; Миллер, Ханна; Гонсалес, Антонио; Макдональд, Дэниел; Рыцарь, Роб (8 октября 2014 г.). «Переосмысление» энтеротипов"". Клеточный хозяин и микроб. 16 (4): 433–437. Дои:10.1016 / j.chom.2014.09.013. ЧВК  5558460. PMID  25299329.
  7. ^ Горвитовская Анастасия; Холмс, Сьюзен П .; Хьюз, Сьюзан М. (12 апреля 2016 г.). «Интерпретация Prevotella и Bacteroides как биомаркеров диеты и образа жизни». Журнал микробиома. 15 (4): 15. Дои:10.1186 / s40168-016-0160-7. ЧВК  4828855. PMID  27068581.
  8. ^ De Filippo, C .; Cavalieri, D .; Ди Паола, М .; Ramazzotti, M .; Poullet, J. B .; Massart, S .; Collini, S .; Pieraccini, G .; Лионетти, П. (2010). «Влияние диеты на формирование микробиоты кишечника, выявленное сравнительным исследованием у детей из Европы и сельских районов Африки». Труды Национальной академии наук. 107 (33): 14691–6. Дои:10.1073 / pnas.1005963107. ЧВК  2930426. PMID  20679230.
  9. ^ Wu GD, Chen J, Hoffmann C, Bittinger K, Chen YY, Keilbaugh SA, Bewtra M, Knights D, Walters WA, Knight R, Sinha R, Gilroy E, Gupta K, Baldassano R, Nessel L, Li H, Bushman FD , Льюис Дж. Д. (7 октября 2011 г.). «Связь долгосрочных диетических моделей с энтеротипами кишечных микробов». Наука. 334 (6052): 105–8. Дои:10.1126 / science.1208344. ЧВК  3368382. PMID  21885731.
  10. ^ Эндрю Х. Мёллер; Патрик Х. Дегнан; Энн Э. Пьюзи; Майкл Л. Уилсон; Беатрис Х. Хан; Ховард Охман (13 ноября 2012 г.). «Шимпанзе и люди имеют сходные по составу кишечные энтеротипы». Nature Communications. 3 (1179): 1179. Дои:10.1038 / ncomms2159. ЧВК  3520023. PMID  23149725.