Модель французского флага - French flag model
В Модель французского флага концептуальное определение морфогена, описанное Льюис Вулперт в 1960-е гг.[2][3] А морфоген определяется как сигнальная молекула, которая действует непосредственно на клетки (не через последовательная индукция ) для получения специфических клеточных ответов в зависимости от концентрации морфогена. Во время раннего развития градиенты морфогенов генерируют разные типы клеток в различном пространственном порядке. Рисунок французского флага часто встречается в сочетании с другими: позвоночные развитие конечностей является одним из многих фенотипов, демонстрирующих перекрытие по Тьюрингу с дополнительным паттерном (в данном случае Паттерн Тьюринга ).[4]
В модели французского флага Французский флаг используется для представления влияния морфогена на дифференцировку клеток: морфоген влияет на состояния клеток в зависимости от концентрации, эти состояния представлены разными цветами французского флага: высокие концентрации активируют «синий» ген, более низкие концентрации активируют «белый» «ген», где «красный» используется как состояние по умолчанию в ячейках ниже необходимого порога концентрации.
Модель французского флага была поддержана ведущими Дрозофила биолог, Питер Лоуренс. Кристиан Нюсслейн-Фольхард идентифицировал первый морфоген, Бикоид, один из факторов транскрипции, присутствующий в градиенте Дрозофила синцитиальный эмбрион. Две лаборатории, Гэри Струл и что из Стивен Коэн, затем продемонстрировали, что секретируемый сигнальный белок Decapentaplegic ( Дрозофила гомолог трансформирующий фактор роста бета ), действовал как морфоген на более поздних стадиях Дрозофила разработка. Вещество определяет характер развития ткани и, в частности, положение различных специализированных типов клеток в ткани. Он распространяется из локализованного источника и образует градиент концентрации через развивающуюся ткань.
К хорошо известным морфогенам относятся: декапентаплегический /трансформирующий фактор роста бета, Ежик /Соник ежик, Бескрылый /Wnt, фактор роста эпидермиса, и фактор роста фибробластов.
Некоторые из самых ранних и наиболее изученных морфогенов: факторы транскрипции которые распространяются в начале Drosophila melanogaster (плодовая муха) эмбрионы. Однако большинство морфогенов - это секретируемые белки, передающие сигнал между клетками.
Морфогены определяются концептуально, а не химически, поэтому простые химические вещества, такие как ретиноевая кислота также могут действовать как морфогены.
Трудности с моделью французского флага
В основе модели French Flag лежит идея о том, что морфоген автономно формирует градиент с отдельными клетками, считывающими концентрацию градиента. Затем клетки реагируют на определенный уровень градиента с определенной дифференциацией, чтобы соответствовать положению, которое градиент указывает, в котором они находятся. Хотя широко признается как важная модель для понимания морфогенез, это не повсеместно признается всеми биологами развития. Трудности со всеми градиентными моделями морфогенеза были подробно рассмотрены Ричард Гордон и включают семь[5] конкретные моменты:
- Чтобы поддерживать градиент в устойчивом состоянии, должен быть сток, то есть способ, которым диффундирующие молекулы разрушаются или удаляются по пути и / или на некоторых границах. Приемники редко, если вообще когда-либо, даже рассматриваются при вызове градиентной модели.
- Если требуется установить градиент, диффузия должна происходить в ограниченном пространстве. Однако многие организмы, такие как аксолотль нормально развиваться, даже если желточная мембрана слои желе удаляются, и развитие происходит в проточной воде.
- Диффузия зависит от температуры, но у животных, яйца которых развиваются вне матери, развитие может протекать нормально при широком диапазоне температур.
- Градиенты диффузии плохо масштабируются, но эмбрионы бывают самых разных размеров.
- Градиенты диффузии следуют принципу суперпозиции. Это означает, что градиент одного вещества в одном направлении и градиент того же вещества в перпендикулярном направлении приводят к единственному одномерному градиенту в диагональном направлении, а не к двумерному градиенту. Биологи развития часто используют двумерный градиент, даже если система двумерного градиента требует двух градиентов морфогенов с двумя разными источниками и стоками, расположенными приблизительно перпендикулярно друг другу.
- Колебания градиентов всегда происходят, особенно при низких концентрациях, обычно обнаруживаемых во время эмбриогенеза, что затрудняет специфический ответ отдельной клетки на определенные пороговые значения концентрации.
- Каждая клетка должна иметь возможность точно «считывать» концентрацию морфогена, иначе границы между тканями станут рваными. И все же такие рваные границы редко встречаются в развитии.
Рекомендации
- ^ Knabe J.F; и другие. (2008). Эволюция и морфогенез дифференцированных многоклеточных организмов: автономно генерируемые градиенты диффузии для позиционной информации. Искусственная жизнь XI: Материалы одиннадцатой международной конференции по моделированию и синтезу живых систем.
- ^ Вольперт Л. (октябрь 1969 г.). «Позиционная информация и пространственный образец клеточной дифференциации». J. Theor. Биол. 25 (1): 1–47. Дои:10.1016 / S0022-5193 (69) 80016-0. PMID 4390734.
- ^ Вольперт, Льюис; и другие. (2007). Принципы развития (3-е изд.). Оксфорд [Оксфордшир]: Издательство Оксфордского университета. ISBN 0-19-927536-X.
- ^ Шарп, Джеймс; Грин, Джереми (2015). «Позиционная информация и реакция-диффузия: сочетаются две большие идеи в биологии развития». Разработка. 142: 1203–1211. Дои:10.1242 / dev.114991.
- ^ Гордон, Н.К., Гордон, Р. Органелла дифференцировки эмбрионов: расщепитель клеточного состояния Теоретическая биология и медицинское моделирование, 13 (11) 2016
внешняя ссылка
- Интерактивный полет
- Flybase
- Модель искусственной жизни многоклеточного морфогенеза с автономно генерируемыми градиентами для позиционной информации