Гэри Б. Фогель - Gary B. Fogel

Гэри Брайс Фогель (1968 г.р.) - американский биолог и ученый-компьютерщик. Он является главным исполнительным директором Natural Selection, Inc.[1] Он наиболее известен своими приложениями вычислительного интеллекта и машинного обучения в биоинформатике, вычислительной биологии и промышленной оптимизации.

ранняя жизнь и образование

Фогель родился и вырос в Ла-Хойя, Калифорния, заканчивая Средняя школа Ла-Хойи. Он получил степень бакалавра искусств. по биологии с небольшим по геологии из Калифорнийский университет в Санта-Крус в 1991 г. Он получил степень доктора философии. в биологии из Калифорнийский университет в Лос-Анджелесе в 1998 г.

Исследование

Фогель опубликовал более 140 рецензируемых публикаций на конференциях и в журналах и 3 отредактированных книги. В 2010-2018 гг. Был главным редактором журнала Elsevier. Биосистемы,[2] и является младшим редактором журнала IEEE Transactions on Emerging Topics in Computational Intelligence.[3] Ранее он работал младшим редактором-основателем для IEEE / ACM Transactions по вычислительной биологии и биоинформатике, и как младший редактор для IEEE Transactions по эволюционным вычислениям. В рамках Общества вычислительного интеллекта IEEE Фогель основал Технический комитет по биоинформатике и биоинженерии и был вице-президентом по конференциям. Он основал серию конференций IEEE «Вычислительный интеллект в биоинформатике и вычислительной биологии», председательствуя на первых двух встречах в 2004 и 2005 годах в Сан-Диего.[4]Его назвали Сотрудник Института инженеров по электротехнике и радиоэлектронике (IEEE) в 2012 г.[5] за вклад в вычислительный интеллект и его применение в биологии, химии и медицине. Он получил награду IEEE Computational Intelligence Meritorious Service Award в 2016 году.[6] Он также является членом Сигма Си и был удостоен награды Sigma Xi San Diego Chapter Award за выдающиеся достижения в области науки. Исследования Гэри Фогеля сосредоточены на применении вычислительного интеллекта, машинного обучения и прогнозной аналитики в областях, не ограничиваясь:

Вирусная эволюция[7][8][9]

Клеточная дифференциация[10][11]

Открытие наркотиков[12][13]

Структура РНК[14][15]

Эволюционная теория игр [16][17][18]

Рекомендации

  1. ^ "Корпоративное управление".
  2. ^ «Биосистемы».
  3. ^ http://cis.ieee.org/ieee-transactions-on-emerging-topics-in-computational-intelligence/675--ieee-transactions-on-emerging-topics-in-computational-intelligence-editor-and-associate -editors.html
  4. ^ http://www.prnewswire.com/news-releases/dr-gary-fogel-chairs-the-inaugural-2004-ieee-symposium-on-computational-intelligence-in-bioinformatics-and-computational-biology-74341687. html
  5. ^ «2012 г. возвышенный» (PDF). Справочник стипендиатов IEEE.
  6. ^ Йен, Гэри Г. (2016). «Премия IEEE CIS Awards 2016 [Краткие сведения о обществе]». Журнал IEEE Computational Intelligence Magazine. 11: 4–7. Дои:10.1109 / MCI.2015.2502123.
  7. ^ Ламерс, Сюзанна Л., Марко Салеми, Майкл С. МакГрат и Гэри Б. Фогель. «Прогнозирование использования корецепторов ВИЧ-1 R5, X4 и R5X4 с помощью развитых нейронных сетей». Транзакции IEEE / ACM по вычислительной биологии и биоинформатике 5, вып. 2 (2008): 291-300.
  8. ^ Ламерс, Сюзанна Л., Гэри Б. Фогель, Элиз Дж. Сингер, Марко Салеми, Дэвид Дж. Нолан, Линн К. Хьюзентруит и Майкл С. МакГрат. «ВИЧ-1 Nef в патогенезе опосредованных макрофагами заболеваний». Международные обзоры иммунологии 31, вып. 6 (2012): 432-450.
  9. ^ Ламерс, Сюзанна Л., Ребекка Роуз, Екатерина Майджи, Мелисса Агсалда-Гарсия, Дэвид Дж. Нолан, Гэри Б. Фогель, Марко Салеми и др. «ДНК ВИЧ часто присутствует в патологических тканях, оцениваемых при вскрытии от пациентов, получавших КАРТ, с неопределяемой вирусной нагрузкой». Журнал вирусологии (2016): JVI-00674.
  10. ^ Хинтон, Эндрю, Шон Э. Хантер, Ивка Африканова, Дж. Адам Джонс, Ана Д. Лопес, Гэри Б. Фогель, Альберто Хайек и Чарльз К. Кинг. «Анализ sRNA-seq человеческих эмбриональных стволовых клеток и окончательной энтодермы выявляет дифференциально экспрессируемые микроРНК и новые IsomiR с различными мишенями». Стволовые клетки 32, нет. 9 (2014): 2360-2372.
  11. ^ Фогель, Гэри Б., Зоя С. Кай, Сахар Заргар, Эндрю Хинтон, Дж. Адам Джонс, Августа С. Вонг, Севан Г. Фичичи, Ана Д. Лопес и Чарльз К. Кинг. «Динамика микроРНК во время дифференцировки эмбриональных стволовых клеток человека в энтодерму поджелудочной железы». Ген 574, нет. 2 (2015): 359-370.
  12. ^ Хехт, Дэвид и Гэри Б. Фогель. «Новый in silico подход к открытию лекарств с помощью вычислительного интеллекта». Журнал химической информации и моделирования 49, вып. 4 (2009): 1105-1121.
  13. ^ Хехт, Дэвид и Гэри Б. Фогель. «Моделирование эволюции лекарственной устойчивости при малярии». Журнал компьютерного молекулярного дизайна 26, вып. 12 (2012): 1343-1353.
  14. ^ Фогель, Гэри Б. и др. «Открытие структурных элементов РНК с помощью эволюционных вычислений». Nucleic Acids Research 30.23 (2002): 5310-5317.
  15. ^ Ламерс, Сюзанна Л., Гэри Б. Фогель и Майкл С. МакГрат. «Возможность эволюции ВИЧ-miR-H1 во время патогенеза ВИЧ». Биосистемы 101, вып. 2 (2010): 88-96.
  16. ^ Фогель, Дэвид Б., Гэри Б. Фогель и Питер К. Эндрюс. «О нестабильности эволюционно устойчивых стратегий». Биосистемы 44, вып. 2 (1997): 135-152.
  17. ^ Фогель, Гэри Б., Питер С. Эндрюс и Дэвид Б. Фогель. «О нестабильности эволюционно устойчивых стратегий в малых популяциях». Экологическое моделирование 109, вып. 3 (1998): 283-294.
  18. ^ Фогель, Гэри Б. и Дэвид Б. Фогель. «Моделирование естественного отбора как механизма отбраковки конечных популяций с помощью игры« ястреб-голубь »». Биосистемы 104, вып. 1 (2011): 57-62.