Гликановый массив - Glycan array

Гликановые массивы, как это предлагает Консорциум функциональной гликомики (CFG), Национальный центр функциональной гликомики (NCFG) и З Биотех, ООО, содержат углеводные соединения, которые можно подвергать скринингу с помощью лектинов, антител или клеточных рецепторов для определения специфичности углеводов и идентификации лигандов. Скрининг с помощью гликанового массива работает во многом так же, как и другие микроматрицы, которые используются, например, для изучения экспрессии генов. ДНК-микрочипы или белковое взаимодействие Белковые микрочипы.

Массивы гликанов состоят из различных олигосахариды и / или полисахариды иммобилизован на твердой опоре в определенном пространстве.[1] Эта технология предоставляет средства для изучения взаимодействия гликанов и белков в высокопроизводительной среде. Эти натуральные или синтетические (см. синтез углеводов ) гликаны затем инкубируют с любым гликан-связывающим белком, таким как лектины, рецепторы клеточной поверхности или, возможно, целый организм, такой как вирус. Связывание количественно определяют с использованием методов обнаружения на основе флуоресценции.

Приложения

Технология гликанового массива применялась и до сих пор применяется для изучения специфики взаимодействие хозяин-патоген.[2]

Ранее было доказано, что массивы гликанов полезны для определения специфичности Гемагглютинин (грипп) из Вирус гриппа А связывание с хозяином и различение различных штаммов гриппа (в том числе птичьего от млекопитающего). Это было показано с массивами CFG [3] а также индивидуальные массивы.[4] Кроссплатформенные тесты позволили выявить влияние представления гликанов и интервалов на связывание.[5]

Массивы гликанов можно комбинировать с другими методами, такими как Поверхностный плазмонный резонанс (SPR) для уточнения характеристик гликановый. Например, эта комбинация позволила продемонстрировать кальций-зависимое связывание гепарина с Аннексин А1 который участвует в нескольких биологических процессах, включая воспаление, апоптоз и мембранная торговля.[6]

Рекомендации

  1. ^ Ойеларан О., Гилдерслив JC (октябрь 2009 г.). «Массивы гликанов: последние достижения и будущие задачи». Curr Opin Chem Biol. 13 (4): 406–413. Дои:10.1016 / j.cbpa.2009.06.021. ЧВК  2749919. PMID  19625207.
  2. ^ Гейсснер А., Аниш С., Сибергер PH (февраль 2014 г.). «Массивы гликанов как инструменты для исследования инфекционных заболеваний». Curr Opin Chem Biol. 18: 38–45. Дои:10.1016 / j.cbpa.2013.11.013. PMID  24534751.
  3. ^ Стивенс Дж., Бликст О., Тампи TM, Таубенбергер Дж. К., Полсон Дж. К., Уилсон И. А. (апрель 2006 г.). «Структура и рецепторная специфичность гемагглютинина вируса гриппа H5N1». Наука. 312 (5772): 404–410. Bibcode:2006Научный ... 312..404С. Дои:10.1126 / science.1124513. PMID  16543414.
  4. ^ Чайлдс Р.А., Пальма А.С., Уортон С., Матросович Т., Лю Й., Чай В., Кампанеро-Родос М.А., Чжан Ю., Эйкманн М., Кисо М., Хэй А., Матросович М., Фейзи Т. (сентябрь 2009 г.). «Рецептор-связывающая специфичность вируса пандемического гриппа A (H1N1) 2009, определенная с помощью углеводного микрочипа». Nat Biotechnol. 27 (9): 797–799. Дои:10.1038 / nbt0909-797. ЧВК  3771066. PMID  19741625.
  5. ^ Ван Л., Каммингс Р. Д., Смит Д. Ф., Хуфлейт М., Кэмпбелл К. Т., Гилдерслив Дж. К., Герлах Дж. К., Килкойн М., Джоши Л., Серна С., Райхардт NC, Парера Пера Н., Питерс Р. Дж., Эн-В, Махал Л.К. (июнь 2014 г.). «Межплатформенное сравнение форматов микрочипов гликанов». Гликобиология. 24 (6): 507–17. Дои:10.1093 / glycob / cwu019. ЧВК  4001710. PMID  24658466.
  6. ^ Хорлахер Т., Ноти С., де Пас Д.Л., Биндсхедлер П., Хехт М.Л., Смит Д.Ф., Фукуда М.Н., Зеебергер PH (апрель 2011 г.). «Характеристика связывания гликанов аннексина А1 показывает связывание с высокосульфатированными гликанами с предпочтением высокосульфатированного гепарансульфата и гепарина». Биохимия. 50 (13): 2650–9. Дои:10.1021 / bi101121a. ЧВК  3068229. PMID  21370880.