Гаплогруппа G-M285 - Википедия - Haplogroup G-M285

Гаплогруппа G1
Карта частотного распределения Y-хромосомы гаплогруппы G1-M285.PNG
Возможное время происхождения18 500 (95% ДИ 16 800 <-> 20 200) лн[1]
Возможное место происхождениявозможно Иран
ПредокГаплогруппа G (Y-ДНК)
ПотомкиG1a, G1b, G1c
Определение мутацийM285 (G1), P20 (G1a), L201, L202, L203 (G1a1), L830, L831, L832, L834, L835 (G1b)

В генетика человека, Гаплогруппа G-M285, также известный как Гаплогруппа G1, это Y-хромосома гаплогруппа. Гаплогруппа G1 является первичным подкладом гаплогруппа G.

Предполагается, что G1 возник в Иран. У современного населения он встречается крайне редко, за исключением (i) Ирана и его западных соседей и (ii) региона, расположенного на юге. Средняя Сибирь (Россия) и северный Казахстан. Большинство базальный примеры G1, идентифицированные у живых людей, которые принадлежат к субкладу G-L830, были обнаружены на территории от Аравийский полуостров (Северные границы Саудовской Аравии, Ad-Dawhah Катара) в Беларусь (Минская обл. ) и Китай (Аньхой ).[1]

Генетические особенности

Почти все люди G1 имеют значение 12 на короткий тандемный повтор (STR) маркер DYS392 и у всех будет M285 SNP мутация, которая характеризует эту группу. Это значение 12 также необычно для других гаплогрупп. Обозначение M для M285 указывает на то, что он был впервые идентифицирован в Стэндфордский Университет.

M285 имеет следующие характеристики: Идентификационный номер ссылки - rs13447378 ..... Положение Y - 21151128 .... Последовательность прямого праймера - ttatcctgagccgttgtccctg и обратная последовательность tgtagagacacggttgtaccct.... Мутация от G до C.[2] Впервые о M285 сообщили в 2004 г. Cinnioglu et al.[3]

Пока что все протестированные люди с мутацией M285 также являются положительными по мутации M342 SNP. Если кто-то проведет другое тестирование, его результаты станут основой новой категории G1. M342 расположен в позиции последовательности 21653330 и является AGAGAGTTTTCTAACAGGGCG в переднем праймере и TGGGAATCACTTTTGCAACT наоборот. Это мутация от C до T.[3] M342 также был идентифицирован в Стэнфордском университете,

Кроме того, внутри гаплогруппы G те люди G1, которые были протестированы до сих пор, однозначно положительны (производные) для SNP L89, в то время как все другие люди G отрицательны (предки). Мутация L89 SNP также была обнаружена в других гаплогруппах. L89 расположен в позиции последовательности 8038725, а идентификационный номер ссылки - rs35160044. Это мутация от T до C. Обозначение L89 было предоставлено Семейное древо ДНК.

Датировка происхождения G1

Хотя научные исследования еще не датировали происхождение мутации SNP M285 G1, она, по-видимому, представляет собой одну из более старых групп G, возникшую, возможно, на полпути между происхождением G и сегодняшним днем, исходя из количества мутаций маркера STR.

Географическое распределение

Географическое распределение

Хотя в большинстве исследований не удалось проверить G1, вероятные или проверенные примеры были обнаружены в четырех группах (по географическому признаку и / или и / или второстепенному подкладу):

Самая высокая зарегистрированная концентрация G1 и его подгрупп в отдельной стране находится в Иран, со следующей по частоте концентрации в соседних странах на западе. В частности, G1 был обнаружен в 5% из 177 образцов из южного Ирана в одном исследовании. То же исследование обнаружило G1 в 3% из 33 проб на севере Ирана. Процент на юге был почти равен проценту G2, единственному региону в мире, где не было обнаружено сильного доминирования типов G2.[5] Более ранние исследования, в которых было обнаружено примерно одинаковое процентное содержание G в различных частях Ирана, не проводились специально для проверки G1.[6][7]

В индюк Чинниоглу обнаружил, что 1% из 523 образцов всех типов, принадлежащих к гаплогруппе G1, и, как и все доступные G1 за пределами Ирана, G1 был затенен гораздо большим количеством мужчин G2 в выборке. Все образцы G1 в этом исследовании, кроме одного, принадлежали к дополнительной подгруппе G1a, и все образцы были из северо-восточной Турции.[8]

Исследование Ливан Заллуа и др. не удалось проверить на G1, но 26% из 38 образцов G имели значение 12 для STR-маркера DYS392, почти всегда характерного для G1. Эти образцы G1 представляют лишь 2% от общего числа 587 ливанских выборок и были хорошо распределены среди всех религиозных групп.[9]

Более широкое исследование Левант Эль-Сибай и др. также не удалось проверить на G1, но 12% из 17 сирийских образцов G имели значение 12 на DYS392. Эти образцы G1 представляют менее 1% из 354 сирийских образцов. В том же исследовании 21% из 14 иорданских образцов G имели значение 12. Эти образцы G1 составляют 1% от 274 иорданских образцов. Ни один из 8 египетских образцов G не имел значения 12.[10]

Вероятные образцы G в базе данных YHRD [11] из Южного Кавказа (Азербайджан, Грузия, Армения, Абазиния, Абхазия ) и с Северного Кавказа (северные осетины, Кабардинцы, Ингуши, Даргинцы, Лезгинцы, Рутулян и чеченцы) имеют только несколько образцов DYS392 с 12 значениями, которые могут быть G1.

Участки с концентрацией G1

Самая высокая концентрация G1 в отдельной группе внутри страны была отмечена среди Маджары из Казахстан где лица G1 составили 87% из 45 выборок, Аргын - 67%.[12]

Подгруппы G1

Подгруппы, определенные SNP

Подгруппа G1a (P20) довольно часто встречается среди лиц G1, но надежность SNP P20 при идентификации лиц G1a делает некоторые тесты на P20 проблемой.[13] Результаты P20 могут быть представлены как P20.1, P20.2 и P20.3, и люди могут иметь разные результаты для каждого. Технические характеристики P20: позиция Y - 25029911; 23396163 ..... передний праймер tggatctgattcacaggtag..... обратный праймер ccaacaatatgtcacaatctc... мутация представляет собой делецию C.[2] Мутация была выявлена ​​на Университет Аризоны и впервые о нем сообщил Консорциум Y-хромосомы в 2002 году.[14] Категория G1a имеет отдельную подгруппу в зависимости от наличия значения 8 у короткий тандемный повтор маркер DYS494. За исключением этой подгруппы G1a, все другие люди G имеют 9 на этом медленно мутирующем маркере. На данный момент около половины людей G1a, которые иначе разгруппированы, имеют это значение 8.[15]

G1a1 (L201, L202 и L203) были идентифицированы у человека G1a, прошедшего тестирование в Семейное древо ДНК Осенью 2009 г. последующее тестирование показало, что только некоторые люди с G1a имеют эти мутации, и пока все они происходят от близкородственных Ашкенази Еврейское скопление мужчин. Были отмечены следующие позиции Y: 2718285 для L201, 13001714 для L202 и 13001715 для L203. В L201 мутация от C до T; в L202 от Т до С; и в L203 от A до G. Если у какого-либо человека должна быть одна из этих мутаций SNP без других, эта информация станет основой новой классификации G1a1.

Старый G1b (P76) был удален из официального списка в августе 2012 года, поскольку его обнаружение у одного человека делает его пока только частным SNP.

G1b (L830, L831, L832, L834, L835) были идентифицированы в конце 2011 г. Семейное древо ДНК. Мутации G1c: L830 (от T к C в положении 6923908), L831 (от T к C в положении 6991562), L832 (от T к G в положении 12796626), L834 (от T к A в положении 16019950), L835 (от G к A в позиции 16291409).

Кластеры значений маркеров STR

Существуют две отличительные черты европейского происхождения. Ашкенази Еврейские кластеры внутри G1a1 и G1c и особый казахский кластер G1a - все три основаны на короткий тандемный повтор (STR) значения маркера.[16] Мужчины в еврейском кластере G1c имеют значение 12 для STR-маркера DYS446, что на несколько значений ниже, чем почти все люди G, но в двух других группах отсутствует одно конкретное значение маркера в качестве идентификатора. Когда при сравнении образцов доступны примерно 30 или более маркеров STR, легко определить членов каждой из трех групп. Одна из отличительных комбинаций значений STR-маркеров G1c ашкеназских евреев европейского происхождения обнаружена также у иракского еврея в одном исследовании.[17] См. Также покрытие страницы Евреи с гаплогруппой G (Y-ДНК).

Среди доступных 67-маркерных образцов G1 STR,[16] еврейский кластер ашкенази G1a1 представляет собой ближайших родственников казахстанского кластера G1a на основании сходства значений маркера STR.

Кластер G1c ашкенази лишь отдаленно связан с кластером G1a1 ашкенази, а кластер G1c ашкенази имеет ближайших родственников среди различных европейцев.

Миграции лиц G1

Концентрация G1, обнаруженная сегодня в Иране и прилегающей территории к его западу, предполагает, но не доказывает, что эта же территория была местом происхождения G1. Из-за длительного возраста G1 отдаленные миграции небольшого числа людей G1 могли произойти в любое время в течение исторического периода посредством различных типов перемещений населения. Было бы спекулятивно предполагать, как ашкеназские группы G1 или казахстанские группы мужчин G1 прибыли в Северо-Восточную Европу и Казахстан соответственно.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б YFull YTree v8.07.00 доступ 30 августа 2020 г.
  2. ^ а б Карафат, Т .; и другие. (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека». Геномные исследования. 18 (5): 830–38. Дои:10.1101 / gr.7172008. ЧВК  2336805. PMID  18385274.
  3. ^ а б Cinnioglu, C .; и другие. (2004). «Раскопки гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии» (PDF). Генетика человека. 114 (2): 127–48. Дои:10.1007 / s00439-003-1031-4. PMID  14586639. S2CID  10763736. Архивировано из оригинал (PDF) 19 июня 2006 г.
  4. ^ | url =https://sites.google.com/site/haplogroupgproject/project-roster Примеры проектов Haplogroup G
  5. ^ Регейро М., Каденас А.М., Гайден Т., Андерхилл ПА, Эррера Р.Дж. (2006). «Иран: триконтинентальный нексус для миграции, вызванной Y-хромосомой». Человеческая наследственность. 61 (3): 132–43. Дои:10.1159/000093774. PMID  16770078. S2CID  7017701.
  6. ^ Насидзе, я; и другие. (2006). «Сопутствующая замена языка и мтДНК в южно-каспийских популяциях Ирана». Текущая биология. 16 (7): 668–73. Дои:10.1016 / j.cub.2006.02.021. PMID  16581511. S2CID  7883334.
  7. ^ Насидзе, я; и другие. (2008). «Тесная генетическая связь между семитоязычными и индоевропейско-говорящими группами в Иране». Анналы генетики человека. 72 (Pt 2): 241–52. Дои:10.1111 / j.1469-1809.2007.00413.x. PMID  18205892. S2CID  5873833.
  8. ^ Cinnioglu, C .; и другие. (2004). «Раскопки гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии». Генетика человека. 114 (2): 127–48. Дои:10.1007 / s00439-003-1031-4. PMID  14586639. S2CID  10763736.
  9. ^ Zalloua, P .; и другие. (2008). «Выявление генетических следов исторической экспансии: финикийские следы в Средиземноморье». Американский журнал генетики человека. 83 (5): 633–42. Дои:10.1016 / j.ajhg.2008.10.012. ЧВК  2668035. PMID  18976729.
  10. ^ Эль-Сибай, М .; и другие. (2009). «Географическая структура генетического ландшафта Y-хромосомы Леванта: контраст между прибрежными и внутренними районами». Анналы генетики человека. 73 (6): 568–81. Дои:10.1111 / j.1469-1809.2009.00538.x. ЧВК  3312577. PMID  19686289.
  11. ^ | url =http://www.yhrd.org/Search
  12. ^ Биро, А .; Залан, А .; и другие. (2009). «Сравнение Y-хромосомы маджаров (Казахстан) и мадьяр (Венгрия)». Американский журнал физической антропологии. 139 (3): 305–10. Дои:10.1002 / ajpa.20984. PMID  19170200. Архивировано из оригинал на 2013-01-05.
  13. ^ http://archiver.rootsweb.ancestry.com/th/read/GENEALOGY-DNA/2007-07/1185576938 Отчет Томаса Крана
  14. ^ Консорциум Y-хромосомы (2002). «Система номенклатуры дерева бинарных гаплогрупп Y-хромосомы человека». Геномные исследования. 12 (2): 339–48. Дои:10.1101 / гр.217602. ЧВК  155271. PMID  11827954.
  15. ^ Результаты проекта Haplogroup G | url =https://sites.google.com/site/haplogroupgproject/nonstandard-markers
  16. ^ а б | url =https://sites.google.com/site/haplogroupgproject/project-roster
  17. ^ Молоток, М .; и другие. (2009). «Расширенные гаплотипы Y-хромосомы определяют множественные и уникальные родословные еврейского священства». Генетика человека. 126 (5): 719–24. Дои:10.1007 / s00439-009-0727-5. ЧВК  2771134. PMID  19669163.

внешняя ссылка