Гелиородопсин - Heliorhodopsin

Гелиородопсин по сравнению с родопсинами 1 и 2 типа. До открытия гелиородопсина всем известно, что у родопсинов N-конец находится вне клеточной мембраны. Знаки плюс представляют собой положительно заряженные аминокислоты.

Гелиородопсин это семья родопсины открыта в 2018 году Алиной Пушкаревой в лаборатории профессора Одед Бежа.[1] Новое семейство гелиородопсинов имеет белковые последовательности, отличные от известных родопсинов типа 1 (микробные) и типа 2 (животные). Гелиородопсины также имеют обратную ориентацию в мембрана по сравнению с другими родопсинами, с N-конец лицом внутрь камеры и C-конец вне клетки.[1]

Использование гелиородопсинов все-транс сетчатка как хромофор, и не обладают какой-либо активностью перекачки ионов через мембрану. Гелиородопсины распространены по всему миру и существуют в эукариоты, прокариоты и даже некоторые вирусы.[1] Несмотря на широкое распространение, гелиородопсины никогда не присутствуют в настоящих diderms, где есть подходящая двойная мембрана вокруг микроорганизм. Было высказано предположение, что функция гелиородопсина требует прямого взаимодействия с окружающей средой.[2]

Кристаллическая структура мономера хелиородопсина из Thermoplasmatales archaeon SG8-52-1 на основе [1].

Кристаллические структуры гелиородопсинов предполагают, что они образуют гомодимер, содержат окно, ведущее к сетчатка молекулы и имеют большой внеклеточный петлю, обращенную наружу клетки.[3][4][5]

Рекомендации

  1. ^ а б c Пушкарева, Алина; Иноуэ, Кейчи; Ларом, Ширли; Флорес-Урибе, Хосе; Сингх, Маниш; Конно, Масаэ; Томида, Сахоко; Ито, Шота; Накамура, Рёко; Tsunoda, Satoshi P .; Философ, Алон (июнь 2018 г.). «Отчетливая многочисленная группа микробных родопсинов, обнаруженная с помощью функциональной метагеномики». Природа. 558 (7711): 595–599. Дои:10.1038 / s41586-018-0225-9. ISSN  0028-0836.
  2. ^ Флорес-Урибе, Хосе; Хеврони, Гур; Гай, Рохит; Пушкарева, Алина; Иноуэ, Кейчи; Кандори, Хидеки; Бежа, Одед (июнь 2019 г.). «Гелиородопсины отсутствуют у дидерм (грамотрицательных) бактерий: некоторые мысли и возможные последствия для активности». Отчеты по экологической микробиологии. 11 (3): 419–424. Дои:10.1111/1758-2229.12730. ISSN  1758-2229.
  3. ^ Шихоя, Ватару; Иноуэ, Кейчи; Сингх, Маниш; Конно, Масаэ; Хососима, Соко; Ямасита, Кейтаро; Икеда, Кенто; Хигучи, Акимицу; Идзуме, Тамаки; Окадзаки, Сае; Хашимото, Масанори (октябрь 2019 г.). «Кристаллическая структура гелиородопсина». Природа. 574 (7776): 132–136. Дои:10.1038 / s41586-019-1604-6. ISSN  0028-0836.
  4. ^ Ковалев, К .; Волков, Д .; Асташкин, Р .; Алексеев, А .; Гущин, И .; Haro-Moreno, J.M .; Рогачев, А .; Баландин, Т .; Борщевский, В .; Попов, А .; Буренков, Г. (2019-09-12). «Структурные исследования семейства гелиородопсинов с высоким разрешением». bioRxiv: 767665. Дои:10.1101/767665.
  5. ^ Лу, Ян; Чжоу, X. Эдвард; Гао, Сян; Ван, На; Ся, Руисюэ; Сюй, Чжэньмэй; Ленг, Ю; Ши, Юйин; Ван, Гуанфу; Мелчер, Карстен; Сюй, Х. Эрик (январь 2020 г.). «Кристаллическая структура гелиородопсина 48C12». Клеточные исследования. 30 (1): 88–90. Дои:10.1038 / s41422-019-0266-0. ISSN  1001-0602.