Семья HrpZ - HrpZ Family
В Pseudomonas syringae Семейство катионных каналов HrpZ (HrpZ) (TC № 1.C.56 ) является членом Суперсемейство RTX-токсинов. Гарпин-ПСС (HrpZ; ТК № 1.C.56.1.1 ) белок секретируется Pseudomonas syringae через систему секреции Hrp (IIISP; TC № 3.A.6 ) и вызывает гиперчувствительный ответ (HR) у растений, не являющихся хозяевами, при инфицировании и патогенности у хозяев.[1] Он содержит несколько повторяющихся областей и две протяженные (20 остатков) области умеренной гидрофобности, которые могут служить α-спиральными ТМС. Катионный канал HrpZ, по прогнозам, в основном имеет α-структуру. HrpZ - гарпин - это высокотермостабильный белок, который проявляет многофункциональные способности, например, он вызывает гиперчувствительный ответ (HR), усиливает рост растений, действует как фактор вирулентности и образует поры в плазматических мембранах растений, а также в искусственных мембранах.[2] Гомологи не встречаются у других организмов, кроме P. syringae.[3][4]
Функция
При введении в липосомы и синтетические бислои в низких концентрациях (2 нМ) он вызывает катион-селективный ионный ток с большой унитарной проводимостью. Хлорид не транспортируется. Была выдвинута гипотеза, что такие каналы могут способствовать высвобождению питательных веществ и / или доставке факторов вирулентности во время бактериальной колонизации растений-хозяев. Мотивы, подобные лейциновой молнии, могут принимать участие в образовании олигомерных агрегатов, и олигомеризация может быть связана с выявлением HR.[3]
Транспортная реакция
Обобщенная транспортная реакция, катализируемая HrpZ, выглядит так:[4]
- Малые молекулы (вход) → Маленькие молекулы (выход)
Рекомендации
- ^ Хаапалайнен, Минна; Энгельгардт, Стефан; Кюфнер, Изабель; Ли, Чун-Мэй; Нюрнбергер, Торстен; Ли, Джастин; Романчук, Мартин; Тайра, Суви (01.02.2011). «Функциональное картирование HrpZ гарпина Pseudomonas syringae выявляет сайты, ответственные за олигомеризацию белков, липидные взаимодействия и индукцию защиты растений». Молекулярная патология растений. 12 (2): 151–166. Дои:10.1111 / j.1364-3703.2010.00655.x. ISSN 1364-3703. ЧВК 6640321. PMID 21199565.
- ^ Чой, Мин-Сон; Ким, Вуки; Ли, Чанхуэй; О, Чанг-Сик (01.10.2013). «Гарпины, многофункциональные белки, секретируемые грамотрицательными патогенными бактериями растений». Молекулярные взаимодействия растений и микробов. 26 (10): 1115–1122. Дои:10.1094 / MPMI-02-13-0050-CR. ISSN 0894-0282. PMID 23745678.
- ^ а б Lee, J .; Klusener, B .; Tsiamis, G .; Stevens, C .; Neyt, C .; Tampakaki, A. P .; Panopoulos, N.J .; Nöller, J .; Вейлер, Э. У. (2001-01-02). «HrpZ (Psph) из патогена растений Pseudomonas syringae pv. Phaseolicola связывается с липидными бислоями и образует ионопроводящую пору in vitro». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (1): 289–294. Дои:10.1073 / pnas.011265298. ISSN 0027-8424. ЧВК 14583. PMID 11134504.
- ^ а б Saier, MH Jr. «1.C.56 Семейство HrpZ-целевых мембранных катионных каналов (HrpZ) клетки-хозяина Pseudomonas syringae». База данных классификации транспортеров. Группа компаний Saier Lab Bioinformatics / SDSC.
дальнейшее чтение
- Чен, Джонатан С .; Редди, Вамзее; Чен, Джошуа Х .; Шлыков, Максим А .; Чжэн, Вэй Хао; Чо, Джэхун; Йен, Мин Рен; Сайер, Милтон Х. (2011). «Филогенетическая характеристика суперсемейств транспортных белков: превосходство программ SuperfamilyTree над программами, основанными на множественных выравниваниях». Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии. 21 (3–4): 83–96. Дои:10.1159/000334611. ЧВК 3290041. PMID 22286036.