Коронавирус человека OC43 - Википедия - Human coronavirus OC43

Коронавирус человека OC43
ТЕМ коронавируса OC43.jpg
Просвечивающая электронная микрофотография коронавируса человека OC43
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Учебный класс:Pisoniviricetes
Заказ:Нидовиралес
Семья:Coronaviridae
Род:Бетакоронавирус
Разновидность:
Бетакоронавирус 1
Напряжение:
Коронавирус человека OC43

Коронавирус человека OC43[1] (HCoV-OC43) является членом вида Бетакоронавирус 1, который поражает людей и крупный рогатый скот.[2][3] Заражение коронавирус является окутанный, положительный смысл, одноцепочечный РНК-вирус который проникает в клетку-хозяин, связываясь с Рецептор N-ацетил-9-O-ацетилнейраминовой кислоты.[4] OC43 - один из семь известных коронавирусов заразить людей. Это один из вирусов, вызывающих простуда.[5][6] У него, как и у других коронавирусов из рода Бетакоронавирус, подрод Эмбековирус, еще более короткий пиковый белок называется гемагглютининэстераза (ОН).[7][2]

Вирусология

Четыре HCoV-OC43 генотипы (От A до D) были идентифицированы, причем генотип D, скорее всего, произошел от генетическая рекомбинация. В полное секвенирование генома двух штаммов генотипов C и D, а анализ bootscan показывает события рекомбинации между генотипами B и C в генерации генотипа D. Из 29 идентифицированных штаммов ни один не принадлежит к более древнему генотипу A. Молекулярные часы анализ с использованием спайков и нуклеокапсид гены датирует самый последний общий предок всех генотипов до 1950-х гг. Генотипы B и C относятся к 1980-м годам. Генотип B до 1990-х годов и генотип C до конца 1990-х - начала 2000-х годов. Рекомбинантные штаммы генотипа D были обнаружены еще в 2004 году.[5]

Сравнение HCoV-OC43 с наиболее близким штаммом вида Betacoronavirus 1, бычий коронавирус BCoV, указали, что у них был наиболее общий недавний предок в конце 19 века, с несколькими методами, позволяющими получить наиболее вероятные даты около 1890 года, что заставило авторов предположить, что вступление бывшего штамма для человеческой популяции, возможно, вызвало 1889–1890 пандемия обычно относят к гриппу.[8] Эпидемия Covid-19 2020 года дала еще одно свидетельство связи. Пандемия 1890 года привела к появлению симптомов, более близких к симптомам, связанным с SARS-CoV-2 чем грипп.[9]

Происхождение HCoV-OC43 не известно, но считается, что он, возможно, возник от грызунов, а затем передался через крупный рогатый скот в качестве промежуточных хозяев.[10] Делеция от BCoV до HCoV-OC43 могла иметь место в случае межвидовой передачи от крупного рогатого скота человеку.[8]

HCoV-OC43 является одним из семь известных коронавирусов известно, что заражает людей. Остальные шесть:[11]

Патогенез

Вместе с HCoV-229E, вид из рода Альфакоронавирус, HCoV-OC43 относятся к числу известных вирусов, вызывающих простуда. Оба вируса могут вызывать серьезные инфекции нижних дыхательных путей, включая пневмония у младенцев, пожилых людей и с ослабленным иммунитетом люди, такие как те, кто проходит химиотерапия и те, у кого ВИЧ / СПИД.[12][13][14]

Эпидемиология

Коронавирусы распространены по всему миру, вызывая 10–15% случаев простуды (вирус, чаще всего вызывающий простуду). риновирус, встречается в 30–50% случаев).[15] Инфекции имеют сезонный характер, причем большинство случаев приходится на зимние месяцы.[16][15][17]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Ли, Пол. Молекулярная эпидемиология коронавируса человека OC43 в Гонконге (Тезис). Библиотеки Гонконгского университета. Дои:10.5353 / th_b4501128. HDL:10722/131538.
  2. ^ а б "Браузер таксономии (Betacoronavirus 1)". www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2020-02-29.
  3. ^ Лим, Ивонн Синьи; Нг, Ян Линь; Tam, James P .; Лю, Дин Сян (25.07.2016). «Коронавирусы человека: обзор взаимодействия вируса с хозяином». Болезни. 4 (3): 26. Дои:10.3390 / болезни4030026. ЧВК  5456285. PMID  28933406. См. Таблицу 1.
  4. ^ Ли, Фанг (2016-09-29). «Структура, функция и эволюция белков коронавируса». Ежегодный обзор вирусологии. 3 (1): 237–261. Дои:10.1146 / annurev-virology-110615-042301. ЧВК  5457962. PMID  27578435. BCoV S1-NTD не распознает галактозу в отличие от галектинов. Вместо этого он распознает 5-N-ацетил-9-O-ацетилнейраминовую кислоту (Neu5,9Ac2) (30, 43). Тот же сахарный рецептор распознается коронавирусом человека OC43 (43, 99). OC43 и BCoV тесно связаны генетически, и OC43 мог возникнуть в результате зоонозного распространения BCoV (100, 101).
  5. ^ а б Lau, Susanna K. P .; Ли, Пол; Цанг, Алан К. Л .; Yip, Cyril C. Y .; Це, Герман; Ли, Родни А .; Итак, Лок-Йи; Lau, Y.-L .; Чан, Квок-Хунг; Ву, Патрик С. Й .; Юэн, Квок-Юнг (2011). «Молекулярная эпидемиология человеческого коронавируса OC43 выявляет эволюцию различных генотипов с течением времени и недавнее появление нового генотипа из-за естественной рекомбинации». Журнал вирусологии. 85 (21): 11325–37. Дои:10.1128 / JVI.05512-11. ЧВК  3194943. PMID  21849456.
  6. ^ Gaunt, E.R .; Hardie, A .; Claas, E.C.J .; Simmonds, P .; Темплтон, К. (2010). «Эпидемиология и клинические проявления четырех человеческих коронавирусов 229E, HKU1, NL63 и OC43, обнаруженных в течение 3 лет с использованием нового метода мультиплексной ПЦР в реальном времени». J Clin Microbiol. 48 (8): 2940–7. Дои:10.1128 / JCM.00636-10. ЧВК  2916580. PMID  20554810.
  7. ^ Ву, Патрик С. Ю.; Хуанг, Йи; Lau, Susanna K. P .; Юэнь, Квок-Юнг (24.08.2010). «Геномика и биоинформатический анализ коронавируса». Вирусы. 2 (8): 1804–20. Дои:10.3390 / v2081803. ЧВК  3185738. PMID  21994708. У всех представителей подгруппы А бетакоронавируса ген гемагглютининэстеразы (HE), который кодирует гликопротеин с нейраминат-O-ацетил-эстеразной активностью и активным сайтом FGDS, присутствует ниже ORF1ab и выше гена S (рис. 1).
  8. ^ а б Виджген, Лин; Кейартс, Эльс; Моэс, Эльен; Толлен, Инге; Волланц, Эльке; Лемей, Филипп; Вандамм, Анн-Мике; Ван Ранст, Марк (2005). «Полная геномная последовательность человеческого коронавируса OC43: анализ молекулярных часов указывает на относительно недавнее событие передачи зоонозного коронавируса». Журнал вирусологии. 79 (3): 1595–1604. Дои:10.1128 / JVI.79.3.1595-1604.2005. ЧВК  544107. PMID  15650185.
  9. ^ Кнудсен, Йеппе Кин (13 августа 2020 г.). "Overraskende opdagelse: Coronavirus har tidligere lagt verden ned" [Удивительное открытие: коронавирус и раньше обрушивал мир]. DR (на датском). Получено 13 августа 2020. Датские исследования показывают, что предполагаемая пандемия гриппа в 1889 году на самом деле была вызвана коронавирусом.
  10. ^ Форни, Диего; Калиани, Рашель; Клеричи, Марио; Сирони, Мануэла (2017). «Молекулярная эволюция геномов коронавируса человека». Тенденции в микробиологии. 25 (1): 35, 37. Дои:10.1016 / j.tim.2016.09.001. ISSN  0966-842X.
  11. ^ Люнг, Дэниел. «Коронавирусы (включая ОРВИ)». Консультант по инфекционным заболеваниям. Поддержка принятия решений в медицине, ООО. Получено 1 августа 2020.
  12. ^ Wevers, Brigitte A .; Ван дер Хук, Лия (2009). «Недавно обнаруженные коронавирусы человека». Клиники лабораторной медицины. 29 (4): 715–724. Дои:10.1016 / j.cll.2009.07.007. ЧВК  7131583. PMID  19892230.
  13. ^ Махони, Джеймс Б. (2007). "Коронавирусы". В Мюррее, Патрик Р .; Барон, Эллен Джо; Йоргенсен, Джеймс Н .; Ландри, Мария Луиза; Пфаллер, Майкл А. (ред.). Руководство по клинической микробиологии (9-е изд.). Вашингтон, округ Колумбия: ASM Press. С. 1414–23. ISBN  978-1-55581-371-0.
  14. ^ Pyrc, K .; Беркхоут, Б .; Ван дер Хук, Л. (2007). «Антивирусные стратегии против коронавирусов человека». Мишени для лекарств от инфекционных заболеваний. 7 (1): 59–66. Дои:10.2174/187152607780090757. PMID  17346212.
  15. ^ а б Уот, Деннис (2004). «Простуда: обзор литературы». Европейский журнал внутренней медицины. 15 (2): 79–88. Дои:10.1016 / j.ejim.2004.01.006. ЧВК  7125703. PMID  15172021.
  16. ^ Ван дер Хук, L (2007). «Коронавирусы человека: что они вызывают?». Противовирусная терапия. 12 (4, ст. B): 651–8. PMID  17944272.
  17. ^ Кисслер, Стивен М. (14 апреля 2020 г.). «Прогнозирование динамики передачи SARS-CoV-2 в постпандемический период». Наука: eabb5793. Дои:10.1126 / science.abb5793. ЧВК  7164482. PMID  32291278.CS1 maint: дата и год (связь)

внешняя ссылка