C2-набор иммуноглобулина - Immunoglobulin C2-set domain

C2-набор иммуноглобулина
Идентификаторы
СимволC2-набор
PfamPF05790
ИнтерПроIPR008424

Основная структура молекул иммуноглобулина (Ig) представляет собой тетрамер из двух легких цепей и двух тяжелых цепей, связанных дисульфидными связями. Есть два типа легких цепей: каппа и лямбда, каждая из которых состоит из константного домена (CL) и вариабельного домена (VL). Существует пять типов тяжелых цепей: альфа, дельта, эпсилон, гамма и мю, все они состоят из вариабельного домена (VH) и трех (в альфа, дельта и гамма) или четырех (в эпсилон и мю) константных доменов (от CH1 до CH4). Молекулы Ig представляют собой высокомодульные белки, в которых вариабельные и константные домены имеют четкие консервативные последовательности последовательностей. Домены в Ig и Ig-подобных молекулах сгруппированы в четыре типа: V-набор (вариабельный; ИнтерПро: IPR013106 ), C1-множество (константа-1; ИнтерПро: IPR003597 ), C2-набор (константа-2; ИнтерПро: IPR008424 ) и I-набор (средний; ИнтерПро: IPR013098 ).[1] Структурные исследования показали, что эти домены имеют общую сердцевинную бета-сэндвич-структуру с греческим ключом, причем типы различаются по количеству нитей в бета-листах, а также по структуре их последовательностей.[2][3]

Иммуноглобулин-подобные домены, которые связаны как по последовательности, так и по структуре, можно найти в нескольких разнообразных семействах белков. Ig-подобные домены участвуют во множестве функций, включая клеточно-клеточное распознавание, рецепторы клеточной поверхности, мышечная структура и иммунная система.[4]

C2-набор доменов, которые представляют собой Ig-подобные домены, напоминающие константный домен антитела. Домены С2-набора обнаружены в основном в поверхностных антигенах Т-клеток млекопитающих CD2 (кластер дифференцировки 2), CD4 и CD80, а также в молекулах адгезии сосудистых (VCAM) и межклеточных (ICAM) клеток.

CD2 опосредует адгезию Т-клеток через свой эктодомен и передачу сигнала, используя свой цитоплазматический хвост из 117 аминокислот.[5] CD2 демонстрирует структурное и функциональное сходство с Вирус африканской чумы свиней (ASFV) LMW8-DR, белок, который участвует в межклеточной адгезии и модуляции иммунного ответа, что предполагает его возможную роль в патогенезе инфекции ASFV.[6] CD4 - это первичный рецептор ВИЧ-1. CD4 имеет четыре иммуноглобулиноподобных домена во внеклеточной области, которые имеют одинаковую структуру, но могут отличаться по последовательности. Некоторые внеклеточные домены могут участвовать в димеризации.[7]

Белки человека, содержащие этот домен

Рекомендации

  1. ^ Смит Д.К., Сюэ Х (1997). «Профили последовательностей иммуноглобулина и иммуноглобулиноподобных доменов». J. Mol. Биол. 274 (4): 530–545. Дои:10.1006 / jmbi.1997.1432. PMID  9417933.
  2. ^ Потапов В, Соболев В, Эдельман М, Кистер А, Гельфанд I (2004). «Распознавание белок-белок: сопоставление ядер домена и интерфейса в иммуноглобулинах и других сэндвич-подобных белках». J. Mol. Биол. 342 (2): 665–679. Дои:10.1016 / j.jmb.2004.06.072. PMID  15327963.
  3. ^ Кларк Дж, Фаулер С.Б. (2001). «Картирование пути сворачивания домена иммуноглобулина: структурные детали из анализа значения Phi и движения переходного состояния». Структура. 9 (5): 355–366. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00596-2. PMID  11377196.
  4. ^ Chothia C, Teichmann SA (2000). «Белки суперсемейства иммуноглобулинов у Caenorhabditis elegans». J. Mol. Биол. 296 (5): 1367–83. CiteSeerX  10.1.1.327.6917. Дои:10.1006 / jmbi.1999.3497. PMID  10698639.
  5. ^ Рейнхерц Э.Л., Ян Х (2001). «Динамическое привлечение CD2 человека в липидные рафты. Связь с передачей сигнала Т-клеток». J. Biol. Chem. 276 (22): 18775–18785. Дои:10.1074 / jbc.M009852200. PMID  11376005.
  6. ^ Кутиш Г.Ф., Рок Д.Л., Афонсо С.Л., Борка М.В., Ируста П., Каррильо С., Брун А., Сассман М. (1994). «Ген вируса африканской чумы свиней, сходный с поверхностным антигеном Т-лимфоцитов CD2, опосредует гемадсорбцию». Вирусология. 199 (2): 463–468. Дои:10.1006 / viro.1994.1146. PMID  7907198.
  7. ^ Sanejouand YH (2004). «Замена домена CD4 при димеризации». Белки. 57 (1): 205–12. Дои:10.1002 / prot.20197. PMID  15326605.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR008424