JAligner - JAligner

JAligner это открытый исходный код Ява реализация Алгоритм Смита-Уотермана[1] с улучшением Гото[2] для биологического локального попарного выравнивание последовательностей с использованием штраф за аффинный пробел модель. Его написал Ахмед Мустафа.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Смит Т.Ф. и Уотерман М.С. (1981). Выявление общих молекулярных подпоследовательностей. J Mol Biol, 147: 195-197..
  2. ^ Гото О. (1982). Улучшенный алгоритм сопоставления биологических последовательностей. J Mol Biol, 162: 705-708..

внешняя ссылка