Джим Кент - Jim Kent

Для вымышленного персонажа см. Джим Кент (Напряжение). Для новозеландского политика см. Джим Кент (политик).
Джим Кент
Джим Кент.JPG
Фото любезно предоставлено Джимом Кентом.
Родившийся (1960-02-10) 10 февраля 1960 г. (возраст 60)
Гавайи
НациональностьСоединенные Штаты
Альма-матерКалифорнийский университет в Санта-Крус
НаградыПриз Овертона
Премия Бенджамина Франклина (биоинформатика)
Научная карьера
ТезисПатч и покраска рабочего проекта генома человека  (2002)
ДокторантАлан М. Захлер
Другие научные консультантыДэвид Хаусслер[1]
Интернет сайтwww.soe.ucsc.edu/ ~ кент

Уильям Джеймс Кент (родился 10 февраля 1960 г.) Американец научный сотрудник и программист. Он участвовал в геном проектов баз данных и победитель конкурса 2003 г. Премия Бенджамина Франклина.

Ранние годы

Кент родился в Гавайи и вырос в Сан - Франциско, Калифорния, Соединенные Штаты.

Компьютерная анимация

Кент начал свою карьеру программиста в 1983 году в компании Island Graphics Inc., где он написал программу Aegis Animator для Amiga домашний компьютер. Эта программа объединила анимацию многоугольников в 3D с простой 2D-анимацией на основе cel. В 1985 году он основал и возглавил программную компанию Dancing Flame, которая адаптировала Aegis Animator для Atari ST,[2] и создал Cyber ​​Paint[3] для этой машины. Cyber ​​Paint была программой 2D-анимации, которая объединила широкий спектр функций анимации и рисования, а также формат дельта-сжатой анимации, разработанный для CAD-3D. Пользователь мог свободно перемещаться между кадрами анимации и рисовать произвольно или использовать различные инструменты анимации для автоматического перехода между кадрами. Cyber ​​Paint была одной из первых, если не первой, потребительской программой, которая позволяла пользователю рисовать сквозь время в сжатом цифровом видеоформате. Позже он разработал аналогичную программу, Autodesk Animator за Совместимость с ПК, где сжатие изображения улучшилось до такой степени, что оно могло воспроизводиться на жестком диске, и можно было рисовать, используя «чернила», которые выполняли алгоритмические преобразования, такие как сглаживание, прозрачность и мозаичные узоры. Autodesk Animator использовался для создания иллюстраций для самых разных видеоигр.[4]

Участие в проекте "Геном человека"

В 2000 году он написал программу GigAssembler,[5] что позволило финансируемым государством Проект "Геном человека" собрать и опубликовать первую последовательность генома человека. Его усилия были мотивированы исследовательскими потребностями его самого и его коллег, но также и опасениями, что данные могут стать собственностью через патенты. Celera Genomics.[6] В их близкой гонке с Селерой, Кентом и профессором UCSC Дэвид Хаусслер быстро построил скромный кластер из 50 товарных персональные компьютеры запуск Linux Операционная система для запуска программного обеспечения. Напротив, Celera использовала то, что тогда считалось одним из самых мощных гражданских суперкомпьютеров в мире. Первая сборка Кента о геноме человека была выпущена 22 июня. Celera завершила сборку через три дня, 25 июня, и двойные результаты были объявлены на конференции. белый дом 26 июня. 7 июля 2000 г. данные Санта-Крус были обнародованы во всемирной паутине, а исследовательский документ, описывающий этот геном, финансируемый государством, был опубликован в специальном выпуске февраля 2001 г. Природа,[7] параллельно с результатами Celera в журнале Наука.[8] В 2002 Тим О'Рейли описал работу Кента как «самую значительную работу в области разработки открытого исходного кода за последний год». Хотя все программное обеспечение для геномики Кента Открытый исходный код в том смысле, что исходный код можно скачать и прочитать бесплатно, и все программное обеспечение можно бесплатно использовать для академических, некоммерческих и личных целей, для некоторых из них требуется лицензия либо от UCSC, либо от Kent Informatics Inc., для коммерческого использования.[9]

После GigAssembler Кент продолжил писать BLAT (Инструмент для выравнивания типа BLAST) [10] и браузер генома UCSC [11] чтобы помочь проанализировать важные данные генома. Кент продолжает работать в UCSC в основном над веб-инструментами, помогающими понять геном человека. Он помогает поддерживать и обновлять браузер, работал над сравнительной геномикой,[12] Parasol, программное обеспечение для управления работой для килокластера UCSC, и КОДИРОВАТЬ Проект.

Рекомендации

  1. ^ Гитшиер, Дж. (2013). «Жизнь, Вселенная и все остальное: интервью с Дэвидом Хаусслером». PLOS Genetics. 9 (1): e1003282. Дои:10.1371 / journal.pgen.1003282. ЧВК  3561096. PMID  23382705.
  2. ^ «Иджис Аниматор СТ и Арт Пак СТ». Atarimagazines.com. Получено 2016-10-21.
  3. ^ «Кибер-краска». Ataricq.org. 2009-05-23. Получено 2016-10-21.
  4. ^ Бретонская Сливка (2008-05-08). "По швам: Autodesk Animator". Bustingseams.blogspot.com. Получено 2016-10-21.
  5. ^ Кент В.Дж., Хаусслер Д. (2001). «Сборка рабочего проекта генома человека с помощью GigAssembler». Геномные исследования. 11 (9): 1461–2. Дои:10.1101 / гр.183201. ЧВК  311095. PMID  11544197.
  6. ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал на 2012-03-20. Получено 2010-09-19.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)
  7. ^ Международный консорциум по секвенированию генома человека (2001 г.). "Начальная последовательность и анализ человеческого генома" (PDF). Природа. 409 (6822): 860–921. Bibcode:2001Натура.409..860л. Дои:10.1038/35057062. PMID  11237011.
  8. ^ Venter, JC; и другие. (2001). «Последовательность генома человека» (PDF). Наука. 291 (5507): 1304–1351. Bibcode:2001Научный ... 291.1304V. Дои:10.1126 / science.1058040. PMID  11181995. S2CID  85981305.
  9. ^ "Индекс / ~ kent / src". Hgwdev.cse.ucsc.edu. Получено 2016-10-21.
  10. ^ Кент, У. Дж. (2002). "BLAT --- Инструмент для выравнивания типа BLAST". Геномные исследования. 12 (4): 656–664. Дои:10.1101 / гр.229202. ЧВК  187518. PMID  11932250.
  11. ^ Кент, В. Дж.; Sugnet, C.W .; Furey, T. S .; Роскин, К. М .; Pringle, T. H .; Захлер, А. М .; Хаусслер, А.Д. (2002). "Браузер генома человека в UCSC". Геномные исследования. 12 (6): 996–1006. Дои:10.1101 / гр.229102. ЧВК  186604. PMID  12045153.
  12. ^ Кент В.Дж., Берч Р., Хинрихс А., Миллер В., Хаусслер Д. (2003). «Котел эволюции: дублирование, удаление и перестройка в геномах мыши и человека». Proc Natl Acad Sci U S A. 100 (20): 11484–9. Bibcode:2003ПНАС..10011484К. Дои:10.1073 / пнас.1932072100. ЧВК  208784. PMID  14500911.

внешняя ссылка