NeuGRID - NeuGRID

NeuGRID
	Логотип NeuGRID
URL	neugrid4you.Европа
Текущее состояние	Активный

нейГРИД это веб-портал, предназначенный для (i) помощи нейробиологи сделать высокую пропускную способность визуализация исследование,^[1] и (ii) предоставить клиническим неврологам автоматические диагностические визуализирующие маркеры нейродегенеративных заболеваний для индивидуальной диагностики пациента. Удобная среда neuGRID адаптирована для широкого круга пользователей, от студентов до старших нейробиологов, работающих в области Болезнь Альцгеймера, психические заболевания, и болезни белого вещества. neuGRID стремится стать широко распространенным ресурсом для анализа изображений мозга.^[2]

Процесс

Через единую виртуальную точку доступа веб-портал Science Gateway пользователи входят в «виртуальную» лабораторию визуализации.^[3] Здесь пользователи могут загружать, использовать и обмениваться алгоритмами для анализа изображений мозга,^[4] иметь доступ к большим наборам данных нейровизуализации и постоянно проводить ресурсоемкие анализы со специальной поддержкой и обучением. Благодаря распределенным сервисам и сетка /облако вычислительные ресурсы, анализ с помощью neuGRID намного быстрее, чем традиционный лабораторный анализ. Доказательство концепции neuGRID было проведено в 2009 году, когда болезнь Альцгеймера биомаркер (3D толщина коры с помощью Freesurfer и CIVET) была извлечена из 6,500 МРТ-сканирований за 2 недели по сравнению с 5 годами, которые можно было бы сделать в традиционных условиях.

История

neuGRID был впервые профинансирован DG INFSO Европейской комиссии в рамках 7-я рамочная программа с 2008 по 2011 год. Здесь разрабатывалась аппаратная и связующая инфраструктура. Вторая волна была профинансирована в 2011 г. Европейская комиссия, теперь DG CONNECT, в рамках проекта нейГРИД для тебя (N4U), с основной целью расширения пользовательских сервисов с помощью более интуитивно понятных и графических интерфейсов. N4U закончился в апреле 2015 года.

Консорциум

В первоначальный консорциум neuGRID вошли 8 европейских партнеров из Италии, Франции, Великобритании, Нидерландов, Швеции, Испании и Швейцарии. В N4U приняли участие 9 европейских партнеров (6 из которых уже в neuGRID) и 2 североамериканца. Международные партнеры были привлечены благодаря акции поддержки, еще раз финансируемой DG INFSO (outGRID, http://www.outgrid.eu ). Координатором всех трех проектов является Джованни Б. Фрисони, невролог из IRCCS Fatebenefratelli, Национального центра болезни Альцгеймера в Брешии, Италия.

Примечания

^ Баркхоф, Фредерик (2012). «Лучшее использование данных исследования МРТ мозга». Европейская радиология. 22 (7): 1395–6. Дои:10.1007 / s00330-012-2408-3. ЧВК 3366293. PMID 22427183.
^ Редольфи, Альберто; Макклатчи, Ричард; Анджум, Ашик; Зийденбос, Алекс; Мансет, Дэвид; Баркхоф, Фредерик; Спенгер, Кристиан; Легре, Янник; Валунд, Ларс-Олоф; Ди Сан Пьетро, Кьяра Бараттьери; Фризони, Джованни Б. (2009). «Грид-инфраструктуры для вычислительной нейробиологии: пример neuGRID». Будущая неврология. 4 (6): 703–22. Дои:10.2217 / фн. 09.53.
^ Frisoni, Giovanni B .; Редольфи, Альберто; Мансет, Дэвид; Руссо, Марк-Этьен; Тога, Артур; Эванс, Алан С. (2011). «Виртуальные лаборатории визуализации для обнаружения маркеров нейродегенеративных заболеваний». Обзоры природы Неврология. 7 (8): 429–38. Дои:10.1038 / nrneurol.2011.99. PMID 21727938.
^ Анджум, Ашик; Бладсворт, Питер; Хабиб, Ирфан; Лэнсдейл, Том; Макклатчи, Ричард; Мехмуд, Ясир; Консорциум neuGRID (2009). «Многоразовые сервисы проекта neuGRID для грид-приложений здравоохранения». Исследования в области технологий здравоохранения и информатики. 147 (978): 283–8. arXiv:1202.5516. Bibcode:2012arXiv1202.5516A. Дои:10.3233/978-1-60750-027-8-283. PMID 19593068.

Прочие публикации

Нейробиологические исследования, в которых neuGRID использовался в качестве ресурса

Редольфи, А; Bosco, P; Manset, D; Фризони, Великобритания; Консорциум Neugrid (2013). «Исследование мозга и концептуализация мозга». Функциональная неврология. 28 (3): 175–90. ЧВК 3812741. PMID 24139654.
Обложка, Кейт С .; Van Schijndel, Ronald A .; Ван Дейк, Боб В .; Редольфи, Альберто; Knol, Dirk L .; Frisoni, Giovanni B .; Баркхоф, Фредерик; Вренкен, Хьюго; NeuGRID; Инициатива по нейровизуализации болезни Альцгеймера (2011 г.). «Оценка воспроизводимости показателей атрофии головного мозга SienaX и Siena с использованием МРТ-сканирования ADNI, выполненного спина к спине MP-RAGE». Психиатрические исследования: нейровизуализация. 193 (3): 182–90. Дои:10.1016 / j.pscychresns.2011.02.012. PMID 21764565.
Frisoni, Giovanni B .; Фокс, Ник С .; Джек-младший, Клиффорд Р.; Шелтенс, Филипп; Томпсон, Пол М. (2010). «Клиническое использование структурной МРТ при болезни Альцгеймера». Обзоры природы Неврология. 6 (2): 67–77. Дои:10.1038 / nrneurol.2009.215. ЧВК 2938772. PMID 20139996.

внешняя ссылка

Официальный веб-сайт

[1] Баркхоф, Фредерик (2012). «Лучшее использование данных исследования МРТ мозга». Европейская радиология. 22 (7): 1395–6. Дои:10.1007 / s00330-012-2408-3. ЧВК 3366293. PMID 22427183.

[2] Редольфи, Альберто; Макклатчи, Ричард; Анджум, Ашик; Зийденбос, Алекс; Мансет, Дэвид; Баркхоф, Фредерик; Спенгер, Кристиан; Легре, Янник; Валунд, Ларс-Олоф; Ди Сан Пьетро, Кьяра Бараттьери; Фризони, Джованни Б. (2009). «Грид-инфраструктуры для вычислительной нейробиологии: пример neuGRID». Будущая неврология. 4 (6): 703–22. Дои:10.2217 / фн. 09.53.

[3] Frisoni, Giovanni B .; Редольфи, Альберто; Мансет, Дэвид; Руссо, Марк-Этьен; Тога, Артур; Эванс, Алан С. (2011). «Виртуальные лаборатории визуализации для обнаружения маркеров нейродегенеративных заболеваний». Обзоры природы Неврология. 7 (8): 429–38. Дои:10.1038 / nrneurol.2011.99. PMID 21727938.

[4] Анджум, Ашик; Бладсворт, Питер; Хабиб, Ирфан; Лэнсдейл, Том; Макклатчи, Ричард; Мехмуд, Ясир; Консорциум neuGRID (2009). «Многоразовые сервисы проекта neuGRID для грид-приложений здравоохранения». Исследования в области технологий здравоохранения и информатики. 147 (978): 283–8. arXiv:1202.5516. Bibcode:2012arXiv1202.5516A. Дои:10.3233/978-1-60750-027-8-283. PMID 19593068.

[1]

[2]

[3]

[4]