Мотив psaA РНК - Википедия - psaA RNA motif
| psaA РНК | |
|---|---|
 Консенсусная вторичная структура psaA РНК | |
| Идентификаторы | |
| Символ | psaA РНК |
| Рфам | RF01752 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | СНГ-регулирующий элемент |
| Домен (ы) | цианобактерии |
| PDB структуры | PDBe |
В psaA Мотив РНК описывает класс РНК с общим вторичная структура.[1] psaA РНК находятся исключительно в местах, которые предположительно соответствуют 5 'непереведенные регионы из опероны сформированный из psaA и psaB гены. По этой причине было высказано предположение, что psaA РНК функционируют как цис-регуляторные элементы этих генов. В psaAB гены кодируют белки которые образуют подразделения в фотосистема I структура, используемая для фотосинтез. psaA РНК обнаружены только в цианобактерии, что согласуется с их ассоциацией с фотосинтезом.
psaAB гены, как известно, регулируются у видов цианобактерий, которые не используют psaA РНК, и эта система регуляции включает фактор транскрипции белки.[2] В этой системе выражение psaAB генов увеличивается, когда клетки растут при ограниченном количестве света, предположительно, чтобы максимизировать свою энергию из ограниченного ресурса.[3] С другой стороны, экспрессия генов снижается при высоком уровне освещения, предположительно для уменьшения ущерба, который может быть вызван свободным радикалы которые являются побочным продуктом фотосинтеза.[3] Регион psaA Мотив РНК соответствует ожидаемой последовательности сайта связывания белка NtcA, который участвует в регуляции азота.[4]
Конструктивно psaA Мотив РНК состоит из несколько сложного расположения стеблей в результате спаривания оснований, и многие стебель-петли прекращаются стабильным UNCG тетрапетля. Большинство консервативных нуклеотидов в мотиве участвуют в стандартных парах оснований Уотсона-Крика. Однако, поскольку точная функция psaA РНК неизвестны, также неизвестно, какую биохимическую роль играют эти особенности.
Рекомендации
- ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж. И др. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геном Биол. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК 2864571. PMID 20230605.
- ^ Мурамацу М., Хихара Ю. (апрель 2007 г.). «Скоординированный световой ответ генов, кодирующих субъединицы фотосистемы I, достигается за счет АТ-богатых вышестоящих последовательностей в цианобактерии Synechocystis sp. Штамм PCC 6803». J. Bacteriol. 189 (7): 2750–2758. Дои:10.1128 / JB.01903-06. ЧВК 1855792. PMID 17277074.
- ^ а б Мурамацу М., Хихара Ю. (июль 2006 г.). «Характеристика светочувствительных промоторов генов psaAB в Synechocystis sp. PCC 6803». Физиология растительной клетки. 47 (7): 878–890. Дои:10.1093 / pcp / pcj060. PMID 16705009.
- ^ Су З, Мао Ф, Дам П и др. (2006). «Вычислительный вывод и экспериментальная проверка сети регуляции ассимиляции азота у цианобактерий Synechococcus sp. WH 8102». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (3): 1050–1065. Дои:10.1093 / nar / gkj496. ЧВК 1363776. PMID 16473855.