Роджер Брент - Roger Brent

Роджер Брент
Роджер Брент (2) .jpg
Роджер Брент в своей лаборатории онкологического исследовательского центра Фреда Хатчинсона
Родившийся(1955-12-28)28 декабря 1955 г.
Спартанбург, Южная Каролина
ГражданствоСоединенные Штаты
Альма-матер
ИзвестенДоменная структура регуляторов транскрипции, системная биология
Научная карьера
ПоляБиолог
Учреждения
ТезисРегулирование клеточного ответа на повреждение ДНК (1982)
Интернет сайтhttp://brentlab.fredhutch.org/brent/en.html

Роджер Брент (родился 28 декабря 1955 г.) - американский биолог, известный своими работами по регуляции генов и системной биологии. Он изучает количественное поведение клеточных сигнальных систем, а также происхождение и последствия изменений в них. Он является действительным членом Отделения фундаментальных наук Онкологический исследовательский центр Фреда Хатчинсона и аффилированный профессор геномных наук в Вашингтонский университет.

Ранние годы

Брент вырос в Хаттисберг, Миссисипи и получил степень бакалавра компьютерных наук и статистики Университет Южного Миссисипи, где он применил методы искусственного интеллекта для сворачивания белков. Он защитил кандидатскую диссертацию (1982).[1] и постдокторская работа (1985) по биохимии и молекулярной биологии в Гарвардский университет в лаборатории Марк Пташне. Там он клонировал Репрессор E. coli LexA и показал, как он контролирует реакцию клетки на повреждение ДНК, использовал LexA в качестве репрессора у дрожжей,[2][3] и создали слитые белки, которые использовали LexA для переноса частей дрожжевого Gal4 и других белков, регулирующих транскрипцию, на синтетические репортерные гены дрожжей.[4] Эти эксперименты по замене доменов установили доменную структуру эукариотических белков, регулирующих транскрипцию.[5][6][7][8]

Карьера

Использование Брентом прокариотических репрессорных белков у эукариот и разработка химерных белков, содержащих прокариотические ДНК-связывающие домены, позволило идентифицировать другие регуляторные домены транскрипции.[9] и технологии регуляции генов, включая репрессию транскрипции, контролируемую тетрациклиновыми репрессорами[10] и системы БПЛА Gal4 и LexA, используемые в других модельных организмах.[11] Использование ДНК-связывающих доменов для нацеливания на привязанные функциональные белковые домены (например, двухцепочечные эндонуклеазы [12] и ДНК-метилазы [13]) или фрагменты-приманки в двухгибридных экспериментах на определенные участки ДНК в настоящее время являются обычным делом.

В 1985 году Брент перешел на кафедру молекулярной биологии в Массачусетская больница общего профиля и кафедрой генетики Гарвардская медицинская школа. Его работа там способствовала созданию двухгибридных методов и развитию крупномасштабных / универсальных функциональный геномный средства (взаимодействие спаривания [14] и разработка пептида аптамеры ) для обнаружения и нарушения белок-белковых взаимодействий.[15] В 1997 г. Сидней Бреннер он помог создать Институт молекулярных наук,[16] некоммерческая исследовательская лаборатория в Беркли, Калифорния, и стал его генеральным директором,[17] директор по исследованиям и президент в 2001 году. Он инициировал в своей лаборатории исследования по контролю клеточного сигнала и изменчивости от клетки к клетке. В настоящее время он является действительным членом Отделения фундаментальных наук в Онкологический исследовательский центр Фреда Хатчинсона и аффилированный профессор геномных наук в Вашингтонский университет.

Работа Брента преследует два основных вопроса: как сигнальные системы клеток контролируют свои сигналы и информацию, которую они передают. [18][19] и происхождение и фенотипические последствия межклеточной изменчивости передачи сигналов и последующих ответов.[20]

В 1987 году компания Brent help нашла и продолжает вносить свой вклад в Текущие протоколы в молекулярной биологии, "как клонировать руководство"[21] который начал Текущие протоколы журналы. С 1995 по 2000 год он организовал семинары «После генома» в Санта-Фе, содержание которых внесло вклад в некоторые из ранних повесток дня системной биологии.[22] В дополнение к обычной консультативной работе с NIH, NSF и промышленными организациями, в 1997 году он начал консультировать правительство США по тактическим и стратегическим соображениям для защиты от биологической атаки и возникающих болезней.[23][24][25][26] В 1998 году в Институте молекулярных наук он участвовал в обсуждениях с Робом Карлсоном и Дрю Энди, которые помогли развить некоторые идеи, лежащие в основе синтетическая биология.[27] С 2011 по 2014 год он руководил Центром биологического будущего, экспериментальной попыткой лучше понять влияние достижений в области биологических знаний и возможностей на человеческие дела.[28]

Он был исследователем Благотворительные фонды Pew[29] и старший научный сотрудник Медицинский фонд Эллисона.[30] В 2003 году он поделился Премия Габбая в области биотехнологии и медицины за работу по методам взаимодействия белков,[31] а в 2011 году он был назван членом Американская ассоциация развития науки «За выдающийся вклад в области биохимии, транскрипции, геномики и системной биологии».[32]

Использование Брентом прокариотических репрессорных белков и их использование в химерных белках для регулирования экспрессии генов у эукариот было предметом основных патентов (в том числе Патент США 4833080 , Регуляция экспрессии эукариотических генов, с Марком Пташне). Доктор Брент является автором 16 дополнительных патентов США и четырех ожидающих патентов США.[33]

Личное

Брент замужем за ученым и лауреатом Нобелевской премии Линда Б. Бак.[34]

Рекомендации

  1. ^ «Регулирование клеточного ответа на повреждение ДНК» (1982)
  2. ^ Брент, Роджер; Пташне, Марк (1984). «Бактериальный репрессорный белок или терминатор транскрипции дрожжей может блокировать активацию дрожжевого гена выше по течению». Природа. 312 (5995): 612–615. Bibcode:1984Натура.312..612Б. Дои:10.1038 / 312612a0. PMID  6390216. S2CID  4309764.
  3. ^ Норт, Г. (1984). «Последние уроки лямбды и лака». Природа. 308 (5961): 687–688. Дои:10.1038 / 308687a0. PMID  6232462. S2CID  4240047.
  4. ^ Брент, Роджер; Пташне, Марк (1985). «Эукариотический активатор транскрипции, несущий ДНК-специфичность прокариотического репрессора». Клетка. 43 (3): 729–736. Дои:10.1016/0092-8674(85)90246-6. PMID  3907859.
  5. ^ Alberts, A .; Bray, D .; Lewis, J .; Raff, M .; Робертс, К. (1989). Молекулярная биология клетки (6-е изд.). Том 1, Глава 10: Наука о гирляндах. п. Рисунок 10–24, 568. ISBN  978-0815344322.CS1 maint: location (связь)
  6. ^ Frankel, A.D .; Ким, П. С. (1991). «Модульная структура факторов транскрипции: значение для регуляции генов». Клетка. 65 (5): 717–719. Дои:10.1016 / 0092-8674 (91) 90378-с. PMID  2040012. S2CID  6632853.
  7. ^ «Генетика: Лекция 21» (PDF). MIT OpenCourseWare. Массачусетский Институт Технологий. HDL:1721.1/34953. В архиве (PDF) с оригинала 18 мая 2020 г.. Получено 15 декабря, 2014.
  8. ^ Grotewold, E .; Kellogg, E .; Чаппелл, Л. (июнь 2015 г.). Гены растений, геномы и генетика (1-е изд.). Джон Уайли и сыновья. ISBN  978-1119998877.
  9. ^ Годовски, П. Дж .; Picard, D .; Ямамото, К. Р. (август 1988 г.). «Сигнальная трансдукция и регуляция транскрипции слиянием белков глюкокортикоидного рецептора-LexA». Наука. 241 (4867): 812–816. Bibcode:1988Научный ... 241..812Г. Дои:10.1126 / science.3043662. PMID  3043662.
  10. ^ Deuschle, U .; Meyer, W. K .; Тизен, Х. Дж. (Апрель 1995 г.). «Тетрациклин-обратимое молчание эукариотических промоторов». Молекулярная клеточная биология. 15 (4): 1907–1914. Дои:10.1128 / mcb.15.4.1907. ЧВК  230416. PMID  7891684.
  11. ^ Родригес, А. Д. В; Didaniol, D .; Десплан, К. (2012). «Электроинструменты для экспрессии генов и клонального анализа у дрозофилы». Методы природы. 9 (1): 47–55. Дои:10,1038 / мес.1800. ЧВК  3574576. PMID  22205518.
  12. ^ Бибикова, М. Дж .; Carroll, D .; Сигал, Д. Дж .; Trautman, J.K .; Smith, J .; Kim, Y.G .; Чандрасегаран, С. (январь 2001 г.). «Стимуляция гомологичной рекомбинации посредством целенаправленного расщепления химерными нуклеазами». Mol Cell Biol. 21 (1): 289–297. Дои:10.1128 / MCB.21.1.289-297.2001. ЧВК  88802. PMID  11113203.
  13. ^ van Steensel, B .; Хеникофф, С. (апрель 2000 г.). «Идентификация in vivo ДНК-мишеней белков хроматина с использованием привязанной плотины метилтрансферазы». Nat. Биотехнология. 18 (4): 424–428. Дои:10.1038/74487. PMID  10748524. S2CID  30350384.
  14. ^ Finley, Jr, R. L., Jr; и Брент Р. (1994). «Взаимодействие при спаривании выявляет бинарные и тройные взаимодействия между регуляторами клеточного цикла дрозофилы». Proc. Natl. Акад. Sci. Соединенные Штаты Америки. 91 (26): 12980–12984. Дои:10.1073 / пнас.91.26.12980. ЧВК  45564. PMID  7809159.
  15. ^ Брент, Роджер; Пташное, Марк. «Регулирование экспрессии эукариотических генов, Патент США 4833080 (1989)». Получено 6 января, 2015.
  16. ^ Фридберг, Эррол (октябрь 2010 г.). Сидней Бреннер: биография. CSHL Press. ISBN  978-0-87969-947-5.
  17. ^ «Протеомика: текущее состояние и будущие направления - интервью с Роджером Брентом, доктором философии». Получено 5 июля, 2010.
  18. ^ Ю., Р .; Гордон, А .; Colman-Lerner, A .; Бенджамин, К. Р .; Pincus, D .; Serra, E .; Холл, М .; Брент, Р. (2008). «Отрицательная обратная связь оптимизирует передачу информации в системе сигнализации соты». Природа. 456 (7223): 755–761. Дои:10.1038 / природа07513. ЧВК  2716709. PMID  19079053.
  19. ^ Брент, Р. (2009). «Что такое сигнал и какую информацию он несет?». Письма FEBS. 583 (24): 4019–24. Дои:10.1016 / j.febslet.2009.11.029. PMID  19917282. S2CID  15873809.
  20. ^ Colman-Lerner, A .; Гордон, А .; Serra, E .; Holl, E .; Брент, Р. (2005). «Регулируемые межклеточные вариации в системе решения клеточной судьбы». Природа. 437 (7059): 699–706. Bibcode:2005Натура 437..699C. Дои:10.1038 / природа03998. PMID  16170311. S2CID  4398874.
  21. ^ Ausubel, F.M .; Brent, R .; Kingston, R.E .; Мур, Д. Д .; Seidman, J. G .; Smith, J. A .; Struhl, K (2012). "Предисловие". Текущие протоколы в молекулярной биологии. 98: 111-v: iii – v. Дои:10.1002 / 0471142727.mbprefs98. ISBN  978-0471142720. S2CID  221604713.
  22. ^ Грубер, М. «Составьте карту генома, взломайте геном». Wired.com. Получено 2 февраля 2010.
  23. ^ Маршалл, Э. (1997). «Слишком радикально для NIH? Попробуйте DARPA». Наука. 275 (5301): 744–746. Дои:10.1126 / science.275.5301.744. PMID  9036531. S2CID  5825319.
  24. ^ Miller, J .; Broad, W. J .; Энгельберг, С. (2001). Микробы: биологическое оружие и секретная война Америки. Нью-Йорк: Саймон и Шустер. ISBN  978-0684871592.
  25. ^ Бхаттачарджи, Ю. (2007). «Группа предоставляет экспертную оценку разведывательных исследований». Наука. 318 (5856): 1538. Дои:10.1126 / science.318.5856.1538. PMID  18063763. S2CID  41060126.
  26. ^ Брент, Р. (22 ноября 2006 г.). «В долине тени смерти». HDL:1721.1/34914. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  27. ^ Карлсон, Р.; и другие. «Компоненты и средства проектирования BIO-IO» (PDF). Получено 5 августа 2010.
  28. ^ Вудворд, Кристин (2011-10-13). «Центр биологического будущего для решения проблем, вызванных взрывом биологических знаний в 21 веке». Онкологический исследовательский центр Фреда Хатчинсона. Онкологический исследовательский центр Фреда Хатчинсона. Получено 6 января 2014.
  29. ^ "Программа ученых Пью в области биомедицины". Благотворительные фонды PEW. Получено 10 октября 2011.
  30. ^ "ГЛАВНАЯ :: Премия старшего ученого в области старения :: 2000 :: Стволовые клетки". Медицинский фонд Эллисона. Медицинский фонд Эллисона. Получено 8 августа 2011.
  31. ^ "ПОБЕДИТЕЛИ 2003" за разработку дрожжевых двугибридных ловушек и ловушек для взаимодействия дрожжей."". Исследовательский центр фундаментальных медицинских наук Rosenstiel. Исследовательский центр фундаментальных медицинских наук Rosenstiel при Университете Брандейса. Получено 13 июн 2012.
  32. ^ Сосвилл, Э. А. (2011). «Награды, назначения, объявления». J Natl Cancer Inst. 103 (4): 295. Дои:10.1093 / jnci / djr038.
  33. ^ "Патентный поиск на USPTO.gov". Получено 15 декабря, 2014.
  34. ^ Значок, Питер (2008). Нобелевские лица. Джон Уайли и сыновья. п. 180. ISBN  9783527406784. Получено 2 декабря, 2015.