Липидомика дробовика - Shotgun lipidomics

В липидомика, процесс липидомика дробовика (назван по аналогии с секвенирование дробовика ) использует аналитическую химию для изучения биологической функции, значения и последствий изменений в липиды и белок составляющие, опосредующие липидный обмен, транспорт или биологическую функцию в клетках.[1][2]Липидомике в значительной степени способствовали недавние достижения и новые применения ионизация электрораспылением масс-спектрометрии (ESI / MS).[3]

Липидомика - это область исследований, изучающая пути и сети клеточных липидов в биологических системах (например, липидомах) в больших масштабах. Он включает идентификацию и количественную оценку тысяч молекулярных видов клеточных липидов и их взаимодействия с другими липидами, белками и другими частями in vivo. Исследователи в области липидомики исследуют структуры, функции, взаимодействия и динамику клеточных липидов, а также динамические изменения, которые происходят во время патофизиологических нарушений. Липидомные исследования играют важную роль в определении биохимических механизмов связанных с липидами процессов заболевания посредством выявления изменений клеточного липидного метаболизма, транспорта и гомеостаза. Две основные платформы, используемые в настоящее время для липидомных анализов, - это ВЭЖХ-МС и липидомика дробовика.

История

Липидомика дробовика была разработана Ричардом В. Гроссом и Сяньлинь Ханом с использованием методов разделения внутри источника ESI. Отдельные молекулярные виды большинства основных и многих второстепенных классов липидов могут быть взяты по отпечаткам пальцев и количественно определены непосредственно из биологических экстрактов липидов без необходимости хроматографической очистки.

Преимущества

Липидомика с дробовиком - быстрая, высокочувствительная и может идентифицировать сотни липидов, пропущенных другими методами - все с гораздо меньшим размером образца ткани, чтобы можно было исследовать конкретные клетки или мельчайшие образцы биопсии.

Рекомендации

  1. ^ Хан X, Gross RW (2005). «Липидомика дробовика: масс-спектрометрический анализ с ионизацией электрораспылением и количественное определение клеточных липидомов непосредственно из неочищенных экстрактов биологических образцов». Масс-спектрометр Rev. 24 (3): 367–412. Дои:10.1002 / mas.20023. PMID  15389848. Архивировано из оригинал на 2013-01-05.
  2. ^ Хан X, Gross RW (апрель 2005 г.). «Липидомика дробовика: многомерный МС анализ клеточных липидомов». Эксперт Rev Proteomics. 2 (2): 253–64. Дои:10.1586/14789450.2.2.253. PMID  15892569. S2CID  29752390.
  3. ^ Хан X, Gross RW (июнь 2003 г.). «Глобальный анализ клеточных липидомов непосредственно из сырых экстрактов биологических образцов с помощью масс-спектрометрии ESI: мост к липидомике». J. Lipid Res. 44 (6): 1071–9. Дои:10.1194 / мл. R300004-JLR200. PMID  12671038.

дальнейшее чтение

  • Ганнинг на жиры
  • Валовой RW, Хан X (2007). «Липидомика при диабете и метаболическом синдроме». Meth. Энзимол. Методы в энзимологии. 433: 73–90. Дои:10.1016 / S0076-6879 (07) 33004-8. ISBN  9780123739667. PMID  17954229.
  • Хан X, Ян Дж, Ченг Х, Е Х, Валовой RW (июль 2004 г.). «К снятию отпечатков пальцев на клеточных липидомах непосредственно из биологических образцов с помощью двухмерной масс-спектрометрии с ионизацией электрораспылением». Анальный. Биохим. 330 (2): 317–31. Дои:10.1016 / j.ab.2004.04.004. PMID  15203339.