Фонд Молекулярной Генеалогии Соренсона - Sorenson Molecular Genealogy Foundation

В Фонд Молекулярной Генеалогии Соренсона (SMGF) был независимым ДНК и генеалогическое исследовательское учреждение с целью продемонстрировать родство народов мира. SMGF собрал образцы ДНК и генеалогическую информацию от людей со всего мира, чтобы установить эти связи.

История

SMGF возник в 1999 году и был вдохновлен несколькими разговорами между изобретателем и филантропом. Джеймс Левой Соренсон и Университет Бригама Янга профессор д-р. Скотт Вудворд.[1] Г-н Соренсон предвидел разработку генетико-генеалогический план всего человечества. Этот план, разработанный доктором Вудвордом, покажет, насколько тесно люди связаны друг с другом, демонстрируя семейные отношения между уникальными людьми. Сбор образцов ДНК и связанных семейных родословных начался в 2000 году, начавшись сначала со студентов Университета Бригама Янга и быстро распространившись за пределы Юты, а затем и на остальной мир.

В 2003 году SMGF переместила свою деятельность из кампуса Университета Бригама Янга в Солт-Лейк-Сити. SMGF также передал всю свою лабораторную работу на Соренсон Геномикс,[2] освобождение исследователей для создания общедоступного онлайн-хранилища. Этот репозиторий был известен как База данных Соренсона.

SMGF собрал более 100 000 образцов ДНК и семейных родословных от доноров со всего мира, все из которых были доступны в базе данных Соренсона. Эта база данных была приобретена Ancestry.com до запуска AncestryDNA при покупке Генное дерево в 2012.[3] Genetree была коммерческим подразделением SMGF.[4]

База данных Соренсона

База данных Соренсона содержала более 100 000 образцов ДНК и семейных родословных, включая 2,8 миллиона генеалогических записей и 2,4 миллиона генотипов.

База данных Соренсона сопоставила генетическую информацию с семейными фамилиями. Человек, выполнявший поиск в базе данных, мог найти как генетические, так и генеалогические совпадения, но мог выполнять поиск, используя либо гаплотипы ДНК, либо семейную фамилию. Средняя семейная родословная включает шесть поколений родословной (более 150 лет) с более чем 6 миллионами генетически связанных предков.

В базе данных Соренсона было только две области для поиска: Y-хромосома база данных и митохондриальная ДНК база данных. База данных Y-ДНК позволяла мужчинам искать свою прямую отцовскую линию; База данных мтДНК позволяла мужчинам и женщинам искать свою прямую материнскую линию. Согласно ISOGG.org, Соренсон «также имел большие базы данных Х-хромосомы и аутосомных STR, но эти базы данных никогда не были общедоступными».[5]

База данных Y-хромосомы:

Y-хромосома передается от отца к сыну с небольшими изменениями в Y-ДНК. Фамилии также обычно передаются от отца к сыну. База данных Соренсона использовала генетические маркеры и фамилии Y-хромосомы для определения общих предков. Пользователи могли поделиться результатами ДНК и родословными, полученными из других источников. Они могли искать предков, используя их фамилию, значения генетических маркеров, полученные с помощью анализа ДНК, или их комбинацию. В базе данных также были значения по умолчанию для генетических маркеров, если у пользователей не было собственной генетической информации.

Тест Y-ДНК анализирует сходство в маркерах ДНК Y-хромосомы, соответствующих определенным участкам на Y-хромосоме. Маркеры имеют Короткий тандемный повтор (STR), которые включают повторы 2–5 пар оснований ДНК. В лабораториях Соренсона количество STR в 36-маркерном гаплотипе сравнивалось между данным образцом и базой данных для определения родства. В Однонуклеотидный полиморфизм (SNP) также был исследован. SNP Y-хромосомы встречаются редко и могут использоваться для разделения популяций мужчин или гаплогрупп и могут использоваться в популяционных исследованиях.[6]

База данных митохондрий:

И мужчины, и женщины наследуют свою митохондриальную ДНК (мтДНК) от своей матери, что позволяет мтДНК определять материнскую линию. База данных Соренсона сравнила митохондриальную ДНК более 76000 человек в своей митохондриальной базе данных, чтобы найти родственников, связанных между поколениями. Пользователи могли делиться своими результатами по мтДНК из других коммерческих лабораторий.

Тест мтДНК исследует три области D-петли мтДНК: HVR1, HVR2 и HVR3, которая называется Гипервариабельная область. Мутации в этих областях мтДНК чрезвычайно редки и, вероятно, не менялись между кузенами по материнской линии в течение последних 500 лет. Следовательно, глядя на мутации в этих областях, можно определить материнское происхождение. Образцы мтДНК, представленные в Фонд молекулярной генеалогии Соренсона, сравнивали с Кембриджская эталонная последовательность (CRS) мтДНК, затем друг к другу на предмет родства.

Участие

Одна из, возможно, слишком амбициозных миссий SMGF заключалась в том, чтобы соединить любых двух людей в мире, показывая им, как они связаны. Для достижения этой цели SMGF собрал образцы ДНК и сопоставил семейные родословные участников со всего мира.[7] Достигнув цели в 100 000 образцов, SMGF изменили свои цели, чтобы сосредоточиться меньше на сборе новых образцов и больше на анализе предыдущих образцов.

Новые участники все еще принимались через дочернюю компанию SMGF, Генное дерево на протяжении многих лет. Кроме того, предыдущие участники SMGF могли купить свой отчет ДНК через GeneTree.com.[8]

Другой целью SMGF было продвижение исследований в области молекулярной генеалогии. SMGF провела исследование с целью выявления дополнительных ДНК-маркеров, которые связывают человека с его генеалогической семьей, как бы прямой, так и отдаленной. Исследователи SMGF опубликовали ряд исследовательских работ,[9] многие из которых предполагали сотрудничество с другими исследователями.

Сбор ДНК для проекта изначально предполагал взятие образцов крови; с августа 2002 года SMGF использовала метод сбора жидкости для полоскания рта (GenetiRinse), который имеет то преимущество, что его можно отправлять по почте участникам, проживающим в отдаленных районах.

Споры и остановка

В мае 2015 года Ancestry.com закрыл веб-сайт SMGF, сославшись на то, что «этот сайт использовался не по назначению, что вынудило [Ancestry.com] прекратить работу с ним».[10] Действия Ancestry.com были предприняты в ответ на новостные сообщения, в которых утверждалось, что база данных SMGF использовалась Ancestry.com и местными правоохранительными органами без какого-либо судебного надзора [например, ордера] и в нарушение политики конфиденциальности SMGF, чтобы попытаться привязать подозреваемых к совершению преступлений.[11] Хотя действия по делу всех сторон, в частности Ancestry.com и местных правоохранительных органов, в конечном итоге были признаны соответствующими конституционным процедурам защиты конфиденциальности и судебного надзора за этим делом,[12] скандал существенно повлиял на репутацию Ancestry.com и привел к решению деактивировать веб-сайт и законсервировать базу данных SMGF.

Рекомендации

  1. ^ Харт, Джон Л. (24 апреля 2004 г.). «Разблокировка ДНК». Церковные новости. Получено 26 июля, 2011.
  2. ^ "О нас". Соренсон Геномика.
  3. ^ Мур, CeCe. «Ancestry.com покупает GeneTree (еще один конкурент) и представляет подписчикам свой новый продукт с аутосомной ДНК». Ваш генетический генеалог.
  4. ^ "Ancestry.com запускает AncestryDNA". Ancestry Insider.
  5. ^ "Фонд Молекулярной Генеалогии Соренсона". ISOGG вики. Международное общество генетической генеалогии.
  6. ^ "Руководство простого дурака по популяционной геномике". Стэнфордский университет - лаборатория Палумби. Архивировано из оригинал 24 февраля 2020 г.
  7. ^ Бойл, Алан (3 июля 2011 г.). «Африканцы навещают своих американских кузенов». MSNBC. Получено 19 мая, 2017.
  8. ^ «База данных генетической генеалогии Фонда Соренсона пересекает историческую веху со 100 000 образцов ДНК благодаря многомиллионному подарку от основателя» (Пресс-релиз). Фонд Молекулярной Генеалогии Соренсона. 28 апреля 2010 г.. Получено 19 мая, 2017.
  9. ^ «В Новом Свете было по крайней мере 15« Матери-основательниц », говорится в последнем исследовании, проведенном Фондом молекулярной генеалогии Соренсона и Университетом Павии, Италия». Деловой провод (Пресс-релиз). Получено 19 мая, 2017.
  10. ^ Эстес, Роберта (15 мая 2015 г.). «РИП Соренсон - сокрушительная потеря». DNAeXplained. Получено 4 мая, 2016.
  11. ^ Линч, Дженнифер (1 мая 2015 г.). «Как частные данные ДНК привели копов Айдахо в погоню за дикими гусями и связали невиновного человека с делом об убийстве 20-летнего подростка». Фонд электронных рубежей. Получено 4 мая, 2016.
  12. ^ Рассел, Джуди Г. (3 мая 2015 г.). "Факты имеют значение!". Юридический специалист по генеалогии. Получено 4 мая, 2016.

внешняя ссылка

Официальные сайты

Новостные статьи