WDR75 - WDR75

WDR75 белок человека, кодируемый геном WDR75[1] содержащий домен суперсемейства WD40.[2] Домен WD40 можно найти во многих эукариотическая клетка типы и, как известно, участвует в функциях клеточного регулятора, таких как пре-мРНК обработка и сборка цитоскелета.[3] Функция белка WDR75 не определяется научное сообщество.

Номера доступаМесто расположенияИдентификаторыM.W.число Пи
NM_032186, NP_115544.12q32.2FLJ12519, DKFZp781N2144[1]94,5 кДа5.56

Белковая последовательность

В аминокислотная последовательность имеет длину 830 остатков и содержит кислотный хвост.[4]

1 MVEEENIRVV RCGGSELNFR RAVFSADSKY IFCVSGDFVK VYSTVTEECV HILHGHRNLV 61 TGIQLNPNNH LQLYSCSLDG TIKLWDYIDG ILIKTFIVGC KLHALFTLAQ AEDSVFVIVN 121 KEKPDIFQLV SVKLPKSSSQ EVEAKELSFV LDYINQSPKC IAFGNEGVYV AAVREFYLSV 181 YFFKKKTTSR FTLSSSRNKK HAKNNFTCVA CHPTEDCIAS GHMDGKIRLW RNFYDDKKYT 241 YTCLHWHHDM VMDLAFSVTG TSLLSGGRES VLVEWRDATE KNKEFLPRLG ​​ATIEHISVSP 301 AGDLFCTSHS DNKIIIIHRN LEASAVIQGL VKDRSIFTGL MIDPRTKALV LNGKPGHLQF 361 YSLQSDKQLY NLDIIQQEYI NDYGLIQIEL TKAAFGCFGN WLATVEQRQE KETELELQMK 421 LWMYNKKTQG FILNTKINMP HEDCITALCF CNAEKSEQPT LVTASKDGYF KVWILTDDSD 481 IYKKAVGWTC DFVGSYHKYQ ATNCCFSEDG SLLAVSFEEI VTIWDSVTWE LKCTFCQRAG 541 KIRHLCFGRL TCSKYLLGAT ENGILCCWNL LSCALEWNAK LNVRVMEPDP NSENIAAISQ 601 SSVGSDLFVF KPSEPRPLYI QKGISREKVQ WGVFVPRDVP ESFTSEAYQW LNRSQFYFLT 661 KSQSLLTFST KSPEEKLTPT SKQLLAEESL PTTPFYFILG KHRQQQDEKL NETLENELVQ 721 LPLTENIPAI SELLHTPAHV LPSAAFLCSM FVNSLLLSKE TKSAKEIPED VDMEEEKESE 781 DSDEENDFTE KVQDTSNTGL GEDIIHQLSK SEEKELRKFR KIDYSWIAAL

Вторичная структура

В вторичная структура предсказано[4] содержать чередующиеся наборы альфа-спиралей и бета-цепей. Нет спираль-поворот-спираль (HTH) регионы были предсказаны.

Гомология

Не существует известных паралогов для Человеческий ген. Для ортологов WDR75 у коров, мышей или крыс паралогов не обнаружено.[5] Сохранность ортологов гена человека среди млекопитающих была сильной, с минимальной идентичностью среди ортологов на уровне 76%. В следующей таблице приведены некоторые ортологи позвоночных и беспозвоночных. Сохранение специфических аминокислоты из положений 340-390, 430-450 и 515-530 все коррелируют с предсказанными альфа-спиралями.[4]

ОрганизмРегистрационный номер% Идентичности человеческому гену
Bos TaurusNP_001095532.1[6]91.7
Mus musculusNP_082875.1[7]84.9
Пан троглодитыXP_001164827.1[8]99.5
Раттус норвегикусNP_001041354.1[9]84.3
Собаки фамильярныеXP_545565[10]90.7
Ксенопус ЛаэвисNP_001086564.1[11]61.0
Gallus gallusXP_001233408.1[12]60.8
Schizosaccharomyces pombeNP_594798[13]19.9
Anopheles gambiaeXP_317524[14]22.7

Рекомендации

  1. ^ а б «Ген Entrez: домен повтора WD WDR75 75». Получено 3 мая 2009.
  2. ^ "ВЗРЫВ". Получено 6 мая 2009.
  3. ^ "CDD: консервативная база данных доменов и классификации белков".
  4. ^ а б c SDSC Biology Workbench 2.0
  5. ^ "Поисковый геном BLAT". Получено 7 мая 2009.
  6. ^ "Белок 75, содержащий повтор WD [Bos taurus] - Белок - NCBI".
  7. ^ "Белок 75, содержащий повторы WD [Mus musculus] - Белок - NCBI".
  8. ^ "Белок 75, содержащий повторы WD [Pan troglodytes] - Белок - NCBI".
  9. ^ «Белок 75, содержащий повтор WD [Rattus norvegicus] - Белок - NCBI».
  10. ^ "Белок 75, содержащий повторы WD [Canis lupus familis] - Белок - NCBI".
  11. ^ «Белок 75, содержащий повтор WD [Xenopus laevis] - Белок - NCBI».
  12. ^ «ПРОГНОЗИРОВАННЫЙ: белок 75, содержащий повторы WD [Gallus gallus] - белок - NCBI».
  13. ^ «U3 snoRNP-ассоциированный белок Nan1 [Schizosaccharomyces pombe 972h-] - белок - NCBI».
  14. ^ «AGAP007948-PA, частичный [Anopheles gambiae STR. PEST] - белок - NCBI».