YcaO - YcaO

YcaO-подобная семья
4bs9 ycao.png
Строение гетероциклазы TruD. YcaO-подобный белок из Прохлор sp. 06037A Запись PDB 4bs9[1]
Идентификаторы
СимволYcaO
PfamPF02624
ИнтерПроIPR003776

YcaO это белок, обнаруженный в бактериях, который участвует в синтезе модифицированного тиазола / оксазола микроцин антибиотики, такие как ботромицин. YcaO выполняет АТФ зависимая циклодегидратация с образованием оксазол и тиазол фрагменты микроцина.[2][3][4]

Рекомендации

  1. ^ Koehnke, J .; Бент, А. Ф .; Zollman, D .; Smith, K .; Houssen, W. E .; Чжу, X .; Mann, G .; Лебль, Т .; Scharff, R .; Shirran, S .; Botting, C.H .; Jaspars, M .; Schwarz-Linek, U .; Нейсмит, Дж. Х. (2013). "Фермент цианобактингетероциклазы: процессивная аденилаза, которая действует с определенным порядком реакции". Angewandte Chemie International Edition. 52 (52): 13991–13996. Дои:10.1002 / anie.201306302. ЧВК  3995012. PMID  24214017.
  2. ^ Dunbar, K. L .; Melby, J. O .; Митчелл, Д. А. (2012). «Домены YcaO используют АТФ для активации амидных цепей во время циклодегидратации пептидов». Природа Химическая Биология. 8 (6): 569–575. Дои:10.1038 / nchembio.944. ЧВК  3428213. PMID  22522320.
  3. ^ Данбар К.Л., Чекан-младший, Кокс К.Л., Буркхарт Б.Дж., Наир С.К., Митчелл Д.А. (2014). «Открытие нового АТФ-связывающего мотива, участвующего в биосинтезе пептидного азолина». Природа Химическая Биология. 10 (10): 823–9. Дои:10.1038 / nchembio.1608. ЧВК  4167974. PMID  25129028.
  4. ^ Коэнке Дж., Манн Дж., Бент А.Ф., Людвиг Х., Ширран С., Боттинг С., Лебл Т., Хаусен В.Е., Джаспарс М., Нейсмит Дж. Х. (2015). «Структурный анализ связывания лидерного пептида делает возможным процессинг цианобактина без лидера». Природа Химическая Биология. 11 (8): 558–63. Дои:10.1038 / nchembio.1841. ЧВК  4512242. PMID  26098679.