Домен Барвин - Barwin domain

Барвин
PDB 1bw4 EBI.jpg
трехмерная структура в растворе барвина, протеина из семян ячменя
Идентификаторы
СимволБарвин
PfamPF00967
Pfam кланCL0199
ИнтерПроIPR001153
PROSITEPDOC00619
SCOP21bw3 / Объем / СУПФАМ

В молекулярной биологии домен barwin это белковый домен обнаружен у барвина («ячменная рана»), базовый белок изолирован от водный экстракты ячмень семена. Барвину 125 лет аминокислоты в длину и содержит шесть цистеин остатки которые объединяются в три дисульфидные мостики. в белок, связанный с патогенезом номенклатура, это ПР-4.[1][2] Этот домен обнаружен на участке из 122 аминокислот на С-конце продуктов двух индуцированных ран гены (win1 и win2; P09761, P09762) из картофеля, продукта Pro-hevein ген каучуковых деревьев и патогенетический белок 4 из табак (P29062, P29063). Высокий уровень сходства этих белков и их способность к связывать сахариды, предполагают, что домен барвина может участвовать в общем защитном механизме в растения.

Рекомендации

  1. ^ Свенссон Б., Свендсен И., Хойруп П., Рёпсторфф П., Людвигсен С., Поульсен FM (сентябрь 1992 г.). «Первичная структура барвина: белок семян ячменя, тесно связанный с С-концевым доменом белков, кодируемых генами растений, индуцированными раной». Биохимия. 31 (37): 8767–70. Дои:10.1021 / bi00152a012. PMID  1390663.
  2. ^ Людвигсен С., Поульсен FM (сентябрь 1992 г.). «Вторичная структура в растворе барвина из семян ячменя с использованием спектроскопии ядерного магнитного резонанса 1H». Биохимия. 31 (37): 8771–82. Дои:10.1021 / bi00152a013. PMID  1390664.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR001153