Несходство Брея-Кертиса - Bray–Curtis dissimilarity

В экология и биология, то Несходство Брея-Кертиса, названный в честь Дж. Роджер Брей и Джон Т. Кертис,[1] - статистика, используемая для количественной оценки различий в составе двух разных участков на основе подсчетов на каждом участке. По определению Брея и Кертиса, показатель несходства равен:

Где представляет собой сумму меньших значений (см. пример ниже) только для тех видов, которые являются общими для обоих участков. и - общее количество экземпляров, подсчитанных на обоих участках. Индекс можно упростить до 1-2C / 2 = 1-C, если численность на каждом участке выражена в виде пропорций, хотя две формы уравнения дают результаты сопоставления только тогда, когда общее количество образцов, подсчитанных на обоих участках, одинаково. . Дальнейшее лечение можно найти в Legendre & Legendre.[2]


Для простой пример, рассмотрим два аквариума:

Первый аквариум: 6 золотых рыбок, 7 гуппи и 4 радужные рыбки.

Второй аквариум: 10 золотых рыбок и 6 радужных рыбок.

Чтобы вычислить Брея-Кертиса, давайте сначала вычислим , сумма только меньших подсчетов для каждого вида, обнаруженного на обоих участках. Золотые рыбки водятся на обоих участках; меньшее количество - 6. Гуппи есть только на одном сайте, поэтому их нельзя добавить сюда. А вот радужные рыбки есть на обоих, и меньшее количество - 4. .

(общее количество экземпляров, подсчитанных на участке i) , и

(общее количество экземпляров, подсчитанных на участке j) .

Это ведет к .


Несходство Брея – Кертиса напрямую связано с количественной Индекс сходства Соренсена между одними и теми же сайтами:

.

Различие Брея-Кертиса ограничено между 0 и 1, где 0 означает, что два участка имеют одинаковый состав (то есть они имеют все виды), а 1 означает, что эти два участка не имеют общих видов. На сайтах, где BC является промежуточным (например, BC = 0,5), этот индекс отличается от других обычно используемых индексов.[3]

Несходство Брея-Кертиса часто ошибочно называют расстоянием («Четко определенная функция расстояния подчиняется неравенству треугольника, но есть несколько оправданных мер различий между выборками, которые не обладают этим свойством: чтобы отличить их от истинных расстояний, мы часто ссылаемся на им как несходство "[4]). Это не расстояние, поскольку оно не удовлетворяет неравенство треугольника, и всегда следует называть несходство, чтобы избежать путаницы.

Брей – Кертис и Жаккар индексы аналогичны по порядку ранжирования, но индекс Жаккара является метрическим, и, вероятно, его следует предпочесть полуметрическому индексу Брея-Кертиса по умолчанию.[5]


Рекомендации

  1. ^ Брей, Дж. Р. и Дж. Т. Кертис. 1957. Ординация горных лесных сообществ южного Висконсина. Экологические монографии 27: 325-349.
  2. ^ Пьер Лежандр и Луи Лежандр. 1998 г. Числовая экология. 2-е английское издание. Elsevier Science BV, Амстердам.
  3. ^ Блум, С.А. 1981. Индексы сходства в исследованиях сообщества: потенциальные ловушки. Морская экология - Progress Series 5: 125-128.
  4. ^ «Глава 5 Меры расстояния между образцами: неевклидово» (PDF).
  5. ^ "R: Индексы несходства для общественных экологов". cc.oulu.fi. Архивировано из оригинал на 2019-07-29. Получено 2017-05-23.

дальнейшее чтение

  • Czekanowski J (1909) Zur Differentialdiagnose der Neandertalgruppe. Korrespbl dt Ges Anthrop 40: 44–47.
  • Ricotta C и Podani J (2017) О некоторых свойствах несходства Брея-Кертиса и их экологическом значении. Экологическая сложность 31: 201–205.
  • Somerfield, PJ (2008) Идентификация индекса сходства Брея-Кертиса: комментарий к Йошиоке (2008). Mar Ecol Prog Ser 372: 303–306.
  • Йошиока П.М. (2008) Неправильная идентификация индекса сходства Брея-Кертиса. Mar Ecol Prog Ser 368: 309–310. http://doi.org/10.3354/meps07728