Независимый от заглавной буквы элемент перевода - Cap-independent translation element
В молекулярной биологии независимый от шапки элемент перевода (CITE или же 3'CITE) является РНК последовательность найдено в 3'UTR из многих РНК растение вирусы.
Эукариотический мРНК содержать 5-футовая конструкция крышки что требуется для эффективного связывания факторы инициации перевода. Многие вирусные мРНК лишены 5'-кэпа, мРНК вирусов животных часто содержат внутренний сайт входа рибосомы который работает при инициации перевода. Многие вирусные мРНК растений содержат независимый от кэпа трансляционный элемент.[1] Эти элементы опосредуют начало перевод из белки кодируется в мРНК либо путем привлечения факторов инициации трансляции, либо 60S рибосомальная субъединица к вирусной РНК.[2] В РНК2 из Вирус некротической мозаики красного клевера (RCNMV) кэп-независимый элемент трансляции необходим для синтеза РНК с отрицательной цепью.[3]
Существует множество различных структурных классов независимого от кэпа элемента трансляции без видимого структурного сходства или сходства последовательностей:[1][2]
| Структура | Примеры видов |
|---|---|
| TED (домен усилителя трансляции) | Спутниковый вирус некроза табака (STNV) |
| BTE (BYDV-подобный элемент перевода) | Вирус желтого карлика ячменя (BYDV) |
| PTE (элемент перевода, подобный PMV) | Вирус мозаики паникум (PMV) |
| TSS (Т-образная конструкция) | Вирус морщинистости репы (TCV) |
| Y-образный | Вирус кустистого трюка помидоров (TBSV) |
| I-образный | Вирус некротической полоски кукурузы (MNeSV) |
Смотрите также
дальнейшее чтение
- Николсон, Б.Л .; Заславер, О; Mayberry, LK; Браунинг, KS; Уайт, КА (февраль 2013 г.). «Y-образный усилитель трансляции Tombusvirus образует комплекс с eIF4F и может быть функционально заменен гетерологичными усилителями трансляции». Журнал вирусологии. 87 (3): 1872–1883. Дои:10.1128 / JVI.02711-12. ЧВК 3554133. PMID 23192876.
Рекомендации
- ^ а б Миллер, Вашингтон; Ван, З; Тредер, К. (декабрь 2007 г.). «Удивительное разнообразие кэп-независимых элементов трансляции в 3'-нетранслируемых областях вирусных РНК растений». Сделки биохимического общества. 35 (Pt 6): 1629–1633. Дои:10.1042 / BST0351629. ЧВК 3081161. PMID 18031280.
- ^ а б Николсон, Б.Л .; Уайт, К.А. (ноябрь 2011 г.). «3 'Cap-независимые усилители трансляции вирусов растений с положительной цепью РНК». Текущее мнение в вирусологии. 1 (5): 373–380. Дои:10.1016 / j.coviro.2011.10.002. PMID 22440838.
- ^ Ан, М; Ивакава, HO; Шахта, А; Кайдо, М; Mise, K; Окуно, Т. (15 сентября, 2010). «Y-образная структура РНК в 3'-нетранслируемой области вместе с трансактиватором и коровым промотором РНК2 вируса некротической мозаики красного клевера необходима для синтеза его РНК с отрицательной цепью» (PDF). Вирусология. 405 (1): 100–109. Дои:10.1016 / j.virol.2010.05.022. PMID 20561661.