Вирус морщинистости репы - Turnip crinkle virus

Вирус морщинистости репы (TCV)
Классификация вирусов
Группа:
IV группа ((+) оцРНК )
Семья:
Tombusviridae
Род:
Кармовирус
Виды:
Вирус морщинистости репы

Вирус морщинистости репы (TCV) является патогенным для растений вирус семьи Tombusviridae. Впервые был изолирован от репа (Brassica campestris ssp. рапа).

Структура

TCV - маленький (4054 пар оснований ), одноцепочечный, позитивно-смысловая РНК вирус (вирусная РНК имеет ту же ориентацию, что и мРНК). Было показано, что он заражает различные виды растений (в том числе Nicotiana benthamiana ) включая общую модель завода, Arabidopsis thaliana. это гРНК кодирует пять белки: p28 и p88 (репликация), p8 и p9 (движение) и CP (белок оболочки или инкапсуляция ).[1] Структура вируса была определена до 3,2Ангстрем разрешение с использованием рентгеновская кристаллография в 1986 году. Конструктивно он очень похож на вирус кустистого трюка томата.[2]

Количество некодирующая РНК элементы были охарактеризованы в TCV геном; примеры шпилька 5 и основной промоутер.[3][4]

Репликация

Репликация вирусной РНК начинается с миграции p28 на митохондриальную мембрану. p28 мигрирует к наружной митохондриальной мембране и инвагинирует ее; несколько молекул p88 доставляют новообразованные везикулы. Вирусная РНК связывается с p28, связанным с мембраной, и РНК-зависимая РНК-полимераза, или p88, инициирует репликацию РНК с положительной цепью с образованием промежуточного соединения с отрицательной цепью. Промежуточное соединение с отрицательной цепью используется в качестве матрицы для получения РНК с положительной цепью потомства.[5] В белки оболочки p8, p9 и p38 участвуют в движении растения.[6]

Спутниковые вирусы

Маленький, вспомогательные вирусы известный как спутниковая РНК было обнаружено, что они одновременно заражают растения только в присутствии TCV.[7] Эти некодирующие РНК усилить симптомы инфекции TCV. Спутниковая РНК зависит от TCV и механизмов хозяина для своего размножения. Акции Satellite C гомология последовательностей с 3'-концом TCV, тогда как сателлит D имеет гомологию последовательности с 5'-концом сателлита C.

использованная литература

  1. ^ Каррингтон Дж, Хитона Л.А., Зуидемаа Д., Хиллман Б.И., Моррис Т.Дж. (1989). «Структура генома вируса морщинистости репы». Вирусология. 170 (1): 219–26. Дои:10.1016/0042-6822(89)90369-3. PMID  2718381.
  2. ^ Хогл Дж. М., Маэда А., Харрисон СК (1986). «Структура и сборка вируса морщинистой репы. I. Рентгеноструктурный анализ с разрешением 3,2 Å». Журнал молекулярной биологии. 191 (4): 625–38. Дои:10.1016 / 0022-2836 (86) 90450-х. PMID  3806676.
  3. ^ Маккормак, JC; Саймон А.Е. (2004). «Предвзятый гипермутагенез, связанный с мутациями в нетранслируемой шпильке РНК-вируса». Журнал вирусологии. 78 (14): 7813–7817. Дои:10.1128 / JVI.78.14.7813-7817.2004. ЧВК  434097. PMID  15220455.
  4. ^ Чжан, G; Чжан Дж; Саймон А.Е. (2004). «Репрессия и дерепрессия синтеза минус-цепи в репликоне вируса с плюсовой РНК». Журнал вирусологии. 78 (14): 7619–7633. Дои:10.1128 / JVI.78.14.7619-7633.2004. ЧВК  434078. PMID  15220437.
  5. ^ Алквист П., Нуири А.О., Ли В.М., Кушнер Д.Б., Дай БТ (2003). "Факторы-хозяева в репликации генома вируса с положительной цепью РНК". Журнал вирусологии. 77 (15): 8181–6. Дои:10.1128 / JVI.77.15.8181-8186.2003. ЧВК  165243. PMID  12857886.
  6. ^ Хакер Д.Л., Петти ИТ, Вей Н., Моррис Т.Дж. (1992). «Гены вируса морщинистой репы, необходимые для репликации РНК и перемещения вируса». Вирусология. 186 (1): 1–8. Дои:10.1016 / 0042-6822 (92) 90055-т. PMID  1727594.
  7. ^ Альтенбах С.Б., Хауэлл С.Х. (1981). «Идентификация сателлитной РНК, связанной с вирусом морщинистости репы». Вирусология. 112 (1): 25–33. Дои:10.1016/0042-6822(81)90608-5. PMID  18635061.

внешние ссылки