Кэролайн Дж. Браун - Carolyn J. Brown

Кэролайн Дж. Браун
Альма-матерУниверситет Гвельфа, BA
Университет Торонто, Кандидат наук
Стэндфордский Университет, Кандидат наук
Научная карьера
ПоляГенетика человека, Эпигенетика, X-инактивация
Академические консультантыХант Уиллард
Интернет сайтВеб-страница лаборатории
Веб-страница университета

Кэролайн Дж. Браун (1961 г.р., Онтарио ) - канадский генетик и профессор кафедры медицинской генетики Университет Британской Колумбии. Браун известна своими исследованиями Инактивация Х-хромосомы, открыв человека XIST ген в 1990 году.

Образование и начало карьеры

Браун получила степень бакалавра наук в Генетика в 1983 году из Университет Гвельфа, Онтарио. Свою кандидатскую диссертацию начала в Университет Торонто в 1983 г. под руководством Хант Уиллард, и заключил его на Стэндфордский Университет после переезда лаборатории Уилларда в 1989 году. Браун инициировал исследования Х хромосома в лаборатории, и ее докторская диссертация была озаглавлена ​​«Исследования инактивации Х-хромосомы человека». Ее работа включала анализ генов, которые «избегают» инактивации Х-хромосомы, которые экспрессируются в (иначе) неактивной Х-хромосоме, а также молекулярную характеристику центра Х-инактивации, генетического локуса, необходимого для подавления хромосомы. Эти две темы сошлись в открытии 1990 г. XIST ген, который локализуется в центре X-инактивации и экспрессируется исключительно из неактивной X-хромосомы. Об этом открытии сообщалось в двух статьях в Природа в 1991 г.[1][2]

Уиллард назвал Брауна «критически настроенным человеком, который изменил изучение инактивации X».[3] Браун стал научным сотрудником в 1990 г. в Стэнфордском отделении генетики, а два года спустя перешел с лабораторией Уилларда в отдел генетики Кейс Вестерн Резервный университет, Огайо, где она продолжила изучение длинной некодирующей РНК XIST. Браун стал доцентом (1994) и доцентом (1999) кафедры медицинской генетики Университет Британской Колумбии в Ванкувере, и была повышена до профессора в 2004 году. Она возглавляла кафедру с 2011 по 2014 год. В своей лаборатории она руководила более чем двадцатью докторантами и аспирантами.

Исследование

Исследования Брауна направлены на Инактивация Х-хромосомы процесс у человека. Ее лаборатория выявила критические различия между инактивацией Х-хромосомы мыши и человека, такие как отсутствие отцовской инактивации Х-хромосомы в экстраэмбриональных тканях человека, более высокая доля человеческих «беглецов» и идентификация различных регуляторные последовательности человеческого XIST и мыши Xist.[4][5] Ее лаборатория каталогизирует гены ускользания, используя как экспрессию, так и Метилирование ДНК анализ r, чтобы определить, какие гены вносят вклад в половые различия в восприимчивости к болезням, и какие участки ДНК чувствительны или устойчивы к ним эпигенетический подавление гена.[6][7][8][9] Поскольку человек эмбриональные стволовые клетки эпигенетически нестабильны, Браун и его коллеги разработали альтернативные модельные системы для изучения инактивации человека, включая индуцибельные трансгены XIST в организме человека. соматические клетки, человек гибриды соматических клеток сохранение активной или неактивной Х-хромосомы и мышиных клеток с Х-сцепленным трансгены ДНК человека.[10] Ее лаборатория сотрудничает с другими исследовательскими группами Б. С. Детская больница и BC Cancer Agency исследовать клиническую значимость инактивации и экспрессии Х-хромосомы в предрасположенности к заболеванию, прогрессировании рака и Х-сцепленные заболевания, хромосомные перестройки и анеуплоидии.[11][12][13][14][15][16]

Награды и отличия

  • 1983-1987: NSERC Стипендия для выпускников столетия 1967 года
  • 1988: Премия за презентацию докторантуры по фундаментальным наукам от Американское общество генетики человека
  • 1995-2000: Стипендия MRC
  • 1999: Ведомственная педагогическая премия
  • 2001: Ученый в начале карьеры, Институт перспективных исследований Питера Уолла, UBC
  • 2008: Приз за преподавание UBC Killam
  • 2018: Почетный филиал Канадского колледжа медицинской генетики

Рекомендации

  1. ^ Браун, Кэролайн Дж .; Баллабио, Андреа; Руперт, Джеймс Л .; Лафренье, Рональд Дж .; Громпе, Маркус; Тонлорензи, Россана; Уиллард, Хантингтон Ф. (1991). «Ген из области центра инактивации Х-хромосомы человека экспрессируется исключительно из неактивной Х-хромосомы». Природа. 349 (6304): 38–44. Bibcode:1991Натура 349 ... 38Б. Дои:10.1038 / 349038a0. PMID  1985261.
  2. ^ Браун, Кэролайн Дж .; Лафренье, Рональд Дж .; Пауэрс, Вики Э .; Себастио, Джанфранко; Баллабио, Андреа; Петтигрю, Анджана Л .; Ледбеттер, Дэвид Х .; Леви, Элейн; Крейг, Ян У .; Уиллард, Хантингтон Ф. (1991). «Локализация центра инактивации X на Х-хромосоме человека в Xq13». Природа. 349 (6304): 82–84. Bibcode:1991Натура 349 ... 82Б. Дои:10.1038 / 349082a0. PMID  1985270.
  3. ^ Уиллард, Хантингтон Ф. (2010). «Обращение к премии Уильяма Аллана в 2009 году: жизнь в песочнице: незаконченное дело». Американский журнал генетики человека. 86 (3): 318–327. Дои:10.1016 / j.ajhg.2010.01.037. ЧВК  2833390.
  4. ^ Yen, Z. C .; Мейер, И. М .; Каралич, С .; Браун, К. Дж. (2007). «Межвидовое сравнение инактивации Х-хромосомы у Eutheria». Геномика. 90 (4): 453–63. Дои:10.1016 / j.ygeno.2007.07.002. PMID  17728098.
  5. ^ Chang, S.C .; Браун, К. Дж. (2010). «Идентификация регуляторных элементов, фланкирующих XIST человека, выявляет видовые различия». BMC Молекулярная биология. 11: 20. Дои:10.1186/1471-2199-11-20. ЧВК  2841178. PMID  20211024.
  6. ^ Куче, Р .; Браун, К. Дж. (2000). «Определение статуса инактивации Х-хромосомы с использованием экспрессированных полиморфизмов Х-хромосомы, идентифицированных путем поиска в базе данных». Геномика. 65 (1): 9–15. Дои:10.1006 / geno.2000.6153. PMID  10777660.
  7. ^ Cotton, A.M .; Lam, L .; Аффлек, Дж. Г .; Wilson, I.M .; Peñaherrera, M. S .; McFadden, D.E .; Кобор, М. С .; Lam, W. L .; Robinson, W. P .; Браун, К. Дж. (2011). «Анализ метилирования ДНК по всей хромосоме позволяет прогнозировать тканеспецифическую инактивацию Х-хромосомы». Генетика человека. 130 (2): 187–201. Дои:10.1007 / s00439-011-1007-8. ЧВК  3132437. PMID  21597963.
  8. ^ Cotton, A.M .; Ge, B .; Light, N .; Adoue, V .; Pastinen, T .; Браун, К. Дж. (2013). «Анализ экспрессируемых SNP выявляет различные степени экспрессии неактивной Х-хромосомы человека». Геномная биология. 14 (11): R122. Дои:10.1186 / gb-2013-14-11-r122. ЧВК  4053723. PMID  24176135.
  9. ^ Cotton, A.M .; Прайс, Э. М .; Джонс, М. Дж .; Balaton, B.P .; Кобор, М. С .; Браун, К. Дж. (2015). «Пейзаж метилирования ДНК на Х-хромосоме отражает плотность CpG, функциональное состояние хроматина и инактивацию Х-хромосомы». Молекулярная генетика человека. 24 (6): 1528–39. Дои:10.1093 / hmg / ddu564. ЧВК  4381753. PMID  25381334.
  10. ^ Тинкер, А. В .; Браун, К. Дж. (1998). «Индукция экспрессии XIST из человеческой активной Х-хромосомы в гибридах соматических клеток мыши / человека путем деметилирования ДНК». Исследования нуклеиновых кислот. 26 (12): 2935–40. Дои:10.1093 / nar / 26.12.2935. ЧВК  147638. PMID  9611238.
  11. ^ Доусон, А. Дж .; Wickstrom, D.E .; Riordan, D .; Cardwell, S .; Кейси, Р.; Baldry, S .; Браун, К. (2004). «Уникальный пациент с вариантом синдрома Ульриха-Тернера и мозаицизмом крошечного r (X) и частичной проксимальной дупликации 1q». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 124A (3): 303–6. Дои:10.1002 / ajmg.a.20302. PMID  14708105.
  12. ^ Gibb, E. A .; Vucic, E.A .; Энфилд, К. С .; Стюарт, Г. Л .; Lonergan, K. M .; Kennett, J. Y .; Беккер-Сантос, Д. Д .; MacAulay, C.E .; Lam, S .; Brown, C.J .; Лам, В. Л. (2011). "Длинные некодирующие транскриптомы РНК рака человека". PLOS ONE. 6 (10): e25915. Bibcode:2011PLoSO ... 625915G. Дои:10.1371 / journal.pone.0025915. ЧВК  3185064. PMID  21991387.
  13. ^ Cheung, K. J .; Johnson, N.A .; Аффлек, Дж. Г .; Severson, T .; Steidl, C .; Ben-Neriah, S .; Schein, J .; Morin, R.D .; Moore, R .; Shah, S.P .; Qian, H .; Paul, J. E .; Telenius, A .; Relander, T .; Lam, W .; Savage, K .; Коннорс, Дж. М .; Brown, C .; Marra, M. A .; Gascoyne, R.D .; Хорсман, Д. Э. (2010). «Приобретенные мутации TNFRSF14 при фолликулярной лимфоме связаны с худшим прогнозом». Исследования рака. 70 (22): 9166–74. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-10-2460. PMID  20884631.
  14. ^ Johnson, N.A .; Аль-Тура, А .; Brown, C.J .; Коннорс, Дж. М .; Gascoyne, R.D .; Хорсман, Д. Э. (2008). «Прогностическое значение вторичных цитогенетических изменений при фолликулярных лимфомах». Гены, хромосомы и рак. 47 (12): 1038–48. Дои:10.1002 / gcc.20606. PMID  18720523.
  15. ^ Hatakeyama, C .; Anderson, C.L .; Beever, C.L .; Peñaherrera, M. S .; Brown, C.J .; Робинсон, У. П. (2004). «Динамика искажения X-инактивации с возрастом женщин». Клиническая генетика. 66 (4): 327–32. Дои:10.1111 / j.1399-0004.2004.00310.x. PMID  15355435.
  16. ^ Beever, C.L .; Stephenson, M.D .; Peñaherrera, M. S .; Jiang, R.H .; Kalousek, D. K .; Hayden, M .; Поле, Л .; Brown, C.J .; Робинсон, У. П. (2003). «Инактивация искаженной Х-хромосомы связана с трисомией у женщин, выявленных на основании рецидивирующего самопроизвольного аборта или хромосомных аномалий беременностей». Американский журнал генетики человека. 72 (2): 399–407. Дои:10.1086/346119. ЧВК  379232. PMID  12497247.