Трансген - Transgene

А трансген это ген который был передан естественным путем или любым из ряда генная инженерия техники от одного организма к другому. Введение трансгена в процессе, известном как трансгенез, может изменить фенотип организма. Трансген описывает сегмент ДНК содержащие последовательность гена, выделенную из одного организма и введенную в другой организм. Этот ненативный сегмент ДНК может сохранять способность производить РНК или же белок в трансгенном организме или изменить нормальную функцию генетического кода трансгенного организма. Как правило, ДНК входит в состав организма. линия зародыша. Например, в высшие позвоночные это может быть достигнуто путем введения чужеродной ДНК в ядро удобрений яйцеклетка. Этот метод обычно используется для введения генов болезней человека или других представляющих интерес генов в штаммы лабораторные мыши изучить функцию или патология связаны с этим конкретным геном.

Конструирование трансгена требует сборки нескольких основных частей. Трансген должен содержать промоутер, который является регуляторной последовательностью, которая будет определять, где и когда трансген активен, экзон, кодирующая последовательность белка (обычно полученная из кДНК для интересующего белка) и стоп-последовательность. Обычно они объединяются в бактериальный плазмида и кодирующие последовательности обычно выбирают из трансгенов с ранее известными функциями.[1]

Трансгенные или генетически модифицированные организмы будь то бактерии, вирусы или грибки, они служат многим исследовательским целям. Трансгенные растения были выведены насекомые, рыбы и млекопитающие (включая человека). Трансгенные растения, такие как кукуруза и соя, заменили дикие сорта в сельском хозяйстве некоторых стран (например, США). Ускользание трансгена было зарегистрировано для ГМО-культур с 2001 года с устойчивостью и инвазивностью. Трансгенетические организмы вызывают этические вопросы и могут вызывать биобезопасность проблемы.

История

Идея создания организма в соответствии с конкретными потребностями - не новая наука. Однако до конца 1900-х годов фермеры и ученые могли вывести новые штаммы растений или организмов только из близкородственных видов, потому что ДНК должна была быть совместимой, чтобы потомство могло воспроизвести другое поколение.[нужна цитата ]

В 1970 и 1980-х годах ученые преодолели это препятствие, изобретя процедуры объединения ДНК двух совершенно разных видов с генная инженерия. Организмы, полученные с помощью этих процедур, были названы трансгенными. Трансгенез такой же, как генная терапия в том смысле, что они оба трансформируют клетки с определенной целью. Однако они совершенно разные по своим целям, поскольку генная терапия направлена ​​на излечение дефекта в клетках, а трансгенез стремится создать генетически модифицированный организм путем включения определенного трансгена в каждую клетку и изменения геном. Таким образом, трансгенез изменяет половые клетки, а не только соматические клетки, чтобы гарантировать передачу трансгенов потомству при воспроизводстве организмов. Трансгены изменяют геном, блокируя функцию гена-хозяина; они могут либо заменить ген хозяина на ген, который кодирует другой белок, либо ввести дополнительный ген.[2]

Первый трансгенный организм был создан в 1974 году, когда Энни Чанг и Стэнли Коэн выразил Золотистый стафилококк гены в кишечная палочка.[3] В 1978 году дрожжевые клетки были первыми эукариотическими организмами, подвергшимися переносу генов.[4] Клетки мыши были впервые трансформированы в 1979 г., а эмбрионы мышей - в 1980 г. Большинство самых первых трансмутаций было выполнено микроинъекция ДНК прямо в клетки. Ученые смогли разработать другие методы выполнения преобразований, такие как включение трансгенов в ретровирусы а затем заражение клеток с помощью электроинфузии, которая использует электрический ток для прохождения чужеродной ДНК через клеточную стенку, биолистика это процедура выстрела пулями ДНК в клетки, а также доставки ДНК в только что оплодотворенную яйцеклетку.[5]

Первые трансгенные животные предназначались только для генетических исследований с целью изучения конкретной функции гена, и к 2003 году были изучены тысячи генов.

Использование в растениях

Разнообразие трансгенные растения были разработаны для сельского хозяйства для производства генетически модифицированные культуры, таких как кукуруза, соя, рапсовое масло, хлопок, рис и другие. По состоянию на 2012 годэти ГМО-культуры были посажены на 170 млн га во всем мире.[6]

Золотой рис

Одним из примеров трансгенных растений является золотой рис. В 1997 г.[нужна цитата ] пять миллионов детей развились ксерофтальмия, заболевание, вызванное витамин А дефицит только в Юго-Восточной Азии.[7] Из этих детей четверть миллиона ослепли.[7] Для борьбы с этим ученые использовали биолистика вставить нарцисс фитоенсинтаза ген в азиатский рис сорта.[8] Вставка нарциссов увеличила производство бета-каротин.[8] Продукт представлял собой трансгенный вид риса, богатый витамином А, называемый золотой рис. Мало что известно о влиянии золотого риса на ксерофтальмию, поскольку кампании против ГМО предотвратили полное коммерческое использование золотого риса в нуждающихся сельскохозяйственных системах.[9]

Побег трансгена

Ускользание генетически созданных генов растений посредством гибридизации с дикими родственниками впервые обсуждалось и исследовалось в Мексике.[10] и Европа в середине 1990-х. Есть согласие, что побег трансгенов неизбежен, даже «какое-то доказательство того, что это происходит».[6] Вплоть до 2008 г. задокументированных случаев было немного.[6][11]

Кукуруза

Кукуруза, отобранная в 2000 г. Сьерра-Хуарес, Оахака, Мексика содержала трансгенный промотор 35S, в то время как большой образец, взятый другим методом из того же региона в 2003 и 2004 годах, не содержал. Образец из другого региона в 2002 г. также не подтвердился, но в целевых образцах, взятых в 2004 г., можно было предположить, что трансгены сохраняются или повторно внедряются.[12] Исследование 2009 года обнаружило рекомбинантные белки в 3,1% и 1,8% образцов, чаще всего на юго-востоке Мексики. Импорт семян и зерна из США может объяснить частоту и распространение трансгенов в западно-центральной Мексике, но не на юго-востоке. Кроме того, 5,0% партий семян кукурузы в мексиканских запасах кукурузы экспрессировали рекомбинантные белки, несмотря на мораторий на ГМ-культуры.[13]

Хлопок

В 2011 году трансгенный хлопок был обнаружен в Мексике среди дикого хлопка после 15 лет выращивания ГМО-хлопка.[14]

Рапс (канола)

Трансгенный рапс Brassicus napus, гибридизированный с аборигенным японским видом Brassica rapa, был найден в Японии в 2011 г.[15] после того, как они были идентифицированы в 2006 году в Квебек, Канада.[16] Они были устойчивыми в течение 6-летнего периода исследования, без давления отбора гербицидов и несмотря на гибридизацию с дикой формой. Это был первый отчет интрогрессия - стабильное включение генов из одного генофонда в другой - трансгена устойчивости к гербицидам из Brassica napus в генофонд дикой формы.[17]

Ползучая полевица

Трансгенный ползучая полевица, спроектированный, чтобы быть глифосат -толерантный, как «одна из первых ветроопыляемых, многолетних и сильно ауткроссинговых трансгенных культур», был посажен в 2003 году в рамках крупных (около 160 га) полевых испытаний в центральном Орегоне, недалеко от Мадрас, Орегон. В 2004 году было обнаружено, что его пыльца достигла дикорастущих популяций полевицы на расстоянии до 14 километров. Перекрестное опыление Agrostis gigantea был даже найден на расстоянии 21 километра.[18] Производитель, Компания Скоттс не смогли удалить все генно-инженерные растения, и в 2007 г. Министерство сельского хозяйства США оштрафовал Скоттса на 500 000 долларов за несоблюдение правил.[19]

Оценка рисков

Было показано, что долгосрочный мониторинг и контроль конкретного трансгена невозможны.[20] В Европейское агентство по безопасности пищевых продуктов опубликовал руководство по оценке рисков в 2010 году.[21]

Использование у мышей

Генетически модифицированные мыши являются наиболее распространенной животной моделью для трансгенных исследований.[22] В настоящее время трансгенных мышей используют для изучения различных заболеваний, включая рак, ожирение, сердечные заболевания, артрит, тревожность и болезнь Паркинсона.[23] Двумя наиболее распространенными типами генетически модифицированных мышей являются: нокаутные мыши и онкомис. Нокаут-мыши - это тип модели мышей, в которой трансгенная вставка используется для нарушения экспрессии существующего гена. Для создания мышей с нокаутом трансген с желаемой последовательностью вставляют в изолированную мышь. бластоциста с помощью электропорация. Потом, гомологичная рекомбинация происходит естественным образом в некоторых клетках, заменяя интересующий ген разработанным трансгеном. Благодаря этому процессу исследователи смогли продемонстрировать, что трансген может быть интегрирован в геном животного, выполнять определенную функцию внутри клетки и передаваться будущим поколениям.[24]

Онкомисы - это еще один генетически модифицированный вид мышей, созданный путем встраивания трансгенов, повышающих уязвимость животного к раку. Исследователи рака используют онкомис для изучения профилей различных видов рака, чтобы применить эти знания в исследованиях на людях.[24]

Использовать в Дрозофила

Было проведено множество исследований трансгенеза у Drosophila melanogaster, плодовая мушка. Этот организм был полезной генетической моделью более 100 лет из-за его хорошо изученной модели развития. Перенос трансгенов в Дрозофила геном был выполнен с использованием различных методов, в том числе P элемент, Cre-loxP, и ΦC31 вставка. Наиболее практичный метод, используемый до сих пор для вставки трансгенов в Дрозофила геном использует элементы P. Сменные элементы P, также известные как транспозоны, представляют собой сегменты бактериальной ДНК, которые перемещаются в геном без наличия комплементарной последовательности в геноме хозяина. P-элементы вводят парами по два, которые фланкируют интересующую область вставки ДНК. Кроме того, P-элементы часто состоят из двух плазмидных компонентов, один из которых известен как транспозаза P-элемента, а другой - остов P-транспозона. Часть плазмиды транспозазы управляет транспозицией остова Р-транспозона, содержащего интересующий трансген и часто маркер, между двумя концевыми участками транспозона. Успешная вставка приводит к необратимому добавлению интересующего трансгена в геном. Хотя этот метод доказал свою эффективность, сайты вставки P-элементов часто неконтролируемы, что приводит к неблагоприятному, случайному внедрению трансгена в Дрозофила геном.[25]

Чтобы улучшить расположение и точность трансгенного процесса, фермент, известный как Cre был введен. Cre оказался ключевым элементом в процессе, известном как опосредованный рекомбинацией обмен кассет. (RMCE). Хотя было показано, что он имеет более низкую эффективность трансгенной трансформации, чем транспозазы P-элемента, Cre значительно снижает трудоемкость балансировки случайных P-вставок. Создает помощь в направленном трансгенезе интересующего сегмента гена ДНК, поскольку поддерживает картирование сайтов встраивания трансгена, известных как сайты loxP. Эти сайты, в отличие от P-элементов, могут быть специально вставлены, чтобы фланкировать интересующий сегмент хромосомы, способствуя направленному трансгенезу. Транспозаза Cre играет важную роль в каталитическом расщеплении пар оснований, присутствующих в тщательно расположенных сайтах loxP, что делает возможным более специфические вставки интересующей трансгенной донорной плазмиды.[26]

Чтобы преодолеть ограничения и низкие выходы, которые дают методы трансформации с транспозоном и Cre-loxP, бактериофаг ΦC31 недавно был использован. Недавние прорывные исследования включают микроинъекцию интегразы бактериофага ФС31, которая показывает улучшенное встраивание трансгена в большие фрагменты ДНК, которые не могут быть транспонированы только Р-элементами. Этот метод включает рекомбинацию между сайтом прикрепления (attP) в фаг и сайт прикрепления в геноме бактериального хозяина (attB). По сравнению с обычными методами вставки трансгена P-элемента, ΦC31 интегрирует весь трансгенный вектор, включая бактериальные последовательности и гены устойчивости к антибиотикам. К сожалению, было обнаружено, что присутствие этих дополнительных вставок влияет на уровень и воспроизводимость экспрессии трансгена.

Использование в животноводстве и аквакультуре

Одним из сельскохозяйственных приложений является селективное разведение животных по определенным признакам: трансгенный крупный рогатый скот с увеличенным мышечным фенотипом был получен путем сверхэкспрессии короткой шпилечной РНК с гомологией с мРНК миостатина с использованием РНК-интерференции.[27]Трансгены используются для производства молока с высоким содержанием белков или шелка из козьего молока. Другое сельскохозяйственное применение - выборочное разведение животных, устойчивых к болезням, или животных для производства биофармацевтических препаратов.[27]

Будущий потенциал

Применение трансгенов - быстрорастущая область молекулярная биология. По состоянию на 2005 год прогнозировалось, что в следующие два десятилетия будет создано 300 000 линий трансгенных мышей.[28] Исследователи определили множество применений трансгенов, особенно в области медицины. Ученые сосредотачиваются на использовании трансгенов для изучения функции человеческий геном чтобы лучше понять болезнь, адаптируя органы животных для трансплантация в людей, и производство фармацевтические продукты Такие как инсулин, гормон роста и факторы, препятствующие свертыванию крови из молока трансгенных коров.[нужна цитата ]

По состоянию на 2004 год было известно пять тысяч генетические заболевания, и возможность лечения этих заболеваний с использованием трансгенных животных, возможно, является одним из самых многообещающих применений трансгенов. Есть возможность использовать человеческий генная терапия для замены мутировавшего гена неизмененной копией трансгена для лечения генетического заболевания. Это можно сделать с помощью Cre-Lox или нокаутировать. Более того, генетические нарушения изучаются с использованием трансгенных мышей, свиней, кроликов и крыс. Трансгенные кролики были созданы для изучения наследственных сердечных аритмий, поскольку сердце кролика заметно больше напоминает сердце человека, чем сердце мыши.[29] Совсем недавно ученые начали использовать трансгенных коз для изучения генетических нарушений, связанных с плодородие.[30]

Трансгены могут быть использованы для ксенотрансплантации органов свиньи. Путем изучения отторжения ксеноорганов было обнаружено, что острое отторжение пересаженного органа происходит при контакте органа с кровью реципиента из-за распознавания чужеродных антитела на эндотелиальные клетки пересаженного органа. Ученые определили у свиней антиген, который вызывает эту реакцию, и поэтому они могут трансплантировать орган без немедленного отторжения путем удаления антигена. Однако позже антиген начинает экспрессироваться, и происходит отторжение. Поэтому ведутся дальнейшие исследования.[нужна цитата ]Трансгенный микроорганизмы способен производить каталитические белки или же ферменты которые увеличивают скорость промышленных реакций.

Этическое противоречие

Использование трансгенов у людей в настоящее время чревато проблемами. Трансформация генов в клетки человека еще не доведена до совершенства. Самый известный пример этого - некоторые пациенты, у которых развивались Т-клеточный лейкоз после лечения от Х-сцепленный тяжелый комбинированный иммунодефицит (X-SCID).[31] Это было связано с близостью вставленного гена к LMO2 промотор, контролирующий транскрипцию протоонкогена LMO2.[32]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ «Трансген Дизайн». Ядро генетики мыши. Вашингтонский университет. Архивировано из оригинал 2 марта 2011 г.
  2. ^ Gordon, J .; Раддл, Ф. (1981-12-11). «Интеграция и стабильная передача генов зародышевой линии, вводимых в пронуклеусы мыши». Наука. 214 (4526): 1244–1246. Дои:10.1126 / science.6272397. ISSN  0036-8075.
  3. ^ Chang, A.C. Y .; Коэн, С. Н. (1974). «Конструирование генома между видами бактерий in vitro: репликация и экспрессия генов плазмиды Staphylococcus в Escherichia coli». Proc. Natl. Акад. Sci. Соединенные Штаты Америки. 71 (4): 1030–1034. Дои:10.1073 / пнас.71.4.1030. ЧВК  388155. PMID  4598290.
  4. ^ Hinnen, A; Hicks, JB; Финк, GR (1978). «Трансформация дрожжей». Proc. Natl. Акад. Sci. Соединенные Штаты Америки. 75 (4): 1929–1933. Дои:10.1073 / пнас.75.4.1929. ЧВК  392455. PMID  347451.
  5. ^ Брайан Д. Несс, изд. (Февраль 2004 г.). «Трансгенные организмы». Энциклопедия генетики (Ред. Ред.). Колледж Тихоокеанского союза. ISBN  1-58765-149-1.
  6. ^ а б c Гилберт, Н. (2013). «Тематические исследования: пристальный взгляд на ГМ-культуры». Природа. 497 (7447): 24–26. Дои:10.1038 / 497024a. PMID  23636378.
  7. ^ а б Соммер, Альфред (1988). «Новые требования к старому витамину (А)» (PDF). Журнал питания. 119 (1): 96–100. Дои:10.1093 / jn / 119.1.96. PMID  2643699.
  8. ^ а б Буркхардт, П. (1997). «Эндосперм трансгенного риса (Oryza Sativa), экспрессирующий нарцисс (Narcissus Pseudonarcissus), фитоен-синтаза накапливает фитоен, ключевой промежуточный продукт биосинтеза провитамина А». Журнал растений. 11 (5): 1071–1078. Дои:10.1046 / j.1365-313x.1997.11051071.x. PMID  9193076.
  9. ^ Хармон, Эми (2013-08-24). "Золотой рис: спасатель?". Нью-Йорк Таймс. ISSN  0362-4331. Получено 2015-11-24.
  10. ^ Ариас, Д. М .; Ризеберг, Л. Х. (ноябрь 1994 г.). «Генный поток между культурным и диким подсолнухом». Теоретическая и прикладная генетика. 89 (6): 655–60. Дои:10.1007 / BF00223700. PMID  24178006.
  11. ^ Кристин Л. Мерсер; Джоэл Д. Уэйнрайт (январь 2008 г.). «Поток генов от трансгенной кукурузы к старым сортам в Мексике: анализ». Сельское хозяйство, экосистемы и окружающая среда. 123 (1–3): 109–115. Дои:10.1016 / j.agee.2007.05.007.(требуется подписка)
  12. ^ Пиньейро-Нельсон А., Ван Хеерваарден Дж., Пералес Х. Р., Серратос-Эрнандес Дж. А., Ранжел А., Хаффорд МБ, Гептс П., Гарай-Арройо А., Ривера-Бустаманте Р., Альварес-Буйлла ER (февраль 2009 г.). «Трансгены мексиканской кукурузы: молекулярные доказательства и методологические соображения для обнаружения ГМО в популяциях староместных сортов». Молекулярная экология. 18 (4): 750–61. Дои:10.1111 / j.1365-294X.2008.03993.x. ЧВК  3001031. PMID  19143938.
  13. ^ Дайер Г.А., Серратос-Эрнандес Дж. А., Пералес Х. Р., Гептс П., Пинейро-Нельсон А. и др. (2009). Хани А. Эль-Шеми (ред.). «Распространение трансгенов через системы семян кукурузы в Мексике». PLOS ONE. 4 (5): e5734. Дои:10.1371 / journal.pone.0005734. ЧВК  2685455. PMID  19503610.
  14. ^ Wegier, A .; Пиньейро-Нельсон, А .; Alarcón, J .; Gálvez-Mariscal, A .; Álvarez-Buylla, E.R .; Пиньеро, Д. (2011). «Недавний поток трансгена на большие расстояния в дикие популяции соответствует историческим моделям потока генов в хлопке (Gossypium hirsutum) в центре его происхождения». Молекулярная экология. 20 (19): 4182–4194. Дои:10.1111 / j.1365-294X.2011.05258.x. PMID  21899621.
  15. ^ Aono, M .; Wakiyama, S .; Nagatsu, M .; Kaneko, Y .; Nishizawa, T .; Nakajima, N .; Tamaoki, M .; Кубо, А .; Саджи, Х. (2011). «Семена возможного природного гибрида между устойчивым к гербицидам Brassica napus и Brassica rapa обнаружены на берегу реки в Японии». ГМ культуры. 2 (3): 201–10. Дои:10.4161 / gmcr.2.3.18931. PMID  22179196.
  16. ^ Simard, M.-J .; Légère, A .; Уорвик, С.И. (2006). "Трансгенные поля Brassica napus и сорняки Brassica rapa в Квебеке: симпатрия и гибридизация сорных растений in situ". Канадский журнал ботаники. 84 (12): 1842–1851. Дои:10.1139 / b06-135.
  17. ^ Warwick, S.I .; Legere, A .; Simard, M.J .; Джеймс, Т. (2008). «Сохраняются ли сбежавшие трансгены в природе? Случай трансгена устойчивости к гербицидам в популяции сорняков Brassica rapa». Молекулярная экология. 17 (5): 1387–1395. Дои:10.1111 / j.1365-294X.2007.03567.x. PMID  17971090.
  18. ^ Watrud, L.S .; Lee, E.H .; Fairbrother, A .; Burdick, C .; Reichman, J.R .; Bollman, M .; Буря, М .; King, G.J .; Ван де Уотер, П.К. (2004). «Доказательства наличия на уровне ландшафта, опосредованного пыльцой потока генов из генетически модифицированных ползучих трав с CP4 EPSPS в качестве маркера». Труды Национальной академии наук. 101 (40): 14533–14538. Дои:10.1073 / pnas.0405154101. ЧВК  521937. PMID  15448206.
  19. ^ USDA (26 ноября 2007 г.). «Министерство сельского хозяйства США завершило расследование генетически модифицированного ползучего полевицы - Министерство сельского хозяйства США оценивает The Scotts Company, LLC в размере $ 500 000 гражданского наказания». Архивировано из оригинал 8 декабря 2015 г.
  20. ^ ван Хирваарден Дж., Ортега Дель Векчио Д., Альварес-Буйлла Э. Р., Беллон М. Р. (2012). «Новые гены в традиционных семенных системах: диффузия, обнаруживаемость и устойчивость трансгенов в метапопуляции кукурузы». PLOS ONE. 7 (10): e46123. Дои:10.1371 / journal.pone.0046123. ЧВК  3463572. PMID  23056246.
  21. ^ EFSA (2010). «Руководство по оценке экологического риска генетически модифицированных растений». Журнал EFSA. 8 (11): 1879. Дои:10.2903 / j.efsa.2010.1879.
  22. ^ «Предыстория: клонированные и генетически модифицированные животные». Центр генетики и общества. 14 апреля 2005 г.
  23. ^ "Нокаут-мыши". Национальный институт исследования генома человека. 27 августа 2015 года.
  24. ^ а б Генетически модифицированная мышь # cite note-8
  25. ^ Venken, K. J. T .; Беллен, Х. Дж. (2007). «Обновления трансгенеза для Drosophila melanogaster». Разработка. 134 (20): 3571–3584. Дои:10.1242 / dev.005686. PMID  17905790.
  26. ^ Оберштейн, А .; Pare, A .; Каплан, Л .; Смолл, С. (2005). «Сайт-специфический трансгенез посредством Cre-опосредованной рекомбинации у дрозофилы». Методы природы. 2 (8): 583–585. Дои:10.1038 / nmeth775. PMID  16094382.
  27. ^ а б Лонг, Чарльз (2014-10-01). «Трансгенное животноводство для сельского хозяйства и биомедицины». BMC Proceedings. 8 (Приложение 4): O29. Дои:10.1186 / 1753-6561-8-S4-O29. ISSN  1753-6561. ЧВК  4204076.
  28. ^ Худебин, Л.-М. (2005). «Использование трансгенных животных для улучшения здоровья человека и животноводства». Размножение у домашних животных. 40 (5): 269–281. Дои:10.1111 / j.1439-0531.2005.00596.x. ЧВК  7190005. PMID  16008757.
  29. ^ Бруннер, Майкл; Пэн, Сювэнь; Лю, GongXin (2008). «Механизмы сердечных аритмий и внезапной смерти трансгенных кроликов с синдромом удлиненного интервала QT». J Clin Invest. 118 (6): 2246. Дои:10.1172 / JCI33578. ЧВК  2373420.
  30. ^ Кус В.А., Ниманн Х (2004). «Вклад сельскохозяйственных животных в здоровье человека». Тенденции биотехнологии. 22 (6): 286–294. Дои:10.1016 / j.tibtech.2004.04.003. PMID  15158058.
  31. ^ Вудс, Н.-Б .; Боттеро, В .; Schmidt, M .; von Kalle, C .; Верма, И. М. (2006). «Генная терапия: терапевтический ген, вызывающий лимфому». Природа. 440 (7088): 1123. Дои:10.1038 / 4401123a. PMID  16641981.
  32. ^ Hacein-Bey-Abina, S .; и другие. (17 октября 2003 г.). «LMO2-ассоциированная пролиферация клональных Т-клеток у двух пациентов после генной терапии SCID-X1». Наука. 302 (5644): 415–419. Дои:10.1126 / science.1088547. PMID  14564000.

дальнейшее чтение