Плазмида - Plasmid

Не путать с плазмоид.

Иллюстрация бактерии с хромосомной ДНК и плазмидами (не в масштабе)

А плазмида маленький, внехромосомная ДНК молекула внутри клетки, которая физически отделена от хромосомная ДНК и может воспроизводиться независимо. Чаще всего они встречаются в виде небольших кольцевых двухцепочечных молекул ДНК в бактерии; однако плазмиды иногда присутствуют в археи и эукариотические организмы. В природе плазмиды часто несут гены, которые способствуют выживанию организма и дают селективные преимущества, такие как устойчивость к антибиотикам. Хотя хромосомы большие и содержат всю важную генетическую информацию для жизни в нормальных условиях, плазмиды обычно очень малы и содержат только дополнительные гены, которые могут быть полезны в определенных ситуациях или условиях. Искусственные плазмиды широко используются в качестве векторов в молекулярное клонирование, служащий для стимулирования репликации рекомбинантная ДНК последовательности внутри организмов-хозяев. В лаборатории плазмиды могут быть введены в клетку через трансформация.

Плазмиды считаются репликоны, единицы ДНК, способные автономно реплицироваться в подходящем хозяине. Однако плазмиды, подобные вирусы, обычно не классифицируются как жизнь.[1] Плазмиды передаются от одной бактерии к другой (даже другого вида) в основном через спряжение.[2] Эта передача генетического материала от хозяина к хозяину является одним из механизмов горизонтальный перенос генов, а плазмиды считаются частью мобиломе. В отличие от вирусов, которые заключают свой генетический материал в защитную белковую оболочку, называемую капсид плазмиды представляют собой «голую» ДНК и не кодируют гены, необходимые для заключения генетического материала для передачи новому хозяину; однако некоторые классы плазмид кодируют сопряженный "половой" пилус необходимо для их собственного перевода. Размер плазмиды варьируется от 1 до более 200 тыс.бп,[3] и количество идентичных плазмид в одном клетка при некоторых обстоятельствах может варьироваться от одного до тысячи.

История

Период, термин плазмида был представлен в 1952 году американским молекулярный биолог Джошуа Ледерберг для обозначения «любой внехромосомной наследственной детерминанты».[4] Раннее использование этого термина включало любой бактериальный генетический материал, который существует вне хромосом, по крайней мере, в течение части его цикла репликации, но поскольку это описание включает бактериальные вирусы, понятие плазмиды со временем было уточнено, чтобы включить генетические элементы, которые воспроизводятся автономно.[5]Позже, в 1968 году, было решено, что термин плазмида следует использовать как термин для внехромосомного генетического элемента,[6] и чтобы отличить его от вирусов, определение было сужено до генетических элементов, которые существуют исключительно или преимущественно вне хромосомы и могут автономно реплицироваться.[5]

Свойства и характеристики

Существует два типа интеграции плазмид в бактерии-хозяева: неинтегрирующиеся плазмиды реплицируются, как в случае с верхним экземпляром, тогда как эписомы, нижний пример, может интегрироваться в хост хромосома.

Чтобы плазмиды могли независимо реплицироваться в клетке, они должны обладать участком ДНК, который может действовать как начало репликации. Самовоспроизводящаяся единица, в данном случае плазмида, называется репликон. Типичный бактериальный репликон может состоять из ряда элементов, таких как ген плазмид-специфичного белка инициации репликации (Rep), повторяющиеся единицы, называемые iterons, DnaA боксов и соседний регион, богатый AT.[5] Плазмиды меньшего размера используют репликативные ферменты хозяина для создания собственных копий, тогда как плазмиды большего размера могут нести гены, специфичные для репликации этих плазмид. Некоторые типы плазмид также могут вставляться в хромосому хозяина, и эти интегративные плазмиды иногда называют эписомы у прокариот.[7]

Плазмиды почти всегда несут хотя бы один ген. Многие из генов, переносимых плазмидой, полезны для клеток-хозяев, например: позволяют клетке-хозяину выживать в среде, которая в противном случае была бы летальной или ограничивающей рост. Некоторые из этих генов кодируют признаки устойчивости к антибиотикам или устойчивости к тяжелым металлам, в то время как другие могут вызывать факторы вирулентности которые позволяют бактерии колонизировать хозяина и преодолевать его защиту или выполнять определенные метаболические функции, которые позволяют бактерии использовать конкретное питательное вещество, в том числе способность разлагать устойчивые или токсичные органические соединения.[5] Плазмиды также могут предоставлять бактериям способность исправить азот. Однако некоторые плазмиды не оказывают заметного влияния на фенотип клетки-хозяина или невозможно определить их пользу для клеток-хозяев, и эти плазмиды называются криптическими плазмидами.[8]

Природные плазмиды сильно различаются по своим физическим свойствам. Их размер может варьироваться от очень маленьких мини-плазмид размером менее 1 пары оснований (Kbp) до очень больших мегаплазмид из нескольких пар оснований мегабаз (Mbp). На верхнем конце мегаплазмиды и мегаплазмиды мало чем отличаются. минихромосома. Плазмиды обычно имеют круглую форму, но известны также примеры линейных плазмид. Эти линейные плазмиды требуют специальных механизмов для репликации их концов.[5]

Плазмиды могут присутствовать в отдельной клетке в разном количестве, от одной до нескольких сотен. Нормальное количество копий плазмиды, которое может быть обнаружено в одной клетке, называется Номер копии плазмиды, и определяется тем, как регулируется инициация репликации, и размером молекулы. Плазмиды большего размера, как правило, имеют меньшее количество копий.[7] Плазмиды с низким числом копий, которые существуют только в виде одной или нескольких копий в каждой бактерии, при деление клеток, в опасности быть потерянными в одной из разделяющих бактерий. Такие однокопийные плазмиды имеют системы, которые пытаются активно распространять копию в обеих дочерних клетках. Эти системы, которые включают система parABS и система parMRC, часто называют система перегородок или статистическая сумма плазмиды.

Классификации и виды

Обзор бактериальной конъюгации
Электронная микрофотография пучка волокон ДНК, предположительно одной петли бактериальной хромосомы
Электронная микрофотография плазмиды бактериальной ДНК (фрагмент хромосомы)

Плазмиды можно классифицировать по-разному. Плазмиды можно широко разделить на конъюгативные плазмиды и неконъюгативные плазмиды. Конъюгативные плазмиды содержат набор переносить гены которые способствуют половой связи между разными клетками.[7] В сложном процессе спряжение плазмиды могут передаваться от одной бактерии к другой через секс пили кодируется некоторыми генами-переносчиками (см. рисунок).[9] Неконъюгативные плазмиды не способны инициировать конъюгацию, поэтому их можно переносить только с помощью конъюгативных плазмид. Промежуточный класс плазмид является подвижным и несут только часть генов, необходимых для переноса. Они могут паразитировать на конъюгированной плазмиде, передаваясь с высокой частотой только в ее присутствии.

Плазмиды также можно разделить на группы несовместимости. Микроб может содержать разные типы плазмид, но разные плазмиды могут существовать только в одной бактериальной клетке, если они совместимы. Если две плазмиды несовместимы, одна или другая будет быстро потеряна из клетки. Поэтому разные плазмиды могут быть отнесены к разным группам несовместимости в зависимости от того, могут ли они сосуществовать вместе. Несовместимые плазмиды (принадлежащие к одной и той же группе несовместимости) обычно используют одни и те же механизмы репликации или разделения и, таким образом, не могут храниться вместе в одной клетке.[10][11]

Другой способ классификации плазмид - по функциям. Есть пять основных классов:

Плазмиды могут принадлежать более чем к одной из этих функциональных групп.

Векторы

Дальнейшая информация: Вектор (молекулярная биология)

Искусственно сконструированные плазмиды могут использоваться в качестве векторов в генная инженерия. Эти плазмиды служат важными инструментами в лабораториях генетики и биотехнологии, где они обычно используются для клонирования и амплификации (создания множества копий) или выражать определенные гены.[12] Для такого использования коммерчески доступно большое количество плазмид. Реплицируемый ген обычно вставляют в плазмиду, которая обычно содержит ряд функций для их использования. К ним относятся ген, который придает устойчивость к определенным антибиотикам (ампициллин наиболее часто используется для бактериальных штаммов), начало репликации чтобы позволить бактериальным клеткам реплицировать плазмидную ДНК, и подходящий сайт для клонирования (называемый сайт множественного клонирования ).

Структурную нестабильность ДНК можно определить как серию спонтанных событий, завершающихся непредвиденной перестройкой, потерей или приобретением генетического материала. Такие события часто инициируются перемещением мобильных элементов или наличием нестабильных элементов, таких как неканонические (не B) структуры. Дополнительные области, относящиеся к остову бактерий, могут участвовать в широком диапазоне явлений структурной нестабильности. Хорошо известные катализаторы генетической нестабильности включают прямые, инвертированные и тандемные повторы, которые, как известно, заметны в большом количестве коммерчески доступных векторов клонирования и экспрессии.[13] Последовательности вставки также могут серьезно влиять на функцию и выход плазмиды, приводя к делециям и перестройкам, активации, подавлению или инактивации экспрессии соседнего гена.[14] Следовательно, уменьшение или полное устранение посторонних некодирующих последовательностей основной цепи значительно снизило бы склонность к таким событиям, и, следовательно, общий рекомбиногенный потенциал плазмиды.[15][16]

Схематическое изображение pBR322 плазмида, одна из первых плазмид, широко используемых в качестве клонирование вектор. На диаграмме плазмиды показаны гены, кодируемые (усилитель и тет за ампициллин и тетрациклин резистентность соответственно), его начало репликации (Ори), и различные сайты ограничения (обозначены синим цветом).

Клонирование

Основная статья: Клонирование вектора

Плазмиды являются наиболее часто используемыми векторами для клонирования бактерий.[17] Эти клонирующие векторы содержат сайт, позволяющий вставлять фрагменты ДНК, например сайт множественного клонирования или полилинкер, который имеет несколько часто используемых сайты ограничения к каким фрагментам ДНК могут относиться перевязанный. После вставки интересующего гена плазмиды вводятся в бактерии с помощью процесса, называемого трансформация. Эти плазмиды содержат выбираемый маркер обычно это ген устойчивости к антибиотикам, который придает бактериям способность выживать и размножаться в селективной среде для выращивания, содержащей определенные антибиотики. Клетки после трансформации подвергаются воздействию селективной среды, и выживают только клетки, содержащие плазмиду. Таким образом, антибиотики действуют как фильтр, отбирающий только бактерии, содержащие плазмидную ДНК. Вектор также может содержать другие маркерные гены или же репортерные гены для облегчения отбора плазмид с клонированными вставками. Бактерии, содержащие плазмиду, затем можно выращивать в больших количествах, собирать и затем выделять интересующую плазмиду с использованием различных методов препарат плазмиды.

Вектор клонирования плазмиды обычно используется для клонирования фрагментов ДНК длиной до 15 kbp.[18] Чтобы клонировать более длинные участки ДНК, лямбда-фаг с удаленными генами лизогении, космиды, бактериальные искусственные хромосомы, или же искусственные хромосомы дрожжей используются.

Производство белка

Основная статья: Вектор выражения

Еще одно важное применение плазмид - производство большого количества белков. В этом случае исследователи выращивают бактерии, содержащие плазмиду, несущую интересующий ген. Так же, как бактерия вырабатывает белки, придающие ей устойчивость к антибиотикам, ее также можно заставить производить большое количество белков из встроенного гена. Это дешевый и простой способ массового производства белка, который кодирует ген, например, инсулин.

Генная терапия

Основная статья: Векторы в генной терапии

Плазмиды также могут использоваться для переноса генов в качестве потенциального лечения при генная терапия так что он может экспрессировать белок, которого не хватает в клетках. Некоторые формы генная терапия требуют введения терапевтических гены на заранее выбранных хромосомный целевые сайты внутри человека геном. Плазмидные векторы - один из многих подходов, которые можно использовать для этой цели. Нуклеазы цинковых пальцев (ZFN) предлагают способ вызвать сайт-специфический двухцепочечный разрыв генома ДНК и вызвать гомологичная рекомбинация. Плазмиды, кодирующие ZFN, могут помочь доставить терапевтический ген в определенное место, чтобы избежать повреждения клеток, мутаций, вызывающих рак, или иммунного ответа.[19]

Модели заболеваний

Плазмиды исторически использовались для генетической инженерии эмбриональных стволовых клеток крыс для создания моделей генетических заболеваний крыс. Ограниченная эффективность методов на основе плазмид не позволила их использовать для создания более точных моделей клеток человека. Однако развитие аденоассоциированный вирус методы рекомбинации и нуклеазы цинковых пальцев, позволили создать новое поколение модели изогенных болезней человека.

Эписомы

«Эпизом» перенаправляется сюда. Об альбоме Билла Ласвелла, Отомо Йошихиде и Тацуи Йошиды см. Эпизом (альбом).

Период, термин эписома был представлен Франсуа Жакоб и Эли Вольман в 1958 г. для обозначения внехромосомного генетического материала, который может автономно реплицироваться или интегрироваться в хромосому.[20][21] Однако с тех пор, как этот термин был введен, его использование изменилось, так как плазмида стал предпочтительным термином для автономной репликации внехромосомной ДНК. На симпозиуме 1968 года в Лондоне некоторые участники предложили термин эписома быть оставленным, хотя другие продолжали использовать термин с изменением значения.[22][23]

Сегодня некоторые авторы используют эписома в контексте прокариот для обозначения плазмиды, которая способна интегрироваться в хромосому. Интегративные плазмиды могут реплицироваться и стабильно сохраняться в клетке в течение нескольких поколений, но на некотором этапе они будут существовать как независимая плазмидная молекула.[24] В контексте эукариот термин эписома используется для обозначения неинтегрированной внехромосомной замкнутой кольцевой молекулы ДНК, которая может реплицироваться в ядре.[25][26] Вирусы являются наиболее частыми примерами этого, например герпесвирусы, аденовирусы, и полиомавирусы, но некоторые из них являются плазмидами. Другие примеры включают аберрантные хромосомные фрагменты, такие как двухминутные хромосомы, которые могут возникнуть при искусственной амплификации генов или при патологических процессах (например, трансформации раковых клеток). Эписомы эукариот ведут себя аналогично плазмидам прокариот в том, что ДНК стабильно сохраняется и реплицируется с клеткой-хозяином. Цитоплазматические вирусные эписомы (как в поксвирус инфекции). Некоторые эписомы, например вирусы герпеса, реплицируются в катящийся круг механизм, подобный бактериальным фаговым вирусам. Другие реплицируются через механизм двунаправленной репликации (Тета-тип плазмиды). В любом случае эписомы остаются физически отделенными от хромосом клетки-хозяина. Несколько вирусов рака, в том числе Вирус Эпштейна-Барра и Вирус герпеса, связанный с саркомой Капоши, поддерживаются в виде латентных, хромосомно различных эписом в раковых клетках, где вирусы экспрессируют онкогены которые способствуют пролиферации раковых клеток. При раке эти эписомы пассивно реплицируются вместе с хромосомами хозяина при делении клетки. Когда эти вирусные эписомы инициируют литическая репликация для генерации нескольких вирусных частиц они обычно активируют клеточные врожденный иммунитет защитные механизмы, убивающие клетку-хозяина.

Плазмидное обслуживание

Основная статья: Модуль зависимости

Некоторые плазмиды или микробные хозяева включают система зависимости или постсегрегационная система убийств (PSK), такая как хок / сок (уничтожение хозяина / супрессор убийства) система плазмиды R1 в кишечная палочка.[27] Этот вариант производит как долгоживущие яд и недолговечный противоядие. Несколько типов систем плазмидной зависимости (токсин / антитоксин, метаболизм, системы ORT) описаны в литература[28] и используется в биотехнических (ферментация) или биомедицинских (вакцинация) приложениях. Дочерние клетки, которые сохраняют копию плазмиды, выживают, в то время как дочерняя клетка, которая не может наследовать плазмиду, умирает или страдает сниженной скоростью роста из-за оставшегося яда от родительской клетки. Наконец, можно повысить общую производительность.

Напротив, плазмиды, используемые в биотехнологии, такие как pUC18, pBR322 и производные векторы, вряд ли когда-либо содержат системы зависимости от токсина и антитоксина, и поэтому их необходимо держать под давлением антибиотиков, чтобы избежать потери плазмиды.

Плазмиды дрожжей

Дрожжи естественно несут в себе различные плазмиды. Среди них выделяются плазмиды размером 2 мкм - маленькие круглые плазмиды, часто используемые для генная инженерия дрожжевых и линейных плазмид pGKL из Kluyveromyces lactis, которые отвечают за киллерные фенотипы.[29]

Другие типы плазмид часто связаны с векторами клонирования дрожжей, которые включают:

  • Интегративная плазмида дрожжей (YIp), дрожжевые векторы, которые зависят от интеграции в хромосому хозяина для выживания и репликации и обычно используются при изучении функциональности соло-гена или когда ген токсичен. Также связан с геном URA3, который кодирует фермент, связанный с биосинтезом пиримидиновых нуклеотидов (T, C);
  • Репликативная плазмида дрожжей (YRp), которые транспортируют последовательность хромосомной ДНК, которая включает точку начала репликации. Эти плазмиды менее стабильны, так как они могут быть потеряны во время бутонизации.

Извлечение плазмидной ДНК

Плазмиды часто используются для очистки определенной последовательности, поскольку их можно легко очистить от остальной части генома. Для их использования в качестве векторов и для молекулярное клонирование, плазмиды часто необходимо изолировать.

Есть несколько способов выделить плазмидную ДНК от бактерий, начиная от miniprep к maxiprep или bulkprep.[12] Первый можно использовать для быстрого определения правильности плазмиды в каком-либо из нескольких бактериальных клонов. Выход представляет собой небольшое количество нечистой плазмидной ДНК, которого достаточно для анализа с помощью ограничительный дайджест и для некоторых методов клонирования.

В последнем выращиваются гораздо большие объемы бактериальной суспензии, из которых можно проводить макси-препарирование. По сути, это минипрепарат в увеличенном масштабе с последующей дополнительной очисткой. Это приводит к относительно большим количествам (несколько сотен микрограммов) очень чистой плазмидной ДНК.

Было создано множество коммерческих наборов для выполнения экстракции плазмид в различных масштабах, чистоте и уровнях автоматизации.

Конформации

Плазмидная ДНК может находиться в одной из пяти конформаций, которые (для данного размера) движутся с разной скоростью в геле во время электрофорез. Конформации перечислены ниже в порядке электрофоретической подвижности (скорости для данного приложенного напряжения) от самой медленной до самой быстрой:

  • Неровный открытый круговой ДНК имеет разрез по одной нити.
  • Расслабленный круговой ДНК полностью неповреждена, обе нити не разрезаны, но ферментативно расслабленный (суперспирали удалены). Это можно смоделировать, позволив скрученному удлинителю размотаться и расслабиться, а затем подключить его к самому себе.
  • Линейный У ДНК есть свободные концы, либо потому, что обе нити были разрезаны, либо потому, что ДНК была линейной. in vivo. Это можно смоделировать с помощью электрического удлинителя, который не вставлен сам в себя.
  • Суперспиральный (или же ковалентно замкнуто-круговой) ДНК полностью неповреждена, обе нити не разрезаны, а скручены за одно целое, что приводит к компактной форме. Это можно смоделировать, скручивая удлинитель а затем подключил его к себе.
  • Суперспиральный денатурированный ДНК похожа на сверхспиральная ДНК, но имеет непарные участки, что делает его немного менее компактным; это может быть результатом чрезмерной щелочности во время приготовления плазмиды.

Скорость миграции небольших линейных фрагментов прямо пропорциональна напряжению, приложенному при низких напряжениях. При более высоких напряжениях более крупные фрагменты перемещаются с постоянно увеличивающейся, но разной скоростью. Таким образом, разрешение геля уменьшается с увеличением напряжения.

При заданном низком напряжении скорость миграции небольших линейных фрагментов ДНК является функцией их длины. Большие линейные фрагменты (более 20 кб или около того) перемещаются с определенной фиксированной скоростью независимо от длины. Это происходит из-за того, что молекулы «перестраиваются», при этом основная часть молекулы следует за передним концом через матрицу геля. Ограничительные дайджесты часто используются для анализа очищенных плазмид. Эти ферменты специально разрушают ДНК в определенных коротких последовательностях. Полученные линейные фрагменты образуют полосы после гель-электрофорез. Некоторые фрагменты можно очистить, вырезав полосы из геля и растворив гель для высвобождения фрагментов ДНК.

Из-за своей плотной конформации суперспиральная ДНК быстрее проходит через гель, чем линейная или открытая кольцевая ДНК.

Программное обеспечение для биоинформатики и дизайна

Основная статья: Список программного обеспечения для генной инженерии

Использование плазмид как методика в молекулярная биология поддерживается биоинформатика программного обеспечения. Эти программы записывают ДНК последовательность плазмидных векторов, помогает предсказать сайты разреза рестрикционные ферменты, и планировать манипуляции. Примерами пакетов программного обеспечения, которые обрабатывают карты плазмид, являются ApE, Менеджер клонов, GeneConstructionKit, Geneious, Компилятор генома, LabGenius, Lasergene, MacVector, pDraw32, Serial Cloner, VectorFriends, Вектор НТИ и WebDSV. Эти части программного обеспечения помогают проводить полные эксперименты in silico перед проведением влажных экспериментов.[30]

Коллекции плазмид

Многие плазмиды были созданы за эти годы, и исследователи предоставили плазмиды в базы данных плазмид, такие как некоммерческие организации. Addgene и BCCM / LMBP. В этих базах данных можно найти и запросить плазмиды для исследования. Исследователи также часто загружают плазмидные последовательности в базу данных. База данных NCBI, из которого могут быть извлечены последовательности конкретных плазмид.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Синкович Дж., Хорват Дж., Хорак А. (1998). «Происхождение и эволюция вирусов (обзор)». Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica. 45 (3–4): 349–90. PMID  9873943.
  2. ^ Смилли С., член парламента Гарсиллан-Барсия, М. В. Франсиа, Е. П. Роча, Ф. де ла Крус (сентябрь 2010 г.). «Подвижность плазмид». Обзоры микробиологии и молекулярной биологии. 74 (3): 434–52. Дои:10.1128 / MMBR.00020-10. ЧВК  2937521. PMID  20805406.
  3. ^ Томас CM, Саммерс Д. (2008). Бактериальные плазмиды. Энциклопедия наук о жизни. Дои:10.1002 / 9780470015902.a0000468.pub2. ISBN  978-0470016176.
  4. ^ Ледерберг Дж (октябрь 1952 г.). «Клеточная генетика и наследственный симбиоз». Физиологические обзоры. 32 (4): 403–30. CiteSeerX  10.1.1.458.985. Дои:10.1152 / Physrev.1952.32.4.403. PMID  13003535.
  5. ^ а б c d е Финбарр Хейс (2003). «Глава 1 - Функция и организация плазмид». В Никола Казали; Эндрю Престо (ред.). Плазмидные векторы E. coli: методы и применение. Методы молекулярной биологии. 235. Humana Press. С. 1–5. ISBN  978-1-58829-151-6.
  6. ^ Стэнли Фалькоу. «Микробная геномика: на плечах гигантов». Общество микробиологов.
  7. ^ а б c Т.А. Браун (2010). «Глава 2 - Векторы для клонирования генов: плазмиды и бактериофаги». Клонирование генов и анализ ДНК: введение (6-е изд.). Вили-Блэквелл. ISBN  978-1405181730.
  8. ^ Дэвид Саммерс (1996). «Глава 1 - Функция и организация плазмид». Биология плазмид (Первое изд.). Вили-Блэквелл. С. 21–22. ISBN  978-0632034369.
  9. ^ Дэвид П. Кларк; Нанетт Жан Паздерник (2012). Молекулярная биология (2-е изд.). Академическая ячейка. п. 795. ISBN  978-0123785947.
  10. ^ Маргарет С. М. Смит; Р. Элизабет Сокетт, ред. (1999). Генетические методы для различных прокариот. Методы в микробиологии, т. 29. Academic Press. С. 75–77. ISBN  978-0-12-652340-9.
  11. ^ Морган К. «Плазмиды 101: происхождение репликации». addgene.org.
  12. ^ а б Рассел, Дэвид В .; Сэмбрук, Джозеф (2001). Молекулярное клонирование: лабораторное руководство. Колд-Спринг-Харбор, Нью-Йорк: Лаборатория Колд-Спринг-Харбор.
  13. ^ Oliveira PH, Prather KJ, Prazeres DM, Monteiro GA (август 2010 г.). «Анализ повторов ДНК в бактериальных плазмидах показывает возможность повторяющихся событий нестабильности». Прикладная микробиология и биотехнология. 87 (6): 2157–67. Дои:10.1007 / s00253-010-2671-7. PMID  20496146. S2CID  19780633.
  14. ^ Gonçalves GA, Oliveira PH, Gomes AG, Prather KL, Lewis LA, Prazeres DM, Monteiro GA (август 2014 г.). «Доказательства того, что события вставки транспозиции IS2 смещены в сторону резких композиционных сдвигов в целевой ДНК и модулируются разнообразным набором параметров культуры» (PDF). Прикладная микробиология и биотехнология. 98 (15): 6609–19. Дои:10.1007 / s00253-014-5695-6. HDL:1721.1/104375. PMID  24769900. S2CID  9826684.
  15. ^ Oliveira PH, Mairhofer J (сентябрь 2013 г.). "Безмаркерные плазмиды для биотехнологических приложений - значение и перспективы". Тенденции в биотехнологии. 31 (9): 539–47. Дои:10.1016 / j.tibtech.2013.06.001. PMID  23830144.
  16. ^ Oliveira PH, Prather KJ, Prazeres DM, Monteiro GA (сентябрь 2009 г.). «Структурная нестабильность плазмидных биофармацевтических препаратов: проблемы и последствия». Тенденции в биотехнологии. 27 (9): 503–11. Дои:10.1016 / j.tibtech.2009.06.004. PMID  19656584.
  17. ^ Улдис Н. Стрейпс; Рональд Э. Ясбин, ред. (2002). Современная микробная генетика (2-е изд.). Вили-Блэквелл. п. 248. ISBN  978-0471386650.
  18. ^ Эндрю Престон (2003). «Глава 2 - Выбор вектора для клонирования». В Никола Казали; Эндрю Престон (ред.). Плазмидные векторы E. coli: методы и применение. Методы молекулярной биологии, Vol. 235. Humana Press. С. 19–26. ISBN  978-1-58829-151-6.
  19. ^ Кандавелу К., Чандрасегаран С. (2008). «Плазмиды для генной терапии». Плазмиды: текущие исследования и будущие тенденции. Caister Academic Press. ISBN  978-1-904455-35-6.
  20. ^ Моранж М (декабрь 2009 г.). «О чем нам рассказывает история XIX. Понятие эписомы» (PDF). Журнал биологических наук. 34 (6): 845–48. Дои:10.1007 / s12038-009-0098-z. PMID  20093737. S2CID  11367145.
  21. ^ Джейкоб Ф., Воллман Э.Л. (1958), «Эпизомы, генетические элементы», Comptes Rendus de l'Académie des Sciences de Paris, 247 (1): 154–56, PMID  13561654
  22. ^ Хейс, В. (1969). "Что такое эписомы и плазмиды?". В Гордоне Э. В. Волстенхолме; Мейв О'Коннор (ред.). Бактериальные эписомы и плазмиды. Симпозиум Фонда CIBA. С. 4–8. ISBN  978-0700014057.
  23. ^ Гордон Э. В. Волстенхолм; Мейв О'Коннор, ред. (1969). Бактериальные эписомы и плазмиды. Симпозиум Фонда CIBA. С. 244–45. ISBN  978-0700014057.
  24. ^ Т.А. Браун (2011). Введение в генетику: молекулярный подход. Наука о гирляндах. п. 238. ISBN  978-0815365099.
  25. ^ Ван Крененбрук К., Ванхонакер П., Хегеман Г. (сентябрь 2000 г.). «Эпизомальные векторы для экспрессии генов в клетках млекопитающих». Европейский журнал биохимии. 267 (18): 5665–78. Дои:10.1046 / j.1432-1327.2000.01645.x. PMID  10971576.
  26. ^ Колозимо А., Гонц К.К., Холмс А.Р., Кунцельманн К., Новелли Дж., Мэлоун Р.В., Беннетт М.Дж., Грюнерт, округ Колумбия (август 2000 г.). «Перенос и экспрессия чужеродных генов в клетках млекопитающих» (PDF). Биотехнологии. 29 (2): 314–18, 320–22, 324 пасс. Дои:10.2144 / 00292rv01. PMID  10948433. Архивировано из оригинал (PDF) 24 июля 2011 г.
  27. ^ Гердес К., Расмуссен ПБ, Молин С. (май 1986 г.). «Уникальный тип функции поддержания плазмиды: постсегрегационное уничтожение свободных от плазмид клеток». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 83 (10): 3116–20. Bibcode:1986PNAS ... 83.3116G. Дои:10.1073 / pnas.83.10.3116. ЧВК  323463. PMID  3517851.
  28. ^ Kroll J, Klinter S, Schneider C, Voss I, Steinbüchel A (ноябрь 2010 г.). «Системы плазмидной зависимости: перспективы и применение в биотехнологии». Микробная биотехнология. 3 (6): 634–57. Дои:10.1111 / j.1751-7915.2010.00170.x. ЧВК  3815339. PMID  21255361.
  29. ^ Гунге Н., Мурата К., Сакагути К. (июль 1982 г.). «Трансформация Saccharomyces cerevisiae с помощью линейных плазмид-киллеров ДНК из Kluyveromyces lactis». Журнал бактериологии. 151 (1): 462–64. Дои:10.1128 / JB.151.1.462-464.1982. ЧВК  220260. PMID  7045080.
  30. ^ "Видео обратной связи Вектор НТИ". Лаборатория ДНК.

дальнейшее чтение

Общие работы

  • Кляйн Д.В., Прескотт Л.М., Харлей Дж. (1999). Микробиология. Бостон: WCB / McGraw-Hill.
  • Моат А.Г., Фостер Дж. В., Спектор депутат (2002). Микробная физиология. Wiley-Liss. ISBN  978-0-471-39483-9.
  • Смит К.Ю. Элементы молекулярной нейробиологии. Вайли. С. 101–11.[ISBN отсутствует ]

Эписомы

внешняя ссылка