LMO2 - LMO2

LMO2
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2XJY, 2XJZ, 2YPA, 4КФЗ
Идентификаторы
Псевдонимы	LMO2, RBTN2, RBTNL1, RHOM2, TTG2, только домен LIM 2, LMO-2
Внешние идентификаторы	OMIM: 180385 MGI: 102811 ГомолоГен: 4072 Генные карты: LMO2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 11 (человек)
Конец	33,892,076 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	103,981,878 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• РНК-полимераза II, активирующая связывание фактора транскрипции; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • связывание фактора транскрипции bHLH; • Переплет электронного ящика; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • связывание ионов металлов;
Сотовый компонент	• ядро клетки; • комплекс регуляторов транскрипции; • нуклеоплазма;
Биологический процесс	• развитие многоклеточного организма; • транскрипция мРНК с промотора РНК-полимеразы II; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • клеточный ответ на стимул гормона щитовидной железы; • регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	4005
	16909
	ENSG00000135363
	ENSMUSG00000032698
	P25791
	P25801
	NM_001142315; NM_001142316; NM_005574
	NM_001142335; NM_001142336; NM_001142337; NM_008505
	NP_001135787; NP_001135788; NP_005565
	NP_001135807; NP_001135808; NP_001135809; NP_032531
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Только домен LIM 2 (ромботиноподобный 1), также известный как LMO2, RBTNL1, RBTN2, RHOM2, LIM Domain Only Protein 2, TTG2, и Белок транслокации Т-клеток 2, это белок который у человека кодируется LMO2 ген.^[5]

Функция

LMO2 кодирует два богатых цистеином LIM домен белок, необходимый для желточного мешка эритропоэз.^[6] Белок LMO2 играет центральную и решающую роль в кроветворный развитие и очень хорошо сохраняется.

Клиническое значение

Аберрантный LMO2 Экспрессия является важным признаком острого лимфобластного лейкоза Т-клеток с множеством описанных механизмов активации.^[7]^[8] Сайт начала транскрипции LMO2 расположен примерно в 25 т.п.н. ниже кластера транслокации Т-клеток 11p13 (11p13 ttc), где ряд Т-клеточный острый лимфобластный лейкоз -специфические транслокации.^[9] Восходящий некодирующая ДНК элемент также является местом повторяющихся мутаций в Т-клеточный острый лимфобластный лейкоз, что приводит к привлечению фактора транскрипции MYB и значительному обогащению H3K27ac и, таким образом, к образованию аберрантного энхансера, который активирует экспрессию LMO2 ^[10] Кроме того, повторяющиеся и соматически приобретенные мутации LMO2 интрон 1 приводит к его чрезмерной экспрессии как у взрослых, так и у детей Т-клеточный острый лимфобластный лейкоз.^[11] Эти мутации вводят новые сайты связывания факторов транскрипции для MYB, ETS1 и RUNX1, что делает возможным образование аберрантного промотора, который управляет LMO2 выражение.

Взаимодействия

LMO2 показал взаимодействовать с:

дальнейшее чтение

Ройер-Покора Б., Лоос Ю., Людвиг В. Д. (октябрь 1991 г.). «TTG-2, новый ген, кодирующий богатый цистеином белок с мотивом LIM, сверхэкспрессируется при остром Т-клеточном лейкозе с t (11; 14) (p13; q11)». Онкоген. 6 (10): 1887–93. PMID 1923511.
Бем Т., Форони Л., Канеко Ю., Перуц М.Ф., Кролик Т.Х. (май 1991 г.). «Семейство ромботинов богатых цистеином онкогенов LIM-домена: различные члены участвуют в транслокациях Т-клеток в хромосомы 11p15 и 11p13 человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (10): 4367–71. Дои:10.1073 / pnas.88.10.4367. ЧВК 51660. PMID 2034676.
Бём Т., Спиллантини М.Г., Софронев М.В., Сурани М.А., Rabbitts TH (май 1991 г.). «Онтогенетически регулируемая и тканеспецифическая экспрессия мРНК, кодирующих две альтернативные формы ромботина онкогена LIM домена: свидетельство экспрессии тимуса». Онкоген. 6 (5): 695–703. PMID 2052354.
Донг В.Ф., Сюй Ю., Ху QL, Манро Д., Миновада Дж., Хаусман Д.Е., Минден, Мэриленд (ноябрь 1995 г.). «Молекулярная характеристика точки останова транслокации хромосомы t (11; 14) (p13; q11) из клеточной линии KOPT-K1». Лейкемия. 9 (11): 1812–7. PMID 7475267.
Osada H, Grutz G, Axelson H, Forster A, Rabbitts TH (октябрь 1995 г.). «Ассоциация факторов транскрипции эритроидов: комплексы с участием белка LIM RBTN2 и белка цинкового пальца GATA1». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (21): 9585–9. Дои:10.1073 / пнас.92.21.9585. ЧВК 40846. PMID 7568177.
Санчес-Гарсия I, Аксельсон Х., Rabbitts TH (апрель 1995 г.). «Функциональное разнообразие LIM белков: амино-концевые домены активации в онкогенных белках RBTN1 и RBTN2». Онкоген. 10 (7): 1301–6. PMID 7731680.
Wadman I., Li J, Bash RO, Forster A, Osada H, Rabbitts TH, Baer R (октябрь 1994). «Специфическая ассоциация in vivo между белками bHLH и LIM, участвующими в лейкемии Т-клеток человека». Журнал EMBO. 13 (20): 4831–9. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06809.x. ЧВК 395422. PMID 7957052.
Валге-Арчер В.Э., Осада Х., Уоррен А.Дж., Форстер А., Ли Дж., Баер Р., Кролик Т.Х. (август 1994 г.). «Белок LIM RBTN2 и основной белок спираль-петля-спираль TAL1 присутствуют в комплексе в эритроидных клетках». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (18): 8617–21. Дои:10.1073 / пнас.91.18.8617. ЧВК 44657. PMID 8078932.
Уилкинсон Д.А., Нил Г.А., Мао С., Наив К.В., Гурха Р.М. (январь 1997 г.). «Эльф-2, фактор транскрипции, связывающий ромботин-2: открытие и потенциальная роль в Т-клеточном лейкозе». Лейкемия. 11 (1): 86–96. Дои:10.1038 / sj.leu.2400516. PMID 9001422.
Мао С., Нил Г.А., Гурха Р.М. (апрель 1997 г.). «Т-клеточный онкоген ромботин-2 взаимодействует со связывающим ретинобластому белком 2». Онкоген. 14 (13): 1531–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1200988. PMID 9129143.
Osada H, Grutz GG, Axelson H, Forster A, Rabbitts TH (апрель 1997 г.). «Только LIM-белок Lmo2 образует белковый комплекс с эритроидным транскрипционным фактором GATA-1». Лейкемия. 11 Дополнение 3: 307–12. PMID 9209374.
Wadman IA, Osada H, Grütz GG, Agulnick AD, Westphal H, Forster A, Rabbitts TH (июнь 1997 г.). «Белок Lmo2, содержащий только LIM, представляет собой мостиковую молекулу, собирающую эритроидный ДНК-связывающий комплекс, который включает белки TAL1, E47, GATA-1 и Ldb1 / NLI». Журнал EMBO. 16 (11): 3145–57. Дои:10.1093 / emboj / 16.11.3145. ЧВК 1169933. PMID 9214632.
Visvader JE, Mao X, Fujiwara Y, Hahm K, Orkin SH (декабрь 1997 г.). «Связывающий белок LIM-домен Ldb1 и его партнер LMO2 действуют как негативные регуляторы дифференцировки эритроидов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (25): 13707–12. Дои:10.1073 / пнас.94.25.13707. ЧВК 28370. PMID 9391090.
Джурата Л. В., Пфафф С. Л., Гилл Г. Н. (февраль 1998 г.). «Ядерный взаимодействующий домен LIM NLI опосредует гомо- и гетеродимеризацию факторов транскрипции LIM домена». Журнал биологической химии. 273 (6): 3152–7. Дои:10.1074 / jbc.273.6.3152. PMID 9452425.
Кенни Д.А., Джурата Л.В., Сага Y, Гилл Г.Н. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация и характеристика LMO4, гена LMO с новым паттерном экспрессии во время эмбриогенеза». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (19): 11257–62. Дои:10.1073 / пнас.95.19.11257. ЧВК 21629. PMID 9736723.
Оно Й, Фукухара Н., Йоши О (декабрь 1998 г.). «Белки TAL1 и LIM-only синергетически индуцируют экспрессию ретинальдегиддегидрогеназы 2 при остром лимфобластном лейкозе Т-клеток, действуя как кофакторы для GATA3». Молекулярная и клеточная биология. 18 (12): 6939–50. Дои:10.1128 / MCB.18.12.6939. ЧВК 109277. PMID 9819382.
Бах I, Родригес-Эстебан С., Каррьер С., Бхушан А., Кронес А., Роуз Д. В. и др. (Август 1999 г.). «RLIM ингибирует функциональную активность факторов транскрипции гомеодомена LIM посредством рекрутирования комплекса гистондеацетилазы». Природа Генетика. 22 (4): 394–9. Дои:10.1038/11970. PMID 10431247. S2CID 22326394.
Вителли Л., Кондорелли Дж., Лулли В., Хоанг Т., Лучетти Л., Кроче С.М., Пешле С. (июль 2000 г.). «Пентамерный транскрипционный комплекс, включающий белок Tal-1 и ретинобластомы, снижает экспрессию c-kit в нормальных эритробластах». Молекулярная и клеточная биология. 20 (14): 5330–42. Дои:10.1128 / MCB.20.14.5330-5342.2000. ЧВК 85982. PMID 10866689.
Давенпорт Дж, Нил Г.А., Гурха Р. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация генов, потенциально участвующих в LMO2-индуцированном лейкемогенезе». Лейкемия. 14 (11): 1986–96. Дои:10.1038 / sj.leu.2401913. PMID 11069036.
Sum EY, Peng B, Yu X, Chen J, Byrne J, Lindeman GJ, Visvader JE (март 2002 г.). «Белок LIM домена LMO4 взаимодействует с кофактором CtIP и опухолевым супрессором BRCA1 и ингибирует активность BRCA1». Журнал биологической химии. 277 (10): 7849–56. Дои:10.1074 / jbc.M110603200. PMID 11751867.

внешняя ссылка

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P25791 (Человеческий ромботин-2) в PDBe-KB.
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P25801 (Мышь Ромботин-2) на PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135363 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032698 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid2034676-5] Бем Т., Форони Л., Канеко Ю., Перуц М.Ф., Кролик Т.Х. (май 1991 г.). «Семейство ромботинов богатых цистеином онкогенов LIM-домена: различные члены участвуют в транслокациях Т-клеток в хромосомы 11p15 и 11p13 человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (10): 4367–71. Дои:10.1073 / pnas.88.10.4367. ЧВК 51660. PMID 2034676.

[pmid8033210-6] Уоррен AJ, Колледж WH, Карлтон МБ, Эванс MJ, Смит AJ, Rabbitts TH (июль 1994). «Онкогенный богатый цистеином белок домена LIM rbtn2 необходим для развития эритроидов». Клетка. 78 (1): 45–57. Дои:10.1016/0092-8674(94)90571-1. PMID 8033210. S2CID 7156927.

[7] Бем Т., Форони Л., Канеко Ю., Перуц М.Ф., Кролик Т.Х. (май 1991 г.). «Семейство ромботинов богатых цистеином онкогенов LIM-домена: отдельные члены участвуют в транслокациях Т-клеток в хромосомы 11p15 и 11p13 человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (10): 4367–71. Дои:10.1073 / pnas.88.10.4367. ЧВК 51660. PMID 2034676.

[8] Фиш П., Бём Т., Лавенир И., Ларсон Т., Арно Дж., Форстер А., Кролик Т.Х. (декабрь 1992 г.). «Острая Т-клеточная лимфобластная лимфома, индуцированная у трансгенных мышей генами LIM-домена RBTN1 и RBTN2». Онкоген. 7 (12): 2389–97. PMID 1461647.

[entrez-9] EntrezGene 4005

[10] Abraham BJ, Hnisz D, Weintraub AS, Kwiatkowski N, Li CH, Li Z и др. (Февраль 2017). «Небольшие геномные вставки образуют энхансеры, которые неправильно регулируют онкогены». Nature Communications. 8: 14385. Дои:10.1038 / ncomms14385. ЧВК 5309821. PMID 28181482.

[11] Рахман С., Магнуссен М., Леон Т.Э., Фарах Н., Ли З., Абрахам Б.Дж. и др. (Июнь 2017). «Онкоген LMO2 через соматически приобретенный неоморфный промотор в Т-клеточном остром лимфобластном лейкозе». Кровь. 129 (24): 3221–3226. Дои:10.1182 / кровь-2016-09-742148. ЧВК 5472898. PMID 28270453.

[pmid7568177-12] а ^б ^c Osada H, Grutz G, Axelson H, Forster A, Rabbitts TH (октябрь 1995 г.). «Ассоциация факторов транскрипции эритроидов: комплексы с участием белка LIM RBTN2 и белка цинкового пальца GATA1». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (21): 9585–9. Дои:10.1073 / пнас.92.21.9585. ЧВК 40846. PMID 7568177.

[pmid9129143-13] Мао С., Нил Г.А., Гурха Р.М. (апрель 1997 г.). «Т-клеточный онкоген ромботин-2 взаимодействует со связывающим ретинобластому белком 2». Онкоген. 14 (13): 1531–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1200988. PMID 9129143.

[pmid12067721-14] Bégay-Müller V, Ansieau S, Leutz A (июнь 2002 г.). «Белок Lmo2 домена LIM связывается с AF6, партнером по транслокации онкогена MLL». Письма FEBS. 521 (1–3): 36–8. Дои:10.1016 / s0014-5793 (02) 02814-4. PMID 12067721. S2CID 29461336.

[pmid7957052-15] Wadman I., Li J, Bash RO, Forster A, Osada H, Rabbitts TH, Baer R (октябрь 1994). «Специфическая ассоциация in vivo между белками bHLH и LIM, участвующими в лейкемии Т-клеток человека». Журнал EMBO. 13 (20): 4831–9. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06809.x. ЧВК 395422. PMID 7957052.

[pmid8078932-16] Валге-Арчер В.Е., Осада Х., Уоррен А.Дж., Форстер А., Ли Дж., Баер Р., Кролик Т.Х. (август 1994). «Белок LIM RBTN2 и основной белок спираль-петля-спираль TAL1 присутствуют в комплексе в эритроидных клетках». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (18): 8617–21. Дои:10.1073 / пнас.91.18.8617. ЧВК 44657. PMID 8078932.

[pmid16407974-17] Goardon N, Lambert JA, Rodriguez P, Nissaire P, Herblot S, Thibault P и др. (Январь 2006 г.). «ETO2 координирует клеточную пролиферацию и дифференцировку во время эритропоэза». Журнал EMBO. 25 (2): 357–66. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600934. ЧВК 1383517. PMID 16407974.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]