Интрон - Википедия - Intron

О препаратах на основе интерферона, используемых при лечении вирусных и онкологических заболеваний, см. Интрон А. Для альбома ЖК-звуковая система, видеть Интроны (альбом).

An интрон (за внутригенная область) любой нуклеотидная последовательность в пределах ген это удалено Сплайсинг РНК в течение созревание конечного продукта РНК.[1][2] Другими словами, интроны представляют собой некодирующие области транскрипта РНК или кодирующей его ДНК, которые удаляются путем сплайсинга перед перевод.[3][4] Слово интрон происходит от термина внутригенная область, то есть область внутри гена.[5] Период, термин интрон относится как к последовательности ДНК в гене, так и к соответствующей последовательности в РНК. стенограммы.[6] Последовательности, которые объединяются в окончательную зрелую РНК после сплайсинга РНК, являются экзоны.[7]

Интроны обнаружены в генах большинства организмов и многих вирусов и могут быть локализованы в широком спектре генов, включая те, которые генерируют белки, рибосомная РНК (рРНК) и переносить РНК (тРНК). Когда белки генерируются из генов, содержащих интрон, сплайсинг РНК происходит как часть пути процессинга РНК, который следует транскрипция и предшествует переводу.[7]

Открытие и этимология

Интроны были впервые обнаружены в генах, кодирующих белок аденовирус,[8][9] и впоследствии были идентифицированы в генах, кодирующих гены транспортной РНК и рибосомной РНК. В настоящее время известно, что интроны встречаются в большом количестве генов организмов и вирусов во всех биологических царствах.

Тот факт, что гены были разделенный или прерванный интронами был открыт независимо в 1977 г. Филипп Аллен Шарп и Ричард Дж. Робертс, для которых они разделили Нобелевская премия по физиологии и медицине в 1993 г.[10] Период, термин интрон был представлен американским биохимик Уолтер Гилберт:[5]

"Понятие цистрон [то есть ген] ... должен быть заменен единицей транскрипции, содержащей области, которые будут потеряны из зрелого мессенджера - который я предлагаю, мы называем интронами (для внутригенных областей) - чередуя с участками, которые будут экспрессироваться - экзонами. "(Гилберт 1978)

Период, термин интрон также относится к внутрицистрон, т.е. дополнительный фрагмент ДНК, возникающий внутри цистрон.[11]

Хотя интроны иногда называют промежуточные последовательности,[12] термин «промежуточная последовательность» может относиться к любому из нескольких семейств внутренних последовательностей нуклеиновых кислот, которые не присутствуют в конечном продукте гена, включая интеины, нетранслируемые последовательности (UTR ), а нуклеотиды удаляются Редактирование РНК, помимо интронов.

Распределение

Наблюдается, что частота интронов в разных геномах широко варьируется в зависимости от спектра биологических организмов. Например, интроны чрезвычайно распространены в ядерном геноме челюстных позвоночных (например, людей и мышей), где гены, кодирующие белок, почти всегда содержат несколько интронов, в то время как интроны редко встречаются в ядерных генах некоторых эукариотических микроорганизмов.[13] Например пекарские / пивные дрожжи (Saccharomyces cerevisiae). Напротив, митохондриальные геномы позвоночных животных полностью лишены интронов, тогда как у эукариотических микроорганизмов может быть много интронов.[14]

Простая иллюстрация несплайсированного предшественника мРНК с двумя интронами и тремя экзонами (вверху). После удаления интронов посредством сплайсинга последовательность зрелой мРНК готова для трансляции (внизу).

Особенно крайним случаем является Дрозофила dhc7 ген, содержащий интрон размером ≥3,6 мегабаз (МБ), для транскрипции которого требуется примерно три дня.[15][16] С другой стороны, недавнее исследование предполагает, что самая короткая известная длина интрона эукариот составляет 30 пар оснований (п.н.), принадлежащих человеческому роду. MST1L ген.[17]

Классификация

Сплайсинг всех содержащих интрон молекул РНК внешне аналогичен описанному выше. Однако различные типы интронов были идентифицированы посредством изучения структуры интронов с помощью анализа последовательности ДНК, а также генетического и биохимического анализа реакций сплайсинга РНК.

Было идентифицировано по крайней мере четыре различных класса интронов:[1]

Интроны III группы Предполагается, что это пятая семья, но мало что известно о биохимическом аппарате, который опосредует их сращивание. Они, по-видимому, связаны с интронами группы II и, возможно, с интронами сплайсосом.[18]

Сплайсосомные интроны

Смотрите также: Сплайсинг РНК § Сплайсосомный

Интроны ядерной пре-мРНК (сплайсосомные интроны) характеризуются специфическими последовательностями интронов, расположенными на границах между интронами и экзонами.[19] Эти последовательности распознаются молекулами сплайсосомной РНК, когда инициируются реакции сплайсинга.[20] Кроме того, они содержат точку ветвления, конкретную нуклеотидную последовательность около 3'-конца интрона, которая становится ковалентно связанной с 5'-концом интрона в процессе сплайсинга, образуя разветвленную (лариат) интрон. Помимо этих трех коротких консервативных элементов, интронные последовательности ядерной пре-мРНК очень вариабельны. Интроны ядерной пре-мРНК часто намного длиннее, чем окружающие их экзоны.

интроны тРНК

Интроны транспортной РНК, удаление которых зависит от белков, находятся в определенном месте внутри антикодоновой петли несплайсированных предшественников тРНК и удаляются эндонуклеазой сплайсинга тРНК. Затем экзоны связываются вместе вторым белком, лигазой сплайсинга тРНК.[21] Обратите внимание, что самосплайсинговые интроны также иногда встречаются в генах тРНК.[22]

Интроны группы I и группы II

Смотрите также: Каталитический интрон группы I и Интрон группы II

Интроны группы I и группы II обнаруживаются в генах, кодирующих белки (информационная РНК ), переносить РНК и рибосомная РНК в очень широком спектре живых организмов.,[23][24] После транскрипции в РНК интроны группы I и группы II также совершают обширные внутренние взаимодействия, которые позволяют им складываться в специфический комплекс. трехмерная архитектура. Эта сложная архитектура позволяет некоторым интронам группы I и группы II быть самосращивание, то есть содержащая интрон молекула РНК может перестроить свою собственную ковалентную структуру, чтобы точно удалить интрон и связать экзоны вместе в правильном порядке. В некоторых случаях определенные связывающие интрон белки участвуют в сплайсинге, действуя таким образом, что они помогают интрону складываться в трехмерную структуру, которая необходима для активности самосплайсинга. Интроны группы I и группы II отличаются разными наборами внутренних консервативных последовательностей и складчатых структур, а также тем фактом, что при сплайсинге молекул РНК, содержащих интроны группы II, образуются разветвленные интроны (как интроны сплайсосомных РНК), в то время как интроны группы I используют не -кодированный нуклеотид гуанозина (обычно GTP), чтобы инициировать сплайсинг, добавляя его к 5'-концу вырезанного интрона.

Биологические функции и эволюция

Хотя интроны не кодируют белковые продукты, они являются неотъемлемой частью регуляции экспрессии генов. Некоторые интроны сами кодируют функциональные РНК посредством дальнейшей обработки после сплайсинга для генерации некодирующая РНК молекулы.[25] Альтернативная сварка широко используется для генерации нескольких белков из одного гена. Кроме того, некоторые интроны играют важную роль в широком спектре функций регуляции экспрессии генов, таких как Нонсенс-опосредованный распад[26] и экспорт мРНК.[27]

Биологическое происхождение интронов неясно. После первоначального открытия интронов в генах, кодирующих белок эукариотического ядра, возникли серьезные споры о том, унаследованы ли интроны в современных организмах от общего древнего предка (так называемая гипотеза раннего интрона) или же они появились в гены сравнительно недавно в эволюционном процессе (так называемая гипотеза интронно-позднего периода). Другая теория заключается в том, что сплайсосома а интрон-экзонная структура генов является пережитком Мир РНК (гипотеза о первых интронах).[28] До сих пор ведутся серьезные споры о том, насколько верна какая из этих гипотез. В настоящее время широко распространено мнение, что интроны возникли внутри линии эукариот как эгоистичные элементы.[29]

Ранние исследования геномных последовательностей ДНК от широкого круга организмов показали, что интрон-экзонная структура гомологичных генов у разных организмов может широко варьироваться.[30] Более свежие исследования всего эукариотический геномы показали, что длина и плотность (интроны / ген) интронов значительно различаются между родственными видами. Например, в то время как геном человека содержит в среднем 8,4 интрона на ген (139 418 в геноме), одноклеточный гриб Encephalitozoon cuniculi содержит всего 0,0075 интронов / ген (15 интронов в геноме).[31] Поскольку эукариоты произошли от общего предка (общее происхождение ), во время эволюции должно было происходить значительное увеличение или уменьшение интронов.[32][33] Считается, что этот процесс подлежит отбору с тенденцией к увеличению интронов у более крупных видов из-за их меньшего размера популяции и наоборот у более мелких (особенно одноклеточных) видов.[34] Биологические факторы также влияют на то, какие гены в геноме теряют или накапливают интроны.[35][36][37]

Альтернативная сварка экзонов в гене после вырезания интрона способствует большей вариабельности белковых последовательностей, транслируемых из одного гена, что позволяет генерировать несколько родственных белков из одного гена и одного транскрипта мРНК-предшественника. Контроль альтернативного сплайсинга РНК осуществляется сложной сетью сигнальных молекул, которые отвечают на широкий спектр внутриклеточных и внеклеточных сигналов.

Интроны содержат несколько коротких последовательностей, которые важны для эффективного сплайсинга, такие как акцепторные и донорные сайты на обоих концах интрона, а также сайт точки ветвления, которые необходимы для правильного сплайсинга посредством сплайсосома. Известно, что некоторые интроны усиливают экспрессию гена, в котором они содержатся, с помощью процесса, известного как интрон-опосредованное усиление (IME).

Активно транскрибируемые регионы ДНК часто образуют R-петли которые уязвимы для Повреждение ДНК. В высокоэкспрессируемых генах дрожжей интроны ингибируют образование R-петли и возникновение повреждений ДНК.[38] Полногеномный анализ как у дрожжей, так и у людей показал, что гены, содержащие интроны, имеют пониженные уровни R-петель и снижение повреждений ДНК по сравнению с генами без интронов с аналогичной экспрессией.[38] Вставка интрона в ген, подверженный R-петле, также может подавлять образование R-петли и рекомбинация. Bonnet et al. (2017)[38] предположили, что функция интронов в поддержании генетической стабильности может объяснить их эволюционное поддержание в определенных местах, особенно в сильно экспрессируемых генах.

Адаптация к голоданию

Физическое присутствие интронов способствует устойчивости клеток к голоданию за счет усиленной интронами репрессии генов рибосомных белков в путях определения питательных веществ.[39]

Как мобильные генетические элементы

Интроны могут теряться или приобретаться с течением времени, как показали многие сравнительные исследования ортологичный гены. Последующий анализ выявил тысячи примеров событий потери и увеличения интронов, и было высказано предположение, что появление эукариот или начальные стадии эволюции эукариот связано с вторжением интронов.[40] Были идентифицированы два определяющих механизма потери интронов: потеря интрона, опосредованная обратной транскриптазой (RTMIL), и геномные делеции, которые, как известно, происходят.[41] Однако окончательные механизмы усиления интронов остаются неуловимыми и спорными. На данный момент описано по крайней мере семь механизмов увеличения интрона: транспозиция интрона, вставка транспозона, тандемная геномная дупликация, перенос интрона, усиление интрона во время восстановления двухцепочечного разрыва (DSBR), вставка интрона группы II и интронизация. Теоретически было бы проще всего установить происхождение недавно приобретенных интронов из-за отсутствия мутаций, индуцированных хозяином, но даже интроны, полученные недавно, не возникли ни в одном из вышеупомянутых механизмов. Таким образом, эти открытия поднимают вопрос о том, не могут ли предложенные механизмы усиления интронов описать механистическое происхождение многих новых интронов, потому что они не являются точными механизмами усиления интронов, или есть ли другие, еще не обнаруженные процессы, порождающие новые интроны.[42]

Считается, что при транспозиции интрона, наиболее часто предполагаемом механизме усиления интрона, сплайсированный интрон выполняет обратное сплайсинг либо в свою собственную мРНК, либо в другую мРНК в ранее не имеющем интрона положении. Эта содержащая интрон мРНК затем подвергается обратной транскрипции, и полученная содержащая интрон кДНК может затем вызывать усиление интрона посредством полной или частичной рекомбинации с исходным геномным локусом. Вставки транспозонов также могут приводить к созданию интронов. Такая вставка может интронизировать транспозон без нарушения кодирующей последовательности, когда транспозон вставляется в последовательность AGGT, что приводит к дублированию этой последовательности с каждой стороны транспозона. Пока не понятно, почему эти элементы сращиваются случайно или в результате какого-либо предпочтительного действия транспозона. При тандемной геномной дупликации из-за сходства между консенсусными донорскими и акцепторными сайтами сплайсинга, которые оба очень похожи на AGGT, тандемная геномная дупликация экзонного сегмента, несущего последовательность AGGT, генерирует два потенциальных сайта сплайсинга. При распознавании сплайсосомой последовательность между исходной и дублированной AGGT будет сплайсирована, что приведет к созданию интрона без изменения кодирующей последовательности гена. Восстановление двухцепочечных разрывов посредством негомологичного соединения концов было недавно идентифицировано как источник увеличения интронов, когда исследователи идентифицировали короткие прямые повторы, фланкирующие 43% полученных интронов у дафний.[42] Эти числа необходимо сравнить с числом консервативных интронов, фланкированных повторами в других организмах, однако для статистической значимости. Для вставки интрона группы II было высказано предположение, что ретросомнение интрона группы II в ядерный ген может вызвать недавнее усиление сплайсосомного интрона.

Предполагается, что перенос интрона приводит к увеличению интрона, когда паралог или псевдоген приобретает интрон, а затем переносит этот интрон посредством рекомбинации в место, где отсутствует интрон, в его сестринском паралоге. Интронизация - это процесс, при котором мутации создают новые интроны из ранее существовавшей экзонной последовательности. Таким образом, в отличие от других предложенных механизмов усиления интрона, этот механизм не требует вставки или генерации ДНК для создания нового интрона.[42]

Единственный гипотетический механизм недавнего увеличения интронов, не имеющий прямых доказательств, - это вставка интрона группы II, которая при демонстрации in vivo отменяет экспрессию генов.[43] Поэтому интроны группы II, вероятно, являются предполагаемыми предками сплайсосомных интронов, действуя как сайт-специфичные ретроэлементы, и больше не отвечают за усиление интронов.[44][45] Тандемная геномная дупликация - единственный предложенный механизм, подтверждающий экспериментальные данные in vivo: короткая внутригенная тандемная дупликация может вставлять новый интрон в ген, кодирующий белок, оставляя соответствующую пептидную последовательность неизменной.[46] Этот механизм также имеет обширные косвенные доказательства, подтверждающие идею о том, что тандемная геномная дупликация является превалирующим механизмом увеличения интронов. Тестирование других предложенных механизмов in vivo, в частности, увеличения интронов во время DSBR, переноса интронов и интронизации, возможно, хотя эти механизмы должны быть продемонстрированы in vivo, чтобы закрепить их как действительные механизмы увеличения интронов. Дальнейший геномный анализ, особенно когда он выполняется на уровне популяции, может затем количественно оценить относительный вклад каждого механизма, возможно, выявляя видоспецифические отклонения, которые могут пролить свет на различные скорости увеличения интронов у разных видов.[42]

Смотрите также

Структура:

Сращивание:

Функция

Другие:

Рекомендации

  1. ^ а б Альбертс, Брюс (2008). Молекулярная биология клетки. Нью-Йорк: Наука Гарланд. ISBN  978-0-8153-4105-5.
  2. ^ Страйер, Люберт; Берг, Джереми Марк; Тимочко, Джон Л. (2007). Биохимия. Сан-Франциско: W.H. Фримен. ISBN  978-0-7167-6766-4.
  3. ^ Гош, Шампа; Синха, Джитендра Кумар (2017), «Интрон», у Вонк, Дженнифер; Шекелфорд, Тодд (ред.), Энциклопедия познания и поведения животных, Springer International Publishing, стр. 1–5, Дои:10.1007/978-3-319-47829-6_70-1, ISBN  978-3-319-47829-6
  4. ^ Редакторы, Б. Д. (6 августа 2017 г.). «Интрон». Биологический словарь. Получено 1 декабря 2019.CS1 maint: дополнительный текст: список авторов (связь)
  5. ^ а б Гилберт, Уолтер (1978). «Почему гены по кусочкам». Природа. 271 (5645): 501. Bibcode:1978Натура.271..501Г. Дои:10.1038 / 271501a0. PMID  622185. S2CID  4216649.
  6. ^ Киннибург, Алан; mertz, j; Росс, Дж. (Июль 1978 г.). «Предшественник матричной РНК β-глобина мыши содержит две промежуточные последовательности РНК». Клетка. 14 (3): 681–693. Дои:10.1016/0092-8674(78)90251-9. PMID  688388. S2CID  21897383.
  7. ^ а б Левин, Бенджамин (1987). Гены (3-е изд.). Нью-Йорк: Вили. С. 159–179, 386. ISBN  0-471-83278-2. OCLC  14069165.
  8. ^ Чоу LT, Гелинас Р.Э., Брокер Т.Р., Робертс Р.Дж. (сентябрь 1977 г.). «Удивительное расположение последовательностей на 5'-концах матричной РНК аденовируса 2». Клетка. 12 (1): 1–8. Дои:10.1016/0092-8674(77)90180-5. PMID  902310. S2CID  2099968.
  9. ^ Бергет С.М., Мур С., Шарп П.А. (август 1977 г.). «Сплайсированные сегменты на 5'-конце поздней мРНК аденовируса 2». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 74 (8): 3171–5. Дои:10.1073 / pnas.74.8.3171. ЧВК  431482. PMID  269380.
  10. ^ https://www.nobelprize.org/nobel_prizes/medicine/laureates/1993/press.html
  11. ^ Tonegawa, S .; Maxam, A.M .; Тизард, Р .; Bernard, O .; Гилберт, В. (1 марта 1978 г.). «Последовательность гена зародышевой линии мыши для вариабельной области легкой цепи иммуноглобулина». Труды Национальной академии наук. 75 (3): 1485–1489. Bibcode:1978PNAS ... 75.1485T. Дои:10.1073 / пнас.75.3.1485. ISSN  0027-8424. ЧВК  411497. PMID  418414.
  12. ^ Tilghman, S.M .; Tiemeier, D.C .; Seidman, J. G .; Петерлин, Б. М .; Салливан, М .; Maizel, J. V .; Ледер, П. (1 февраля 1978 г.). «Промежуточная последовательность ДНК, идентифицированная в структурной части гена бета-глобина мыши». Труды Национальной академии наук. 75 (2): 725–729. Bibcode:1978PNAS ... 75..725T. Дои:10.1073 / пнас.75.2.725. ISSN  0027-8424. ЧВК  411329. PMID  273235.
  13. ^ Стаджич Дж. Э., Дитрих Ф. С., Рой С. В. (2007). «Сравнительный геномный анализ геномов грибов выявил предков, богатых интронами». Геном Биол. 8 (10): R223. Дои:10.1186 / gb-2007-8-10-r223. ЧВК  2246297. PMID  17949488.
  14. ^ Таанман, Ян-Виллем (1999). «Митохондриальный геном: структура, транскрипция, трансляция и репликация». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биоэнергетика. 1410 (2): 103–123. Дои:10.1016 / с0005-2728 (98) 00161-3. PMID  10076021 - через Elsevier Science Direct.
  15. ^ Толлервей, Дэвид; Касерес, Хавьер Ф (ноябрь 2000 г.). «Процессинг РНК продолжается». Клетка. 103 (5): 703–709. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00174-4. PMID  11114327.
  16. ^ Reugels, AM; Курек, Р; Ламмерманн, У; Бюнеманн, H (февраль 2000 г.). «Мега-интроны в гене динеина DhDhc7 (Y) на гетерохроматической Y-хромосоме дают начало петлям гигантских нитей в первичных сперматоцитах Drosophila hydei». Генетика. 154 (2): 759–69. ЧВК  1460963. PMID  10655227. Получено 12 декабря 2014.
  17. ^ Пиовезан, Эллисон; Каракаузи, Мария; Риччи, Марко; Стрипполи, Пьерлуиджи; Витале, Лоренца; Пеллери, Мария Кьяра (1 декабря 2015 г.). «Идентификация минимальных эукариотических интронов с помощью GeneBase, удобного инструмента для анализа банка данных NCBI Gene». ДНК исследования. 22 (6): 495–503. Дои:10.1093 / dnares / dsv028. ЧВК  4675715. PMID  26581719.
  18. ^ Copertino DW, Hallick RB (декабрь 1993 г.). «Интроны группы II и группы III твинтронов: потенциальные отношения с ядерными интронами пре-мРНК». Trends Biochem. Наука. 18 (12): 467–71. Дои:10.1016 / 0968-0004 (93) 90008-б. PMID  8108859.
  19. ^ Паджетт Р.А., Грабовски П.Дж., Конарска М.М., Зайлер С., Шарп П.А. (1986). «Сплайсинг предшественников матричной РНК». Анну. Преподобный Biochem. 55: 1119–50. Дои:10.1146 / annurev.bi.55.070186.005351. PMID  2943217.
  20. ^ Гатри С., Паттерсон Б. (1988). «Сплайсосомные мяРНК». Анну. Преподобный Жене. 22: 387–419. Дои:10.1146 / annurev.ge.22.120188.002131. PMID  2977088.
  21. ^ Грир С.Л., Пиблз С.Л., Гегенхаймер П., Абельсон Дж. (Февраль 1983 г.). «Механизм действия дрожжевой РНК-лигазы при сплайсинге тРНК». Клетка. 32 (2): 537–46. Дои:10.1016/0092-8674(83)90473-7. PMID  6297798. S2CID  44978152.
  22. ^ Рейнхольд-Гурек Б., Шуб Д.А. (май 1992 г.). «Самосплайсинговые интроны в генах тРНК широко расходящихся бактерий». Природа. 357 (6374): 173–6. Bibcode:1992Натура.357..173р. Дои:10.1038 / 357173a0. PMID  1579169. S2CID  4370160.
  23. ^ Чех TR (1990). «Самосплайсинг интронов группы I». Анну. Преподобный Biochem. 59: 543–68. Дои:10.1146 / annurev.bi.59.070190.002551. PMID  2197983.
  24. ^ Мишель Ф, Ферат Дж. Л. (1995). «Строение и активность интронов группы II». Анну. Преподобный Biochem. 64: 435–61. Дои:10.1146 / annurev.bi.64.070195.002251. PMID  7574489.
  25. ^ Рерик Д., Пракаш А., Максуини А., Шепард С.С., Федорова Л., Федоров А. (март 2011 г.). «Критическая ассоциация нкРНК с интронами». Нуклеиновые кислоты Res. 39 (6): 2357–66. Дои:10.1093 / nar / gkq1080. ЧВК  3064772. PMID  21071396.
  26. ^ Бикнелл А.А., Сеник С., Чуа Н.Н., Рот Ф.П., Мур М.Дж. (декабрь 2012 г.). «Интроны в UTR: почему мы должны перестать их игнорировать». BioEssays. 34 (12): 1025–34. Дои:10.1002 / bies.201200073. PMID  23108796. S2CID  5808466.
  27. ^ Ченик, Джан; Чуа, Хон Нянь; Чжан, Хуэй; Tarnawsky, Stefan P .; Акеф, Абдалла; Дерти, Аднан; Тасан, Мурат; Мур, Мелисса Дж .; Палаццо, Александр Ф .; Рот, Фредерик П. (2011). Снайдер, Майкл (ред.). «Геномный анализ выявляет взаимодействие между интронами 5′UTR и ядерным экспортом мРНК для секреторных и митохондриальных генов». PLOS Genetics. 7 (4): e1001366. Дои:10.1371 / journal.pgen.1001366. ISSN  1553-7404. ЧВК  3077370. PMID  21533221.
  28. ^ Пенни Д., член парламента Хёппнера, Пул А.М., Джеффарес, округ Колумбия (ноябрь 2009 г.). «Обзор теории интронов прежде всего». Журнал молекулярной эволюции. 69 (5): 527–40. Bibcode:2009JMolE..69..527P. Дои:10.1007 / s00239-009-9279-5. PMID  19777149. S2CID  22386774.
  29. ^ Кавальер-Смит, Т. (1985). «Эгоистичная ДНК и происхождение интронов». Природа. 315 (6017): 283–4. Bibcode:1985 Натур. 315..283C. Дои:10.1038 / 315283b0. PMID  2987701. S2CID  4367253.
  30. ^ Родригес-Треллес Ф., Таррио Р., Аяла Ф.Дж. (2006). «Происхождение и эволюция сплайсосомных интронов». Анну. Преподобный Жене. 40: 47–76. Дои:10.1146 / annurev.genet.40.110405.090625. PMID  17094737.
  31. ^ Мурье Т., Джеффарес, округ Колумбия (май 2003 г.). «Утрата эукариотических интронов». Наука. 300 (5624): 1393. Дои:10.1126 / science.1080559. PMID  12775832. S2CID  7235937.
  32. ^ Рой С.В., Гилберт В. (март 2006 г.). «Эволюция сплайсосомных интронов: закономерности, загадки и прогресс». Природа Обзоры Генетика. 7 (3): 211–21. Дои:10.1038 / nrg1807. PMID  16485020. S2CID  33672491.
  33. ^ de Souza SJ (июль 2003 г.). «Возникновение синтетической теории эволюции интронов». Genetica. 118 (2–3): 117–21. Дои:10.1023 / А: 1024193323397. PMID  12868602. S2CID  7539892.
  34. ^ Линч М. (апрель 2002 г.). «Эволюция интрона как популяционно-генетический процесс». Труды Национальной академии наук. 99 (9): 6118–23. Bibcode:2002PNAS ... 99.6118L. Дои:10.1073 / pnas.092595699. ЧВК  122912. PMID  11983904.
  35. ^ Джеффарес, округ Колумбия, Мурье Т., Пенни Д. (январь 2006 г.). «Биология увеличения и потери интронов». Тенденции в генетике. 22 (1): 16–22. Дои:10.1016 / j.tig.2005.10.006. PMID  16290250.
  36. ^ Джеффарес, округ Колумбия, Пенкетт С.Дж., Бэлер Дж. (Август 2008 г.). «Быстро регулируемые гены бедны интронами». Тенденции в генетике. 24 (8): 375–8. Дои:10.1016 / j.tig.2008.05.006. PMID  18586348.
  37. ^ Кастильо-Дэвис К.И., Мехедов С.Л., Хартл Д.Л., Кунин Е.В., Кондрашов Ф.А. (август 2002 г.). «Отбор коротких интронов в высоко экспрессируемых генах». Природа Генетика. 31 (4): 415–8. Дои:10,1038 / ng940. PMID  12134150. S2CID  9057609.
  38. ^ а б c Боннет А, Гросу А.Р., Элькаутари А., Колено Е., Пресли А, Шридхара С.К., Джанбон Г., Гели В., де Алмейда С.Ф., Паланкаде Б (2017). «Интроны защищают геномы эукариот от генетической нестабильности, связанной с транскрипцией». Мол. Клетка. 67 (4): 608–621.e6. Дои:10.1016 / j.molcel.2017.07.002. PMID  28757210.
  39. ^ Паренто, Жюли; Меньон, Лорин; Бертумье, Мелоди; Катала, Матьё; Ганьон, Ванесса; Абу Элела, Шериф (16 января 2019 г.). «Интроны - медиаторы реакции клеток на голодание». Природа. 565 (7741): 612–617. Bibcode:2019Натура.565..612P. Дои:10.1038 / s41586-018-0859-7. ISSN  1476-4687. PMID  30651641. S2CID  58014466.
  40. ^ Рогозин, И. Б .; Carmel, L .; Csuros, M .; Кунин, Э. В. (2012). «Происхождение и эволюция сплайсосомных интронов». Биология Директ. 7: 11. Дои:10.1186/1745-6150-7-11. ЧВК  3488318. PMID  22507701.
  41. ^ Derr, L.K .; Стрэтерн, Дж. Н. (1993). «Роль обратных транскриптов в конверсии генов». Природа. 361 (6408): 170–173. Bibcode:1993Натура.361..170D. Дои:10.1038 / 361170a0. PMID  8380627. S2CID  4364102.
  42. ^ а б c d Yenerall, P .; Чжоу, Л. (2012). «Выявление механизмов усиления интронов: прогресс и тенденции». Биология Директ. 7: 29. Дои:10.1186/1745-6150-7-29. ЧВК  3443670. PMID  22963364.
  43. ^ Chalamcharla, V. R .; Curcio, M. J .; Белфорт, М. (2010). «Ядерная экспрессия интрона группы II согласуется со сплайсосомным происхождением интрона». Гены и развитие. 24 (8): 827–836. Дои:10.1101 / gad.1905010. ЧВК  2854396. PMID  20351053.
  44. ^ Чех, Т. Р. (1986). «Общность самосплайсинга РНК: отношение к ядерному сплайсингу мРНК». Клетка. 44 (2): 207–210. Дои:10.1016/0092-8674(86)90751-8. PMID  2417724. S2CID  11652546.
  45. ^ Диксон, Л .; Huang, H. -R .; Liu, L .; Мацуура, М .; Lambowitz, A.M .; Перлман, П. С. (2001). «Ретротранспозиция интрона группы II дрожжей происходит путем обратного сплайсинга непосредственно в эктопические участки ДНК». Труды Национальной академии наук. 98 (23): 13207–13212. Bibcode:2001PNAS ... 9813207D. Дои:10.1073 / pnas.231494498. ЧВК  60849. PMID  11687644.
  46. ^ Hellsten, U .; Aspden, J. L .; Rio, D.C .; Рохсар, Д. С. (2011). «Сегментарная дупликация генома порождает функциональный интрон». Nature Communications. 2: 454–. Bibcode:2011NatCo ... 2..454H. Дои:10.1038 / ncomms1461. ЧВК  3265369. PMID  21878908.

внешняя ссылка