Полинуклеотид аденилилтрансфераза - Polynucleotide adenylyltransferase
| полинуклеотид-аденилилтрансфераза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 2.7.7.19 | ||||||||
| Количество CAS | 9026-30-6 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
В энзимология, а полинуклеотид-аденилилтрансфераза (EC 2.7.7.19 ) является фермент это катализирует то химическая реакция
- АТФ + РНК-3'OH пирофосфат + RNApA-3'OH
Таким образом, два субстраты этого фермента АТФ и РНК, а его два продукты находятся пирофосфат и РНК с дополнительным аденозин нуклеотид на его 3'-конце.
Именование
Этот фермент принадлежит к семейству трансферазы, особенно те, которые переносят фосфорсодержащие нуклеотид группы (нуклеотидилтрансферазы ). В систематическое название этого класса ферментов АТФ: полинуклеотид-аденилилтрансфераза.
Другие широко используемые имена включают:
- Полимераза NTP
- Фермент аденилирования РНК
- AMP полинуклеотидилексотрансфераза
- АТФ-полинуклеотид-аденилилтрансфераза
- АТФ: полинуклеотидиллексотрансфераза
- Поли (А) полимераза
- Поли (А) синтетаза
- Полиаденилат нуклеотидилтрансфераза
- Полиаденилат-полимераза
- Полиаденилатсинтетаза
- Полимераза полиадениловой кислоты
- Полиадениловая полимераза
- Терминальная рибоаденилаттрансфераза
- Поли (А) гидролаза
- Факторы образования РНК
- PF1
- Аденозинтрифосфат: аденилилтрансфераза рибонуклеиновой кислоты
Функция
Этот фермент отвечает за добавление 3' полиадениновый хвост к вновь синтезированному пре-информационная РНК (пре-мРНК) молекула в процессе транскрипция гена. Белок - последняя добавка к большому белковый комплекс который также содержит более мелкие сборки, известные как фактор специфичности расщепления и полиаденилирования (CPSF) и фактор стимуляции расщепления (CtSF) и его связывание является необходимой предпосылкой для расщепления 3'-конца пре-мРНК. После расщепления 3'-сигнальной области, которая управляет сборкой комплекса, полиаденилатполимераза (PAP) добавляет полиадениновый хвост к новому 3'-концу.
Скорость, с которой PAP добавляет аденин нуклеотиды зависит от наличия другого регуляторного белка, PABPII (полиаденин-связывающий белок II). Первые несколько нуклеотидов, добавленных PAP, добавляются очень медленно, но короткий полиадениновый хвост затем связывается PABPII, что увеличивает скорость добавления аденина с помощью PAP. Последний хвост составляет около 200-250 адениновых нуклеотидов.
PAP - это фосфорилированный от фактор, способствующий митозу, ключевой регулятор клеточный цикл. Высокий уровень фосфорилирования снижает активность PAP.
Структурные исследования
На конец 2007 г. структуры были решены для этого класса ферментов, с PDB коды доступа 1AV6, 1B42, 1BKY, 1EAM, 1EQA, 1F5A, 1FA0, 1JSZ, 1JTE, 1JTF, 1П39, 1Q78, 1 квартал 79, 1V39, 1VFG, 1VP3, 1VP9, 1VPT, 2GA9, 2GAF, 2 л.с., 2O1P, 2Q66, 2VP3, 3MAG, 3MCT, и 4DCG.
использованная литература
- Август Дж. Т., Ортис П. Дж., Гурвиц Дж. (Декабрь 1962 г.). «Рибонуклеиновая кислота-зависимое включение рибонуклеотидов. I. Очистка и свойства фермента». J. Biol. Chem. 237: 3786–93. PMID 13965521.
- Эдмондс М., Абрамс Р. (1960). «Биосинтез полинуклеотидов: образование последовательности аденилатных единиц из аденозинтрифосфата ферментом из ядер тимуса». J. Biol. Chem. 235 (4): 1142–1149.
- Готтесман М.Э., Канеллакис Е.С. (1966). «Концевые нуклеотидилтрансферазы ядер тимуса теленка». J. Biol. Chem. 241 (19): 4339–52. PMID 4288534.
- Krakow Js; Coutsogeorgopoulos C; Канеллакис ES (1962). «Исследования по включению дезоксирибонуклеиновой кислоты». Биохим. Биофиз. Acta. 55 (5): 639–50. Дои:10.1016/0006-3002(62)90842-9. PMID 14459258.
- Ман Р.Дж., Уолтер Т.Дж. (1971). «Трансферная РНК-праймированная синтез олигоаденилата в проростках кукурузы. II. Специфичность праймера, субстрата и металла и размер продукта». Биохим. Биофиз. Acta. 247 (1): 113–21. Дои:10.1016/0005-2787(71)90814-8. PMID 4946277.
- Шелдон Р., Джураль С., Кейтс Дж. (1972). «Обнаружение последовательностей полиадениловой кислоты в вирусной и эукариотической РНК (поли (U) -целлюлозные колонки-поли (U) фильтры-стекловолокно-клетки HeLa-бактериофаг Т4)». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 69 (2): 417–21. Дои:10.1073 / pnas.69.2.417. ЧВК 426470. PMID 4501121.
- Колган Д.Ф., Мурти К.Г., Привес С., Мэнли Дж. Л. (ноябрь 1996 г.). «Связанная с клеточным циклом регуляция поли (А) полимеразы путем фосфорилирования». Природа. 384 (6606): 282–5. Bibcode:1996Натура 384..282C. Дои:10.1038 / 384282a0. PMID 8918882. S2CID 4304275.
