ДНК-полимераза эпсилон - Википедия - DNA polymerase epsilon

ДНК-направленная ДНК-полимераза
Идентификаторы
Номер ЕС2.7.7.7
Количество CAS9012-90-2
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum

ДНК-полимераза эпсилон является членом ДНК-полимераза семейство ферментов, обнаруженных в эукариоты. Он состоит из следующих четырех подразделений: СТОЛБ (центральный каталитический блок), ПОЛЮС 2 (субъединица 2), ПОЛЮС 3 (субъединица 3) и ПОЛЮС 4 (субъединица 4). Последние данные свидетельствуют о том, что он играет важную роль в ведущая нить Синтез ДНК и нуклеотид и базовая эксцизионная пластика.[1][2]

Исследования были проведены для изучения синтеза ДНК с эксцизионной репарацией нуклеотидов с помощью ДНК-полимеразы эпсилон в присутствии PCNA (ядерный антиген пролиферирующих клеток), RFC (фактор репликации C) и RPA (белок репликации А). Либо ДНК-полимераза эпсилон, либо ДНК-полимераза дельта вместе с ДНК-лигаза может использоваться для восстановления поврежденной ультрафиолетом ДНК. Однако обнаружено, что дельта ДНК-полимеразы требует присутствия как RFC, так и PCNA для восстановления ДНК. Кроме того, он производит только небольшое количество фракционированных продуктов с лигированием ДНК. ДНК-полимераза эпсилон оказалась наиболее подходящей для эксцизионной репарации нуклеотидов. ДНК-полимераза эпсилон не зависит ни от PCNA, ни от RFC и производит в основном лигированные продукты ДНК. Также обнаружено, что при одном условии, когда ДНК-полимераза эпсилон требует PCNA и RFC: эксцизионная репарация нуклеотидов в присутствии однонитевого связывающего белка RPA. PCNA и RFC действуют как якорь и направляют эпсилон-ДНК-полимеразу на матрицу ДНК.[3]

Рекомендации

  1. ^ Джонсон Р. Э., Классен Р., Пракаш Л., Пракаш С. (июль 2015 г.). «Основная роль ДНК-полимеразы δ в репликации как ведущих, так и отстающих нитей ДНК». Молекулярная клетка. 59 (2): 163–175. Дои:10.1016 / j.molcel.2015.05.038. ЧВК  4517859. PMID  26145172.
  2. ^ Lujan SA, Williams JS, Kunkel TA (сентябрь 2016 г.). «ДНК-полимеразы разделяют труд репликации генома». Тенденции в клеточной биологии. 26 (9): 640–54. Дои:10.1016 / j.tcb.2016.04.012. ЧВК  4993630. PMID  27262731.
  3. ^ Шивджи М.К., Подуст В.Н., Хюбшер У., Вуд Р.Д. (апрель 1995 г.). «Синтез ДНК эксцизионной репарации нуклеотидов с помощью ДНК-полимеразы эпсилон в присутствии PCNA, RFC и RPA». Биохимия. 34 (15): 5011–7. Дои:10.1021 / bi00015a012. PMID  7711023.