Компонент теломеразной РНК - Telomerase RNA component

TERC
PDB 1ymo EBI.png
Идентификаторы
ПсевдонимыTERC, DKCA1, PFBMFT2, SCARNA19, TR, TRC3, hTR, компонент теломеразной РНК
Внешние идентификаторыOMIM: 602322 Генные карты: TERC
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

н / д

н / д

RefSeq (белок)

н / д

н / д

Расположение (UCSC)н / дн / д
PubMed поиск[1]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
РНК теломеразы позвоночных
RF00024.jpg
Идентификаторы
СимволТеломераза-верт
РфамRF00024
Прочие данные
РНК типГен
Домен (ы)Эукариот; Вирус
PDB структурыPDBe
РНК теломеразы ресничек
RF00025.jpg
Идентификаторы
СимволТеломераза-цил
РфамRF00025
Прочие данные
РНК типГен
Домен (ы)Эукариот
PDB структурыPDBe
РНК теломеразы Saccharomyces cerevisiae
RF01050.png
Идентификаторы
СимволSacc_telomerase
РфамRF01050
Прочие данные
РНК типГен
Домен (ы)Эукариот
PDB структурыPDBe

Компонент теломеразной РНК, также известный как TR, TER или TERC, является нкРНК нашел в эукариоты это компонент теломераза, фермент, используемый для увеличения теломеры.[2][3] TERC служит шаблоном для теломер репликация (обратная транскрипция ) теломеразой. Теломеразные РНК сильно различаются по последовательности и структуре у позвоночных, инфузорий и дрожжей, но они имеют общий 5' псевдоузел структура близка к шаблонной последовательности. РНК теломеразы позвоночных имеют 3 ' H / ACA snoRNA -подобный домен.[4][5][6]

Структура

TERC - это Длинная некодирующая РНК (lncRNA) длиной от ~ 150 нт у инфузорий до 400-600 нт у позвоночных и 1300 нт у дрожжей (Алнафах). Зрелый человеческий TERC (hTR) имеет длину 451 н.[7] TERC имеет обширные вторичные структурные особенности более 4 основных консервативных доменов.[8] Основной домен, самый большой домен на 5 ’конце TERC, содержит CUAAC Теломер последовательность шаблона. Его вторичная структура состоит из большой петли, содержащей матричную последовательность, спирали, замыкающей петлю P1, и P2 / P3 псевдоузел.[9] Основной домен и консервативный домен CR4 / CR5 ассоциируются с TERT, и являются единственными доменами TERC, необходимыми для каталитической активности теломеразы in vitro.[10] 3 ’конец TERC состоит из консервативного домена H / ACA,[9] структура из 2 шпилек, соединенных однонитевым шарниром и окаймленных на 3 ’конце однонитевой последовательностью АСА.[7] Домен H / ACA связывает Дискерин, GAR1, NOP10, NHP2, чтобы сформировать H / ACA RNP сложный.[9] Консервативный домен CR7 также локализован на 3 ’конце TERC и содержит 3nt CAB (Тело Кахала Локализация), который связывает TCAB1.[9]

Иллюстрация: hTR и ассоциированные белки теломеразного комплекса

Функция

Теломераза - это рибонуклеопротеиновая полимераза, которая поддерживает концы теломер за счет добавления теломерного повтора TTAGGG. Это повторение различается в зависимости от эукариоты (см. таблицу на теломер статью для полного списка). Фермент состоит из белкового компонента (TERT ) с обратная транскриптаза активность и компонент РНК, кодируемый этим геном, который служит шаблоном для теломерного повтора. CCCUAA, обнаруженный около позиции 50 последовательности TERC позвоночных, действует как матрица. Экспрессия теломеразы играет роль в клеточном старение, поскольку это обычно подавляется в послеродовой период соматические клетки в результате прогрессирующего укорачивания теломер. Нарушение регуляции экспрессии теломеразы в соматических клетках может быть вовлечено в онкогенез. Исследования на мышах показывают, что теломераза также участвует в хромосомный ремонт, поскольку de novo синтез теломерных повторов могут встречаться двухцепочечные разрывы.[11] Гомологи TERC также можно найти в Вирусы галлидного герпеса.[12]

Основной домен TERC содержит РНК шаблон, из которого TERT синтезирует теломерные повторы TTAGGG.[9] В отличие от других RNP, в теломераза, белок TERT является каталитическим, в то время как днРНК TERC является структурным, а не действует как рибозим.[13] Основной регион TERC и TERT достаточны для восстановления каталитической активности теломеразы in vitro.[9][10] Домен H / ACA TERC принимает на работу Дискерин сложный (DKC1, GAR1, NOP10, NHP2 ), который стабилизирует TERC, увеличивая образование комплекса теломеразы и общую каталитическую активность.[9] Домен CR7 связывает TCAB1, который локализует теломеразу в кахальные тела, дополнительно увеличивая каталитическую активность теломеразы.[9] TERC экспрессируется повсеместно, даже в клетках, лишенных теломеразной активности и экспрессии TERT.[14] В результате были предложены различные независимые от TERT функциональные роли TERC. 14 гены содержащие мотив связывания TERC, непосредственно транскрипционно регулируемый с помощью TERC посредством увеличения экспрессии, опосредованного образованием триплекса РНК-ДНК. TERC-опосредованная активация Lin37, Trpg1l, Tyrobp, УСП16 стимулирует NF-κB пути, что приводит к увеличению экспрессии и секреции воспалительных цитокины.[15]

Биосинтез

В отличие от большинства днРНК которые собраны из интроны посредством сплайсосома, hTR напрямую записано из специального промоутерский сайт[7] расположен в геномном локусе 3q26.2[16] к РНК-полимераза II.[7] Зрелый hTR имеет длину 451nt, но примерно 1/3 клеточных транскриптов hTR в устойчивом состоянии имеют ~ 10nt геномно кодируемых 3 ’хвостов. Большинство этих удлиненных видов hTR имеют дополнительное удлинение олиго-A 3 ’.[7] Обработка незрелого 3’-хвостового hTR до зрелого 451nt hTR может быть выполнена прямым 3’-5 ’ эксорибонуклеолитический деградация или косвенный путь олигоаденилирования с помощью PAPD5, удаление 3’-олиго-A-хвоста экзонуклеазой 3’-5 ’РНК ПАРН и последующее 3’-5 ’экзорибонуклеолитическое разложение.[7] Расширенные транскрипты hTR также расщепляются РНК. экзосома.[7]

5’-концы транскриптов hTR также дополнительно процессируются. ТГС-1 гиперметилирование то 5'-метилгуанозиновый кэп к кэпу N2,2,7 триметилгуанозина (TMG), который ингибирует созревание hTR.[17] Связывание Дискерин комплекс с транскрибируемыми доменами H / ACA hTR во время транскрипции способствует прекращению транскрипции.[7] Контроль относительной скорости этих различных конкурирующих путей, которые активируют или ингибируют созревание hTR, является важным элементом регуляции общей активности теломеразы.

Клиническое значение

Потеря функции мутации в геномном локусе TERC были связаны с множеством дегенеративные заболевания. Мутации в TERC были связаны с врожденный дискератоз,[18] идиопатический фиброз легких,[19] апластическая анемия, и миелодисплазия.[9] Сверхэкспрессия и неправильное регулирование TERC были связаны с множеством раки. Повышенная регуляция hTR широко наблюдается у пациентов с предраковым фенотипом шейки матки в результате ВПЧ инфекционное заболевание.[20] Сверхэкспрессия TERC усиливает MDV -опосредованный онкогенез,[21] и наблюдается в рак желудка.[22] Сверхэкспрессия TERC также наблюдается в воспалительный такие условия как Сахарный диабет II типа и рассеянный склероз из-за TERC-опосредованной активации NF-κB воспалительный путь.[15]

TERC использовался как защитный остеопороз, с его повышенной экспрессией, задерживающей скорость остеогенез.[23] Из-за его сверхэкспрессии в ряде фенотипов рака, TERC был исследован как потенциальный биомаркер рака. Было обнаружено, что он является эффективным биомаркером плоскоклеточный рак легкого (LUSC).[24]

Рекомендации

  1. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  2. ^ Фенг Дж., Фанк В.Д., Ван СС, Вайнрих С.Л., Авилион А.А., Чиу С.П. и др. (Сентябрь 1995 г.). «РНК-компонент теломеразы человека». Наука. 269 (5228): 1236–41. Bibcode:1995Научный ... 269.1236F. Дои:10.1126 / science.7544491. PMID  7544491. S2CID  9440710.
  3. ^ Джади Б. Э., Ричард П., Бертран Э., Поцелуй Т. (февраль 2006 г.). «Зависимое от клеточного цикла рекрутирование теломеразной РНК и тел Кахала на теломеры человека». Молекулярная биология клетки. 17 (2): 944–54. Дои:10.1091 / mbc.E05-09-0904. ЧВК  1356602. PMID  16319170.
  4. ^ Маккормик-Грэм М., Ромеро Д.П. (апрель 1995 г.). «Структурные особенности теломеразной РНК ресничек». Исследования нуклеиновых кислот. 23 (7): 1091–7. Дои:10.1093 / nar / 23.7.1091. ЧВК  306816. PMID  7739888.
  5. ^ Лингнер Дж., Хендрик Л.Л., Чех Т.Р. (август 1994 г.). «Теломеразные РНК разных инфузорий имеют общую вторичную структуру и пермутированную матрицу». Гены и развитие. 8 (16): 1984–98. Дои:10.1101 / гад.8.16.1984. PMID  7958872.
  6. ^ Theimer CA, Feigon J (июнь 2006 г.). «Структура и функции теломеразной РНК». Текущее мнение в структурной биологии. 16 (3): 307–18. Дои:10.1016 / j.sbi.2006.05.005. PMID  16713250.
  7. ^ а б c d е ж грамм час Roake CM, Chen L, Chakravarthy AL, Ferrell JE, Raffa GD, Artandi SE (май 2019 г.). «Нарушение кинетики созревания теломеразной РНК вызывает болезнь». Молекулярная клетка. 74 (4): 688–700.e3. Дои:10.1016 / j.molcel.2019.02.033. ЧВК  6525023. PMID  30930056.
  8. ^ Алнафах Р.А., Адишеш М., Баттон L, Сарецки Г., Хапангама, Д.К. (2019). «Теломераза и теломеры при раке эндометрия». Границы онкологии. 9: 344. Дои:10.3389 / fonc.2019.00344. ЧВК  6533802. PMID  31157162.
  9. ^ а б c d е ж грамм час я Чжан К., Ким Н.К., Фейгон Дж. (Декабрь 2011 г.). «Архитектура теломеразной РНК человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 108 (51): 20325–32. Bibcode:2011PNAS..10820325Z. Дои:10.1073 / pnas.1100279108. ЧВК  3251123. PMID  21844345.
  10. ^ а б Уэбб С.Дж., Закян В.А. (август 2016 г.). «Теломеразная РНК - это больше, чем матрица ДНК». РНК Биология. 13 (8): 683–9. Дои:10.1080/15476286.2016.1191725. ЧВК  4993324. PMID  27245259.
  11. ^ "Entrez Gene: компонент теломеразной РНК TERC".
  12. ^ Fragnet L, Kut E, Rasschaert D (июнь 2005 г.). «Сравнительное функциональное исследование теломеразной РНК вируса на основе естественных мутаций». Журнал биологической химии. 280 (25): 23502–15. Дои:10.1074 / jbc.M501163200. PMID  15811851. S2CID  24301693.
  13. ^ Ван И, Сушак Л., Фейгон Дж. (Декабрь 2019 г.). «Структурная биология теломеразы». Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии. 11 (12): a032383. Дои:10.1101 / cshperspect.a032383. ЧВК  6886448. PMID  31451513.
  14. ^ Шей Дж. У., Райт В. Е. (май 2019 г.). «Теломеры и теломераза: три десятилетия прогресса». Природа Обзоры Генетика. 20 (5): 299–309. Дои:10.1038 / s41576-019-0099-1. PMID  30760854. S2CID  61156603.
  15. ^ а б Лю Х, Ян Й, Гэ И, Лю Дж, Чжао И (сентябрь 2019 г.). «TERC способствует клеточному воспалительному ответу независимо от теломеразы». Исследования нуклеиновых кислот. 47 (15): 8084–8095. Дои:10.1093 / нар / gkz584. ЧВК  6735767. PMID  31294790.
  16. ^ "Запись OMIM - * 602322 - КОМПОНЕНТ РНК ТЕЛОМЕРАЗЫ; TERC". www.omim.org. Получено 2020-03-02.
  17. ^ Чен Л., Роак С.М., Галати А., Бавассо Ф., Микели Э., Саджо I и др. (Февраль 2020 г.). «Потеря человеческой TGS1-гиперметилазы способствует увеличению теломеразной РНК и удлинению теломер». Отчеты по ячейкам. 30 (5): 1358–1372.e5. Дои:10.1016 / j.celrep.2020.01.004. ЧВК  7156301. PMID  32023455.
  18. ^ Rich RR (13.01.2018). Клиническая иммунология: принципы и практика (Пятое изд.). [Св. Луи, Миссури] ISBN  978-0-7020-7039-6. OCLC  1023865227.
  19. ^ Свигрис Дж.Дж., Браун К.К. (25.07.2018). Идиопатический фиброз легких. Святой Луи. ISBN  978-0-323-54432-0. OCLC  1053744041.
  20. ^ Лю И, Фан П, Ян И, Сюй Ц, Хуанг И, Ли Д. и др. (Ноябрь 2019 г.). «Вирус папилломы человека и ген компонента РНК теломеразы человека в прогрессировании рака шейки матки». Научные отчеты. 9 (1): 15926. Bibcode:2019НатСР ... 915926Л. Дои:10.1038 / s41598-019-52195-5. ЧВК  6828729. PMID  31685833.
  21. ^ Kheimar A, Trimpert J, Groenke N, Kaufer BB (март 2019 г.). «Сверхэкспрессия клеточной теломеразной РНК усиливает индуцированное вирусом образование рака». Онкоген. 38 (10): 1778–1786. Дои:10.1038 / s41388-018-0544-1. PMID  30846849. S2CID  53085869.
  22. ^ Хайне Б., Хаммель М., Демель Г., Штейн Х (июнь 1998 г.). «Демонстрация постоянной активации компонента теломеразной РНК в карциномах желудка человека с использованием гибридизации in situ». Журнал патологии. 185 (2): 139–44. Дои:10.1002 / (SICI) 1096-9896 (199806) 185: 2 <139 :: AID-PATH79> 3.0.CO; 2-L. PMID  9713339.
  23. ^ Гао ГК, Ян Д.В., Лю В. (январь 2020 г.). «LncRNA TERC облегчает прогрессирование остеопороза, поглощая miRNA-217, чтобы активировать RUNX2». Европейский обзор медицинских и фармакологических наук. 24 (2): 526–534. Дои:10.26355 / eurrev_202001_20029. PMID  32016954.
  24. ^ Storti CB, de Oliveira RA, de Carvalho M, Hasimoto EN, Cataneo DC, Cataneo AJ, et al. (Февраль 2020 г.). «Теломерные гены и теломерные днРНК являются кандидатами в биомаркеры плоскоклеточного рака легких (LUSC)». Экспериментальная и молекулярная патология. 112: 104354. Дои:10.1016 / j.yexmp.2019.104354. PMID  31837325.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка