Альфа-каталитическая субъединица ДНК-полимеразы - Википедия - DNA polymerase alpha catalytic subunit
Альфа-каталитическая субъединица ДНК-полимеразы является фермент что у людей кодируется POLA1 ген.[5]
Функция
Этот ген кодирует каталитическую субъединицу p180 ДНК-полимеразы α-примазы. Pol α имеет ограниченное процессивность и не хватает 3 ′ экзонуклеаза деятельность по исправлению ошибок. Таким образом, он не очень подходит для эффективного и точного копирования длинных шаблонов (в отличие от Pol Delta и Epsilon). Вместо этого он играет более ограниченную роль в репликации. Pol α отвечает за инициацию репликации ДНК в источниках репликации (как на ведущей, так и на отстающей цепи) и во время синтеза Фрагменты Окадзаки на отстающей пряди. Комплекс Pol α (комплекс pol α-ДНК-примаза) состоит из четырех субъединиц: каталитической субъединицы POLA1, регуляторной субъединицы POLA2, а также малая и большая субъединицы примазы PRIM1 и PRIM2 соответственно. Как только примаза создала праймер РНК, Pol α начинает репликацию, удлиняя праймер примерно на 20 нуклеотидов.
Клиническое значение
Помимо своей роли во время репликации ДНК, POLA1 играет роль в активации интерферона I типа. Ген POLA1 оказался местом мутации, приводящей к Х-сцепленное ретикулярное пигментное расстройство (XLPDR), OMIM 301220 ). Это приводит к измененному сплайсингу мРНК и снижению экспрессии белка POLA1 до уровня, который не нарушает репликацию ДНК. Снижение экспрессии POLA1 сопровождается заметным снижением цитозольной РНК: гибридных молекул ДНК и сопутствующей гиперактивацией пути IRF3 с последующей гиперпродукцией интерферонов типа I.[6]
Более того, дефицит POLA1, типичный для XLPDR, также ухудшает прямую цитотоксичность NK-клеток. Ингибирование POLA1 или естественный дефицит (XLPDR) влияет на то, как литические гранулы секретируются в направлении клеток-мишеней. В результате NK-клетки у пациентов с XLPDR обнаруживают функциональную недостаточность. Интересно, что дефицит POLA1, типичный для XLPDR, не связан с какими-либо геномными повреждениями или остановкой клеточного цикла.[7][8]
В то время как мутация XLPDR находится в 13-м интроне, были также описаны другие соматические мутации в POLA1. Соматические мутации связаны с более глубоким дефицитом POLA1, который перерастает в Х-сцепленную интеллектуальную инвалидность (XLID). В случае мутаций, не относящихся к XLPDR, пациенты, помимо характерных для интерферона I типа, также проявляют признаки умственной отсталости от легкой до средней степени, остановку клеточного цикла, пропорциональный низкий рост, микроцефалия и гипогонадизм.[9]
Взаимодействия
Было показано, что ДНК-зависимая полимераза альфа (Pol α) взаимодействовать с MCM4 и GINS1,[7] Белок ретинобластомы,[10] PARP1[11][12] и RBMS1.[13]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101868 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000006678 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ген Entrez: полимераза POLA1 (ДНК-направленная), альфа-1».
- ^ Старокадомский П., Джемелли Т., Риос Дж.Дж., Син Си, Ван Р.С., Ли Х., Покатаев В., Дозморов И., Хан С., Мията Н., Фрайле Дж., Радж П., Сюй З, Сюй З, Ма Л., Линь З, Ван Х , Ян Й., Бен-Амитаи Д., Оренштейн Н., Муссаффи Х., Базельга Е., Тадини Г., Грюнебаум Е., Сараджлия А., Кшевски К., Вакеланд Е. К., Ян Н., де ла Морена М. Т., Зинн А. Р., Бурштейн Е. (2016). «ДНК-полимераза-α регулирует активацию интерферонов типа I через цитозольную РНК: синтез ДНК». Иммунология природы. 17 (5): 495–504. Дои:10.1038 / ni.3409. ЧВК 4836962. PMID 27019227.
- ^ а б Старокадомский, Петр; Уилтон, Кейтлинн М .; Кшевский, Конрад; Лопес, Адам; Сифуэнтес-Домингес, Луис; Оверли, Бретань; Чен, Цин; Рэй, Энн; Гиль-Кшевска, Александра; Петерсон, Мэри; Кинч, Лиза Н. (2019-11-01). «Дефекты NK-клеток при Х-сцепленном расстройстве пигментной сети». JCI Insight. 4 (21). Дои:10.1172 / jci.insight.125688. ISSN 0021-9738. ЧВК 6948767. PMID 31672938.
- ^ Старокадомский, П .; Sifuentes-Dominguez, L .; Gemelli, T .; Zinn, A. R .; Dossi, M. T .; Mellado, C .; Bertrand, P .; Борзуцкий, А .; Бурштейн, Э. (ноябрь 2017 г.). «Эволюция кожных проявлений Х-хромосомного пигментного ретикулята». Британский журнал дерматологии. 177 (5): e200 – e201. Дои:10.1111 / bjd.15586. ISSN 0007-0963. ЧВК 5640471. PMID 28407217.
- ^ Ван Эш Х, Колнаги Р., Фресон К., Старокадомский П., Занкл А., Бэккс Л., Абрамович И., Аутвин Е., Рохена Л., Фолкнер С., Леонг GM, Ньюбери-Экоб Р. А., Чаллис Р. К., Лунап К., Яекен Дж., Сюнтьенс Э. , Девриендт К., Бурштейн Э, Лоу К.Дж., О'Дрисколл М. (апрель 2019 г.). «Дефектная ДНК-полимераза α-примаза приводит к Х-связанной умственной отсталости, связанной с серьезной задержкой роста, микроцефалией и гипогонадизмом». Американский журнал генетики человека. 104 (5): 957–967. Дои:10.1016 / j.ajhg.2019.03.006. ЧВК 6506757. PMID 31006512.
- ^ Такемура М., Китагава Т., Изута С., Васа Дж., Такай А., Акияма Т., Ёсида С. (ноябрь 1997 г.). «Фосфорилированный белок ретинобластомы стимулирует ДНК-полимеразу альфа». Онкоген. 15 (20): 2483–92. Дои:10.1038 / sj.onc.1201431. PMID 9395244.
- ^ Dantzer F, Nasheuer HP, Vonesch JL, de Murcia G, Ménissier-de Murcia J (апрель 1998 г.). «Функциональная ассоциация поли (АДФ-рибоза) полимеразы с альфа-примазным комплексом ДНК-полимеразы: связь между обнаружением разрыва цепи ДНК и репликацией ДНК». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (8): 1891–8. Дои:10.1093 / nar / 26.8.1891. ЧВК 147507. PMID 9518481.
- ^ Симбулан С.М., Сузуки М., Изута С., Сакураи Т., Савойский Е., Кодзима К., Мияхара К., Шизута Ю., Йошида С. (январь 1993 г.). «Поли (АДФ-рибоза-полимераза стимулирует ДНК-полимеразу альфа за счет физической ассоциации»). J. Biol. Chem. 268 (1): 93–99. PMID 8416979.
- ^ Ники Т., Галли I, Арига Х, Игучи-Арига С.М. (июнь 2000 г.). «MSSP, белок, связывающийся с точкой начала репликации в гене c-myc, взаимодействует с каталитической субъединицей ДНК-полимеразы альфа и стимулирует ее полимеразную активность». FEBS Lett. 475 (3): 209–12. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01679-3. PMID 10869558.
внешняя ссылка
- PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для каталитической субъединицы альфа-полимеразы ДНК человека
дальнейшее чтение
- Поллок С., Ступель Дж., Бауэршмидт С., Креммер Э., Нашойер HP (2003). «Регулирование репликации эукариотической ДНК на стадии инициации». Biochem. Soc. Транс. 31 (Пт 1): 266–9. Дои:10.1042 / BST0310266. PMID 12546699.
- Фишер П.А., Корн Д. (1977). «ДНК-полимераза-альфа. Очистка и структурная характеристика близкого к гомогенному ферменту из человеческих клеток KB». J. Biol. Chem. 252 (18): 6528–35. PMID 893425.
- Дорнрайтер I, Эрдил Л.Ф., Гилберт И.Ю., фон Винклер Д., Келли Т.Дж., Фаннинг Э. (1992). «Взаимодействие ДНК-полимеразы альфа-примазы с клеточным белком репликации А и Т-антигеном SV40». EMBO J. 11 (2): 769–76. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05110.x. ЧВК 556510. PMID 1311258.
- Коверли Д., Кенни М.К., Лейн Д.П., Вуд Р.Д. (1992). «Роль человеческого одноцепочечного ДНК-связывающего белка HSSB / RPA на ранней стадии эксцизионной репарации нуклеотидов». Нуклеиновые кислоты Res. 20 (15): 3873–80. Дои:10.1093 / nar / 20.15.3873. ЧВК 334061. PMID 1508673.
- Попанда О., Тильманн HW (1992). «Функция ДНК-полимераз в синтезе репарации ДНК фибробластов человека, облученных ультрафиолетом». Биохим. Биофиз. Acta. 1129 (2): 155–60. Дои:10.1016 / 0167-4781 (92) 90480-Н. PMID 1730053.
- Коллинз К.Л., Келли Т.Дж. (1991). «Влияние Т-антигена и репликационного белка А на инициацию синтеза ДНК ДНК-полимеразой альфа-примазой». Мол. Клетка. Биол. 11 (4): 2108–15. Дои:10.1128 / mcb.11.4.2108. ЧВК 359898. PMID 1848671.
- Мартелли AM, Cocco L, Manzoli FA (1991). «Об ассоциации активности ДНК-полимеразы альфа с ядерным матриксом в клетках HeLa». Cell Biol. Int. Представитель. 15 (2): 131–40. Дои:10.1016 / 0309-1651 (91) 90104-Q. PMID 1903085.
- Пирсон Б.Е., Нашеуэр HP, Ван Т.С. (1991). «Ген альфа-ДНК-полимеразы человека: последовательности, контролирующие экспрессию в клетках, стимулированных циклами и сывороткой».. Мол. Клетка. Биол. 11 (4): 2081–95. Дои:10.1128 / mcb.11.4.2081. ЧВК 359896. PMID 2005899.
- Мацумото Т., Эки Т., Гурвиц Дж. (1991). «Исследования реакций инициации и удлинения в системе репликации ДНК обезьяньего вируса 40». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (24): 9712–6. Дои:10.1073 / пнас.87.24.9712. ЧВК 55243. PMID 2175912.
- Си К.Л., Коупленд В.К., Ван Т.С. (1991). "Каталитический полипептид ДНК-полимеразы человека альфа связывает ConA и RCA и содержит специфический лабильный сайт на N-конце". Нуклеиновые кислоты Res. 18 (21): 6231–7. Дои:10.1093 / nar / 18.21.6231. ЧВК 332486. PMID 2243771.
- Ван Т.С., Пирсон Б.Е., Суомалайнен Х.А., Мохандас Т., Шапиро Л.Дж., Шредер Дж., Корн Д. (1985). «Присвоение гена ДНК-полимеразы альфа человека Х-хромосоме». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 82 (16): 5270–4. Bibcode:1985PNAS ... 82,5 270 Вт. Дои:10.1073 / пнас.82.16.5270. ЧВК 390549. PMID 2410918.
- Кнорре Д.Г., Лаврик О.И., Невинский Г.А. (1988). «Взаимодействие белков с нуклеиновой кислотой в реакциях, катализируемых ДНК-полимеразами». Биохимия. 70 (5): 655–61. Дои:10.1016/0300-9084(88)90250-7. PMID 3139084.
- Нишида С., Рейнхард П., Линн С. (1988). «Синтез репарации ДНК в человеческих фибробластах требует дельта ДНК-полимеразы». J. Biol. Chem. 263 (1): 501–10. PMID 3335506.
- Вонг С.В., Валь А.Ф., Юань П.М., Арай Н., Пирсон Б.Е., Араи К., Корн Д., Хункапиллер М.В., Ван Т.С. (1988). «Экспрессия гена альфа ДНК-полимеразы человека зависит от пролиферации клеток, и его первичная структура аналогична репликативным ДНК-полимеразам как прокариот, так и эукариот».. EMBO J. 7 (1): 37–47. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1988.tb02781.x. ЧВК 454213. PMID 3359994.
- Цуда М., Масуяма М., Кацунума Т. (1986). «Ингибирование человеческой ДНК-полимеразы альфа альфа-1-антихимотрипсином». Рак Res. 46 (12, п. 1): 6139–42. PMID 3490907.
- Джексон Д.А., Кук PR (1987). «Различные популяции ДНК-полимеразы альфа в клетках HeLa». J. Mol. Биол. 192 (1): 77–86. Дои:10.1016/0022-2836(86)90465-1. PMID 3820307.
- Миллер М.Р., Займан К., Ульрих Р.Г. (1986). «Ингибирование репликации ДНК и активности ДНК-полимеразы альфа с помощью моноклональных анти- (ДНК-полимераза альфа) фрагментов иммуноглобулина G и F (ab)». Биохимия. 24 (25): 7440–5. Дои:10.1021 / bi00346a061. PMID 4084590.
- Бенш К.Г., Танака С., Ху С.З., Ван Т.С., Корн Д. (1982). «Внутриклеточная локализация человеческой ДНК-полимеразы альфа с моноклональными антителами». J. Biol. Chem. 257 (14): 8391–6. PMID 7045121.
- Танака С., Ху С.З., Ван Т.С., Корн Д. (1982). «Приготовление и предварительная характеристика моноклональных антител против ДНК-полимеразы альфа человека». J. Biol. Chem. 257 (14): 8386–90. PMID 7085672.
- Эккерт К.А., Кункель Т.А. (1993). «Верность синтеза ДНК, катализируемого ДНК-полимеразой альфа человека и обратной транскриптазой ВИЧ-1: влияние рН реакции». Нуклеиновые кислоты Res. 21 (22): 5212–20. Дои:10.1093 / nar / 21.22.5212. ЧВК 310639. PMID 7504813.
Эта статья о ген на человека Х хромосома и / или связанный с ним белок это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |