PRPF19 - PRPF19

PRPF19
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	4LG8
Идентификаторы
Псевдонимы	PRPF19, NMP200, PRP19, PSO4, SNEV, UBOX4, hPSO4, фактор процессинга пре-мРНК 19
Внешние идентификаторы	OMIM: 608330 MGI: 106247 ГомолоГен: 6421 Генные карты: PRPF19
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 11 (человек)
Конец	60,906,585 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 19 (мышь)
Конец	10,909,559 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы; • активность убиквитин-протеинтрансферазы; • активность убиквитин-убиквитинлигазы; • GO: 0001948 связывание с белками; • идентичное связывание с белками; • трансферазная активность;
Сотовый компонент	• место двухцепочечного разрыва; • ядерное пятнышко; • каталитическая стадия 2 сплайсосомы; • мембрана; • липидная капля; • шпиндель; • Прп19 комплекс; • Комплекс фактора репликации ДНК А; • сплайсосомальный комплекс; • цитоскелет; • ядро клетки; • цитоплазма; • нуклеоплазма; • Каталитическая сплайсосома стадии 1 U2; • Каталитическая сплайсосома 2-го типа U2;
Биологический процесс	• Сплайсинг мРНК через сплайсосомы; • сплайсосомная сборка комплекса три-мяРНП; • процесс биосинтеза липидов; • отрицательная регуляция дифференцировки нейронов; • положительная регуляция дифференцировки астроцитов; • положительная регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосомы; • убиквитинирование, связанное с белком K63; • обработка мРНК; • полиубиквитинирование белков; • пролиферация клеток внутренней клеточной массы; • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК; • локализация клеточного белка; • сборка сплайсосомального комплекса; • передача сигнала, участвующая в контрольной точке повреждения ДНК; • убиквитинирование белков; • катаболический процесс протеасомного белка; • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов; • восстановление двухниточного разрыва за счет негомологичного соединения концов; • Ремонт ДНК; • Сплайсинг РНК; • создание каталитических сплайсосом для первой стадии переэтерификации; • положительная регуляция дифференцировки нейронов;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	27339
	28000
	ENSG00000110107
	ENSMUSG00000024735
	Q9UMS4
	Q99KP6
	NM_014502
	NM_001253843; NM_001253844; NM_134129
	NP_055317
	NP_001240772; NP_001240773; NP_598890
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Фактор пре-мРНК-процессинга 19 это белок что у людей кодируется PRPF19 ген.^[5]^[6]

У S. cerevisiae Pso4 выполняет плейотропные функции в рекомбинации ДНК и в подверженной ошибкам репарации ДНК с негомологичным соединением концов [предоставлено OMIM]^[6]

Взаимодействия

PRPF19 был показан взаимодействовать с участием CDC5L.^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000110107 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000024735 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Махаджан К.Н., Митчелл Б.С. (сентябрь 2003 г.). «Роль человеческого Pso4 в репарации ДНК млекопитающих и ассоциации с терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазой». Proc Natl Acad Sci U S A. 100 (19): 10746–51. Bibcode:2003ПНАС..10010746М. Дои:10.1073 / pnas.1631060100. ЧВК 196874. PMID 12960389.
^ ^а ^б «Ген Entrez: PRPF19 PRP19 / PSO4, гомолог фактора 19 процессинга пре-мРНК (S. cerevisiae)».
^ Ajuh, P; Kuster B; Панов К; Zomerdijk J C; Mann M; Ламонд А. I (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ человеческого комплекса CDC5L и идентификация его компонентов с помощью масс-спектрометрии». EMBO J. 19 (23): 6569–81. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ISSN 0261-4189. ЧВК 305846. PMID 11101529.

дальнейшее чтение

Гернер С., Хольцманн К., Мейснер М. и др. (1999). «Сборка белков и шаперонов во фракциях белков ядерного матрикса человека». J. Cell. Биохим. 74 (2): 145–51. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19990801) 74: 2 <145 :: AID-JCB1> 3.0.CO; 2- #. PMID 10404385.
Гоцманн Дж., Гернер С., Мейснер М. и др. (2000). «hNMP 200: новый человеческий белок общего ядерного матрикса, сочетающий структурные и регуляторные функции». Exp. Cell Res. 261 (1): 166–79. Дои:10.1006 / excr.2000.5025. PMID 11082287.
Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Юрица М.С., Ликлидер Л.Дж., Гиги С.Р. и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, пригодных для трехмерного структурного анализа». РНК. 8 (4): 426–39. Дои:10.1017 / S1355838202021088. ЧВК 1370266. PMID 11991638.
Scherl A, Couté Y, Déon C и др. (2003). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека». Мол. Биол. Ячейка. 13 (11): 4100–9. Дои:10.1091 / mbc.E02-05-0271. ЧВК 133617. PMID 12429849.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Макарова О.В., Макаров Е.М., Урлауб Х. и др. (2004). «Подмножество белков 35S U5 человека, включая Prp19, функционирует до каталитической стадии 1 сплайсинга». EMBO J. 23 (12): 2381–91. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600241. ЧВК 423283. PMID 15175653.
Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005Натура 433 ... 77А. Дои:10.1038 / природа03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Löscher M, Fortschegger K, Ritter G, et al. (2005). "Взаимодействие SNEV U-box E3 лигазы с PSMB4, субъединицей beta7 20 S протеасомы". Biochem. J. 388 (Pt 2): 593–603. Дои:10.1042 / BJ20041517. ЧВК 1138967. PMID 15660529.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Чжан Н., Каур Р., Лу Х и др. (2006). «Комплекс сплайсинга мРНК Pso4 и репарации ДНК взаимодействует с WRN для обработки межцепочечных перекрестных связей ДНК». J. Biol. Chem. 280 (49): 40559–67. Дои:10.1074 / jbc.M508453200. PMID 16223718.
Гриллари Дж., Аджух П., Стадлер Дж. И др. (2005). «SNEV - это эволюционно консервативный фактор сплайсинга, олигомеризация которого необходима для сборки сплайсосом». Нуклеиновые кислоты Res. 33 (21): 6868–83. Дои:10.1093 / нар / gki986. ЧВК 1310963. PMID 16332694.
Фоглауэр Р., Чанг М.В., Дампир Б. и др. (2006). «Сверхэкспрессия SNEV увеличивает продолжительность жизни эндотелиальных клеток человека». Exp. Cell Res. 312 (6): 746–59. Дои:10.1016 / j.yexcr.2005.11.025. PMID 16388800.
Лу X, Легерски Р.Дж. (2007). «Ядерный комплекс Prp19 / Pso4 подвергается убиквитилированию и структурным изменениям в ответ на повреждение ДНК». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 354 (4): 968–74. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.01.097. ЧВК 1810354. PMID 17276391.
Фортшеггер К., Вагнер Б., Фоглауэр Р. и др. (2007). «Ранняя эмбриональная летальность мышей, лишенных необходимого белка SNEV». Мол. Cell. Биол. 27 (8): 3123–30. Дои:10.1128 / MCB.01188-06. ЧВК 1899945. PMID 17283042.
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.

Эта статья о ген на хромосома человека 11 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000110107 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000024735 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid12960389-5] Махаджан К.Н., Митчелл Б.С. (сентябрь 2003 г.). «Роль человеческого Pso4 в репарации ДНК млекопитающих и ассоциации с терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазой». Proc Natl Acad Sci U S A. 100 (19): 10746–51. Bibcode:2003ПНАС..10010746М. Дои:10.1073 / pnas.1631060100. ЧВК 196874. PMID 12960389.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: PRPF19 PRP19 / PSO4, гомолог фактора 19 процессинга пре-мРНК (S. cerevisiae)».

[pmid11101529-7] Ajuh, P; Kuster B; Панов К; Zomerdijk J C; Mann M; Ламонд А. I (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ человеческого комплекса CDC5L и идентификация его компонентов с помощью масс-спектрометрии». EMBO J. 19 (23): 6569–81. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ISSN 0261-4189. ЧВК 305846. PMID 11101529.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]