POLRMT - POLRMT

POLRMT
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPOLRMT, APOLMT, MTRNAP, MTRPOL, h-mtRPOL, митохондриальная полимераза (РНК), митохондриальная РНК-полимераза
Внешние идентификаторыOMIM: 601778 MGI: 1915843 ГомолоГен: 37996 Генные карты: POLRMT
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное местоположение для POLRMT
Геномное местоположение для POLRMT
Группа19p13.3Начинать617,221 бп[1]
Конец633,537 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE POLRMT 203782 s в формате fs.png

PBB GE POLRMT 203783 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_005035

NM_172551

RefSeq (белок)

NP_005026

NP_766139

Расположение (UCSC)Chr 19: 0,62 - 0,63 МбChr 10: 79.74 - 79.75 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

ДНК-направленная РНК-полимераза, митохондриальная является фермент что у людей кодируется POLRMT ген.[5][6]

Функция

Этот ген кодирует митохондриальная ДНК -направленный РНК-полимераза. Продукт гена отвечает за экспрессию митохондриальных генов, а также за обеспечение Праймеры РНК для инициации репликации митохондриального генома. Хотя этот полипептид имеет ту же функцию, что и три ядерные ДНК-направленные РНК-полимеразы, он более близок к РНК-полимеразам бактериофаг (включая РНК-полимераза Т7 ), митохондриальные полимеразы низшего эукариоты а также хлоропластные полимеразы RpoT.[6]

Структура

Структура фермента решена. Он имеет общую структуру, аналогичную структуре фаговой РНКП, но механизм инициации отличается тем, что требует факторов инициации. TFAM (только у млекопитающих) и TFB2M.[7] Для удлинения требуется коэффициент удлинения ТЭФМ.[8] Точный процесс прекращения действия менее понятен, но MTERF1 считается, что играет роль.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000099821 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020329 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Tiranti V, Savoia A, Forti F, D'Apolito MF, Centra M, Rocchi M, Zeviani M (июль 1997 г.). «Идентификация гена, кодирующего митохондриальную РНК-полимеразу человека (h-mtRPOL), посредством киберскрининга базы данных экспрессируемых тегов последовательностей». Хум Мол Генет. 6 (4): 615–25. Дои:10,1093 / чмг / 6.4.615. PMID  9097968.
  6. ^ а б «Ген Entrez: митохондриальная полимераза POLRMT (РНК) (направленная ДНК)».
  7. ^ Хиллен, HS; Морозов Ю.И.; Сарфаллах, А; Темяков, Д; Крамер, П. (16 ноября 2017 г.). «Структурные основы инициации митохондриальной транскрипции». Клетка. 171 (5): 1072–1081.e10. Дои:10.1016 / j.cell.2017.10.036. ЧВК  6590061. PMID  29149603.
  8. ^ Hillen, Hauke ​​S .; Паршин, Андрей В .; Агаронян, Карен; Морозов, Ярослав I .; Грабер, Джеймс Дж .; Чернев, Александар; Швингхаммер, Катрин; Урлауб, Хеннинг; Аникин, Михаил; Крамер, Патрик; Темяков, Дмитрий (ноябрь 2017). «Механизм анти-терминации транскрипции в митохондриях человека». Клетка. 171 (5): 1082–1093.e13. Дои:10.1016 / j.cell.2017.09.035. ЧВК  5798601. PMID  29033127.
  9. ^ Д'Суза, АР; Минчук, М. (20 июля 2018 г.). «Митохондриальная транскрипция и перевод: обзор». Очерки биохимии. 62 (3): 309–320. Дои:10.1042 / EBC20170102. ЧВК  6056719. PMID  30030363.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: O00411 (ДНК-направленная РНК-полимераза человека, митохондриальная (POLRMT)) в PDBe-KB.