TFAM - TFAM

TFAM
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTFAM, MTTF1, MTTFA, TCF6, TCF6L1, TCF6L2, TCF6L3, фактор транскрипции A, митохондриальный, MTDPS15
Внешние идентификаторыOMIM: 600438 MGI: 107810 ГомолоГен: 31139 Генные карты: TFAM
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение TFAM
Геномное расположение TFAM
Группа10q21.1Начните58,385,345 бп[1]
Конец58,399,220 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TFAM 203176 s в формате fs.png

PBB GE TFAM 208541 x в формате fs.png

PBB GE TFAM 203177 x в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001270782
NM_003201
NM_012251

NM_009360

RefSeq (белок)

NP_001257711
NP_003192

NP_033386

Расположение (UCSC)Chr 10: 58.39 - 58.4 МбChr 10: 71.23 - 71.24 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции митохондрий А, сокращенно TFAM или mtTFA, это белок что у людей кодируется TFAM ген.[5][6]

Функция

Этот ген кодирует митохондриальный фактор транскрипции это ключевой активатор митохондриальной транскрипции, а также участник репликации митохондриального генома. TFAM связывает митохондриальную промоторную ДНК, чтобы способствовать транскрипции митохондриального генома. Исследования на мышах показали, что этот генный продукт необходим для регулирования числа копий митохондриального генома и важен для эмбриональное развитие. Модель мыши для Синдром Кирнса – Сайра был произведен, когда экспрессия этого гена была устранена путем целенаправленного разрушения в клетках сердца и мышц.[6]

TFAM - это двойная коробка Группа высокой мобильности ДНК-связывающий и изгибающий белок.[7] Это действие изгиба важно для инициации митохондриальной транскрипции у млекопитающих, но не у дрожжей с гомологом Abf2. TFAM может также участвовать в упаковке митохондриального генома, поскольку его связывающая активность неспецифична для последовательности. [8]

Взаимодействия

TFAM было показано взаимодействовать с участием TFB1M и[9] TFB2M.[10]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108064 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003923 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Тиранти В., Росси Е., Руис-Каррильо А., Росси Г., Рокки М., ДиДонато С., Дзуффарди О., Зевиани М. (июль 1995 г.). «Хромосомная локализация митохондриального фактора транскрипции A (TCF6), одноцепочечного ДНК-связывающего белка (SSBP) и эндонуклеазы G (ENDOG), трех генов домашнего хозяйства человека, участвующих в митохондриальном биогенезе». Геномика. 25 (2): 559–64. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80058-Т. PMID  7789991.
  6. ^ а б «Ген Entrez: фактор транскрипции А TFAM, митохондриальный».
  7. ^ Murugesapillai D, McCauley MJ, Maher LJ, Williams MC (15 ноября 2016 г.). «Одномолекулярные исследования белков, изгибающих архитектурную ДНК группы B с высокой подвижностью». Биофизические обзоры. 9 (1): 17–40. Дои:10.1007 / s12551-016-0236-4. ЧВК  5331113. PMID  28303166.
  8. ^ Ngo, HB; Kaiser, JT; Чан, округ Колумбия (30 октября 2011 г.). «Фактор транскрипции и упаковки митохондрий Tfam вызывает разворот митохондриальной ДНК». Структурная и молекулярная биология природы. 18 (11): 1290–6. Дои:10.1038 / nsmb.2159. ЧВК  3210390. PMID  22037171.
  9. ^ Маккаллох В., Шадель Г.С. (август 2003 г.). «Фактор транскрипции митохондрий человека B1 взаимодействует с С-концевой областью активации h-mtTFA и стимулирует транскрипцию независимо от его активности РНК-метилтрансферазы». Мол. Cell. Биол. 23 (16): 5816–24. Дои:10.1128 / MCB.23.16.5816-5824.2003. ЧВК  166325. PMID  12897151.
  10. ^ Хиллен, HS; Морозов Ю.И.; Сарфаллах, А; Темяков, Д; Крамер, П. (16 ноября 2017 г.). «Структурные основы инициации митохондриальной транскрипции». Ячейка. 171 (5): 1072–1081.e10. Дои:10.1016 / j.cell.2017.10.036. ЧВК  6590061. PMID  29149603.

дальнейшее чтение

внешние ссылки

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q00059 (Фактор транскрипции A, митохондриальный) на PDBe-KB.