Общее происхождение - Википедия - Common descent

Для использования этого термина в лингвистике и филологии см. Сравнительный метод (лингвистика), Историческая лингвистика, Протоязык, и Текстовая критика.
«Общий предок» перенаправляется сюда. Для использования этого термина в теории графов см. Самый низкий общий предок.
Часть серии по
Эволюционная биология
Зяблики Дарвина, автор Gould.jpg
Ключевые темы

Общий спуск это концепция в эволюционная биология применимо, когда один вид позже стал предком двух или более видов. На самом деле все живые существа являются потомками уникального предка, которого обычно называют последний универсальный общий предок (LUCA) всех жизнь на земной шар, согласно современной эволюционной биологии.[1][2][3][4]

Общее происхождение - это результат видообразование, в котором несколько видов происходят от одной предковой популяции. Чем более поздние общие предки имеют два вида, тем теснее они связаны. Самый недавний общий предок всех ныне живущих организмов - последний универсальный предок,[3] который жил около 3,9 миллиарда лет назад.[5][6] Два самых ранних свидетельства существования жизни на Земле: графит установлено, что биогенный в возрасте 3,7 миллиарда лет метаосадочные породы обнаружен в западных Гренландия[7] и микробный коврик окаменелости найдено в 3,48 миллиарда лет песчаник обнаружен в Западная Австралия.[8][9] Все живые в настоящее время организмы на Земле имеют общую генетический наследие, хотя и предполагается существенное горизонтальный перенос генов во время ранней эволюции привел к вопросам о монофилия (единое происхождение) жизни.[3] 6 331 группа гены выявлены общие для всех живых животных; они могли возникнуть из-за одного общий предок что жила 650 миллионов лет назад в Докембрийский.[10][11]

Универсальное общее происхождение через эволюционный процесс был впервые предложен британскими натуралист Чарльз Дарвин в заключительном предложении его книги 1859 г. О происхождении видов:

В этом взгляде на жизнь есть величие с ее несколькими силами, которые изначально были вдохнуты в несколько форм или в одну; и что, пока эта планета двигалась в соответствии с фиксированным законом всемирного тяготения, с самого начала развивались и развиваются бесконечные формы, самые прекрасные и самые чудесные.[12]

История

Смотрите также: История эволюционной мысли

В 1740-х годах французы математик Пьер Луи Мопертюи сделал первое известное предположение, что все организмы имели общего предка и разошлись в результате случайных изменений и естественный отбор.[13][14] В Essai de cosmologie (1750), Мопертюи отмечал:

Не можем ли мы сказать, что в результате случайного сочетания произведений природы, поскольку только эти существа мог выжить, в чьих организациях присутствовала определенная степень адаптации, нет ничего экстраординарного в том факте, что такая адаптация действительно обнаруживается у всех этих существующих сейчас видов? Случайно, можно сказать, оказалось огромное количество людей; небольшая часть из них была организована таким образом, чтобы органы животных могли удовлетворить их потребности. Гораздо большее число не показало ни адаптации, ни порядка; эти последние все погибли ... Таким образом, виды, которые мы видим сегодня, являются лишь небольшой частью всех тех, кого произвела слепая судьба.[15]

В 1790 году философ Иммануил Кант написал в Критик дер Уртейльскрафт (Критика суждения ), что подобие[а] форм животных подразумевает общий исходный тип и, следовательно, общего родителя.[16]

В 1794 году дед Чарльза Дарвина, Эразм Дарвин спросил:

[Мы] не могли бы быть слишком смелыми, чтобы вообразить, что за столь большой промежуток времени, с тех пор как Земля начала существовать, возможно, за миллионы веков до начала истории человечества, было бы слишком смелым вообразить, что все теплые -окровные животные произошли из одной живой нити, которая великая первопричина наделенный животностью, способностью приобретать новые части с новыми склонностями, управляемыми раздражениями, ощущениями, волениями и ассоциациями; и, таким образом, обладать способностью продолжать совершенствоваться своей собственной неотъемлемой деятельностью и передавать эти улучшения из поколения в поколение своим потомкам, миру без конца?[17]

Чарльз Дарвин взгляды на общее происхождение, выраженные в О происхождении видов, если было вероятно, что существовал только один прародитель для всех форм жизни:

Поэтому я должен сделать вывод из аналогии, что, вероятно, все органические существа, когда-либо жившие на этой Земле, произошли от какой-то одной изначальной формы, в которую впервые была вдохнута жизнь.[18]

Но он предшествует этому замечанию следующим образом: «Аналогия привела бы меня на один шаг дальше, а именно к убеждению, что все животные и растения произошли от какого-то одного прототипа. Но аналогия может быть обманчивым руководством». И в последующем издании[19] он скорее утверждает,

«Мы не знаем всех возможных переходных градаций между простейшими и наиболее совершенными органами; нельзя утверждать, что мы знаем все разнообразные средства распространения в течение долгих лет или что мы знаем, насколько несовершенна геологическая летопись. Какими бы серьезными ни были эти трудности, я считаю, что они не опровергают теорию происхождения от нескольких сотворенных форм с последующей модификацией ".

Общее происхождение было широко распространено среди научное сообщество после публикации Дарвина.[20] В 1907 г. Вернон Келлог прокомментировал, что «практически никто из натуралистов положения и признанных достижений не сомневается в теории происхождения».[21]

В 2008 году биолог Т. Райан Грегори отметил, что:

Не было обнаружено ни одного надежного наблюдения, противоречащего общему представлению об общем происхождении. Поэтому неудивительно, что научное сообщество в целом приняло эволюционное происхождение как историческую реальность со времен Дарвина и считает его одним из наиболее достоверно установленных и фундаментально важных фактов во всей науке.[22]

Свидетельство

Дальнейшая информация: Доказательства общего происхождения

Общая биохимия

Все известные формы жизни основаны на одной и той же фундаментальной биохимической организации: генетическая информация, закодированная в ДНК, транскрибируется в РНК, за счет эффекта белок - и РНК-ферменты, а затем переводится в белки (очень похоже) рибосомы, с АТФ, НАДФН и другие в качестве источников энергии. Анализ небольших различий в последовательностях широко распространенных веществ, таких как цитохром с далее поддерживает универсальное общее происхождение.[23] Около 23 белков содержатся во всех организмах и служат ферменты выполнение основных функций, таких как репликация ДНК. Тот факт, что существует только один такой набор ферментов, убедительно свидетельствует об одном происхождении.[3][24] 6,331 гены выявлены общие для всех живых животных; они могли возникнуть из-за одного общий предок что жила 650 миллионов лет назад в Докембрийский.[10][11]

Общий генетический код

Дальнейшая информация: Генетический код
АминокислотынеполярныйполярныйбазовыйкислыйСтоп-кодон
Стандартный генетический код
1-й
основание		2-я база
ТCАграмм
ТTTTФенил-
аланин		TCTСеринТАТТирозинTGTЦистеин
TTCTCCTACТГК
TTAЛейцинTCATAAОстанавливатьсяTGAОстанавливаться
ТТГTCGТЕГОстанавливатьсяTGGТриптофан  
CCTTCCTПролинКОТГистидинCGTАргинин
CTCCCCСАСCGC
CTACCACAAГлутаминCGA
CTGCCGCAGCGG
АATTИзолейцинДЕЙСТВОВАТЬТреонин  AATАспарагинAGTСерин
УВДАККAACAGC
ATAACAAAAЛизинAGAАргинин
ПТГМетионинАЧГAAGAGG
граммGTTВалинGCTАланинGATАспарагиновая
кислота		GGTГлицин
GTCGCCGACGGC
GTAGCAGAAГлутаминовый
кислота		GGA
GTGGCGGAGGGG

В генетический код («таблица трансляции», согласно которой информация ДНК переводится в аминокислоты и, следовательно, белки) практически идентичны для всех известных форм жизни, начиная с бактерии и археи к животные и растения. Универсальность этого кода обычно рассматривается биологами как окончательное свидетельство в пользу универсального общего происхождения.[23]

Способ, которым кодоны (Тройки ДНК) отображаются на аминокислоты вроде сильно оптимизирован. Ричард Эгель утверждает, что, в частности, гидрофобный (неполярные) боковые цепи хорошо организованы, что позволяет предположить, что они позволили самым ранним организмам создавать пептиды с водоотталкивающими областями, способными поддерживать существенный электронный обмен (редокс ) реакции передачи энергии.[25]

Избирательно нейтральные сходства

Сходства, не имеющие адаптивного значения, не могут быть объяснены конвергентная эволюция, и поэтому они обеспечивают убедительную поддержку универсального общего происхождения. Такие доказательства были получены в двух областях: аминокислота последовательности и последовательности ДНК. Белки с одинаковой трехмерной структурой не обязательно должны иметь идентичные аминокислотные последовательности; любое несущественное сходство между последовательностями свидетельствует об их общем происхождении. В некоторых случаях есть несколько кодоны (Триплеты ДНК), повторяющие код одной и той же аминокислоты. Поскольку многие виды используют один и тот же кодон в одном и том же месте для определения аминокислоты, которая может быть представлена ​​более чем одним кодоном, это свидетельствует об их недавнем общем предке. Если бы аминокислотные последовательности происходили от разных предков, они были бы закодированы любым из избыточных кодонов, и поскольку правильные аминокислоты уже были бы на месте, естественный отбор не повлекло бы за собой никаких изменений в кодонах, сколько бы времени ни было доступно. Генетический дрейф может изменить кодоны, но крайне маловероятно, чтобы все повторяющиеся кодоны во всей последовательности точно совпадали по нескольким линиям. Точно так же общие нуклеотидные последовательности, особенно если они явно нейтральны, такие как расположение интроны и псевдогены, представляют собой убедительные доказательства общего происхождения.[26]

Другие сходства

Биологи часто[количественно оценить ] указывают на универсальность многих аспектов клеточной жизни в качестве подтверждающего доказательства более убедительных доказательств, перечисленных выше. Эти сходства включают энергоноситель аденозинтрифосфат (АТФ) и тот факт, что все аминокислоты, содержащиеся в белках, являются левша. Однако не исключено, что эти сходства возникли из-за законы физики и химии - а не через универсальное общее происхождение - и поэтому привело к конвергентной эволюции. Напротив, есть доказательства гомологии центральных субъединиц Трансмембранные АТФазы во всех живых организмах, особенно в том, как вращающиеся элементы связаны с мембраной. Это подтверждает предположение о LUCA как о клеточном организме, хотя первичные мембраны, возможно, были полупроницаемыми и позже эволюционировали до мембран современных бактерий, а также на втором пути к мембранам современных архей.[27]

Филогенетические деревья

БактерииАрхеиЭукариотAquifexThermotogaЦитофагаБактероидыBacteroides-CytophagaPlanctomycesЦианобактерииПротеобактерииСпирохетыГрамположительные бактерииЗеленые нитчатые бактерииPyrodicticumТермопротеусТермококк ЦелерМетанококкМетанобактерииMethanosarcinaГалофилыEntamoebaeСлизь плесеньЖивотноеГрибокРастениеИнфузорияЖгутикТрихомонадаМикроспоридииДипломонад
А филогенетическое дерево на основе рибосомная РНК гены подразумевают единое происхождение всей жизни.
Основная статья: Филогенетическое дерево
Смотрите также: Древо жизни (биология)

Еще одно важное свидетельство - подробные филогенетические деревья (то есть «генеалогические деревья» видов), отображающие предлагаемые подразделения и общих предков всех живых видов. В 2010 году Дуглас Л. Теобальд опубликовал статистический анализ имеющихся генетических данных:[3] сопоставление их с филогенетическими деревьями, что дало «сильную количественную поддержку, посредством формального теста, единства жизни».[4]

Традиционно эти деревья строились с использованием морфологических методов, таких как внешний вид, эмбриология и т. д. Недавно стало возможным построить эти деревья с использованием молекулярных данных, основанных на сходстве и различиях между генетическими и белковыми последовательностями. Все эти методы дают практически одинаковые результаты, хотя большинство генетическая вариация не влияет на внешнюю морфологию. То, что филогенетические деревья, основанные на различных типах информации, согласуются друг с другом, является убедительным свидетельством реального основного общего происхождения.[28]

Возможные возражения

2005 Дерево жизни показывает много горизонтальный перенос генов, подразумевая множественное возможное происхождение.

Филогенетический анализ облаков обмена генов

Дальнейшая информация: Горизонтальный перенос генов

Теобальд отметил, что существенные горизонтальный перенос генов мог произойти на ранней стадии эволюции. Бактерии сегодня остаются способными к обмену генами между отдаленно родственными линиями. Это ослабляет основное предположение филогенетического анализа о том, что сходство геномов подразумевает общее происхождение, потому что достаточный обмен генами позволит клонам разделять большую часть своего генома независимо от того, разделял предка (монофилия). Это привело к вопросам о едином происхождении жизни.[3] Однако биологи считают очень маловероятным, что совершенно не связанные между собой протоорганизмы могли обмениваться генами, поскольку их разные механизмы кодирования привели бы только к искажению, а не к функционированию систем. Позже, однако, многие организмы, произошедшие от одного предка, могли легко иметь общие гены, которые работали одинаково, и, похоже, они так и были.[3]

Конвергентная эволюция

Дальнейшая информация: Конвергентная эволюция

Если бы ранние организмы в одних и тех же условиях окружающей среды конвергентно развивать подобную биохимию, они могли независимо получить аналогичные генетические последовательности. Соответственно, «формальный тест» Теобальда подвергся критике со стороны Такахиро Йонезава и его коллег.[29] за исключением рассмотрения сходимости. Они утверждали, что теста Теобальда было недостаточно, чтобы различать конкурирующие гипотезы. Теобальд защищает свой метод от этого утверждения, утверждая, что его тесты различают филогенетическую структуру и простое сходство последовательностей. Таким образом, утверждал Теобальд, его результаты показывают, что «реальный универсальный консервированный белки гомологичный."[30][31]

Смотрите также

Библиография

Примечания

  1. ^ Сейчас называется гомология.

Рекомендации

  1. ^ Вайс, Мадлен С .; Sousa, Filipa L .; Мрнявац, Наталья; Нойкирхен, Синье; Рёттгер, Мэйо; Нельсон-Сати, Шиджулал; Мартин, Уильям Ф. (25 июля 2016 г.). «Физиология и среда обитания последнего универсального общего предка». Природная микробиология. 1 (9): 16116. Дои:10.1038 / nmicrobiol.2016.116. ISSN  2058-5276. PMID  27562259. S2CID  2997255.
  2. ^ Фортер, Патрик; Грибальдо, Симонетта; Брошье, Селин (октябрь 2005 г.). «[Лука: последний универсальный общий предок]». Médecine / Науки. 21 (10): 860–865. Дои:10.1051 / medsci / 20052110860. ISSN  0767-0974. PMID  16197904.
  3. ^ а б c d е ж грамм Теобальд, Дуглас Л. (13 мая 2010 г.). «Формальный тест теории всеобщего общего предка». Природа. 465 (7295): 219–222. Bibcode:2010Натура.465..219Т. Дои:10.1038 / природа09014. PMID  20463738. S2CID  4422345.
  4. ^ а б Сталь, Майк; Пенни, Дэвид (13 мая 2010 г.). «Истоки жизни: проверка общих предков». Природа. 465 (7295): 168–169. Bibcode:2010Натура.465..168С. Дои:10.1038 / 465168a. PMID  20463725. S2CID  205055573.
  5. ^ Дулиттл, У. Форд (Февраль 2000 г.). "Выкорчевывание древа жизни" (PDF). Scientific American. 282 (2): 90–95. Bibcode:2000SciAm.282b..90D. Дои:10.1038 / scientificamerican0200-90. PMID  10710791. Архивировано из оригинал (PDF) на 2006-09-07. Получено 2015-11-22.
  6. ^ Глансдорф, Николас; Инь Сюй; Лабедан, Бернард (9 июля 2008 г.). «Последний всеобщий общий предок: возникновение, конституция и генетическое наследие неуловимого предшественника». Биология Директ. 3: 29. Дои:10.1186/1745-6150-3-29. ЧВК  2478661. PMID  18613974.
  7. ^ Отомо, Йоко; Какегава, Такеши; Исида, Акизуми; и другие. (Январь 2014). «Доказательства биогенного графита в метаосадочных породах Исуа раннего архея». Природа Геонауки. 7 (1): 25–28. Bibcode:2014НатГе ... 7 ... 25О. Дои:10.1038 / ngeo2025.
  8. ^ Боренштейн, Сет (13 ноября 2013 г.). «Самое древнее найденное ископаемое: познакомьтесь со своей мамой-микробом». Yahoo News. Ассошиэйтед Пресс. Получено 2015-11-22.
  9. ^ Ноффке, Нора; Кристиан, Даниэль; Уэйси, Дэвид; Хейзен, Роберт М. (16 декабря 2013 г.). «Микробиологически индуцированные осадочные структуры, фиксирующие древнюю экосистему в ок. 3,48 миллиард-летняя формация Дрессера, Пилбара, Западная Австралия ". Астробиология. 13 (12): 1103–1124. Bibcode:2013AsBio..13.1103N. Дои:10.1089 / аст.2013.1030. ЧВК  3870916. PMID  24205812.
  10. ^ а б Циммер, Карл (4 мая 2018 г.). «Самое первое животное появилось на фоне взрыва ДНК». Нью-Йорк Таймс. Получено 4 мая 2018.
  11. ^ а б Папс, Хорди; Голландия, Питер В. Х. (30 апреля 2018 г.). «Реконструкция генома предкового многоклеточного животного показывает увеличение геномной новизны». Nature Communications. 9 (1730 (2018)): 1730. Bibcode:2018НатКо ... 9.1730P. Дои:10.1038 / s41467-018-04136-5. ЧВК  5928047. PMID  29712911.
  12. ^ Дарвин 1859, п. 490
  13. ^ Кромби и Хоскин 1970, стр.62–63
  14. ^ Сокровище 1985, п. 142
  15. ^ Харрис 1981, п.107
  16. ^ Кант 1987, п.304: «Несмотря на все разнообразие этих форм, они, кажется, были произведены в соответствии с общим архетипом, и эта аналогия между ними усиливает наше подозрение, что они на самом деле родственны, произведены общей изначальной матерью».
  17. ^ Дарвин 1818, п. 397 [§ 39.4.8]
  18. ^ Дарвин 1859, п. 484
  19. ^ Дарвин, К. Р. 1860. О происхождении видов посредством естественного отбора или о сохранении избранных рас в борьбе за жизнь. Лондон: Джон Мюррей. 2-е издание, второй выпуск, стр. 466
  20. ^ Крог, Дэвид. (2005). Биология: Путеводитель по миру природы. Пирсон / Прентис Холл. п. 323. ISBN  978-0321946768 "Происхождение с модификацией было принято большинством ученых вскоре после публикации книги Дарвина. О происхождении видов путем естественного отбора в 1859 году. Ученые приняли его, потому что он объяснил так много аспектов живого мира ».
  21. ^ Келлог, Вернон Л. (1907). Дарвинизм сегодня. Генри Холт и компания. п. 3
  22. ^ Грегори, Т. Райан (2008). «Эволюция как факт, теория и путь». Эволюция: образование и пропаганда. 1: 46–52. Дои:10.1007 / s12052-007-0001-z.
  23. ^ а б Рыцарь, Робин; Фриланд, Стивен Дж .; Ландвебер, Лаура Ф. (январь 2001 г.). «Перепрограммирование клавиатуры: эволюционируемость генетического кода». Природа Обзоры Генетика. 2 (1): 49–58. Дои:10.1038/35047500. PMID  11253070. S2CID  12267003.
  24. ^ Тан, Кер (14 мая 2010 г.). «Все виды произошли от одной клетки, результаты исследования». Национальная география. Получено 22 ноября 2017.
  25. ^ Эгель, Ричард (март 2012 г.). «Первичный эукариогенез: о коллективной природе доклеточных состояний, предков современной жизни». Жизнь. 2 (1): 170–212. Дои:10.3390 / жизнь2010170. ЧВК  4187143. PMID  25382122.
  26. ^ Шарма, Н. С. (2005). Преемственность и эволюция животных. Mittal Publications. С. 32–. ISBN  978-81-8293-018-6.
  27. ^ Лейн, Ник (2015). Жизненно важный вопрос: почему жизнь такая, какая она есть?. Профильные книги. ISBN  978-1781250365.
  28. ^ Теобальд, Дуглас Л. «Предсказание 1.3: соответствие независимых филогений». 29+ свидетельств макроэволюции: научное обоснование общего происхождения. Версия 2.89. Фонд TalkOrigins. Получено 2009-11-20.
  29. ^ Ёнэдзава, Такахиро; Хасэгава, Масами (16 декабря 2010 г.). «Была ли доказана универсальная общая родословная?». Природа. 468 (7326): E9. Bibcode:2010Натура.468Э ... 9л. Дои:10.1038 / природа09482. PMID  21164432. S2CID  4318346.
  30. ^ Теобальд, Дуглас Л. (16 декабря 2010 г.). "Теобальд ответ". Природа. 468 (7326): E10. Bibcode:2010Натура.468Э..10Т. Дои:10.1038 / природа09483. S2CID  4317014.
  31. ^ Теобальд, Дуглас Л. (24 ноября 2011 г.). «Об универсальном общем происхождении, сходстве последовательностей и филогенетической структуре: грехи P-значений и достоинства байесовских доказательств». Биология Директ. 6 (1): 60. Дои:10.1186/1745-6150-6-60. ЧВК  3314578. PMID  22114984.

внешняя ссылка