Рибосомная РНК - Ribosomal RNA

Трехмерное изображение рибосомы, показывающее рРНК темно-синим (малая субъединица) и темно-красным (большая субъединица). Более светлые цвета представляют рибосомальные белки.

Рибосомальная рибонуклеиновая кислота (рРНК) является разновидностью некодирующая РНК который является основным компонентом рибосомы, необходим для всех клеток. рРНК представляет собой рибозим который выполняет синтез белка в рибосомах. Рибосомная РНК транскрибируется с рибосомная ДНК (рДНК), а затем связывается с рибосомальные белки формировать маленький и большой субъединицы рибосомы. рРНК - это физический и механический фактор рибосомы, который заставляет переносить РНК (тРНК) и информационная РНК (мРНК) для обработки и преобразования последних в белки.[1] Рибосомная РНК - преобладающая форма РНК, обнаруживаемая в большинстве клеток; он составляет около 80% клеточной РНК, хотя сам никогда не транслировался в белки. Рибосомы состоят примерно из 60% рРНК и 40% рибосомных белков по массе.

Структура

Хотя первичная структура последовательностей рРНК могут различаться у разных организмов, спаривание оснований внутри этих последовательностей обычно образует стебель-петля конфигурации. Длина и положение этих стержневых петель рРНК позволяют им создавать трехмерные структуры рРНК, которые похожи по всей длине. разновидность.[2] Благодаря этим конфигурациям рРНК может образовывать тесные и специфические взаимодействия с рибосомными белками с образованием рибосомных субъединиц. Эти рибосомальные белки содержат основные остатки (в отличие от кислотных остатков) и ароматических остатков (т.е. фенилаланин, тирозин и триптофан ) позволяя им образовывать химические взаимодействия со связанными с ними участками РНК, такими как складывающиеся взаимодействия. Рибосомные белки также могут поперечно связываться с сахарно-фосфатным остовом рРНК с сайтами связывания, которые состоят из основных остатков (т. Е. лизин и аргинин ). Все рибосомные белки (включая специфические последовательности, которые связываются с рРНК) были идентифицированы. Эти взаимодействия наряду с ассоциацией малых и больших рибосомных субъединиц приводят к функционированию рибосомы, способной синтезировать белки.[3]

Пример полностью собранной малой субъединицы рибосомной РНК у прокариот, в частности Thermus Thermophilus. Фактическая рибосомная РНК (16S) показана оранжевым цветом, а рибосомные белки присоединены синим.

Рибосомная РНК состоит из двух рибосомных субъединиц: большой рибосомальной субъединицы (LSU ) и малая рибосомная субъединица (СумГУ ). Между этими субъединицами типы рРНК, используемые для формирования субъединицы, различаются.

В рибосомах прокариот, таких как бактерии SSU содержит одну небольшую молекулу рРНК (~ 1500 нуклеотидов), в то время как LSU содержит одну небольшую молекулу рРНК и одну большую молекулу рРНК (~ 3000 нуклеотидов). Они сочетаются с ~ 50 рибосомными белки с образованием рибосомных субъединиц. В прокариотических рибосомах обнаружены три типа рРНК: 23S и 5S рРНК в LSU и 16S рРНК в SSU.

В рибосомах эукариот, таких как люди SSU содержит одну небольшую рРНК (~ 1800 нуклеотидов), тогда как LSU содержит две небольшие рРНК и одну молекулу большой рРНК (~ 5000 нуклеотидов). РРНК эукариот насчитывает более 70 рибосомных белки которые взаимодействуют с образованием более крупных и полиморфных рибосомных единиц по сравнению с прокариотами.[4] У эукариот существует четыре типа рРНК: 3 вида в LSU и 1 в SSU.[5] Дрожжи была традиционной моделью наблюдения за эукариотический Поведение и процессы рРНК, приводящие к дефициту разнообразия исследований. Только в течение последнего десятилетия технический прогресс (особенно в области Крио-ЭМ ) позволили провести предварительное исследование рибосомного поведения в других эукариоты.[6] В дрожжи, LSU содержит 5S, 5.8S и 28S рРНК. Комбинированные 5.8S и 28S примерно эквивалентны по размеру и функциям прокариотическому подтипу 23S рРНК, за исключением сегментов расширения (ES), которые локализованы на поверхности рибосома которые считались происходящими только в эукариоты. Однако недавно Асгард филы, а именно, Lokiarchaeota и Heimdallarchaeota, считающихся ближайшими родственниками архей Эукария, как сообщалось, обладают двумя сверхразмерными ES в их 23S рРНК.[7] Точно так же 5S рРНК содержит 108-нуклеотидную вставку в рибосомы галофильной археи. Halococcus morrhuae.[8][9]

SSU эукариот содержит субъединицу 18S рРНК, которая также содержит ES. ES SSU обычно меньше, чем ES LSU.

Последовательности рРНК SSU и LSU широко используются для изучения эволюционные отношения среди организмов, так как они имеют древнее происхождение[10], встречаются во всех известных формах жизни и устойчивы к горизонтальный перенос генов. Последовательности рРНК сохраняются (не изменяются) с течением времени из-за их решающей роли в функции рибосомы.[11] Филогенный информация, полученная из 16s рРНК, в настоящее время используется в качестве основного метода разграничения схожих видов прокариот путем вычисления нуклеотид сходство.[12] Каноническое древо жизни - это родословная системы перевода.

Подтипы рРНК LSU были названы рибозимы потому что рибосомные белки не могут связываться с каталитическим сайтом рибосома в этой области (особенно пептидилтрансфераза center, или PTC). Подтипы рРНК SSU декодируют мРНК в ее центре декодирования (DC).[13] Рибосомные белки не могут попасть в ДК.

Структура рРНК может резко измениться, чтобы повлиять на связывание тРНК с рибосомой во время трансляции других мРНК.[14] В 16s рРНК это происходит, когда определенные нуклеотиды в рРНК, по-видимому, чередуют спаривание оснований между одним нуклеотидом или другим, образуя «переключатель», который изменяет конформацию рРНК. Этот процесс может влиять на структуру LSU и SSU, предполагая, что этот конформационный переключатель в структуре рРНК влияет на всю рибосому в ее способности сопоставлять кодон с его антикодоном при выборе тРНК, а также декодировать мРНК.[15]

Сборка

Интеграция и сборка рибосомальной РНК в рибосомы начинается с их складывания, модификации, обработки и сборки с рибосомальные белки чтобы сформировать две рибосомные субъединицы, LSU и SSU. В Прокариоты, включение рРНК происходит в цитоплазме из-за отсутствия мембраносвязанных органелл. В Эукариоты однако этот процесс в основном происходит в ядрышко и инициируется синтезом пре-РНК. Для этого необходимо присутствие всех трех РНК-полимераз. Фактически, транскрипция пре-РНК с помощью РНК-полимеразы I составляет около 60% от общей транскрипции клеточной РНК.[16] За этим следует сворачивание пре-РНК, так что она может быть собрана с рибосомными белками. Это сворачивание катализируется эндо- и экзонуклеазы, РНК геликасы, GTPases и АТФазы. Затем рРНК подвергается эндо- и экзонуклеолитическому процессингу для удаления внешний и внутренние расшифрованные прокладки.[17] Затем пре-РНК претерпевает модификации, такие как метилирование или псевдоуридинилирование перед сборкой факторов сборки рибосом и рибосомных белков с пре-РНК с образованием пре-рибосомных частиц. После прохождения нескольких стадий созревания и последующего выхода из ядрышка в цитоплазму эти частицы объединяются, образуя рибосомы.[17] Основные и ароматный остатки, обнаруженные в первичной структуре рРНК, позволяют благоприятно штабелирование взаимодействия и притяжение к рибосомным белкам, создавая эффект перекрестного сшивания между остовом рРНК и другими компонентами рибосомной единицы. Более подробную информацию об инициации и начальной части этих процессов можно найти в разделе «Биосинтез».

Функция

Упрощенное изображение рибосомы (с SSU и LSU, искусственно отделенными здесь для целей визуализации), изображающее сайты A и P, а также малые и большие субъединицы рибосомы, работающие вместе.

Универсально консервативные вторичные структурные элементы рРНК у разных видов показывают, что эти последовательности являются одними из старейших обнаруженных. Они играют важную роль в формировании каталитических сайтов трансляции мРНК. Во время трансляции мРНК функция рРНК связывает как мРНК, так и тРНК, облегчая процесс трансляции кодоновой последовательности мРНК в аминокислоты. рРНК инициирует катализ синтеза белка, когда тРНК зажата между SSU и LSU. В SSU мРНК взаимодействует с антикодонами тРНК. В LSU акцепторный стержень аминокислоты тРНК взаимодействует с рРНК LSU. Рибосома катализирует сложноэфирно-амидный обмен, переводя С-конец растущего пептида с тРНК на амин аминокислоты. Эти процессы могут происходить благодаря участкам внутри рибосомы, в которых эти молекулы могут связываться, образованным петлями-стеблями рРНК. У рибосомы есть три таких сайта связывания, которые называются сайтами A, P и E:

  • Как правило, сайт A (аминоацил) содержит аминоацил-тРНК (a тРНК этерифицирован до аминокислоты на 3'-конце).
  • Сайт P (пептидил) содержит тРНК этерифицированный к возникающему пептиду. Свободный амино (NH2) группа сайта A тРНК атакует сложноэфирную связь тРНК P-сайта, вызывая перенос растущего пептида на аминокислоту в A-сайте. Реакция протекает в центр пептидилтрансферазы.
  • Сайт E (выход) содержит тРНК который был выведен, со свободным 3'-концом (без аминокислоты или растущего пептида).

Один мРНК могут транслироваться одновременно несколькими рибосомами. Это называется полисом.

В прокариоты, была проделана большая работа для дальнейшего определения важности рРНК в трансляции мРНК. Например, было обнаружено, что сайт A состоит в основном из 16S рРНК. Помимо различных белковых элементов, которые взаимодействуют с тРНК Предполагается, что если бы эти белки были удалены без изменения структуры рибосомы, сайт продолжал бы нормально функционировать. На участке P путем наблюдения кристаллические структуры было показано, что 3'-конец 16s рРНК может складываться в сайт, как если бы молекула мРНК. Это приводит к межмолекулярным взаимодействиям, которые стабилизируют субъединицы. Точно так же, как и сайт A, сайт P в основном содержит рРНК с небольшим количеством белки. В пептидилтрансфераза центр, например, образован нуклеотиды от субъединицы 23S рРНК. Фактически, исследования показали, что пептидилтрансфераза center не содержит белков и полностью инициируется присутствием рРНК. В отличие от сайтов A и P, сайт E содержит больше белки. Потому что белки не являются существенными для функционирования сайтов A и P, молекулярный состав сайта E показывает, что он, возможно, возник позже. В примитивном рибосомы, похоже, что тРНК вышел с сайта P. Кроме того, было показано, что Электронный сайт тРНК связываются как с 16S, так и с 23S субъединицами рРНК.[18]

Субъединицы и ассоциированная рибосомная РНК

Схема типов рибосомных РНК и того, как они объединяются для создания рибосомных субъединиц.

Обе прокариотический и эукариотический рибосомы можно разделить на две субъединицы, одну большую и одну маленькую. Типичные виды, используемые в таблице ниже для их соответствующих рРНК, представляют собой бактерии кишечная палочка (прокариот ) и человеческий (эукариот ). Обратите внимание, что «nt» представляет длину типа рРНК в нуклеотидах, а «S» (например, в «16S») представляет Сведберг единицы.

ТипРазмерБольшая субъединица (LSU рРНК )Малая субъединица (SSU рРНК )
прокариотический70S50S (5S : 120 нт, 23S : 2906 нт)30S (16S : 1542 нт)
эукариотический80-е годы60S (5S : 121 нт,[19] 5,8S : 156 нт,[20] 28S : 5070 н.[21])40S (18S : 1869 н.[22])

S-единицы субъединиц (или рРНК) нельзя просто добавить, потому что они представляют собой меры скорости оседания, а не массы. На скорость оседания каждой субъединицы влияет ее форма, а также ее масса. Могут быть добавлены единицы нуклеотидов, поскольку они представляют собой целое число единиц в линейных полимерах рРНК (например, общая длина человеческой рРНК = 7216 нуклеотидов).

Кластеры генов кодирование рРНК обычно называют "рибосомная ДНК " или же рДНК (обратите внимание, что этот термин, кажется, подразумевает, что рибосомы содержат ДНК, что не так).

У прокариот

Пример типичной последовательности рДНК, повторяющейся по всему бактериальному геному, с выделением внутренняя расшифрованная прокладка особенности в Фитоплазма.

В прокариоты небольшая 30S рибосомная субъединица содержит 16S рибосомная РНК. Большая 50S рибосомная субъединица содержит два вида рРНК (5S и 23S рибосомные РНК ). Следовательно, можно сделать вывод, что в обоих бактерии и археи есть один ген рРНК, который кодирует все три типа рРНК: 16S, 23S и 5S.[23]

Бактериальные гены 16S рибосомной РНК, 23S рибосомной РНК и 5S рРНК обычно организованы как совместно транскрибируемые гены. оперон. Как показано на изображении в этом разделе, есть внутренняя расшифрованная прокладка между 16S и 23S рРНК гены.[24] Может быть одна или несколько копий оперон рассредоточены в геном (Например, кишечная палочка их семь). Обычно у бактерий насчитывается от одной до пятнадцати копий.[23]

Археи содержит либо один ген рРНК оперон или до четырех экземпляров одного и того же оперон.[23]

3'-конец рибосомной РНК 16S (в рибосоме) распознает последовательность на 5'-конце мРНК называется Последовательность Шайна-Далгарно.

У эукариот

Маленькая субъединица рибосомной РНК, 5 'домен, взятый из Рфам база данных. Этот пример RF00177, фрагмент некультивируемой бактерии.

В отличие, эукариоты обычно имеют много копий генов рРНК, организованных в тандем повторяет. У человека примерно 300–400 повторов присутствуют в пяти кластерах, расположенных на хромосомы 13 (RNR1 ), 14 (RNR2 ), 15 (RNR3 ), 21 (RNR4 ) и 22 (RNR5 ). Диплоидные люди имеют 10 кластеров геномных рДНК которые в сумме составляют менее 0,5% от человеческий геном.[25]

Ранее считалось, что повторение рДНК последовательности были идентичны и служили дублированием или отказоустойчивостью для учета естественных ошибок репликации и точечные мутации. Однако изменение последовательности в рДНК (и впоследствии рРНК) у людей через несколько хромосомы наблюдается как внутри, так и между людьми. Многие из этих вариаций палиндромные последовательности и возможные ошибки из-за репликации.[26] Некоторые варианты также экспрессируются тканеспецифичным образом у мышей.[27]

Клетки млекопитающих имеют 2 митохондриальных (12S и 16S ) молекулы рРНК и 4 типа цитоплазматической рРНК (субъединицы 28S, 5,8S, 18S и 5S). 28S, 5.8S и 18S рРНК кодируются одной транскрипционной единицей (45S), разделенной 2 расшифрованные внутри распорки. Первый спейсер соответствует найденному у бактерий и археи, а другой спейсер представляет собой вставку в то, что было 23S рРНК у прокариот.[24] 45S рДНК организован в 5 кластеров (каждый имеет 30-40 повторов) на хромосомах 13, 14, 15, 21 и 22. Они транскрибируются с помощью РНК-полимераза I. ДНК субъединицы 5S встречается в тандемные массивы (~ 200–300 истинных генов 5S и множество дисперсных псевдогенов), самый крупный на хромосоме 1q41-42. 5S рРНК транскрибируется РНК-полимераза III. В 18S рРНК в большинстве эукариоты находится в малой субъединице рибосомы, а большая субъединица содержит три вида рРНК ( 5S, 5,8S и 28S у млекопитающих, 25S у растений, рРНК).

Третичная структура малой субъединицы рибосомальной РНК (SSU рРНК) была решена с помощью Рентгеновская кристаллография.[28] Вторичная структура SSU рРНК содержит 4 различных домена - 5 ', центральный, 3' главный и 3 'минорный домены. Модель вторичная структура для домена 5 '(500-800 нуклеотиды ) Показано.

Биосинтез

Основная статья: Биогенез рибосом

У эукариот

В качестве строительных блоков для органелла, производство рРНК в конечном итоге ограничивающий шаг в синтезе рибосома. в ядрышко, рРНК синтезируется РНК-полимераза I используя специальные гены (рДНК ), которые кодируют его, которые неоднократно встречаются в геном.[29] Гены, кодирующие 18S, 28S и 5.8S рРНК, расположены в область организатора ядрышка и транскрибируются в большие молекулы предшественников рРНК (пре-рРНК) посредством РНК-полимераза I. Эти молекулы пре-рРНК разделены внешними и внутренними спейсерами, а затем метилированный, что является ключевым для дальнейшей сборки и складывание.[30][31][32] После разделения и высвобождения в виде отдельных молекул сборочные белки связываются с каждой цепью голой рРНК и сворачивают ее в ее функциональную форму, используя кооперативную сборку и постепенное добавление дополнительных складчатых белков по мере необходимости. Точные детали того, как сворачивающиеся белки связываются с рРНК и как достигается правильная укладка, остаются неизвестными.[33] Комплексы рРНК затем подвергаются дальнейшему процессингу реакциями, включающими экзо- и эндо-нуклеолитические расщепления под руководством snoRNA (малые ядрышковые РНК) в комплексе с белками. Поскольку эти комплексы уплотняются вместе, образуя связную единицу, взаимодействия между рРНК и окружающими рибосомами белки постоянно модернизируются во время сборки, чтобы обеспечить стабильность и защиту участок связывания.[34] Этот процесс называется фазой «созревания» жизненного цикла рРНК. Было обнаружено, что модификации, происходящие во время созревания рРНК, непосредственно влияют на контроль экспрессия гена путем обеспечения физического регулирования трансляционного доступа тРНК и мРНК.[35] Некоторые исследования показали, что обширные метилирование различных типов рРНК также необходимо в это время для поддержания рибосома стабильность.[36][37]

Гены 5S рРНК расположены внутри ядрышко и транскрибируются в пре-5S рРНК посредством РНК-полимераза III.[38] Пре-5S рРНК входит в ядрышко для обработки и сборки с 28S и 5.8S рРНК с образованием LSU. 18S рРНК образует SSU путем объединения с многочисленными рибосомальные белки. После сборки обоих субъединиц они по отдельности экспортируются в цитоплазма сформировать блок 80S и начать инициацию перевод из мРНК.[39][40]

Рибосомная РНК некодирование и никогда не переводится на белки любого вида: рРНК только записано из рДНК а затем созрели для использования в качестве структурного строительного блока для рибосом. Транскрибируемая рРНК связана с рибосомальные белки сформировать подразделения рибосомы и действует как физическая структура, которая подталкивает мРНК и тРНК сквозь рибосома обработать и перевести их.[1]

Эукариотическая регуляция

Синтез рРНК с повышенным и пониженным регулированием поддерживать гомеостаз посредством множества процессов и взаимодействий:

  • В киназа AKT косвенно способствует синтезу рРНК как РНК полимераза I является AKT-зависимой.[41]
  • Определенные ангиогенные рибонуклеазы, Такие как ангиогенин (ANG), могут перемещаться и накапливаться в ядрышко. Когда концентрация АНГ становится слишком высокой, некоторые исследования показали, что АНГ может связываться с промоутер регион рДНК и излишне увеличивают транскрипцию рРНК. Это может повредить ядрышко и даже привести к неконтролируемой транскрипции и рак.[42]
  • Во время ограничения клеточной глюкозы, АМФ-активированная протеинкиназа (AMPK) обескураживает метаболические процессы которые потребляют энергию, но не являются необходимыми. В результате он способен фосфорилировать РНК-полимераза I (по сайту Ser-635), чтобы подавить синтез рРНК путем нарушения инициация транскрипции.[43]
  • Обесценение или удаление более чем одного псевдоуридин или 29-O-метилирование участков из центра декодирования рибосомы значительно снижает скорость рРНК транскрипция за счет снижения темпов включения новых аминокислоты.[44]
  • Формирование гетерохроматин важен для подавления транскрипции рРНК, без которой рибосомная РНК синтезируется бесконтрольно и значительно сокращает продолжительность жизни организма.[45]

У прокариот

Похожий на эукариоты, продукция рРНК - это ограничивающий шаг в прокариотический синтез рибосома. В Кишечная палочка, было обнаружено, что рРНК записано от двух промоторов P1 и P2, обнаруженных в семи различных ррн опероны. P1 промоутер специфически отвечает за регулирование синтеза рРНК при умеренных и высоких темпах роста бактерий. Поскольку транскрипционная активность этого промоутер прямо пропорциональна скорости роста, в первую очередь отвечает за рРНК регулирование. Повышенная концентрация рРНК служит механизмом отрицательной обратной связи для синтеза рибосом. Было обнаружено, что высокая концентрация NTP необходима для эффективного транскрипция из ррн Промоторы P1. Считается, что они образуют стабилизирующие комплексы с РНК-полимераза и промоутеры. В бактерии в частности, эта связь высокой концентрации NTP с повышенным синтезом рРНК дает молекулярное объяснение того, почему синтез рибосом и, следовательно, белков зависит от скорости роста. Низкая скорость роста дает более низкие скорости синтеза рРНК / рибосом, в то время как более высокая скорость роста дает более высокую скорость синтеза рРНК / рибосом. Это позволяет ячейке экономить энергию или увеличивать ее метаболическая активность в зависимости от его потребностей и имеющихся ресурсов.[46][47][48]

В прокариотические клетки, каждый ген рРНК или оперон транскрибируется в единый предшественник РНК, который включает 16S, 23S, 5S рРНК и тРНК последовательности вместе с транскрибированными спейсерами. Затем обработка РНК начинается до того, как транскрипция завершено. Во время реакций процессинга рРНК и тРНК высвобождаются как отдельные молекулы.[49]

Прокариотическая регуляция

Поскольку рРНК играет жизненно важную роль в физиология клетки из прокариоты, есть много перекрытий в рРНК регулирование механизмы. На уровне транскрипции существуют как положительные, так и отрицательные эффекторы транскрипции рРНК, которые способствуют поддержанию клеткой гомеостаз:

Деградация

Рибосомная РНК довольно стабильна по сравнению с другими распространенными типами РНК и сохраняется в течение более длительных периодов времени в здоровой клеточной среде. После сборки в функциональные единицы рибосомная РНК внутри рибосом стабильна в стационарной фазе жизненного цикла клетки в течение многих часов.[50] Деградация может быть вызвана «остановкой» рибосомы, состоянием, которое возникает, когда рибосома распознает дефектную мРНК или сталкивается с другими трудностями обработки, которые вызывают прекращение трансляции рибосомы. Как только рибосома останавливается, на рибосоме запускается специальный путь, нацеленный на весь комплекс для разборки.[51]

У эукариот

Как и любой белок или РНК, продукция рРНК подвержена ошибкам, приводящим к продукции нефункциональной рРНК. Чтобы исправить это, клетка допускает деградацию рРНК через нефункциональный путь распада рРНК (NRD).[52] Большая часть исследований по этой теме проводилась на эукариотических клетках, в частности Saccharomyces cerevisiae дрожжи. В настоящее время только базовое понимание того, как клетки способны нацеливать функционально дефектные рибосомы для убиквинирования и деградации у эукариот.[53]

  • Путь NRD для субъединицы 40S может быть независимым или отдельным от пути NRD для субъединицы 60S. Было замечено, что некоторые гены были способны влиять на деградацию одних пре-РНК, но не других.[54]
  • Многочисленные белки вовлечены в путь NRD, такие как Mms1p и Rtt101p, которые, как полагают, образуют комплекс для нацеливания рибосомы на деградацию. Обнаружено, что Mms1p и Rtt101p связываются вместе, а Rtt101p, как полагают, рекрутирует убиквитин E3 лигаза сложный, учитывающий нефункциональные рибосомы быть убихинизированным до разложения.[55]
    • Прокариотам не хватает гомолог для Mms1, поэтому непонятно, как прокариоты способны разрушать нефункциональные рРНК.
  • Темпы роста эукариотические клетки не оказалось, на что существенно влияет накопление нефункциональных рРНК.

У прокариот

Хотя исследований деградации рибосомальной РНК в прокариоты в сравнении с эукариоты, все еще был интерес к тому, бактерии следовать аналогичной схеме деградации по сравнению с NRD у эукариот. Большая часть исследований сделана для прокариоты был проведен на кишечная палочка. Было обнаружено множество различий между деградацией эукариотической и прокариотической рРНК, что привело исследователей к выводу, что эти две деградации происходят по разным путям.[56]

  • Определенный мутации в рРНК, которые были способны запускать деградацию рРНК в эукариоты не смогли сделать это в прокариоты.
  • Точечные мутации в 23S рРНК будет вызывать деградацию как 23S, так и 16S рРНК, по сравнению с эукариоты, в котором мутации в одной субъединице приведет только к деградации этой субъединицы.
  • Исследователи обнаружили, что удаление целого спиральная структура (H69) из 23S рРНК не запускал ее деградацию. Это заставило их поверить, что H69 имеет решающее значение для эндонуклеазы для распознавания и деградации мутированной рРНК.

Сохранение и стабильность последовательности

Из-за преобладающего и непоколебимого характера рРНК во всех организмы, изучение его устойчивости к передача гена, мутация, а изменение без разрушения организма стало популярной областью интересов. Было обнаружено, что гены рибосомной РНК толерантны к модификации и вторжению. Когда секвенирование рРНК является измененные, было обнаружено, что клетки становятся скомпрометированными и быстро прекращают нормальную функцию.[57] Эти ключевые характеристики рРНК стали особенно важны для проектов баз данных генов (обширные онлайн-ресурсы, такие как SILVA[58] или SINA[59]), где выравнивание последовательностей рибосомных РНК из разных биологических доменов значительно облегчает "таксономический назначение, филогенетический анализ и исследование микробного разнообразия ».[58]

Примеры устойчивости:

  • Добавление больших бессмысленных фрагментов РНК во многие части единицы 16S рРНК не изменяет функции рибосомальный агрегат в целом.[60]
  • Некодирующая РНКRD7 обладает способностью изменять процессинг рРНК, чтобы сделать молекулы устойчивыми к деградации под действием карбоновая кислота. Это ключевой механизм в поддержании концентрации рРНК во время активного роста, когда кислота нарост (из-за субстрата фосфорилирование требуется для производства АТФ ) может стать токсичным для внутриклеточный функции.[61]
  • Вставка рибозимы-молот которые способны к цис-расщеплению вдоль 16S рРНК, значительно подавляют функцию и снижают стабильность.[60]
  • В то время как большинство клеточных функций сильно ухудшается после короткого периода воздействия гипоксический окружающей среде, рРНК остается не деградированной и рассасывается после шести дней продолжительной гипоксии. Только после такого продолжительного периода времени промежуточные соединения рРНК (свидетельствующие о том, что наконец происходит деградация) начинают проявляться.[62]

Значимость

На этой диаграмме показано, как секвенирование рРНК у прокариот может в конечном итоге быть использовано для производства фармацевтических препаратов для борьбы с болезнями, вызванными теми самыми микробами, из которых изначально была получена рРНК.

Характеристики рибосомной РНК важны в эволюция, таким образом, таксономия и лекарство.

Гены человека

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Берк, Арнольд; Балтимор, Дэвид; Лодиш, Харви; Дарнелл, Джеймс; Мацудаира, Пол; Зипурский, С. Лоуренс (1996-01-31). Molekulare Zellbiologie. Берлин, Бостон: DE GRUYTER. Дои:10.1515/9783110810578. ISBN  9783110810578.
  2. ^ Лодиш, Харви; Берк, Арнольд; Зипурский, С. Лоуренс; Мацудаира, Пол; Балтимор, Дэвид; Дарнелл, Джеймс (2000). «Три роли РНК в синтезе белка». Молекулярная клеточная биология. 4-е издание.
  3. ^ Урлауб Х., Круфт В., Бишоф О., Мюллер Е.С., Виттманн-Либольд Б. (сентябрь 1995 г.). «Особенности связывания белка с рРНК и их структурное и функциональное значение в рибосомах, как определено исследованиями перекрестного связывания». Журнал EMBO. 14 (18): 4578–88. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00137.x. ЧВК  394550. PMID  7556101.
  4. ^ Ferreira-Cerca S, Pöll G, Gleizes PE, Tschochner H, Milkereit P (октябрь 2005 г.). «Роль эукариотических рибосомных белков в созревании и транспорте пре-18S рРНК и функции рибосом». Молекулярная клетка. 20 (2): 263–75. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.09.005. PMID  16246728.
  5. ^ Szymański M, Barciszewska MZ, Erdmann VA, Barciszewski J (май 2003 г.). «5 S рРНК: структура и взаимодействия». Биохимический журнал. 371 (Pt 3): 641–51. Дои:10.1042 / bj20020872. ЧВК  1223345. PMID  12564956.
  6. ^ Хенрас А.К., Плиссон-Частанг К., О'Донохью М.Ф., Чакраборти А., Глейзес ЧП (01.03.2015). «Обзор прерибосомального процессинга РНК у эукариот». Междисциплинарные обзоры Wiley: РНК. 6 (2): 225–42. Дои:10.1002 / wrna.1269. ЧВК  4361047. PMID  25346433.
  7. ^ Пенев П.И., Фахретаха-Аваль С., Патель В.Дж., Канноне Дж.Дж., Гутелл Р.Р., Петров А.С., Уильямс Л.Д., Гласс Дж.Б. (август 2020 г.). «Увеличенные сегменты экспансии рибосомной РНК в архей Асгарда». Геномная биология и эволюция. 12 (10): 1694–1710. Дои:10.1093 / gbe / evaa170. ЧВК  7594248. PMID  32785681.
  8. ^ Luehrsen, KR .; Николсон, Делавэр; Юбэнкс, округ Колумбия; Fox, GE (май 1981 г.). «Архебактериальная 5S рРНК содержит длинную инсерционную последовательность». Природа. 293 (5835): 755–756. Bibcode:1981Натура.293..755L. Дои:10.1038 / 293755a0. PMID  6169998. S2CID  4341755.
  9. ^ Тирумалай, MR; Kaelber, JT; Парк, ДР; Тран, Q; Fox, GE (31 августа 2020 г.). "Крио-электронная микроскопия, визуализация большой вставки в 5S рибосомной РНК чрезвычайно галофильной археи. Halococcus morrhuae". FEBS Open Bio. 10 (10): 1938–1946. Дои:10.1002/2211-5463.12962. ЧВК  7530397. PMID  32865340.
  10. ^ Woese CR, Fox GE (ноябрь 1977 г.). «Филогенетическая структура прокариотического домена: первичные царства». Proc. Natl. Акад. Sci. Соединенные Штаты Америки. 74 (11): 5088–5090. Bibcode:1977PNAS ... 74.5088W. Дои:10.1073 / пнас.74.11.5088. ЧВК  432104. PMID  270744.
  11. ^ Лагесен К., Халлин П., Родланд Э.А., Стерфельдт Х.Х., Рогнес Т., Уссери Д.В. (01.05.2007). «RNAmmer: последовательная и быстрая аннотация генов рибосомной РНК». Исследования нуклеиновых кислот. 35 (9): 3100–8. Дои:10.1093 / нар / гкм160. ЧВК  1888812. PMID  17452365.
  12. ^ Чун Дж., Ли Дж. Х., Чон Й, Ким М., Ким С., Ким Б. К., Лим Ю. В. (октябрь 2007 г.). «EzTaxon: веб-инструмент для идентификации прокариот на основе последовательностей гена 16S рибосомной РНК». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 57 (Пт 10): 2259–61. Дои:10.1099 / ijs.0.64915-0. PMID  17911292.
  13. ^ Гош, Арнаб; Комар, Антон А (2 января 2015 г.). «Эукариот-специфические расширения малой субъединицы рибосомных белков: структура и функция». Перевод. 3 (1): e999576. Дои:10.1080/21690731.2014.999576. ЧВК  4682806. PMID  26779416.
  14. ^ Лодмелл Дж. С., Дальберг А. Э. (август 1997 г.). «Конформационный переключатель в рибосомной РНК Escherichia coli 16S во время декодирования матричной РНК». Наука. 277 (5330): 1262–7. Дои:10.1126 / science.277.5330.1262. PMID  9271564.
  15. ^ Габашвили И.С., Агравал Р.К., Грассуччи Р., Сквайрс К.Л., Дальберг А.Е., Франк Дж. (Ноябрь 1999 г.). «Основные перестройки в трехмерной рибосомной структуре 70S, вызванные конформационным переключением в 16S рибосомной РНК». Журнал EMBO. 18 (22): 6501–7. Дои:10.1093 / emboj / 18.22.6501. ЧВК  1171713. PMID  10562562.
  16. ^ Вулфорд Дж. Л., Базерга С. Дж. (Ноябрь 2013 г.). «Биогенез рибосом в дрожжах Saccharomyces cerevisiae». Генетика. 195 (3): 643–81. Дои:10.1534 / genetics.113.153197. ЧВК  3813855. PMID  24190922.
  17. ^ а б Баслер Дж., Хёрт Э. (июнь 2019 г.). «Сборка эукариотических рибосом». Ежегодный обзор биохимии. 88 (1): 281–306. Дои:10.1146 / annurev-biochem-013118-110817. PMID  30566372.
  18. ^ Мур ПБ, Стейтц Т.А. (июль 2002 г.). «Участие РНК в функции рибосом». Природа. 418 (6894): 229–35. Bibcode:2002Натура.418..229М. Дои:10.1038 / 418229a. PMID  12110899. S2CID  4324362.
  19. ^ "Homo sapiens 5S рибосомная РНК ». 2018-05-24. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  20. ^ "Homo sapiens 5.8S рибосомная РНК ". 2017-02-10. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  21. ^ "Homo sapiens 28S рибосомная РНК ". 2017-02-04. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  22. ^ "Homo sapiens 18S рибосомная РНК ". 2017-02-04. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  23. ^ а б c Стоддард С.Ф., Смит Б.Дж., Хайн Р., Роллер Б.Р., Шмидт TM (январь 2015 г.). «rrnDB: улучшенные инструменты для интерпретации обилия генов рРНК у бактерий и архей и новая основа для будущего развития». Исследования нуклеиновых кислот. 43 (Проблема с базой данных): D593-8. Дои:10.1093 / нар / gku1201. ЧВК  4383981. PMID  25414355.
  24. ^ а б Лафонтен Д.Л., Толлервей Д. (июль 2001 г.). «Функция и синтез рибосом». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология. 2 (7): 514–20. Дои:10.1038/35080045. HDL:1842/729. PMID  11433365. S2CID  2637106.
  25. ^ Stults DM, Killen MW, Williamson EP, Hourigan JS, Vargas HD, Arnold SM и др. (Декабрь 2009 г.). «Кластеры генов рРНК человека являются горячими точками рекомбинации при раке». Исследования рака. 69 (23): 9096–104. Дои:10.1158 / 0008-5472.can-09-2680. PMID  19920195. S2CID  6162867.
  26. ^ Ким Дж. Х., Дильтей А. Т., Нагараджа Р., Ли Х. С., Корен С., Дудекула Д. и др. (Июль 2018). «Вариация генов рибосомной РНК 21 хромосомы человека, характеризующаяся клонированием TAR и долгосрочным секвенированием». Исследования нуклеиновых кислот. 46 (13): 6712–6725. Дои:10.1093 / нар / gky442. ЧВК  6061828. PMID  29788454.
  27. ^ Паркс М.М., Курило С.М., Дасс Р.А., Боймар Л., Лайден Д., Винсент К.Т., Бланшар СК (февраль 2018 г.). «Вариантные аллели рибосомной РНК консервативны и проявляют тканеспецифическую экспрессию». Достижения науки. 4 (2): eaao0665. Bibcode:2018SciA .... 4..665P. Дои:10.1126 / sciadv.aao0665. ЧВК  5829973. PMID  29503865.
  28. ^ Юсупов М.М., Юсупова Г.З., Бауком А., Либерман К., Эрнест Т.Н., Кейт Дж. Х., Ноллер Х. Ф. (май 2001 г.). «Кристаллическая структура рибосомы при разрешении 5,5 А». Наука. 292 (5518): 883–96. Bibcode:2001Научный ... 292..883Y. Дои:10.1126 / science.1060089. PMID  11283358. S2CID  39505192.
  29. ^ «Рибосомная РНК | генетика». Энциклопедия Британника. Получено 2019-10-02.
  30. ^ Земора Г., Вальдсих С. ​​(ноябрь 2010 г.). «Сворачивание РНК в живых клетках». РНК Биология. 7 (6): 634–41. Дои:10.4161 / rna.7.6.13554. ЧВК  3073324. PMID  21045541.
  31. ^ Фернандес-Торнеро С., Морено-Морсилло М., Рашид У. Дж., Тейлор Н. М., Руис Ф. М., Грун Т. и др. (Октябрь 2013). «Кристаллическая структура 14-субъединичной РНК-полимеразы I». Природа. 502 (7473): 644–9. Bibcode:2013Натура.502..644F. Дои:10.1038 / природа12636. PMID  24153184. S2CID  205235881.
  32. ^ Энгель C, Sainsbury S, Cheung AC, Kostrewa D, Cramer P (октябрь 2013 г.). «Структура РНК-полимеразы I и регуляция транскрипции». Природа. 502 (7473): 650–5. Bibcode:2013Натура.502..650E. Дои:10.1038 / природа12712. HDL:11858 / 00-001M-0000-0015-3B48-5. PMID  24153182. S2CID  205236187.
  33. ^ Dutca LM, Gallagher JE, Baserga SJ (июль 2011 г.). «Первоначальное взаимодействие спаривания оснований U3 snoRNA: пре-рРНК, необходимое для укладки пре-18S рРНК, выявленное химическим зондированием in vivo». Исследования нуклеиновых кислот. 39 (12): 5164–80. Дои:10.1093 / nar / gkr044. ЧВК  3130255. PMID  21349877.
  34. ^ Woodson SA (декабрь 2011 г.). «Пути сворачивания РНК и самосборка рибосом». Отчеты о химических исследованиях. 44 (12): 1312–9. Дои:10.1021 / ar2000474. ЧВК  4361232. PMID  21714483.
  35. ^ Sloan KE, Warda AS, Sharma S, Entian KD, Lafontaine DL, Bohnsack MT (сентябрь 2017 г.). «Настройка рибосомы: влияние модификации рРНК на биогенез и функцию эукариотических рибосом». РНК Биология. 14 (9): 1138–1152. Дои:10.1080/15476286.2016.1259781. ЧВК  5699541. PMID  27911188.
  36. ^ Гигова А., Дуггимпуди С., Поллекс Т., Шефер М., Кош М. (октябрь 2014 г.). «Кластер метилирования в домене IV 25S рРНК необходим для стабильности рибосом». РНК. 20 (10): 1632–44. Дои:10.1261 / rna.043398.113. ЧВК  4174444. PMID  25125595.
  37. ^ Методиев М.Д., Леско Н., Парк CB, Камара Й., Ши Й., Вибом Р. и др. (Апрель 2009 г.). «Метилирование 12S рРНК необходимо для стабильности in vivo малой субъединицы митохондриальной рибосомы млекопитающих». Клеточный метаболизм. 9 (4): 386–97. Дои:10.1016 / j.cmet.2009.03.001. PMID  19356719.
  38. ^ Томпсон М., Хойслер Р.А., Хороший П.П., Энгельке Д.Р. (ноябрь 2003 г.). «Ядерная кластеризация дисперсных генов тРНК». Наука. 302 (5649): 1399–401. Bibcode:2003Наука ... 302.1399Т. Дои:10.1126 / science.1089814. ЧВК  3783965. PMID  14631041.
  39. ^ «синтез и обработка рРНК».
  40. ^ а б Смит С., Видманн Дж., Найт Р. (2007). «Скорость эволюции зависит от структурных элементов рРНК». Исследования нуклеиновых кислот. 35 (10): 3339–54. Дои:10.1093 / нар / гкм101. ЧВК  1904297. PMID  17468501.
  41. ^ Чан Дж. К., Ханнан К. М., Ридделл К., Нг ПЙ, Пек А., Ли Р. С. и др. (Август 2011 г.). «AKT способствует синтезу рРНК и взаимодействует с c-MYC, чтобы стимулировать биогенез рибосом при раке». Научная сигнализация. 4 (188): ra56. Дои:10.1126 / scisignal.2001754. PMID  21878679. S2CID  20979505.
  42. ^ Ли С., Ибараги С., Ху Г.Ф. (май 2011 г.). «Ангиогенин как молекулярная мишень для лечения рака простаты». Текущие обзоры противораковой терапии. 7 (2): 83–90. Дои:10.2174/1573394711107020083. ЧВК  3131147. PMID  21743803.
  43. ^ Hoppe S, Bierhoff H, Cado I, Weber A, Tiebe M, Grummt I, Voit R (октябрь 2009 г.). «АМФ-активированная протеинкиназа адаптирует синтез рРНК к энергоснабжению клетки». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 106 (42): 17781–6. Bibcode:2009PNAS..10617781H. Дои:10.1073 / pnas.0909873106. ЧВК  2764937. PMID  19815529.
  44. ^ Лян XH, Лю Q, Fournier MJ (сентябрь 2009 г.). «Потеря модификаций рРНК в декодирующем центре рибосомы ухудшает трансляцию и сильно задерживает процессинг пре-рРНК». РНК. 15 (9): 1716–28. Дои:10.1261 / rna.1724409. ЧВК  2743053. PMID  19628622.
  45. ^ Ларсон К., Ян С.Дж., Цуруми А., Лю Дж., Чжоу Дж., Гаур К. и др. (Январь 2012 г.). «Образование гетерохроматина способствует долголетию и подавляет синтез рибосомальной РНК». PLOS Genetics. 8 (1): e1002473. Дои:10.1371 / journal.pgen.1002473. ЧВК  3266895. PMID  22291607.
  46. ^ а б Гаал Т., Бартлетт М.С., Росс В., Тернбоу К.Л., Гурс Р.Л. (декабрь 1997 г.). «Регуляция транскрипции путем инициирования концентрации NTP: синтез рРНК в бактериях». Наука. 278 (5346): 2092–7. Bibcode:1997Sci ... 278.2092G. Дои:10.1126 / science.278.5346.2092. PMID  9405339.
  47. ^ Маэда М., Шимада Т., Исихама А. (2015-12-30). «Сила и регуляция семи промоторов рРНК в Escherichia coli». PLOS ONE. 10 (12): e0144697. Bibcode:2015PLoSO..1044697M. Дои:10.1371 / journal.pone.0144697. ЧВК  4696680. PMID  26717514.
  48. ^ Gaal T., Bratton BP, Sanchez-Vazquez P, Sliwicki A, Sliwicki K, Vegel A, et al. (Октябрь 2016 г.). «Колокализация отдаленных хромосомных локусов в пространстве в E. coli: бактериальное ядрышко». Гены и развитие. 30 (20): 2272–2285. Дои:10.1101 / gad.290312.116. ЧВК  5110994. PMID  27898392.
  49. ^ Вулф, Стивен (1993). Молекулярная и клеточная биология. ISBN  978-0534124083.
  50. ^ Пийр К., Пайер А., Лийв А., Тенсон Т., Майвяли У. (май 2011 г.). «Деградация рибосом у растущих бактерий». Отчеты EMBO. 12 (5): 458–62. Дои:10.1038 / embor.2011.47. ЧВК  3090016. PMID  21460796.
  51. ^ Brandman O, Hegde RS (январь 2016 г.). «Контроль качества белка, ассоциированного с рибосомами». Структурная и молекулярная биология природы. 23 (1): 7–15. Дои:10.1038 / nsmb.3147. ЧВК  4853245. PMID  26733220.
  52. ^ Фудзи К., Китабатаке М., Саката Т., Мията А., Оно М. (апрель 2009 г.). «Роль убиквитина в очистке нефункциональных рРНК». Гены и развитие. 23 (8): 963–74. Дои:10.1101 / gad.1775609. ЧВК  2675866. PMID  19390089.
  53. ^ Донован, Бриджит М .; Jarrell, Kelli L .; ЛаРивьер, Фредерик Дж. (01.04.2011). «Исследование нефункционального распада рРНК как стрессовой реакции у Saccharomyces cerevisiae». Журнал FASEB. 25 (1_дополнение): 521.3. Дои:10.1096 / fasebj.25.1_supplement.521.3 (неактивно 09.11.2020). ISSN  0892-6638.CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на ноябрь 2020 г. (связь)
  54. ^ ЛаРивьер Ф.Дж., Коул С.Е., Ферулло Д.Дж., Мур М.Дж. (ноябрь 2006 г.). «Процесс контроля качества позднего действия для зрелых эукариотических рРНК». Молекулярная клетка. 24 (4): 619–26. Дои:10.1016 / j.molcel.2006.10.008. PMID  17188037.
  55. ^ Мишель Дж. Дж., Маккарвилл Дж. Ф., Сюн Й. (июнь 2003 г.). «Роль убиквитинлигазы Saccharomyces cerevisiae Cul8 в правильной анафазной прогрессии». Журнал биологической химии. 278 (25): 22828–37. Дои:10.1074 / jbc.M210358200. PMID  12676951. S2CID  33099674.
  56. ^ Пайер А., Леппик М., Соосаар А., Тенсон Т., Майвяли Ю. (январь 2015 г.). «Влияние нарушений активных центров рибосом и межсубъединичных контактов на деградацию рибосом у Escherichia coli». Научные отчеты. 5: 7712. Bibcode:2015НатСР ... 5Э7712П. Дои:10.1038 / srep07712. ЧВК  4289901. PMID  25578614.
  57. ^ Идэ С., Миядзаки Т., Маки Х., Кобаяши Т. (февраль 2010 г.). «Изобилие копий гена рибосомной РНК поддерживает целостность генома». Наука. 327 (5966): 693–6. Bibcode:2010Sci ... 327..693I. Дои:10.1126 / science.1179044. PMID  20133573. S2CID  206522454.
  58. ^ а б Quast C, Pruesse E, Yilmaz P, Gerken J, Schweer T., Yarza P, et al. (Январь 2013). «Проект базы данных генов рибосомной РНК SILVA: улучшенная обработка данных и веб-инструменты». Исследования нуклеиновых кислот. 41 (Проблема с базой данных): D590-6. Дои:10.1093 / нар / gks1219. ЧВК  3531112. PMID  23193283.
  59. ^ Прюсс Э., Пеплис Дж., Глёкнер Ф.О. (июль 2012 г.). «SINA: точное высокопроизводительное выравнивание множественных последовательностей генов рибосомной РНК». Биоинформатика. 28 (14): 1823–9. Дои:10.1093 / биоинформатика / bts252. ЧВК  3389763. PMID  22556368.
  60. ^ а б Виланд М., Бершнайдер Б., Эрлахер, доктор медицины, Хартиг Дж.С. (март 2010 г.). «Аптазим-опосредованная регуляция 16S рибосомальной РНК». Химия и биология. 17 (3): 236–42. Дои:10.1016 / j.chembiol.2010.02.012. PMID  20338515.
  61. ^ Борден Дж. Р., Джонс С. В., Индурти Д., Чен Ю., Папуцакис И. Т. (май 2010 г.). «Открытие на основе геномной библиотеки нового, возможно синтетического, механизма устойчивости к кислоте у Clostridium acetobutylicum, включающего некодирующие РНК и процессинг рибосомной РНК». Метаболическая инженерия. 12 (3): 268–81. Дои:10.1016 / j.ymben.2009.12.004. ЧВК  2857598. PMID  20060060.
  62. ^ Trauner A, Lougheed KE, Bennett MH, Hingley-Wilson SM, Williams HD (июль 2012 г.). «Регулятор покоя DosR контролирует стабильность рибосом у гипоксических микобактерий». Журнал биологической химии. 287 (28): 24053–63. Дои:10.1074 / jbc.m112.364851. ЧВК  3390679. PMID  22544737.
  63. ^ Мейер А., Тодт С., Миккельсен Н.Т., Либ Б. (март 2010 г.). «Быстро развивающиеся последовательности 18S рРНК из Solenogastres (Mollusca) сопротивляются стандартной ПЦР-амплификации и дают новое представление о гетерогенности скорости замены моллюсков». BMC Эволюционная биология. 10 (1): 70. Дои:10.1186/1471-2148-10-70. ЧВК  2841657. PMID  20214780.
  64. ^ Коул Дж. Р., Чай Б., Марш Т. Л., Фаррис Р. Дж., Ван К., Кулам С. А. и др. (Январь 2003 г.). «Проект базы данных рибосом (RDP-II): предварительный просмотр нового средства автоматического выравнивания, которое позволяет регулярно обновлять и новую таксономию прокариот». Исследования нуклеиновых кислот. 31 (1): 442–3. Дои:10.1093 / nar / gkg039. ЧВК  165486. PMID  12520046.
  65. ^ Pruesse E, Quast C, Knittel K, Fuchs BM, Ludwig W, Peplies J, Glöckner FO (2007). «SILVA: всеобъемлющий онлайн-ресурс для проверенных и согласованных данных о последовательностях рибосомных РНК, совместимых с ARB». Исследования нуклеиновых кислот. 35 (21): 7188–96. Дои:10.1093 / нар / гкм864. ЧВК  2175337. PMID  17947321.
  66. ^ «Механизмы лекарственной устойчивости Mycobacterium tuberculosis», Туберкулез и туберкулезная палочка, Американское общество микробиологов, 2005 г., стр. 115–140, Дои:10.1128 / 9781555817657.ch8, ISBN  9781555817657, S2CID  36002898
  67. ^ Long KS, Poehlsgaard J, Hansen LH, Hobbie SN, Böttger EC, Vester B (март 2009 г.). «Единичные мутации 23S рРНК в центре рибосомальной пептидилтрансферазы придают устойчивость к валнемулину и другим антибиотикам у Mycobacterium smegmatis за счет нарушения кармана связывания лекарственного средства». Молекулярная микробиология. 71 (5): 1218–27. Дои:10.1111 / j.1365-2958.2009.06596.x. PMID  19154331. S2CID  23728518.
  68. ^ Джу Сон Д. (2013). «Атипичная механочувствительная микроРНК-712, полученная из прерибосомальной РНК, вызывает эндотелиальное воспаление и атеросклероз». Nature Communications. 4: 3000. Bibcode:2013НатКо ... 4.3000S. Дои:10.1038 / ncomms4000. ЧВК  3923891. PMID  24346612.

внешняя ссылка