Гистидин - Histidine

л-Гистидин
L-гистидин физиологический.svg
L-гистидин-цвиттерион-from-xtal-1993-3D-balls-B.png
Имена
Название ИЮПАК
Гистидин
Другие имена
2-амино-3- (1ЧАС-имидазол-4-ил) пропановая кислота
Идентификаторы
3D модель (JSmol )
ЧЭБИ
ЧЭМБЛ
ChemSpider
DrugBank
ECHA InfoCard100.000.678 Отредактируйте это в Викиданных
КЕГГ
UNII
Свойства
C6ЧАС9N3О2
Молярная масса155.157 г · моль−1
4,19 г / 100 г при 25 ° C [1]
Опасности
Паспорт безопасностиУвидеть: страница данных
NFPA 704 (огненный алмаз)
Страница дополнительных данных
Показатель преломления (п),
Диэлектрическая постояннаяр), так далее.
Термодинамический
данные
Фазовое поведение
твердое тело – жидкость – газ
УФ, ИК, ЯМР, РС
Если не указано иное, данные для материалов приводятся в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
проверятьY проверить (что проверятьY☒N ?)
Ссылки на инфобоксы

Гистидин (символ Его или ЧАС)[2] является α-аминокислота который используется в биосинтезе белки. Он содержит α-аминогруппа (который находится в протонированный –NH3+ форма под биологические условия ), а карбоновая кислота группа (которая находится в депротонированной –COO форма в биологических условиях), и имидазол боковая цепь (которая частично протонирована), классифицируя ее как положительно заряженную аминокислоту на физиологических pH. Первоначально думал существенный только для младенцев, в долгосрочных исследованиях было показано, что он необходим и для взрослых.[3] это закодированный посредством кодоны CAU и CAC.

Гистидин был впервые выделен немецким врачом. Альбрехт Коссель и Свен Густав Хедин в 1896 г.[4] Это также предшественник к гистамин, жизненно важный воспалительный агент в иммунных ответах. Ацил радикальный является гистидил.

Свойства боковой цепи имидазола

Конъюгированная кислота (протонированная форма) имидазол боковая цепь в гистидине есть пKа примерно 6.0. Таким образом, ниже pH 6 имидазольное кольцо в основном протонированный (как описано Уравнение Хендерсона – Хассельбаха ). Образовавшееся имидазолиевое кольцо несет две связи NH и имеет положительный заряд. Положительный заряд равномерно распределяется между обоими азот и может быть представлен двумя одинаково важными резонансные структуры. При pH выше 6 теряется один из двух протонов. Оставшийся протон имидазольного кольца может находиться на любом атоме азота, давая начало тому, что известно как N1-H или N3-H. таутомеры. Таутомер N3-H, показанный на рисунке выше, протонирован на атоме азота №3, дальше от основной цепи аминокислоты, несущей амино- и карбоксильные группы, тогда как таутомер N1-H протонирован на азоте ближе к основной цепи. Имидазол / имидазолиевое кольцо гистидина представляет собой ароматный при всех значениях pH.[5]

Кислотно-основные свойства боковой цепи имидазола имеют отношение к каталитический механизм из многих ферменты.[6] В каталитические триады, основной азот гистидина отрывает протон от серин, треонин, или цистеин активировать его как нуклеофил. В гистидине протонный шаттл, гистидин используется для быстрого перемещения протонов. Он может сделать это, отвлекая протон с его основным азотом, чтобы получить положительно заряженный промежуточный продукт, а затем использовать другую молекулу, буфер, для извлечения протона из его кислого азота. В углеангидразы, гистидиновый протонный челнок используется для быстрого перемещения протонов от цинк -связанная молекула воды для быстрой регенерации активной формы фермента. По спиралям E и F гемоглобин, гистидин влияет на связывание кислорода, а также монооксид углерода. Это взаимодействие увеличивает сродство Fe (II) к O2, но дестабилизирует связывание CO, который связывается только в 200 раз сильнее в гемоглобине по сравнению с 20000 раз сильнее в свободном гем.

Таутомерия и кислотно-основные свойства боковой цепи имидазола были охарактеризованы 15Спектроскопия ЯМР N. Два химических сдвига 14N аналогичны (около 200 частей на миллион относительно азотная кислота по сигма-шкале, на которой повышенное экранирование соответствует повышенному химический сдвиг ). ЯМР спектральные измерения показывают, что химический сдвиг N1-H немного падает, тогда как химический сдвиг N3-H значительно падает (примерно 190 против 145 ppm). Это изменение указывает на то, что таутомер N1-H предпочтителен, возможно, из-за водородной связи с соседними аммоний. Экранирование на N3 существенно снижается из-за второго порядка парамагнитный эффект, который включает разрешенное симметрией взаимодействие между неподеленной парой азота и возбужденными π * -состояниями ароматическое кольцо. При pH> 9 химические сдвиги N1 и N3 составляют примерно 185 и 170 ppm.[7]

Лиганд

Связанный гистидином гем группа сукцинатдегидрогеназа, электронный носитель в митохондриальный цепь переноса электронов. Большая полупрозрачная сфера указывает на расположение утюг ион. От PDB: 1YQ3​.
Сайт трикоппера встречается во многих лакахах, обратите внимание, что каждый медь центр привязан к имидазол боковые цепи гистидин (цветовой код: медь-коричневый, азот синий).

Гистидиновые формы комплексы со многими ионами металлов. Боковая цепь имидазола остатка гистидина обычно служит лиганд в металлопротеины. Одним из примеров является осевое основание, прикрепленное к Fe в миоглобине и гемоглобине. Полигистидиновые метки (из шести или более последовательных H-остатков) используются для очистки белка путем связывания с колонками с никелем или кобальтом с микромолярным сродством. [8] Природные поли-гистидиновые пептиды, содержащиеся в яде гадюки. Атерис чешуйчатый было показано, что они связывают Zn (2+), Ni (2+) и Cu (2+) и влияют на функцию металлопротеаз яда. [9] Кроме того, богатые гистидином регионы низкой сложности содержатся в связывающих металлы и особенно никель-кобальтсвязывающих белках. [10]

Метаболизм

Биосинтез

Путь биосинтеза гистидина Восемь различных ферментов могут катализировать десять реакций. На этом изображении His4 катализирует четыре различные реакции в пути.

л-Гистидин, незаменимая аминокислота, которая не синтезируется de novo в людях.[11] Люди и другие животные должны принимать гистидин или гистидинсодержащие белки. Биосинтез гистидина широко изучался у прокариот, таких как Кишечная палочка. Синтез гистидина в Кишечная палочка включает восемь генных продуктов (His1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 и 8) и происходит в десять этапов. Это возможно, потому что продукт одного гена способен катализировать более одной реакции. Например, как показано в пути, Его4 катализирует 4 различных этапа пути.[12]

Гистидин синтезируется из фосфорибозилпирофосфат (ПРПП), который изготавливается из рибозо-5-фосфат от рибозо-фосфатдифосфокиназа в пентозофосфатный путь. Первая реакция биосинтеза гистидина - конденсация PRPP и аденозинтрифосфат (АТФ) ферментом АТФ-фосфорибозилтрансфераза. АТФ-фосфорибозилтрансфераза обозначена His1 на изображении.[12] Затем продукт гена His4 гидролизует продукт конденсации, фосфорибозил-АТФ, с образованием фосфорибозил-АМФ (PRAMP), что является необратимым этапом. His4 затем катализирует образование фосфорибозилформино-AICAR-фосфата, который затем превращается в фосфорибулозилформино-AICAR-P продуктом гена His6.[13] His7 расщепляет фосфорибулозилформино-AICAR-P с образованием d-эритро-имидазол-глицеринфосфат. После этого His3 образует имидазол-ацетол-фосфат с выделением воды. His5 затем делает л-гистидинолфосфат, который затем гидролизуется His2, образуя гистидинол. Его4 катализирует окисление л-гистидинол с образованием л-гистидинал, аминоальдегид. На последнем этапе л-histidinal преобразуется в л-гистидин.[13][14]

Так же, как животные и микроорганизмы, растениям нужен гистидин для роста и развития.[6] Микроорганизмы и растения схожи в том, что они могут синтезировать гистидин.[15] Оба синтезируют гистидин из промежуточного биохимического фосфорибозилпирофосфата. В целом биосинтез гистидина у растений и микроорганизмов очень похож.[16]

Регуляция биосинтеза

Этот путь требует энергии для того, чтобы возникать, поэтому присутствие АТФ активирует первый фермент пути, АТФ-фосфорибозилтрансферазу (показан как His1 на изображении справа). АТФ-фосфорибозилтрансфераза - это фермент, определяющий скорость, который регулируется посредством ингибирования по обратной связи, что означает, что он ингибируется в присутствии продукта, гистидина.[17]

Деградация

Гистидин - одна из аминокислот, которая может превращаться в промежуточные продукты цикла трикарбоновых кислот (ТСА).[18] Гистидин, наряду с другими аминокислотами, такими как пролин и аргинин, принимает участие в дезаминировании, процессе, в котором его аминогруппа удаляется. В прокариоты гистидин сначала превращается в уроканат под действием гистидазы. Затем уроканаза превращает уроканат в 4-имидазолон-5-пропионат. Имидазолонепропионаза катализирует реакцию с образованием форминоглутамат (FIGLU) из 4-имидазолон-5-пропионата.[19] Группа формимино передается в тетрагидрофолат, а оставшиеся пять атомов углерода образуют глутамат.[18] В целом эти реакции приводят к образованию глутамата и аммиака.[20] Затем глутамат может быть дезаминирован глутаматдегидрогеназой или трансаминирован с образованием α-кетоглутарата.[18]

Превращение в другие биологически активные амины

Превращение гистидина в гистамин от гистидиндекарбоксилаза

Требования

Совет по пищевым продуктам и питанию (FNB) Института медицины США установил Рекомендуемые диетические нормы (RDA) для незаменимые аминокислоты в 2002 г. Для гистидина для взрослых от 19 лет и старше 14 мг / кг массы тела / день.[25]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ http://prowl.rockefeller.edu/aainfo/solub.htm[требуется полная цитата ]
  2. ^ «Номенклатура и символика аминокислот и пептидов». Совместная комиссия IUPAC-IUB по биохимической номенклатуре. 1983. Архивировано с оригинал 9 октября 2008 г.. Получено 5 марта 2018.
  3. ^ Коппле, Дж. Д.; Свендсейд М.Е. (1975). «Доказательства того, что гистидин является незаменимой аминокислотой для нормального и хронического уремического человека». Журнал клинических исследований. 55 (5): 881–91. Дои:10.1172 / JCI108016. ЧВК  301830. PMID  1123426.
  4. ^ Викери, Хьюберт Брэдфорд; Ливенворт, Чарльз С. (1928-08-01). «О РАЗДЕЛЕНИИ ГИСТИДИНА И АРГИНИНА IV. ПРИГОТОВЛЕНИЕ ГИСТИДИНА» (PDF). Журнал биологической химии. 78 (3): 627–635. ISSN  0021-9258.
  5. ^ Мрозек, Агнешка; Каролак-Войцеховская, Янина; Кец-Кононович, Катажина (2003). «Пятичленные гетероциклы. Часть III. Ароматичность 1,3-имидазола в 5 + n гетеробициклических молекулах». Журнал молекулярной структуры. 655 (3): 397–403. Bibcode:2003JMoSt.655..397M. Дои:10.1016 / S0022-2860 (03) 00282-5.
  6. ^ а б Ингл, Роберт А. (2011). «Биосинтез гистидина». Книга об арабидопсисе. 9: e0141. Дои:10.1199 / таб.0141. ЧВК  3266711. PMID  22303266.
  7. ^ Робертс, Джон Д. (2000). Азбука FT-ЯМР. Саусалито, Калифорния: Университетские научные книги. С. 258–9. ISBN  978-1-891389-18-4.
  8. ^ Bornhorst, J. A .; Фальке, Дж. Дж. (2000). «Очистка белков с использованием полигистидиновых аффинных меток». Методы в энзимологии. 326: 245–254. Дои:10.1016 / с0076-6879 (00) 26058-8. ISSN  0076-6879. ЧВК  2909483. PMID  11036646.
  9. ^ Уотли, Джоанна; Симоновский, Эяль; Барбоса, Нуно; Spodzieja, Marta; Wieczorek, Роберт; Родзевич-Мотовидло, Сильвия; Миллер, Йифат; Козловский, Хенрик (2015-08-17). «Пептидный фрагмент poly-His Tag африканской гадюки эффективно связывает ионы металлов и складывается в α-спиральную структуру». Неорганическая химия. 54 (16): 7692–7702. Дои:10.1021 / acs.inorgchem.5b01029. ISSN  1520-510X. PMID  26214303.
  10. ^ Нтунтуми, Криса; Властаридис, Панайотис; Моссиалос, Димитрис; Статопулос, Константинос; Илиопулос, Иоаннис; Промпонас, Василиос; Оливер, Стивен Дж. Амуциас, Григорис Д. (04.11.2019). «Области низкой сложности в белках прокариот выполняют важные функциональные роли и являются высококонсервативными». Исследования нуклеиновых кислот. 47 (19): 9998–10009. Дои:10.1093 / нар / gkz730. ISSN  0305-1048. ЧВК  6821194. PMID  31504783.
  11. ^ Карта биохимических путей Рош Карта биохимических путей Рош
  12. ^ а б Алифано, П; Fani, R; Liò, P; Ласкано, А; Bazzicalupo, M; Карломаньо, M S; Бруни, Си Би (1996-03-01). «Путь и гены биосинтеза гистидина: структура, регуляция и эволюция». Микробиологические обзоры. 60 (1): 44–69. Дои:10.1128 / MMBR.60.1.44-69.1996. ISSN  0146-0749. ЧВК  239417. PMID  8852895.
  13. ^ а б Кулис-Хорн, Роберт К; Персике, Маркус; Калиновски, Йорн (01.01.2014). «Биосинтез гистидина, его регуляция и биотехнологическое применение у Corynebacterium glutamicum». Микробная биотехнология. 7 (1): 5–25. Дои:10.1111/1751-7915.12055. ISSN  1751-7915. ЧВК  3896937. PMID  23617600.
  14. ^ Адамс, Э. (1955-11-01). «L-гистидинал, биосинтетический предшественник гистидина». Журнал биологической химии. 217 (1): 325–344. ISSN  0021-9258. PMID  13271397.
  15. ^ "Понимание генетики". genetics.thetech.org. Получено 2016-05-19.
  16. ^ Степанский, А .; Леустек, Т. (01.03.2006). «Биосинтез гистидина в растениях». Аминокислоты. 30 (2): 127–142. Дои:10.1007 / s00726-005-0247-0. ISSN  0939-4451. PMID  16547652. S2CID  23733445.
  17. ^ Ченг, Йонгсонг; Чжоу Юньцзяо; Ян, Лэй; Чжан, Чэнлинь; Сюй, Цинъян; Се, Сисянь; Чен, Нин (01.05.2013). «Модификация генов пути биосинтеза гистидина и влияние на продукцию L-гистидина в Corynebacterium glutamicum». Письма о биотехнологии. 35 (5): 735–741. Дои:10.1007 / s10529-013-1138-1. ISSN  1573-6776. PMID  23355034. S2CID  18380727.
  18. ^ а б c Серия обзоров Правления (BRS) - Биохимия, молекулярная биология и генетика (пятое издание): Swanson, Kim, Glucksman
  19. ^ Coote, J. G .; Хассалл, Х. (1973-03-01). «Разложение L-гистидина, имидазолил-1-лактата и имидазолилпропионата под действием Pseudomonas testosteroni». Биохимический журнал. 132 (3): 409–422. Дои:10.1042 / bj1320409. ISSN  0264-6021. ЧВК  1177604. PMID  4146796.
  20. ^ Mehler, A.H .; Табор, Х. (1953-04-01). «Дезаминирование гистидина с образованием урокановой кислоты в печени». Журнал биологической химии. 201 (2): 775–784. ISSN  0021-9258. PMID  13061415.
  21. ^ Andersen, Hjalte H .; Эльберлинг, Джеспер; Арендт-Нильсен, Ларс (2015-09-01). «Суррогатные модели человека гистаминергического и негистаминергического зуда» (PDF). Acta Dermato-Venereologica. 95 (7): 771–777. Дои:10.2340/00015555-2146. ISSN  1651-2057. PMID  26015312.
  22. ^ «3-метилгистидин». HMDB версии 4.0. База данных человеческого метаболома. 20 декабря 2017 г.. Получено 25 декабря 2017.
  23. ^ Дерав, Вим; Эвераерт, Инге; Бикман, Сэм; Баге, Одри (2010-03-01). «Метаболизм карнозина в мышцах и добавление бета-аланина в связи с упражнениями и тренировками». Спортивная медицина. 40 (3): 247–263. Дои:10.2165/11530310-000000000-00000. HDL:1854 / LU-897781. ISSN  1179-2035. PMID  20199122. S2CID  7661250.
  24. ^ Фэйи, Роберт С. (2001). «Новелтиолы прокариот». Ежегодный обзор микробиологии. 55: 333–56. Дои:10.1146 / annurev.micro.55.1.333. PMID  11544359.
  25. ^ Институт медицины (2002). «Белок и аминокислоты». Нормы потребления энергии, углеводов, клетчатки, жиров, жирных кислот, холестерина, белков и аминокислот с пищей. Вашингтон, округ Колумбия: The National Academies Press. С. 589–768.

внешние ссылки