Интрон группы III - Group III intron

Интрон группы III это класс интроны обнаружены в генах мРНК хлоропластов в эвгленида протисты. У них есть обычный группа II типа dVI с выпуклым аденозином, обтекаемым dI, без dII-dV и расслабленным консенсусом по сайту сплайсинга.[1](инжир. 2) Склейка производится двумя переэтерификация реакции с выпуклым аденозином dVI в качестве инициирующего нуклеофил; интрон иссечен как лариат.[2] О том, как они работают, известно немного,[1] хотя была построена изолированная система трансформации хлоропластов.[3]

Открытие и идентификация

В 1984 году Монтандон и Штутц сообщили о примерах интронов нового типа в эвглене. хлоропласт.[4] В 1989 году Дэвид А. Кристофер и Ричард Б. Халлик нашли еще несколько примеров и предложили название «интроны группы III», чтобы идентифицировать этот новый класс со следующими характеристиками:[5]

  • Интроны группы III намного короче, чем другие классы самосплайсинговых интронов, в диапазоне от 95 до 110 нуклеотидов среди тех, которые известны Кристоферу и Халлику и идентифицированы в хлоропластах. С другой стороны, Кристофер и Халлик заявили: «Напротив, самая маленькая эвглена. хлоропласт интрон группы II ... составляет 277 нуклеотидов ».[5]
  • Их консервативные последовательности, проксимальные к сайтам сплайсинга, имеют сходство с таковыми интронов группы II, но имеют меньше консервативных положений.
  • Они не отображаются в консервативной вторичной структуре интронов группы II. (Действительно, Кристофер и Халлик не смогли идентифицировать какие-либо консервативные элементы вторичной структуры среди интронов группы III.)
  • Обычно они связаны с генами, участвующими в трансляции и транскрипции.
  • Они очень богаты на A + T.

В 1994 году открытие интрона группы III с длиной на порядок больше показало, что длина сама по себе не является определяющим фактором сращивание в интронах III группы.[2]

Сплайсинг интронов III группы происходит через лариат и кольцевая РНК формирование.[2] Сходства между группой III и ядерными интронами включают консервативные 5'-граничные последовательности, образование лари, отсутствие внутренней структуры и способность использовать альтернативные границы сплайсинга.[1]

Рекомендации

  1. ^ а б c Копертино Д.В., Халлик Р.Б. (декабрь 1993 г.). «Интроны группы II и группы III твинтронов: потенциальные отношения с ядерными интронами пре-мРНК». Trends Biochem. Наука. 18 (12): 467–71. Дои:10.1016 / 0968-0004 (93) 90008-б. PMID  8108859.
  2. ^ а б c Дональд В. Копертино DW; Зал ET; Ван Хук FW; Jenkins KP; Халлик РБ (1994). «Двойной твинтрон группы III, кодирующий ген, подобный матуразе, вырезает через лариатные промежуточные соединения». Нуклеиновые кислоты Res. 22 (6): 1029–36. Дои:10.1093 / nar / 22.6.1029. ЧВК  307926. PMID  7512259.
  3. ^ Doetsch, NA; Фавро, MR; Кускуоглу, Н; Томпсон, доктор медицины; Халлик, РБ (февраль 2001 г.). «Трансформация хлоропластов в Euglena gracilis: сплайсинг твинтрона группы III, транскрибируемого с трансгенного оперона psbK». Текущая генетика. 39 (1): 49–60. Дои:10.1007 / s002940000174. PMID  11318107.
  4. ^ Montandon PE, Stutz E (сентябрь 1983 г.). «Нуклеотидная последовательность области генома хлоропласта Euglena gracilis, кодирующая фактор элонгации Tu; свидетельство сплайсированной мРНК». Нуклеиновые кислоты Res. 11 (17): 5877–92. Дои:10.1093 / nar / 11.17.5877. ЧВК  326324. PMID  6310519.
  5. ^ а б Кристофер Д.А., Халлик Р.Б. (октябрь 1989 г.). «Оперон рибосомного белка хлоропласта Euglena gracilis: новый ген хлоропласта для рибосомного белка L5 и описание новой категории интронов органелл, обозначенной как группа III». Нуклеиновые кислоты Res. 17 (19): 7591–608. Дои:10.1093 / nar / 17.19.7591. ЧВК  334869. PMID  2477800.

Смотрите также

внешняя ссылка