Ферментибактерии - Википедия - Fermentibacteria

Ферментибактерии
Научная классификация
Домен:
Бактерии
Суперфилум:
Группа FCB
Тип:
Ферментибактерии

Ферментибактерии (ранее Hyd24-12) - это бактериальный тип с кандидат положение дел. Это часть Группа FCB.[1]

Исходная последовательность клона, использованная для определения Fermentibacteria как типа (AJ535232 ) был извлечен из среды холодного просачивания Hydrate Ridge (Cascadia Margin, на шельфе от OR, США).[2] Первые геномы этого типа были извлечены из образцов полномасштабных мезофильных анаэробных варочных котлов на датских очистных сооружениях.[1] Предполагалось, что все три извлеченных генома представляют организмы, которые полагаются на ферментацию простых сахаров в качестве источника энергии, и поэтому было предложено название «ферментибактерии» (от «ферментировать»).[1]

Члены этого типа были обнаружены в широком диапазоне сред, включая просачивание метана,[3] пески коралловых рифов,[4] и пасть дельфина.[5]

Предлагаемые виды включают Fermentibacter daniensis[1] и Сабулиектум молчание[6]

Рекомендации

  1. ^ а б c d Киркегор, Расмус Хансен; Дуэхольм, Мортен Симонсен; Макилрой, Саймон Джон; Ниерихло, Марта; Карст, Сорен Майкл; Альбертсен, Мадс; Нильсен, Пер Халькьер (октябрь 2016 г.). «Геномное понимание членов кандидата филума Hyd24-12, часто встречающегося в мезофильных анаэробных варочных котлах». Журнал ISME. 10 (10): 2352–2364. Дои:10.1038 / ismej.2016.43. ISSN  1751-7370. PMID  27058503.
  2. ^ Knittel, Katrin; Боэтиус, Антье; Лемке, Андреас; Эйлерс, Хайке; Лохте, Карин; Пфаннкуче, Олаф; Линке, Питер; Аманн, Рудольф (июль 2003 г.). «Активность, распределение и разнообразие сульфатредукторов и других бактерий в отложениях над газовыми гидратами (Каскадия Марджин, Орегон)». Журнал геомикробиологии. 20 (4): 269–294. Дои:10.1080/01490450303896. ISSN  0149-0451.
  3. ^ Руфф, С. Эмиль; Биддл, Дженнифер Ф .; Теске, Андреас П .; Knittel, Katrin; Боэтиус, Антье; Раметт, Албан (16 марта 2015 г.). «Глобальное распространение и локальная диверсификация микробиома просачиваемого метана». Труды Национальной академии наук. 112 (13): 4015–4020. Дои:10.1073 / pnas.1421865112. ISSN  0027-8424. ЧВК  4386351. PMID  25775520.
  4. ^ Шёттнер, Сандра; Пфицнер, Барбара; Грюнке, Стефани; Рашид, Мохаммед; Дикий, Кристиан; Раметт, Олбан (09.05.2011). «Факторы динамики бактериального разнообразия в проницаемых карбонатных и силикатных песках коралловых рифов Красного моря». Экологическая микробиология. 13 (7): 1815–1826. Дои:10.1111 / j.1462-2920.2011.02494.x. ISSN  1462-2912. ЧВК  3207121. PMID  21554515.
  5. ^ Дудек, Наташа К .; Сан, Кристин Л .; Бурштейн, Дэвид; Кантор, Роза С .; Алиага Гольцман, Даниэла С .; Бик, Элизабет М .; Томас, Брайан Ч .; Банфилд, Джиллиан Ф .; Релман, Дэвид А. (18 декабря 2017 г.). «Новое микробное разнообразие и функциональный потенциал в оральном микробиоме морских млекопитающих». Текущая биология. 27 (24): 3752–3762.e6. Дои:10.1016 / j.cub.2017.10.040. ISSN  1879-0445. PMID  29153320.
  6. ^ Саад, Саинаб; Бхатнагар, Шриджак; Тегетмейер, Халина Е .; Geelhoed, Jeanine S .; Строус, Марк; Руфф, С. Эмиль (2017). «Кратковременное воздействие кислорода или нитратов показывает экофизиологию ферментативных и сульфатредуцирующих популяций бентосных микробов». Экологическая микробиология. 19 (12): 4866–4881. Дои:10.1111/1462-2920.13895. ISSN  1462-2920. ЧВК  5763382. PMID  28836729.