Анализ дисперсии, вызванной потоком - Википедия - Flow-induced dispersion analysis
Анализ дисперсии, вызванной потоком (FIDA) - это технология без иммобилизации, используемая для характеристики и количественной оценки биомолекулярного взаимодействия и белок концентрация в нативных условиях.[1][2][3] В FIDA проба, размер лиганд (индикатор) сродства к целевому аналиту. Когда индикатор взаимодействует с аналитом, видимый размер увеличивается, и это изменение размера может использоваться для определения концентрации и взаимодействия аналита.[1][2][4] Кроме того, гидродинамический радиус комплекса аналит-индикатор. Анализ FIDA обычно завершается за считанные минуты и требует небольшого расхода образца в несколько мкл.[1]
Приложения
- Количественная оценка аналитов (например, белки, пептиды, ДНК, наночастицы[5]) в сложных решениях (например, плазма и бульон для брожения [6][7])
- Определение
- константы сродства
- кинетика связывания
- размер молекулы (гидродинамический радиус )
- коэффициент диффузии
Принцип
Принцип FIDA основан на измерении изменения видимого размера (диффузионность ) селективного индикатора, взаимодействующего с молекулой аналита.[1][2][4] Видимый размер индикатора измеряется Дисперсия Тейлора анализ в капилляре при гидродинамическом потоке.[8]
Рекомендации
- ^ а б c d е Poulsen, Nicklas N .; Андерсен, Нина З .; Østergaard, Jesper; Чжуан, Гуйшэн; Петерсен, Николай Дж .; Дженсен, Хенрик (15.06.2015). «Анализ дисперсии, индуцированной потоком, быстро определяет количество белков в образцах плазмы человека». Аналитик. 140 (13): 4365–4369. Дои:10.1039 / c5an00697j. ISSN 1364-5528. PMID 26031223.
- ^ а б c Мортен Э., Педерсен; Østergaard, Jesper; Дженсен, Хенрик (2019). «Анализ дисперсии, вызванной потоком (FIDA) для количественной оценки и характеристики белков». В Филлипс, Терри М. (ред.). Клиническое применение капиллярного электрофореза: методы и протоколы. Методы молекулярной биологии. 1972. Нью-Йорк, Нью-Йорк: Springer New York. С. 109–123. Дои:10.1007/978-1-4939-9213-3. ISBN 9781493992126. S2CID 23665803.
- ^ Pedersen, Morten E .; Гад, Сара I .; Østergaard, Jesper; Дженсен, Хенрик (2019-04-05). «Характеристика белков в 3D: размер, складывание и функциональная оценка в едином подходе». Аналитическая химия. 91 (8): 4975–4979. Дои:10.1021 / acs.analchem.9b00537. ISSN 0003-2700. PMID 30916933.
- ^ а б Дженсен, Хенрик; Остергаард, Джеспер (31 марта 2010 г.). «Анализ дисперсии, вызванной потоком, количественно определяет нековалентные взаимодействия в образцах нанолитров». Журнал Американского химического общества. 132 (12): 4070–4071. Дои:10.1021 / ja100484d. ISSN 0002-7863. PMID 20201527.
- ^ Чолак, Эрсой; Бугге, Катрин; Хондкер, Адри; Гаугер, Кимми; Педрас-Куэста, Елена; Педерсен, Мортен Энгхаве; Буччарелли, Саския; Вестергаард, Бенте; Pedersen, Stine F .; Rheinstädter, Maikel C .; Лангкильде, Аннетт Ева (2020). «Авидность внутри N-концевого якоря управляет взаимодействием и внедрением альфа-синуклеина в мембрану». Журнал FASEB. 34 (6): 7462–7482. Дои:10.1096 / fj.202000107R. ISSN 1530-6860. PMID 32277854. S2CID 215742011.
- ^ Poulsen, Nicklas N .; Pedersen, Morten E .; Østergaard, Jesper; Петерсен, Николай Дж .; Nielsen, Christoffer T .; Heegaard, Niels H.H .; Дженсен, Хенрик (2016-09-20). «Поток-индуцированный дисперсионный анализ для исследования гетерогенности связывания антител против дцДНК у пациентов с системной красной волчанкой: к новому подходу к диагностике и стратификации пациентов». Аналитическая химия. 88 (18): 9056–9061. Дои:10.1021 / acs.analchem.6b01741. ISSN 0003-2700. PMID 27571264.
- ^ Pedersen, Morten E .; Østergaard, Jesper; Дженсен, Хенрик (2020-04-28). «Определение титра IgG в растворе в ферментационном бульоне с использованием аффител и анализа дисперсии, индуцированной потоком». СКУД Омега. 5 (18): 10519–10524. Дои:10.1021 / acsomega.0c00791. ISSN 2470-1343. ЧВК 7227040. PMID 32426609.
- ^ Тейлор, сэр Джеффри; С., Ф. Р. (1953-08-25). «Дисперсия растворимых веществ в растворителе, медленно протекающем по трубке». Proc. R. Soc. Лондон. А. 219 (1137): 186–203. Дои:10.1098 / rspa.1953.0139. ISSN 0080-4630. S2CID 97372019.