Домен GAF - Википедия - GAF domain
| Домен GAF | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 3 ', 5'-Циклическая нуклеотидфосфодиэстераза 2A, содержащая домены GAF A и GAF B.[1] | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | GAF | ||||||||
| Pfam | PF01590 | ||||||||
| Pfam клан | CL0161 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR003018 | ||||||||
| УМНАЯ | GAF | ||||||||
| SCOP2 | 1fl4 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В Домен GAF это тип белковый домен который содержится в широком спектре белков всех видов.[2] Домен GAF назван в честь некоторых белков, в которых он обнаружен: cграммMP-специфические фосфодиэстеразы, аденилил циклазы и FhlA. Первая структура домена GAF, решенная Хо и его коллегами, показала, что этот домен имеет схожую складку с PAS домен.[3] У млекопитающих домены GAF обнаружены у пяти членов суперсемейства циклических нуклеотид-фосфодиэстераз: PDE2, PDE5 и PDE6, которые связывают цГМФ с доменом GAF, PDE10, который связывает цАМФ, и PDE11, который связывает цГМФ и цАМФ.[4][5]
Примеры
Белки человека, содержащие этот домен, включают:
Рекомендации
- ^ Мартинес С.Е., Ву А.Ю., Главас Н.А., Тан XB, Терли С., Хол В.Г., Биво Дж.А. (октябрь 2002 г.). «Два домена GAF в фосфодиэстеразе 2A играют разные роли в димеризации и связывании цГМФ». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (20): 13260–5. Bibcode:2002ПНАС ... 9913260М. Дои:10.1073 / pnas.192374899. JSTOR 3073384. ЧВК 130621. PMID 12271124.
- ^ Аравинд Л., Понтинг С.П. (декабрь 1997 г.). «Домен GAF: эволюционная связь между различными фототрансдукционными белками». Тенденции в биохимических науках. 22 (12): 458–9. Дои:10.1016 / S0968-0004 (97) 01148-1. PMID 9433123.
- ^ Хо Ю.С., Бёрден Л.М., Херли Дж. Х. (октябрь 2000 г.). «Структура домена GAF, повсеместно распространенный сигнальный мотив и новый класс циклических рецепторов GMP». Журнал EMBO. 19 (20): 5288–99. Дои:10.1093 / emboj / 19.20.5288. ЧВК 314001. PMID 11032796.
- ^ Fawcett L, Baxendale R, Stacey P, McGrouther C, Harrow I, Soderling S, Hetman J, Beavo JA, Phillips SC (март 2000 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика отдельного семейства генов фосфодиэстеразы человека: PDE11A». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (7): 3702–7. Bibcode:2000PNAS ... 97.3702F. Дои:10.1073 / pnas.050585197. JSTOR 121956. ЧВК 16303. PMID 10725373.
- ^ Шульц JE (2009). «Структурные и биохимические аспекты тандемных доменов GAF». Справочник по экспериментальной фармакологии. 191 (191): 93–109. Дои:10.1007/978-3-540-68964-5_6. ISBN 978-3-540-68960-7. PMID 19089327. Цитировать журнал требует
| журнал =(помощь)