Биологическая база данных
Эта статья слишком полагается на Рекомендации к основные источники . Пожалуйста, улучшите это, добавив вторичные или третичные источники. (Сентябрь 2015 г. ) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения)
Простой инструмент исследования модульной архитектуры (УМНАЯ ) это биологическая база данных который используется при идентификации и анализе белковые домены внутри белковых последовательностей.[1] [2] марковские модели со скрытым профилем построен из множественное выравнивание последовательностей для обнаружения белковых доменов в белковых последовательностях. Самый последний выпуск SMART содержит 1204 модели предметной области.[3] Сохраненная база данных домена коллекции, а также распространяется как часть ИнтерПро база данных.[4] Европейская лаборатория молекулярной биологии в Гейдельберге.
Рекомендации ^ Шульц Дж., Милпец Ф., Борк П., Понтинг С.П. (май 1998 г.). «SMART, простой инструмент исследования модульной архитектуры: определение доменов сигнализации» (PDF) . Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ . 95 (11): 5857–64. Bibcode :1998PNAS ... 95.5857S . Дои :10.1073 / пнас.95.11.5857 . ЧВК 34487 PMID 9600884 . ^ Letunic I, Doerks T, Bork P (январь 2009 г.). «SMART 6: последние обновления и новые разработки» . Нуклеиновые кислоты Res . 37 (Выпуск базы данных): D229–32. Дои :10.1093 / nar / gkn808 . ЧВК 2686533 PMID 18978020 . ^ Летунич, Ивица; Доеркс, Тобиас; Борк, Пер (январь 2015 г.). «SMART: последние обновления, новые разработки и статус в 2015 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (Выпуск базы данных): D257–260. Дои :10.1093 / нар / gku949 . ISSN 1362-4962 . ЧВК 4384020 PMID 25300481 . ^ Малдер Н.Дж., Апвейлер Р., Аттвуд Т.К. и др. (Сентябрь 2002 г.). «InterPro: интегрированный ресурс документации для семейств белков, доменов и функциональных сайтов» . Краткий. Биоинформатика . 3 (3): 225–35. Дои :10.1093 / bib / 3.3.225 PMID 12230031 . внешняя ссылка
